Filtry
wszystkich: 289
wybranych: 252
-
Katalog
Filtry wybranego katalogu
Wyniki wyszukiwania dla: PEPTYDY PENETRUJĄCE
-
Relative quantification of pork and beef in meat products using global and species-specific peptide markers for the authentication of meat composition
PublikacjaWe used global and species-specific peptide markers for a relative quantitative determination of pork and beef in raw and processed meat products made of the two meat species. Four groups of products were prepared (i.e., minced raw meats, sausages, raw and fried burgers) in order to represent products with different extents of food processing. In each group, the products varied in the pork/beef proportions. All products were analysed...
-
Antimicrobial Activity of Chimera Peptides Composed of Human Neutrophil Peptide 1 (HNP-1) Truncated Analogues and Bovine Lactoferrampin
PublikacjaThree chimera peptides composed of bovine lactoferrampin and the analogue of truncated human neutrophil peptide 1 were synthesized by the solid-phase method. In two compounds peptide chains were connected via isopeptide bond, whereas in the third one disulfide bridge served as a linker. All three chimeras displayed significantly higher antimicrobial activity than the constituent peptides as well as their equimolar mixtures. The...
-
Peptide bond modification. I. Simple and efficient method of Boc-Gly[CH(OH)CH2]Gly-OH synthesis.
PublikacjaZaprezentowano prostą i efektywną metodę syntezy obu enancjomerów t-butoksykarbonylo chronionego pseudo dipeptydu (R) oraz (S)-Boc-Gly[CH(OH)CH2]Gly-OH.
-
Design, synthesis and in vitro biological evaluation of a small cyclic peptide as inhibitor of vascular endothelial growth factor binding to neuropilin-1
Publikacja -
A Novel Biological Role for Peptidyl-Arginine Deiminases: Citrullination of Cathelicidin LL-37 Controls the Immunostimulatory Potential of Cell-Free DNA
Publikacja -
Osteoblast and bacterial cell response on RGD peptide‐functionalized chitosan coatings electrophoretically deposited from different suspensions on Ti13Nb13Zr alloy
PublikacjaMetallic materials for long-term load-bearing implants still do not provide high antimicrobial activity while maintaining strong compatibility with bone cells. This study aimed to modify the surface of Ti13Nb13Zr alloy by electrophoretic deposition of a chitosan coating with a covalently attached Arg-Gly-Asp (RGD) peptide. The suspensions for coating deposition were prepared in two different ways either using hydroxyacetic acid...
-
Naturalne związki organiczne
PublikacjaNowoczesny podręcznik stanowiący kompendium podstawowych wiadomości o najważniejszych naturalnych związkach organicznych, takich jak: aminokwasy, peptydy, białka, cukry, lipidy, alkaloidy, steroidy, terpeny i terpenoidy. Omówiono w nim właściwości chemiczne i fizyczne, działanie fizjologiczne oraz otrzymywanie i zastosowanie tych związków. Przedstawiono również najnowsze osiągnięcia naukowe dotyczące produktów naturalnych, m.in....
-
Naturalne związki organiczne.
PublikacjaNowoczesny podręcznik stanowiący kompendium podstawowych wiadomości o najważniejszych naturalnych związkach organicznych, takich jak: aminokwasy, peptydy, białka, cukry, lipidy, alkaloidy, steroidy, terpeny i terpenoidy. Omówono w nim właściwości chemiczne i fizyczne, działanie fizjologiczne oraz otrzymywanie i zastosowanie tych związków. Przedstawiono również najnowszeosiągnięcia naukowe dotyczące produktów naturalnych, m.in....
-
Surface cracking of laser melted Ti-6Al-4V alloy
PublikacjaOpisano charakterystyczne cechy pękania powierzchniowego obserwowanego po nadtapianiu laserem CO2 i Nd:YAG stopu Ti-6Al-4V. Obserwowano pęknięcia niezależnie od sposobu nadtapiania, penetrujące głęboko strefę przetopioną i w niewielkim stopniu zależne od sposobu nadtapiania. Przypisano obserwowane zjawisko przemianie martenzytycznej i (lub) naprężeniom cieplnym powstającym podczas gwałtownego chłodzenia.
-
Probing the binding selected metal ions and biologically active substances to the antimicrobial peptide LL-37 using DSC, ITC measurements and calculations
Publikacja -
The influence of a synthetic growth hormone‐releasing hormone analogue G11 and opioid peptide biphalin on selected fibroblasts parameters relevant to wound healing
Publikacja -
Comparison of peptide cancer signatures identified by mass spectrometry in serum of patients with head and neck, lung and colorectal cancers: Association with tumor progression
Publikacja -
Electrochemical detection of bacterial endotoxin lipopolysaccharide (LPS) on gold electrode modified with DAL-PEG-DK5-PEG-OH - Antimicrobial peptide conjugate
PublikacjaThis work describes fabrication of gold electrodes modified with peptide conjugate DAL-PEG-DK5-PEG-OH that enables ultra-sensitive detection of lipopolysaccharide (LPS) isolated from the reference strain of Escherichia coli O26:B6. The initial step of the established procedure implies immobilization of the fully protected DAL-PEG-DK5-PEG-OH peptide on the surface of the gold electrode previously modified by cysteamine. Then side...
-
The Arctic mutation alters helix length and type in the 11–28 β-amyloid peptide monomer—CD, NMR and MD studies in an SDS micelle
Publikacja -
Inhibition of inflammatory response in human keratinocytes by magnetic nanoparticles functionalized with PBP10 peptide derived from the PIP2-binding site of human plasma gelsolin
Publikacja -
Peptide dendrimers as antifungal agents and carriers for potential antifungal agent—N3‐(4‐methoxyfumaroyl)‐(S)‐2,3‐ diaminopropanoic acid—synthesis and antimicrobial activity
PublikacjaA series of peptide dendrimers and their conjugates with antimicrobial agent FMDP (N3‐(4‐methoxyfumaroyl)‐(S)‐2,3‐diamino‐propanoic acid) were synthesized. The obtained compounds were tested for the antibacterial and antifungal activity. All novel dendrimers displayed much better activity against the tested strains than FMDP itself. Moreover, their conjugates with FMDP also exhibited antimicrobial activity. The most promising molecules...
-
The Product of Matrix Metalloproteinase Cleavage of Doxorubicin Conjugate for Anticancer Drug Delivery: Calorimetric, Spectroscopic, and Molecular Dynamics Studies on Peptide–Doxorubicin Binding to DNA
PublikacjaMatrix metalloproteinases (MMPs) are extracellular matrix degradation factors, promoting cancer progression. Hence, they could provide an enzyme-assisted delivery of doxorubicin (DOX) in cancer treatment. In the current study, the intercalation process of DOX and tetrapeptide-DOX, the product of the MMPs' cleavage of carrier-linked DOX, into dsDNA was investigated using stationary and time-resolved fluorescence spectroscopy, UV-Vis...
-
Simulation of damage process of containership's side structure due to collision with a rock
PublikacjaW artykule przedstawiono wyniki uproszczonego modelowania numerycznego procesu kolizji burty kontenerowca ze skałą. Analiza wyników modelowania pozwala wyciągnąć wnioski o charakterze zjawiska jak również określić obszar i głębokość uszkodzenia wywołanego przez penetrującą skałę w celu doboru wymiarów geometrii i wypełniacza dla drugiej bariery ochronnej.
-
Corrigendum to “Rapid PD-L1 detection in tumors with PET using a highly specific peptide” [Biochemical and Biophysical Research Communications 483/1 (2017) 258–263]
Publikacja -
Exploiting the S4–S5 Specificity of Human Neutrophil Proteinase 3 to Improve the Potency of Peptidyl Di(chlorophenyl)-phosphonate Ester Inhibitors: A Kinetic and Molecular Modeling Analysis
Publikacja -
Baktericyna o aktywności gronkowcobójczej wytwarzana przez Staphylococcus xylosus - identyfikacja, oczyszczanie oraz wstępna charakterystyka
PublikacjaCelem badań prowadzonych w ramach realizacji niniejszej pracy była identyfikacja szczepów bakterii z rodzaju Staphylococcus produkujących substancje o działaniu przeciwbakteryjnym, w tym szczególnie bakteriocyny. W trakcie badań przesiewowych, których przedmiotem było 206 szczepów z kolekcji Katedry Technologii Leków i Biochemii Politechniki Gdaoskiej z gatunków Staphylococcus aureus, Staphylococcus epidermidis oraz Staphylococcus...
-
Właściwości otoczki hydratacyjnej wokół β-warstw o zróżnicowanym składzie aminokwasowym - analiza wyników dynamiki molekularnej
Publikacjaβ-warstwa to jedna z najczęściej spotykanych struktur drugorzędowych w białkach. Jak dotąd mechanizmy rządzące ustrukturyzowaniem wody w warstwie solwatacyjnej wokół tej struktury są słabo poznane [1]. W celu lepszego zrozumienia zjawiska hydratacji wokół struktur o konformacji β-warstwy przeprowadzono analizę wyników pochodzących z symulacji metodą dynamiki molekularnej β-warstw składających się z 8 równoległych nici o różnym...
-
The immunoregulatory effects of edeine analogues in mice
PublikacjaZbadano właściwości immunoregulatorowe kilku, otrzymanych na drodze syntezy, uproszczonych analogów peptydowego antybiotyku edeiny w testach in vivo i in vitro z wykorzystaniem modelu mysiego. Jako związek referencyjny zastosowano edeinę B. Otrzymane peptydy wykazywały efekt stymulacyny na proliferację splenocytów z użyciem konkawaliny, podczas gdy zastosowanie mitogenu powodowało hamowanie proliferacji splenocytów. Peptydy hamowały...
-
Application of Alanine Scanning to Determination of Amino Acids Essential for Peptide Adsorption at the Solid/Solution Interface and Binding to the Receptor: Surface-Enhanced Raman/Infrared Spectroscopy versus Bioactivity Assays
Publikacja -
Multicopy Suppressor Analysis of Strains Lacking Cytoplasmic Peptidyl-Prolyl cis/trans Isomerases Identifies Three New PPIase Activities in Escherichia coli That Includes the DksA Transcription Factor
PublikacjaConsistent with a role in catalyzing rate-limiting step of protein folding, removal of genes encoding cytoplasmic protein folding catalysts belonging to the family of peptidyl-prolyl cis/trans isomerases (PPIs) in Escherichia coli confers conditional lethality. To address the molecular basis of the essentiality of PPIs, a multicopy suppressor approach revealed that overexpression of genes encoding chaperones (DnaK/J and GroL/S),...
-
Structure-activity relationship study of a small cyclic peptide H-c[Lys-Pro-Glu]-Arg-OH: a potent inhibitor of Vascular Endothelial Growth Factor interaction with Neuropilin-1
Publikacja -
Electrochromic foil-based devices: optical transmittance and modulation range, effect of ultraviolet irradiation,and quality assessment by 1/f current noise
PublikacjaPrzedstawiono technologię wytwarzania elementów wykazujących zjawisko elektrochromizmu - zmiany transmitancji optycznej pod wpływem gromadzenia ładunku. Pokazano, że zastosowanie warstwy odbijającej może poprawić stopień zmian transmitancji optycznej. Ponadto, pokazano, że zjawiska losowe generujące szum typu 1/f w tych elementach może być wykorzystane do oceny ich jakości.
-
Naturalne związki organiczne
PublikacjaKsiążka zawiera dwanaście rozdziałów merytorycznych, w których omówiono występowanie, właściwości, otrzymywanie i zastosowanie następujących naturalnych organicznych: aminokwasy, peptydy, białka, cukry, lipidy, alkaloidy, steroidy, kwasy nukleinowe, polifenole i flawonoidy, hormony owadzie i roślinne, terpenoidy i izoterpenoidy oraz związki sygnałowe (feromony).
-
The structurally similar TRFH domain of TRF1 and TRF2 dimers shows distinct behaviour towards TIN2
PublikacjaThe telomere repeat binding-factor 1 and 2 (TRF1 and TRF2) proteins of the shelterin complex bind to duplex telomeric DNA as homodimers, and the homodimerization is mediated by their TRFH (TRF-homology) domains. We performed molecular dynamic (MD) simulations of the dimer forms of TRF1TRFH and TRF2TRFH in the presence/absence of the TIN2TBM (TIN2, TRF-interacting nuclear protein 2, TBM, TRF-binding motif) peptide. The MD results...
-
Tire/road noise - generation, measurement, and abatement
PublikacjaPodano określenia i definicje dotyczące hałasu opon samochodowych. Omówiono mechanizmy generowania tego hałasu oraz zasady modelowania. Przedstawiono metody pomiaru hałasu opon oraz stosowane systemy pomiarowe. Podano normy dotyczące hałasu opon. Omówiono wpływ opony i nawierzchni na hałas generowany przez toczące się koło ogumione. Zaprezentowano koła kompozytowe oraz opony z bieżnikiem poroelastycznym generujące niski poziom...
-
Lipopeptides - synthesis and their properties
PublikacjaPrzedstawiono syntezę nowych peptydów zawierających Hyp, Met, Gly podstawionych w miejscu histydyny tripeptydu o sekwencji Gly-His-Lys oraz ich odpowiednie modyfikacje na N- i C-końcach. Syntezę zaprojektowanych analogów prowadzono na fazie stałej z zastosowaniem procedury Fmoc. Po otrzymaniu zaplanowanego łańcucha peptydowego metodą karbodiimidową (z zastosowaniem DIC oraz HOBt), przystąpiono do wprowadzania na N-koniec glicyny...
-
Structure activity relationship for a series of peptidomimetic antimicrobial prodrugs containing glutamine analogues.
PublikacjaZbadano specyficzność transporterów Dpp i Opp w stosunku do peptydów zawierających FMDP. Przy pomocy modelowania cząsteczkowego zaproponowano najbardziej prawdopodobne struktury konformerów peptydów i skorelowano je z aktywnością przeciwbakteryjną oraz specyficznością transporterów peptydowych.
-
Design, Synthesis, and Enzymatic Evaluation of Novel ZnO Quantum Dot-Based Assay for Detection of Proteinase 3 Activity
PublikacjaHerein, the synthesis and application of functionalized quantum dot-based protease probes is described. Such probes are composed of nontoxic ZnO nanocrystals decorated by amino groups followed by linker and labeled peptide attachment. Spherical NH2-terminated ZnO quantum dots (QDs) with the average size ranging from 4 to 8 nm and strong emission centered at 530 nm were prepared using the sol−gel method. The fluorescence of ZnO...
-
Generatory labiryntów: modyfikacje algorytmu komórkowego i analiza właściwości generowanej klasy
PublikacjaWyróżniamy trzy podstawowe algorytmy generujące labirynty, których grafowa reprezentacja ma postać drzew: błądzenia losowego, budowania ścian i komórkowy[1]. W pracy przedstawione zostaną modyfikacje algorytmu komórkowego, które potrafią wygenerować tę samą klasę labiryntów, co podstawowa wersja algorytmu, przy jednoczesnej zmianie parametrów opisujących ich wygląd (preferencja kierunku wyjścia, średnia liczba wyjść z pokoju, średnia...
-
Structural and dynamic properties of water within the solvation layer around various conformations of the glycine-based polypeptide
PublikacjaSeveral conformations of the solvated glycine-based polypeptides were investigated using molecular dynamics simulations. Some properties of water in the neighbouring space around these molecules were investigated. It was found, that water forms a well-defined layer - the first solvation shell - around the peptide molecule, and thickness of this layer is independent of the peptide structure, and it equals to approximately 0.28 nm....
-
Antifungal activity of thionated analogues of nva-fmdp and lys-nva-fmdp
Publikacjaotrzymano dwa peptydy w których wiązanie amidowe łączące aminokwasy zamieniono na tioamidowe w wyniku kilkunastoetapowej syntezy chemicznej. do reakcji tionowania zastosowano odczynnik lawessona. otrzymane związki poddano badaniom aktywności z wykorzystaniem pięciu szczepów candida , w tym szczepów opornych na flukonazol. stwierdzono, ze obecniość wiązania tioamidowego znacznie obniża aktywność przeciwgrzybową testowanych związków...
-
Niebiałkowe związki azotowe
PublikacjaNiebiałkowe związki azotowe powstają w żywności wskutek enzymatycznych prze-mian różnych substratów zawierających w swym składzie azot. Są wśród nichprzede wszystkim aminokwasy, peptydy, nukleotydy, tlenek trimetyloaminy orazaminy i ich pochodne. Wywierają one korzystny lub niepożądany wpływ na smak,zapach i barwę żywności, mogą służyć jako wskaźniki świeżości, lub mogą byćspożywane w nadmiernych ilościach, wywierać działanie...
-
Structural and Dynamic Properties of Water within the Solvation Layer around Various Conformations of the Glycine-based Polypeptide
PublikacjaSeveral conformations of the solvated glycine-based polypeptides were investigated using molecular dynamics simulations. Some properties of water in the neighboring space around these molecules were investigated. It was found that water forms a well-defined layer—the first solvation shell—around the peptide molecule, and thickness of this layer is independent of the peptide structure and is equal to approximately 0.28 nm. Within...
-
Wpływ rodzaju kwasu jako dodatku do eluentu na parametry rozdzielania polifenoli techniką chromatografii cieczowej w odwróconych układach faz (RP-HPLC)
PublikacjaChromatografia cieczowa jest jedną z technik wykorzystywanych w badaniach składu mieszanin, a także do wydzielania czystych składników z mieszanin w postaci frakcji eluatu. Z punktu widzenia współczesnej chemii, farmakologii, a także medycyny, czy biotechnologii, chromatografia pełni ważną rolę, w zakresie analityki jakościowej i ilościowej. Dzięki możliwości otrzymywania naturalnych składników biologicznie czynnych w czystej...
-
Niebiałkowe związki azotowe. Rozdział 8
PublikacjaAzot związków niebiałkowych stanowi od kilku do kilkudziesięciu procent ogólnej ilości azotu w różnych surowcach żywnościowych. Wskutek enzymatycznych i chemicznych przemian w czasie przechowywania i przetwarzania zmienia się udział i skład tych związków. Niebiałkowe związki azotowe uczestniczą w tworzeniu zapachu i smaku produktów żywnościowych, niektóre z nich, np. histamina są szkodliwe dla zdrowia, inne np N-nitrozoaminy lub...
-
Effect of ectoine on hydration spheres of peptides–spectroscopic studies
PublikacjaIn this paper, we use FTIR spectroscopy to characterize the hydration water of ectoine, its interactions with two peptides–diglycine and NAGMA, and the properties of water molecules in the hydration spheres of both peptides changed by the presence of the osmolyte. We found that the interaction of ectoine with the peptide hydration shells had no effect on its own hydration sphere. However, the enhanced hydration layer of the osmolyte...
-
Phage-Directed Synthesis of Photoluminescent Zinc Oxide Nanoparticles under Benign Conditions
PublikacjaBiological systems, especially bacteriophages and peptides, are an attractive green alternative to other known methods of nanoparticle synthesis. In this work, for the first time, bacteriophages were employed to synthesize a specific peptide, capable of producing nanoparticles (NPs). Derivatives of M13 bacteriophage exposing a ZnO-binding peptide (TMGA-LGLKWPV) on either pIII or pVIII phage coat protein were constructed and used...
-
Molecular basis and quantitative assessment of TRF1 and TRF2 protein interactions with TIN2 and Apollo peptides
PublikacjaShelterin is a six-protein complex (TRF1, TRF2, POT1, RAP1, TIN2, and TPP1) that also functions in smaller subsets in regulation and protection of human telomeres. Two closely related proteins, TRF1 and TRF2, make high-affinity contact directly with double-stranded telomeric DNA and serve as a molecular platform. Protein TIN2 binds to TRF1 and TRF2 dimer-forming domains, whereas Apollo makes interaction only with TRF2. To elucidate...
-
Release systems based on self-assembling RADA16-I hydrogels with a signal sequence which improves wound healing processes
PublikacjaSelf-assembling peptides can be used for the regeneration of severely damaged skin. They can act as scaffolds for skin cells and as a reservoir of active compounds, to accelerate scarless wound healing. To overcome repeated administration of peptides which accelerate healing, we report development of three new peptide biomaterials based on the RADA16-I hydrogel functionalized with a sequence (AAPV) cleaved by human neutrophil elastase...
-
Fatty acyl benzamido antibacterials based on inhibition of DnaK-catalyzed protein folding
PublikacjaWe have reported that the hsp70 chaperone DnaK from Escherichia coli might assist protein folding by catalyzing the cis/trans isomerization of secondary amide peptide bonds in unfolded or partially folded proteins. In this study a series of fatty acylated benzamido inhibitors of the cis/trans isomerase activity of DnaK was developed and tested for antibacterial effects in E. coli MC4100 cells. Nα-[Tetradecanoyl-(4-aminomethylbenzoyl)]-l-asparagine...
-
Synthesis of conjugates of muramyl dipeptide and nor-muramyl dipeptide with retro-tuftsin (Arg-Pro-Lys-ThrOMe) as potential immunostimulants.
PublikacjaOpisano syntezę nowych koniugatów muramylodipeptydu i nor-muramylo-dipeptydu z estrem metylowym tuftsyny o odwróconej sekwencji (Arg-Pro-Lys-Thr-OMe)jako potencjalnych immunostymulantów. Synteza tych połączeń została przeprowadzona zgodnie z zasadami chemii peptydów.
-
Projektowanie i analiza rekursywnych cyfrowych oscylatorów sygnałów sinusoidalnych i świergotowych
PublikacjaPrzedmiotem badań w rozprawie są rzeczywiste liniowe filtry cyfrowe rekursywne stacjonarne rzędu drugiego i wyższych, o dwu, trzech i więcej wyjściach - generujące, po pobudzeniu ich warunkami początkowymi, drgania niegasnące sinusoidalne lub przebiegi świergotowe na każdym wyjściu. Informacja o parametrach generowanych sygnałów jest zadawana w postaci warunków początkowych i współczynników struktury filtru. W rozprawie dokonano...
-
Butyrylcholinesterase signal sequence self-aggregates and enhances amyloid fibril formation in vitro
PublikacjaAlzheimer’s disease (AD) pathogenesis has been attributed to extracellular aggregates of amyloid β (Aβ) plaques and neurofibrillary tangles in the human brain. It has been reported that butyrylcholinesterase (BChE) also accumulates in the brain Aβ plaques in AD. We have previously found that the BChE substitution in 5′UTR caused an in-frame N-terminal extension of 41 amino acids of the BChE signal peptide. The resultant variant...
-
Photovoltaic solar cells and modules as the source of electricity in the world and its future in Poland
PublikacjaJedną z metod ograniczenia emisji CO2 na świecie i w Polsce jest zastępowanie paliw kopalnych odnawialnymi źródłami energii. Systemy fotowoltaiczne, generujące energie elektryczną, są uważane za technologię wpisująca się w politykę zrównoważonego rozwoju dzięki znacznemu postępowi technologicznemu w zakresie ich wytwarzania i znacznej redukcji kosztów tych systemów.W artykule naświetlono postęp, jaki dokonał się w tej dziedzinie...
-
Structural properties of hydration shell around various conformations of simple polypeptides
PublikacjaIn this paper we investigate structural properties of water within the solvation shell around the peptide core created by a well-defined conformation of polypeptide chain. The following secondary structures are investigated: linear (straight chain), and three helices PII (polyproline-like), 310, and α. We propose using the two-particle contribution to entropy as a rational measure of the water structural ordering within the solvation...