Search
Search results for: bioaktywne peptydy
-
New Selective Peptidyl Di(chlorophenyl) Phosphonate Esters for Visualizing and Blocking Neutrophil Proteinase 3 in Human Diseases
Publication -
Cis/trans conformational equilibrium across the N-methylphenylalanine2- N-methylphenylalanine3 peptide bond of arginine vasopressin analogs
Publication -
Structural changes of a simple peptide—Trpzip-1—in aqueous solutions and the corresponding hydration phenomena under the influence of temperature
PublicationTrpzip-1, a simple β-hairpin, is a rare example of peptide with stable secondary structure and can be a convenient model to study temperature-related processes that potential prion or amyloid proteins undergo. Although its sequence is simple, the exact processes which the peptide undergoes in aqueous solutions are quite complex and not well understood. The selection of well-established experimental (DSC, FTIR) and theoretical methods...
-
Understanding the interactions between protein stabilizers and the peptide bond through the analysis of the volumetric and compressibility properties for the model systems
PublicationThis work confirms our earlier supposition, that volumetric and acoustic parameters for simple model proposed by us are directly related to stabilizing/destabilizing effect of osmolytes on proteins structure. The apparent molar volumes, V and the apparent molar isentropic compressions, KS,, of glycine and N,N,N –trimethylglycine (betaine) were determined from densities and speed of sound measurements in aqueous solution of N-methylacetamide...
-
Peptide splicing in a double‐sequence analogue of trypsin inhibitor SFTI‐1 substituted in the P1 positions by peptoid monomers
Publication -
Aktywność przeciwgrzybowa koniugatów inhibitorów enzymatycznych z nośnikami peptydowymi
PublicationCelem badań przedstawionych w rozprawie było określenie aktywności przeciwgrzybowej szeregu związków będących koniugatami peptydów z inhibitorami enzymatycznymi (FMDP, cispentacyna). Zakres badań obejmował zbadanie aktywności peptydów-FMDP, CPP oraz FMDP-CPP wobec grzybów z rodzaju Candida w różnego typu podłożach, określenie możliwości powstawania oporności na FMDP-CPP i peptydy-FMDP, a także określenie szybkości transportu i...
-
Antimicrobial Activity of Chimera Peptides Composed of Human Neutrophil Peptide 1 (HNP-1) Truncated Analogues and Bovine Lactoferrampin
PublicationThree chimera peptides composed of bovine lactoferrampin and the analogue of truncated human neutrophil peptide 1 were synthesized by the solid-phase method. In two compounds peptide chains were connected via isopeptide bond, whereas in the third one disulfide bridge served as a linker. All three chimeras displayed significantly higher antimicrobial activity than the constituent peptides as well as their equimolar mixtures. The...
-
Peptide bond modification. I. Simple and efficient method of Boc-Gly[CH(OH)CH2]Gly-OH synthesis.
PublicationZaprezentowano prostą i efektywną metodę syntezy obu enancjomerów t-butoksykarbonylo chronionego pseudo dipeptydu (R) oraz (S)-Boc-Gly[CH(OH)CH2]Gly-OH.
-
Inhibitory activity of double‐sequence analogues of trypsin inhibitor SFTI‐1 from sunflower seeds: an example of peptide splicing
Publication -
Influence of Dimerization of Lipopeptide Laur-Orn-Orn-Cys–NH2 and an N-terminal Peptide of Human Lactoferricin on Biological Activity
Publication -
Binding modes of a new epoxysuccinyl–peptide inhibitor of cysteine proteases. Where and how do cysteine proteases express their selectivity?
Publication -
Lipidated Analogs of the LL-37-Derived Peptide Fragment KR12—Structural Analysis, Surface-Active Properties and Antimicrobial Activity
Publication -
Relative quantification of pork and beef in meat products using global and species-specific peptide markers for the authentication of meat composition
PublicationWe used global and species-specific peptide markers for a relative quantitative determination of pork and beef in raw and processed meat products made of the two meat species. Four groups of products were prepared (i.e., minced raw meats, sausages, raw and fried burgers) in order to represent products with different extents of food processing. In each group, the products varied in the pork/beef proportions. All products were analysed...
-
Development of a Peptide Derived from Platelet-Derived Growth Factor (PDGF-BB) into a Potential Drug Candidate for the Treatment of Wounds
PublicationObjective: This study evaluated the use of novel peptides derived from platelet-derived growth factor (PDGF-BB) as potential wound healing stimulants. One of the compounds (named PDGF2) was subjected for further research after cytotoxicity and proliferation assays on human skin cells. Further investigation included evaluation of: migration and chemotaxis of skin cells, immunological and allergic safety, the transcriptional analyses...
-
Inhibitory endopeptydazy prolinowej pochodzące z białek żywności
PublicationBioaktywne peptydy pochodzące z białek żywności mają nie tylko znaczenie żywieniowe, ale szczególnie profilaktyczne i terapeutyczne w przypadku wielu chorób. Są to małocząsteczkowe fragmenty białek, które po uwolnieniu podczas hydrolizy mogą wykazywać m.in. właściwości przeciwcukrzycowe, przeciwnadciśnieniowe, przeciwdrobnoustrojowe, przeciwutleniające, immunomodulujące...
-
Marek Szkodo dr hab. inż.
People -
Piotr Jabłoński
PeopleJestem naukowcem pracującym w Akademii Górniczo-Hutniczej im. Stanisława Staszica w Krakowie. Swoje badania prowadzę w dyscyplinie inżynieria materiałowa. W zakres moich zainteresowań badawczych wchodzą bioaktywne materiały kompozytowe na bazie biopolimerów oraz nanocząstek metali szlachetnych.
-
A Novel Biological Role for Peptidyl-Arginine Deiminases: Citrullination of Cathelicidin LL-37 Controls the Immunostimulatory Potential of Cell-Free DNA
Publication -
Design, synthesis and in vitro biological evaluation of a small cyclic peptide as inhibitor of vascular endothelial growth factor binding to neuropilin-1
Publication -
Osteoblast and bacterial cell response on RGD peptide‐functionalized chitosan coatings electrophoretically deposited from different suspensions on Ti13Nb13Zr alloy
PublicationMetallic materials for long-term load-bearing implants still do not provide high antimicrobial activity while maintaining strong compatibility with bone cells. This study aimed to modify the surface of Ti13Nb13Zr alloy by electrophoretic deposition of a chitosan coating with a covalently attached Arg-Gly-Asp (RGD) peptide. The suspensions for coating deposition were prepared in two different ways either using hydroxyacetic acid...
-
Naturalne związki organiczne
PublicationNowoczesny podręcznik stanowiący kompendium podstawowych wiadomości o najważniejszych naturalnych związkach organicznych, takich jak: aminokwasy, peptydy, białka, cukry, lipidy, alkaloidy, steroidy, terpeny i terpenoidy. Omówiono w nim właściwości chemiczne i fizyczne, działanie fizjologiczne oraz otrzymywanie i zastosowanie tych związków. Przedstawiono również najnowsze osiągnięcia naukowe dotyczące produktów naturalnych, m.in....
-
Naturalne związki organiczne.
PublicationNowoczesny podręcznik stanowiący kompendium podstawowych wiadomości o najważniejszych naturalnych związkach organicznych, takich jak: aminokwasy, peptydy, białka, cukry, lipidy, alkaloidy, steroidy, terpeny i terpenoidy. Omówono w nim właściwości chemiczne i fizyczne, działanie fizjologiczne oraz otrzymywanie i zastosowanie tych związków. Przedstawiono również najnowszeosiągnięcia naukowe dotyczące produktów naturalnych, m.in....
-
Electrochemical detection of bacterial endotoxin lipopolysaccharide (LPS) on gold electrode modified with DAL-PEG-DK5-PEG-OH - Antimicrobial peptide conjugate
PublicationThis work describes fabrication of gold electrodes modified with peptide conjugate DAL-PEG-DK5-PEG-OH that enables ultra-sensitive detection of lipopolysaccharide (LPS) isolated from the reference strain of Escherichia coli O26:B6. The initial step of the established procedure implies immobilization of the fully protected DAL-PEG-DK5-PEG-OH peptide on the surface of the gold electrode previously modified by cysteamine. Then side...
-
Comparison of peptide cancer signatures identified by mass spectrometry in serum of patients with head and neck, lung and colorectal cancers: Association with tumor progression
Publication -
Probing the binding selected metal ions and biologically active substances to the antimicrobial peptide LL-37 using DSC, ITC measurements and calculations
Publication -
The influence of a synthetic growth hormone‐releasing hormone analogue G11 and opioid peptide biphalin on selected fibroblasts parameters relevant to wound healing
Publication -
Inhibition of inflammatory response in human keratinocytes by magnetic nanoparticles functionalized with PBP10 peptide derived from the PIP2-binding site of human plasma gelsolin
Publication -
The Arctic mutation alters helix length and type in the 11–28 β-amyloid peptide monomer—CD, NMR and MD studies in an SDS micelle
Publication -
The Product of Matrix Metalloproteinase Cleavage of Doxorubicin Conjugate for Anticancer Drug Delivery: Calorimetric, Spectroscopic, and Molecular Dynamics Studies on Peptide–Doxorubicin Binding to DNA
PublicationMatrix metalloproteinases (MMPs) are extracellular matrix degradation factors, promoting cancer progression. Hence, they could provide an enzyme-assisted delivery of doxorubicin (DOX) in cancer treatment. In the current study, the intercalation process of DOX and tetrapeptide-DOX, the product of the MMPs' cleavage of carrier-linked DOX, into dsDNA was investigated using stationary and time-resolved fluorescence spectroscopy, UV-Vis...
-
Peptide dendrimers as antifungal agents and carriers for potential antifungal agent—N3‐(4‐methoxyfumaroyl)‐(S)‐2,3‐ diaminopropanoic acid—synthesis and antimicrobial activity
PublicationA series of peptide dendrimers and their conjugates with antimicrobial agent FMDP (N3‐(4‐methoxyfumaroyl)‐(S)‐2,3‐diamino‐propanoic acid) were synthesized. The obtained compounds were tested for the antibacterial and antifungal activity. All novel dendrimers displayed much better activity against the tested strains than FMDP itself. Moreover, their conjugates with FMDP also exhibited antimicrobial activity. The most promising molecules...
-
Exploiting the S4–S5 Specificity of Human Neutrophil Proteinase 3 to Improve the Potency of Peptidyl Di(chlorophenyl)-phosphonate Ester Inhibitors: A Kinetic and Molecular Modeling Analysis
Publication -
Corrigendum to “Rapid PD-L1 detection in tumors with PET using a highly specific peptide” [Biochemical and Biophysical Research Communications 483/1 (2017) 258–263]
Publication -
Funkcjonalne i Bioaktywne Składniki Żywności 2022
e-Learning CoursesKurs jest uzupełnieniem treści przedmiotu Funkcjonalne i Bioaktywne Składniki Żywności, który realizowany jest w formie wykładów, ćwiczeń laboratoryjnych i seminariów na semestrze letnim 2022 i dedykowany jest dla Studentów II stopnia sem. 1 kierunku Biotechnologia na Wydziale Chemicznym
-
Baktericyna o aktywności gronkowcobójczej wytwarzana przez Staphylococcus xylosus - identyfikacja, oczyszczanie oraz wstępna charakterystyka
PublicationCelem badań prowadzonych w ramach realizacji niniejszej pracy była identyfikacja szczepów bakterii z rodzaju Staphylococcus produkujących substancje o działaniu przeciwbakteryjnym, w tym szczególnie bakteriocyny. W trakcie badań przesiewowych, których przedmiotem było 206 szczepów z kolekcji Katedry Technologii Leków i Biochemii Politechniki Gdaoskiej z gatunków Staphylococcus aureus, Staphylococcus epidermidis oraz Staphylococcus...
-
Właściwości otoczki hydratacyjnej wokół β-warstw o zróżnicowanym składzie aminokwasowym - analiza wyników dynamiki molekularnej
Publicationβ-warstwa to jedna z najczęściej spotykanych struktur drugorzędowych w białkach. Jak dotąd mechanizmy rządzące ustrukturyzowaniem wody w warstwie solwatacyjnej wokół tej struktury są słabo poznane [1]. W celu lepszego zrozumienia zjawiska hydratacji wokół struktur o konformacji β-warstwy przeprowadzono analizę wyników pochodzących z symulacji metodą dynamiki molekularnej β-warstw składających się z 8 równoległych nici o różnym...
-
The immunoregulatory effects of edeine analogues in mice
PublicationZbadano właściwości immunoregulatorowe kilku, otrzymanych na drodze syntezy, uproszczonych analogów peptydowego antybiotyku edeiny w testach in vivo i in vitro z wykorzystaniem modelu mysiego. Jako związek referencyjny zastosowano edeinę B. Otrzymane peptydy wykazywały efekt stymulacyny na proliferację splenocytów z użyciem konkawaliny, podczas gdy zastosowanie mitogenu powodowało hamowanie proliferacji splenocytów. Peptydy hamowały...
-
Application of Alanine Scanning to Determination of Amino Acids Essential for Peptide Adsorption at the Solid/Solution Interface and Binding to the Receptor: Surface-Enhanced Raman/Infrared Spectroscopy versus Bioactivity Assays
Publication -
Multicopy Suppressor Analysis of Strains Lacking Cytoplasmic Peptidyl-Prolyl cis/trans Isomerases Identifies Three New PPIase Activities in Escherichia coli That Includes the DksA Transcription Factor
PublicationConsistent with a role in catalyzing rate-limiting step of protein folding, removal of genes encoding cytoplasmic protein folding catalysts belonging to the family of peptidyl-prolyl cis/trans isomerases (PPIs) in Escherichia coli confers conditional lethality. To address the molecular basis of the essentiality of PPIs, a multicopy suppressor approach revealed that overexpression of genes encoding chaperones (DnaK/J and GroL/S),...
-
Maria Jolanta Milewska prof. dr hab. inż.
PeopleMaria Jolanta Milewska, po ukończeniu Technikum Chemiczno-Mechanicznego w Wąbrzeźnie (specjalizacja: przetwórstwo tworzyw sztucznych) kontynuowała naukę na Wydziale Chemicznym Politechniki Gdańskiej. W 1979 r. zdobywa tytuł mgr inżyniera na kierunku Chemia, o specjalizacji Lekka Synteza Organiczna. Studium Doktoranckie PG ukończyła w 1984 r. W 1983 r została zatrudniona na macierzystym wydziale w Katedrze Chemii Organicznej, początkowo...
-
Materiały stosowane do wytwarzania implantów kości
PublicationMateriały stosowane do wytwarzania implantów kostnych muszą być biokompatybilne, nietoksyczne, bioaktywne oraz wykazywać odpowiednie właściwości mechaniczne, takie jak wytrzymałość na ściskanie, na zginanie oraz sztywność i twardość. Gama stosowanych materiałów jest bardzo szeroka, obejmuje metale, polimery, ceramikę oraz ich kompozyty. Każdy z tych materiałów ma swoje mocne i słabe strony. Praca stanowi przegląd materiałów stosowanych...
-
Structure-activity relationship study of a small cyclic peptide H-c[Lys-Pro-Glu]-Arg-OH: a potent inhibitor of Vascular Endothelial Growth Factor interaction with Neuropilin-1
Publication -
The effect of cabbage juice and it's active components on the protein level and expression of CYP19 in MCF-7 breast cancer cells
PublicationWiadomo, że bioaktywne skladniki kapusty mają chemoprewencyjne działanie w przypadku nowotworów piersi, między innymi ze względu na hamowanie aktywności enzymu aromatazy uczestniczącego w biosyntezie estrogenów. Badania prowadzono przy użyciu komórek raka piersi i stwierdzono, że soki z kapusty, zarówno pochodzącej z uprawy ekologicznej jak i przemysłowej, znacząco hamowały ekspresję genu CYP19 kodującego wspomniany enzym. Sugeruje...
-
Some analytical assays for the determination of bioactivity of exotic fruits
PublicationPrzedmiotem badań były próbki owoców egzotycznych (mango, durian, gruszka adwokacka) zebrane w 2008 roku w Tajlandii i w Izraelu (po etapie liofilizacji). W próbkach oznaczano zawartość:- białek, - tłuszczów,- węglowodanów,- flawonoidów,- tanin- polifenoli stosując zarówno zaawansowane techniki instrumentalne jak i proste testy spektrofotometryczne (FRAP, ABTS, DPPH, CUPRAC). Uzyskana wieloparametrowa baza danych pomiarowych została...
-
Badania bioaktywności modyfikowanego cementu kostnego – przegląd literaturowy
PublicationCelem pracy jest przybliżenie aspektów związanych z modyfikowaniem cementu kostnego w celu nadania mu właściwości bioaktywnych. Przedstawiono obecnie stosowane bioaktywne modyfikacje, które mają charakter profilaktyczny (zapobiegają infekcjom), terapeutyczny (zwalczają bakterie) oraz pobudzający osteointegrację. Ukazano metody oceny modyfikacji bioaktywnych i zreferowano ich procedury, m.in. badania mikroskopowe, starzenie w roztworze...
-
Comparative characterisation of durian, mango and avocado
PublicationCelem przeprowadzonych badan była ocena właściwości odżywczych i bioaktywnych stosunkowo mało znanych egzotycznych owoców duriana i ich porównanie z parametrami charakteryzującymi powszechnie znane owoce mango i gruszki adwokackiej. W badaniach wykorzystano takie techniki jak HPLC, trójwymiarowa fluorescencja (3D-FL), testy oparte na zastosowaniu rodników (ABTS i DPPH) oraz zaawansowane techniki chemometryczne. na podstawie uzyskanych...
-
CYP19 mRNA and protein levels in nontumorogenic breast epithelial cells (MCF10A) treated with active components of cabbage juices
PublicationZbadano wpływ soków z kapusty na poziom ekspresji genu CYP19 w nietumorogennych komórkach nabłonka gruczołu mlekowego MCF10A kodującego enzym aromatazę uczestniczący w biosyntezie estrogenów i w związku z tym wpływający na zagrożenie rakiem piersi. Soki z kapusty oraz bioaktywne związki w nich występujące stosowane w niskich dawkach obniżały poziom ekspresji tego genu, a zatem miały działanie chemoprewencyjne. Wyższe dawki zarowno...
-
Naturalne związki organiczne
PublicationKsiążka zawiera dwanaście rozdziałów merytorycznych, w których omówiono występowanie, właściwości, otrzymywanie i zastosowanie następujących naturalnych organicznych: aminokwasy, peptydy, białka, cukry, lipidy, alkaloidy, steroidy, kwasy nukleinowe, polifenole i flawonoidy, hormony owadzie i roślinne, terpenoidy i izoterpenoidy oraz związki sygnałowe (feromony).
-
The structurally similar TRFH domain of TRF1 and TRF2 dimers shows distinct behaviour towards TIN2
PublicationThe telomere repeat binding-factor 1 and 2 (TRF1 and TRF2) proteins of the shelterin complex bind to duplex telomeric DNA as homodimers, and the homodimerization is mediated by their TRFH (TRF-homology) domains. We performed molecular dynamic (MD) simulations of the dimer forms of TRF1TRFH and TRF2TRFH in the presence/absence of the TIN2TBM (TIN2, TRF-interacting nuclear protein 2, TBM, TRF-binding motif) peptide. The MD results...
-
Lipopeptides - synthesis and their properties
PublicationPrzedstawiono syntezę nowych peptydów zawierających Hyp, Met, Gly podstawionych w miejscu histydyny tripeptydu o sekwencji Gly-His-Lys oraz ich odpowiednie modyfikacje na N- i C-końcach. Syntezę zaprojektowanych analogów prowadzono na fazie stałej z zastosowaniem procedury Fmoc. Po otrzymaniu zaplanowanego łańcucha peptydowego metodą karbodiimidową (z zastosowaniem DIC oraz HOBt), przystąpiono do wprowadzania na N-koniec glicyny...
-
Structure activity relationship for a series of peptidomimetic antimicrobial prodrugs containing glutamine analogues.
PublicationZbadano specyficzność transporterów Dpp i Opp w stosunku do peptydów zawierających FMDP. Przy pomocy modelowania cząsteczkowego zaproponowano najbardziej prawdopodobne struktury konformerów peptydów i skorelowano je z aktywnością przeciwbakteryjną oraz specyficznością transporterów peptydowych.