Search
Filters
total: 1249
-
Catalog
- Publications 648 available results
- Conferences 1 available results
- Publishing Houses 1 available results
- People 28 available results
- Inventions 1 available results
- Research Teams 1 available results
- e-Learning Courses 96 available results
- Events 3 available results
- Open Research Data 470 available results
displaying 1000 best results Help
Search results for: PROLYL ISOMERASE
-
Identification of Substrates of Cytoplasmic Peptidyl-Prolyl Cis/Trans Isomerases and Their Collective Essentiality in Escherichia Coli
PublicationProtein folding often requires molecular chaperones and folding catalysts, such as peptidyl-prolyl cis/trans isomerases (PPIs). The Escherichia coli cytoplasm contains six well-known PPIs, although a requirement of their PPIase activity, the identity of their substrates and relative enzymatic contribution is unknown. Thus, strains lacking all periplasmic and one of the cytoplasmic PPIs were constructed. Measurement of their PPIase...
-
Crystal structures of the DsbG disulfide isomerase reveal an unstable disulfide
PublicationDsb proteins control the formation and rearrangement of disulfide bonds during the folding of secreted and membrane proteins in bacteria. DsbG, a member of this family, has disulfide bond isomerase and chaperone activity. Here, we present two crystal structures of DsbG at 1.7- and 2.0-Angstrom resolution that are meant to represent the reduced and oxidized forms, respectively. The oxidized structure, however, reveals a mixture...
-
Multicopy Suppressor Analysis of Strains Lacking Cytoplasmic Peptidyl-Prolyl cis/trans Isomerases Identifies Three New PPIase Activities in Escherichia coli That Includes the DksA Transcription Factor
PublicationConsistent with a role in catalyzing rate-limiting step of protein folding, removal of genes encoding cytoplasmic protein folding catalysts belonging to the family of peptidyl-prolyl cis/trans isomerases (PPIs) in Escherichia coli confers conditional lethality. To address the molecular basis of the essentiality of PPIs, a multicopy suppressor approach revealed that overexpression of genes encoding chaperones (DnaK/J and GroL/S),...
-
Gracjana Klein-Raina dr hab.
People -
Distant Non-Obvious Mutations Influence the Activity of a Hyperthermophilic Pyrococcus furiosus Phosphoglucose Isomerase
Publication -
Structural analogues of reactive intermediates as inhibitors of glucosamine-6-phosphate synthase and phosphoglucose isomerase
PublicationCentra aktywne izomerazy fosfoglukozowej (PGI) oraz domeny izomerazowej (HPI) syntazy glukozamino-6-fosforanu (GlcN-6-P), wykazują podobieństwo ułożenia przestrzennego kluczowych reszt aminokwasowych, z wyjątkiem reszty Arg272 PGI i reszt Lys603 i Lys485 HPI. Dziesięć pochodnych D-heksitolo-6-P, kwasu 5-fosfoarabonowego i kwasu 6-fosfoglukonowego, strukturalnych analogów cis-enolaminy lub cis-enolanu, przypuszczalnych stanów przejściowych...
-
Electron scattering on C3H6 isomers
PublicationZmierzono całkowity przekrój czynny na rozproszenie elektronów na dwóch izomerach strukturalnych węglowodoru C3H6 dla energii 0.5-370 eV. Wykorzystano spektometr pracujący w oparciu o liniową metodę transmisyjną. Zaobserwowano wyraźny efekt izomeryczny. Uzyskane wyniki porównano z wcześniejszymi danymi eksperymentalnymi oraz obliczeniami.
-
Crystallization and preliminary X-ray analysis of the isomerase domain of glucosamine-6-phosphate synthase from Candida albicans
PublicationSyntaza glukozamino-6-fosforanu (EC 2.6.1.16) katalizuje pierwszy, praktycznie nieodwracalny etap w szlaku biosyntezy heksozoamin, którego produktem końcowym jest UDP-GlcNAc, kluczowy substrat dla tworzenia ściany komórkowej drobnoustrojów. Otrzymano kryształy domeny izomerazowej syntazy GlcN-6-P z Candida albicans, składającej się z reszt 346-712 (42 kDa). Analiza rentgenograficzna kryształu wykazała, że należy on do grupy przestrzennej...
-
Molecular modelling of transition state analogue inhibitors of glucosamine-6-P synthase and glucose-6-P isomerase.
PublicationStruktura kompleksu 2-amino-2-deoksy-D-glucitolo-6-P (ADGP) z centrum aktywnym syntazy GlcN-6-P z E. coli została wykorzystAna jako punkt wyjścia do modelowania molekularnego analogów ADGP. Używając programu GROMOS96 wygenerowano konformacje analogów o najniższych energiach wewnętrznych, które następnie ''dokowano'' w centrum aktywnym enzymu. Dokonano syntezy wybranych związków i określono parametry kinetyczne i termodynamiczne...
-
QSRR Evaluation of the New Anticancer Sulfonamides in View of the cis-trans Isomerism
Publication -
Negatively Charged Xanthine. I. Anions Formed by Canonical Isomers
Publication -
Impact of selected amino acids of HP0377 (Helicobacter pylori thiol oxidoreductase) on its functioning as a CcmG (cytochrome c maturation) protein and Dsb (disulfide bond) isomerase
Publication -
Influence of e-Beam Irradiation on the Physicochemical Properties of Poly(polyol Succinate-co-Butylene Succinate) Ester Elastomers
Publication -
Synthesis, structure and properties of poly(ether-urethane)s synthesized using a tri-functional oxypropylated glycerol as a polyol
PublicationThe main aim of this work was to obtain poly(ether-urethane)s using tri-functional polyoxyalkylene polyol (Rokopol G1000), which introducing the chemical cross-links into the structure of polyurethanes. Poly(ether-urethane)s were prepared using two-step method, called prepolymer method, which involves in the first step the reaction of 4,4'-diphenylmethane diisocyanate (MDI) and tri-functional polypropylene glycol glycerol triether...
-
Unexpected Z/E isomerism of N-methyl-O-phosphothioyl benzohydroxamic acids, their oxyphilic reactivity and inertness to amines
PublicationThiophosphinoylation of N-methyl p-substituted benzohydroxamic acids using disulfanes (method A) or diphenylphosphinothioyl chloride (method B) provides only one conformer of the respective O-phosphothioyl derivative (Xray and NMR analysis). Undergoing the P-transamidoxylation reaction is an evidence of the reversibility of thiophosphinoylation. Only those products containing strong EWG substituents in the aroyl residue or bulky...
-
A spectroscopic study of the cis/trans-isomers of penta-2,4-dienoic acid attached to gold nanoclusters
PublicationIn this theoretical work, we present a spectroscopic analysis of the cis/trans-isomers of a molecular switch, penta-2,4-dienoic acid, attached to gold clusters of different size (1, 2 and 20 gold atoms). We have simulated 4 different spectroscopic techniques: Infrared spectroscopy, normal Raman scattering, absorption spectra and resonance Raman scattering. We discuss how the position and the conformation of the molecule determine...
-
Elevated Levels of Renalase, the β-NAD(P)H Isomerase, Can Be Used as Risk Factors of Major Adverse Cardiovascular Events and All-Cause Death in Patients with Chronic Kidney Disease
Publication -
Corrosion Inhibition Mechanism and Efficiency Differentiation of Dihydroxybenzene Isomers Towards Aluminum Alloy 5754 in Alkaline Media
PublicationThe selection of efficient corrosion inhibitors requires detailed knowledge regarding the interaction mechanism, which depends on the type and amount of functional groups within the inhibitor molecule. The position of functional groups between different isomers is often overlooked, but is no less important, since factors like steric hinderance may significantly affect the adsorption mechanism. In this study, we have presented how...
-
A method for the production of D-tagatose using a recombinant Pichia pastoris strain secreting beta-D-galactosidase from Arthrobacter chlorophenolicus and a recombinant L-arabinose isomerase from Arthrobacter sp. 22c
PublicationD-Tagatose is a natural monosaccharide which can be used as a low-calorie sugar substitute in food, beverages and pharmaceutical products. It is also currently being tested as an anti-diabetic and obesity control drug. D-Tagatose is a rare sugar, but it can be manufactured by the chemical or enzymatic isomerization of D-galactose obtained by a beta-D-galactosidase-catalyzed hydrolysis of milk sugar lactose and the separation of...
-
The biological role of prolyl oligopeptidase and the procognitive potential of its peptidic inhibitors from food proteins
PublicationProlyl oligopeptidase (POP) is a conserved serine protease belonging to proline-specific peptidases. It has both enzymatic and non-enzymatic activity and is involved in numerous biological processes in the human body, playing a role in e.g., cellular growth and differentiation, inflammation, as well as the development of some neurodegenerative and neuropsychiatric disorders. This article describes the physiological and pathological...
-
Quest for the Molecular Basis of Improved Selective Toxicity of All-Trans Isomers of Aromatic Heptaene Macrolide Antifungal Antibiotics
PublicationThree aromatic heptaene macrolide antifungal antibiotics, Candicidin D, Partricin A (Gedamycin) and Partricin B (Vacidin) were subjected to controlled cis-trans to all trans photochemical isomerization. The obtained all-trans isomers demonstrated substantially improved in vitro selective toxicity in the Candida albicans cells: human erythrocytes model. This effect was mainly due to the diminished hemotoxicity. The molecular modeling...
-
The Influence of Substitution of a Phosphorus-Containing Polyol with the Bio-polyol on the Properties of Bio-based PUR/PIR Foams
PublicationIn this work, effects of incorporating of a phosphorus-containing polyol into rigid polyurethane/polyisocyanurate foams’ formulations developed with use of two different bio-based polyols, derived from crude glycerol or liquefied cellulose were examined. The bio-polyol derived from crude glycerol was synthesized via two-step process from crude glycerol and castor oil, whereas the bio-polyol derived from liquefied cellulose was...
-
Serwery pośredniczące (proxy).
PublicationDokonano przeglądu obecnego stanu wiedzy dotyczącego serwerów proxy. Porównano pierwotne i obecne zastosowania serwerów oraz omówiono najpopularniejsze algorytmy buforowania dokumentów ( obiektów internetowych) i protokoły komunikacji wykorzystywane w internetowych implementacjach serwerów proxy. Nakreślono obecne trendy w grupowaniu serwerów proxy w większe struktury organizacyjne oraz dokonano porównania efektywności najpopularniejszych...
-
Separation of nicotinic acid and its structural isomers using 1-ethyl-3-methylimidazolium ionic liquid as a buffer additive by capillary electrophoresis
Publication -
Crystallographic studies of (Z) and (E) isomers of 2-amino-5-(2-chlorobenzylidene)-1-methyl-1H-imidazol-4(5H)-one
Publication -
ProSIL software for computer aided functional Safety management = Program komputerowy ProSIL do wspomagania zarządzaniem bezpieczeństwa funkcjonalnego
Publication..
-
ProSIL Software for functional saferty management in life cycle = Aplikacja ProSIL do zarządzania bezpieczeństwem funkcjonalnym w cyklu życia
PublicationIn the paper the ProSIL software to aid the functional safety management is presented. The software consists of three modules to aid: determination of the required SIL level (ProSILen), veryfication of the SIL level (ProSILver). In the aplication the method of the calibrated risk graph to determine the required safety integrity level SIL for defined safety instrumented functions is applied. The methods concerning functional safety...
-
Mass spectrometry based identification of geometric isomers during metabolic stability study of a new cytotoxic sulfonamide derivatives supported by quantitative structure-retention relationships
PublicationA set of 15 new sulphonamide derivatives, presenting antitumor activity have been subjected to a metabolic stability study. The results showed that besides products of biotransformation, some additional peaks occurred in chromatograms. Tandem mass spectrometry revealed the same mass and fragmentation pathway, suggesting that geometric isomerization occurred. Thus, to support this hypothesis, quantitative structure-retention relationships...
-
New amino acid propyl ester ibuprofenates from synthesis to use in drug delivery systems
Publication -
Influence of bulky pyrrolyl substitent on the physicochemical properties of porphyrazines
Publication -
Rigid polyurethane foams from a polyglycerol-based polyol
PublicationRigid polyurethane foams (rPUs) were synthesized by replacing 35 and 70 wt.% of petrochemical polyol with polyglycerol. Two types of polyglycerol with different molecular weights and hydroxyl numbers were used to obtain new ‘‘green’’ polyurethane–polyglycerol foams. The foams were prepared by a single step method for the ratio of NCO/OH groups equal to 2. rPUs synthesized with polyglycerol showed regular cellular structure, with...
-
Novel liquid chromatography method based on linear weighted regression for the fast determination of isoprostane isomers in plasma samples using sensitive tandem mass spectrometry detection
PublicationA simple, fast, sensitive and accurate methodology based on a LLE followed by liquid chromatography–tandem mass spectrometry for simultaneous determination of four regioisomers (8-iso prostaglandin F2α, 8-iso-15(R)-prostaglandin F2α, 11β-prostaglandin F2α, 15(R)-prostaglandin F2α) in routine analysis of human plasma samples was developed. Isoprostanes are stable products of arachidonic acid peroxidation and are regarded as the...
-
Recovery of bis(1-chloro-2-propyl) ether from aqueous solution onto activated carbon
Publication -
The stability of a damaged roll-on roll-off vessel with water on deck
PublicationPrzeprowadzono analizę stateczności statku ro-ro w stanie awaryjnym z wodą na pokładzie. Pokazano, że moment przechylający związany jest z wypiętrzeniem wody na pokładzie ponad poziom wody zaburtowej, pochodzącym od fali. Omówiono trzy metody wyznaczania kąta przechyłu, wywołanego wodą na pokładzie. Zidentyfikowano krytyczne wypiętrzenie wody, przy którym następuje utrata stateczności statku.
-
A modified static equivalency method for roll-on/roll-off vessels
PublicationPrzedstawiono zmodyfikowaną metodę statycznej równoważności dla statków ro-ro, opartą na wypiętrzaniu się wody na pokładzie samochodowym w wypadku wystąpienia otworu w burcie, do oceny bezpieczeństwa statku.
-
Knowledge-based functional safety management using ProSIL software
PublicationIn the article the ProSIL software for computer aided functional safety management is presented. The software consists of three modules for the determination of the required SIL level (ProSILen) and verification of the SIL level (ProSILver). In the ProSIL the calibrated knowledge-based risk graph method for determining the required safety integrity level (SIL) of the safety functions identified in hazard analysis is implemented....
-
Evaluation of the glycerolysis process and valorisation of recovered polyol in polyurethane synthesis
PublicationIn this study, the glycerolysis of polyurethane (PU) foam and the applicability of obtained glycerolysate (GLY) for cast PUs were investigated. It was found that crude glycerine with purity grade of 84% might be successfully used for the glycerolysis. The optimal conditions were determined as follows: reaction time of 60 min at 220 °C using dibutyltin dilaurate catalyst (0.5%). Moreover, the purification of GLY by means of liquid-liquid...
-
Elektryczne promy morskie na przykładzie Norwegii
PublicationNorwegia jest światowym liderem wdrażania rozwiązań z zakresu e-mobilności (elektromobilności). W 2018 roku odbyła się ekspedy-cja naukowa projektu ELMAR w norweskich fiordach, podczas której zwizytowano wybrane promy pasażerskie oraz pasażersko-samochodowe. Zebrane przez autorów doświadczenia zostały przedstawione w artykule.
-
Poll Reader - the working prototype of optical mark recognition software
PublicationAutomatyczne rozpoznawanie zaznaczeń wydaje się stosunkowo prostym zadaniem z dziedziny przetwarzania dokumentów, a komercyjne systemy OMR są dostępne na rynku już od dłuższego czasu. Zdecydowaliśmy się jednak na stworzenie prostego darmowego oprogramowania, które mogłoby być wykorzystywane przez uczelnie zobowiązane do przeprowadzania ankiet wśród studentów. W rozdziale opisano konstrukcję programu oraz najważniejsze algorytmy...
-
Interactions between amphotericin B 3-(N',N'-dimethylamino)propyl amide and cellular membrane components in Langmuir monolayers
PublicationPublikacja zawiera charakterystykę monowarstw Langmuir'a tworzonych przez pochodną amfoterycyny B tj.amid 3-(N',N'-dimetyloamino)propylowy (AMA) oraz wyniki badań nad jej oddziaływaniem z cholesterolem, ergosterolem i fosfolipidami. Znaleziono, iż stan jonowy cząsteczki pochodnej AMA, a także jej wielkość mają znaczący wpływ na właściwości biologiczne związku.
-
Serwer Diameter w architekturze Proxy Mobile IPv6
PublicationW pracy przedstawiono mechanizmy współpracy serwera Diameter z systemem Proxy Mobile IPv6. Opisany został sposób integracji obu rozwiązań na potrzeby obsługi mobilności terminali ruchomych w sieci IPv6. W ramach realizowanych badań wykonano implementację opisanego systemu. Dla przygotowanej implementacji przeprowadzono szereg testów wydajnościowych uwzględniających parametry jakości QoS oraz QoE.
-
Innovation by proxy – clusters as ecosystems facilitating open innovation
PublicationOpen innovation is a concept, whose attributes can be perceived as naturally complementing the proximity-based offer of clusters. The purpose of this paper is to investigate the potential role of clusters as intermediaries of open innovation for cluster members. A literature review and an exploratory study were performed, involving in-depth interviews with experts in the field of innovation and clusters in Poland. This article...
-
Zbigniew Kaźmierczyk dr hab.
PeopleProf. Zbigniew Kaźmierczyk, PhD in Literature, associate professor in the Department of History of Literature at the Institute of Polish Language and Literature at the University of Gdańsk. He has displayed the Gnostic – Manichaean dimension of existence in Miłosz’s writings ('The Work of Demiurge', 2011) by applying the language of access to apocrypha of the religion of gnosis. He has gathered linguistic, historic, religious,...
-
X-ray and NMR structural studies of the series of porphyrazines with peripheral pyrrolyl groups
Publication -
Synthesis and characterization of periphery-functionalized porphyrazines containing mixed pyrrolyl and pyridylmethylamino groups
Publication -
METODA ANALIZY NIEZAWODNOŚCI CZŁOWIEKA SPAR-H W APLIKACJI ProSIL-EAL
PublicationW referacie przedstawiono zagadnienie wyznaczania prawdopodobieństwa błędu człowieka HEP za pomocą metody SPAR-H w oprogramowaniu ProSIL-EAL. Oprogramowanie wspomaga proces zarządzania bezpieczeństwem funkcjonalnym w cyklu życia systemów technicznych. Prawdopodobieństwo błędu człowieka jest zagadnieniem związanym z etapem weryfikacji określonych poziomów nienaruszalności bezpieczeństwa SIL dla funkcji bezpieczeństwa. ProSIL-EAL...
-
On ship roll resonance frequency
PublicationThe paper deals with the problem of modeling of rolling motion under a variety of excitation parameters. Special emphasis is put on the analysis and prediction of the frequency of the resonant mode of rolling, since it is often an essential issue in terms of motion of a ship related to her safety against capsizing or excessive amplitudes of roll. The research is performed for both free rolling and excited rolling and it is based...
-
Ship roll damping moments
PublicationWprowadzono nieliniową formę współczynnika tłumienia kołysań bocznych statku oraz jego ekwiwalentną liniową formę. Zastępczy liniowy współczynnik tłumienia może być określony na podstawie kołysań. Przedstawiono przykładowe wyniki nieliniowego współczynnika tłumienia dla promu pasażerskiego "Polonia".
-
High-performance liquid chromatography of di- and trisubstituted aromatic positional isomers on 1,3-alternate 25,27-dipropoxy-26,28-bis-[3-propyloxy]-calix[4]arene-bonded silica gel stationary phase.
PublicationOtrzymano nową fazę stacjonarną na bazie dipropyloksy pochodnej kaliks[4]arenu w konformacji 1,3-naprzemianległej chemicznie związaną z żelem krzemionkowym. Przeprowadzono badanie selektywności i sprawności tej fazy w rozdzielaniu izomerów konstytucyjnych benzenu. Zaprezentowano wyniki badania wpływu warunków chromatograficznych (pH fazy ruchomej, temperatura, stężenie modyfikatora organicznego) na zdolność rodzielczą tej nowej...
-
The influence of a cone-in-cone insert on flow pattern and wall pressure in a full-scale silo
PublicationArtykuł opisuje przeprowadzone badania przepływów silosowych i naporu materiałów sypkich podczas napełniania i opróżniania silosu o średnicy 2.5 m wyposażonego we wkładkę "stożek w stożku''. Badania przeprowadzane były w Instytucie Badawczym Tel-Tek w Norwegii. Materiałem użytym był suchy piasek. Napór na ścianę mierzony był bezpośrednio za pomocą 10 czujników wbudowanych w ścianę. Badania eksperymentalne pokazały duży wpływ wkładki...