Filters
total: 4888
filtered: 4084
-
Catalog
Chosen catalog filters
displaying 1000 best results Help
Search results for: MOLECULAR DYNAMICS SIMULATION
-
Molecular features of thymidine analogues governing the activity of human thymidine kinase
Publication -
The FMO analysis of the molecular interaction of fentanyl derivatives with the μ-opioid receptor
Publication -
Molecular self-assembly and optical activity of chiral thionooxalamic acid esters
PublicationZsyntezowano kilka optycznie czynnych estrów dietylowych kwasu bis(tiooksamowego). Związki te, z powodu ich zdolności do tworzenia ze sobą komplementarnych cyklicznych wiązań wodorowych, są potencjalnie użytecznym materiałem budulcowym większych układów supramolekularnych. Odpowiednie układy modelowe otrzymano z optycznie czynnych 1,2-diamin, które poddano acylowaniu chlorooksooctanem etylu, a następnie otrzymane półprodukty tionowano...
-
Ab initio molecular treatment for charge transfer by S3+ ion on hydrogen.
PublicationPoliczono adiabatyczne potencjały oddziaływania między jonem siarki i wodoru. Dokonano obliczeń nieadiabatycznych sprzężeń pomiędzy tymi potencjałami. Obliczenia wykazały, że należy wziąć pod uwagę niezbadany wcześniej poziom energetyczny jonu siarki aby dokładnie wyjaśnić mechanizm przechwytu ładunku.
-
On the possibility of molecular recognition of taste substances studied by Gabor analysis of oscillations
PublicationBadano wpływ substancji odpowiedzialnych za wrażenia smakowe należące do czterech klas smaku (słodki, słony, gorzki i kwaśny) na charakterystyki oscylacyjne w nitrometanowym oscylatorze zawierającym kationowy surfaktant: chlorek benzylodimetylotetradecyloamoniowy. Zapropnowano nowe podejście oparte o transformację Gabora za pomocą której otrzymano widma mocy dla posczególnych układów. Wykazano, że dwuwymiarowa forma tych widm może...
-
Low-Molecular Pyrazine-Based DNA Binders: Physicochemical and Antimicrobial Properties
PublicationPyrazine and its derivatives are a large group of compounds that exhibit broad biological activity, the changes of which can be easily detected by a substituent effect or a change in the functional group. The present studies combined theoretical research with the density functional theory (DFT) approach (B3LYP/6-311+G**) and experimental (potentiometric and spectrophotometric) analysis for a thorough understanding of the structure...
-
Phase I and phase II metabolism simulation of antitumor-active 2-hydroxyacridinone with electrochemistry coupled on-line with mass spectrometry.
PublicationHere, we report the metabolic profile and the results of associated metabolic studies of 2-hydroxyacridinone (2-OH-AC), the reference compound for antitumor-active imidazo- and triazoloacridinones. Electrochemistry coupled with mass spectrometry was applied to simulate the general oxidative metabolism of 2-OH-AC for the first time. The reactivity of 2-OH-AC products to biomolecules was also examined. The usefulness of the electrochemistry...
-
Prediction of Overall In Vitro Microsomal Stability of Drug Candidates Based on Molecular Modeling and Support Vector Machines. Case Study of Novel Arylpiperazines Derivatives
PublicationOther than efficacy of interaction with the molecular target, metabolic stability is the primary factor responsible for the failure or success of a compound in the drug development pipeline. The ideal drug candidate should be stable enough to reach its therapeutic site of action. Despite many recent excellent achievements in the field of computational methods supporting drug metabolism studies, a well-recognized procedure to model...
-
Molecular Characterization of a DNA Polymerase from Thermus thermophilus MAT72 Phage vB_Tt72: A Novel Type-A Family Enzyme with Strong Proofreading Activity
Publication -
Synergic Effect of Selected Ingredients and Calcium Chloride on the Technological, Molecular and Microbial Usefulness of Eggshells and Their Impact on Sensory Properties in a Food Model System
Publication -
A Simulation Model of Construction Projects Executed in Random Conditions with the Overlapping Construction Works
Publication -
Simulation Method for Scheduling Linear Construction Projects Using the Learning– Forgetting Effect
Publication -
Cost minimization of locating construction machinery park with the use of simulation and optimization algorithms
Publication -
Numerical simulation of the quaternary aquifer groundwater flow of the northern Vistula delta plain
PublicationW pracy przedstawiono wyniki obliczeń krążenia wód podziemnych w czwartorzędowym poziomie wodonośnym rejonu Żuław Gdańskich. Czwartorzędowy poziom wodonośny odgrywa najważniejszą rolę w zaopatrzeniu w wodę aglomeracji gdańskiej. W obliczeniach wykorzystano programy Modflow i Modpath zawarte w pakiecie (GMS 3.1). Odtworzono warunki przed uruchomieniem ujecia Lipce wykorzystując obliczenia dla stanu ustalonego krążenia wody w warstwie...
-
Comparison of numerical models of impact force for simulation of earthquake-induced structural pounding
PublicationW artykule przedstawiono porównanie trzech modeli numerycznych służących do symulacji siły zderzenia w czasie kontaktu pomiędzy konstrukcjami budowlanymi podczas trzęsień ziemi. Efektywność każdego z modeli zbadano porównując wyniki analiz numerycznych z wynikami badań eksperymentalnych. Wyniki pracy pokazują, iż nieliniowy model lepkosprężysty najdokładniej symuluje przebieg czasowy siły zderzenia w czasie kontaktu.
-
Half-order analytical modelling of ferromagnetic sheet. Validation with finite elements simulation
Publication -
Simulation Tests of Working Press Loads under Pre-tensioned Body Conditions
Publication -
Simulation and Experiments of High Speed Machining Vibration Monitoring with Variable Spindle Velocity
PublicationArtykuł poświęcony jest nadzorowaniu drgań wirujących narzędzi podczas obróbki szybkościowej na nowoczesnych centrach frezarskich. Przeprowadzono analizę dynamiki procesu skrawania smukłym frezem kulistym. W celu zredukowania drgań zastosowano, z powodzeniem, zmienną prędkość obrotową narzędzia. Badania symulacyjne dotyczące efektywności proponowanej metody zostały potwierdzone wynikami badań eksperymentlanych na frezarce Alcera...
-
Rapid Simulation-Driven Multiobjective Design Optimization of Decomposable Compact Microwave Passives
PublicationIn this paper, a methodology for fast multiobjective optimization of the miniaturized microwave passives has been presented. Our approach is applicable to circuits that can be decomposed into individual cells [e.g., compact microstrip resonant cells (CMRCs)]. The structures are individually modeled using their corresponding equivalent circuits and aligned with their accurate, EM simulated...
-
Simulation of Residence Time Distribution and Mixing in Reactors with Recirculation Using 2D Approach
PublicationIn this paper, we propose a 2D approach in order to create a mathematical model for the determination of the residence time distribution for a flow reactor with recirculation. Apart from characterizing the functional residence time distribution, this model can help improve the operation of the reactor at the design stage. The mathematical model was validated by comparison with experiments carried out in a hydraulic laboratory.
-
Influence of a Radio Frequency on RF Fingerprinting Accuracy Based on Ray Tracing Simulation
PublicationIn this paper the influence of a radio signal frequency on performance of Indoor Positioning System based on fingerprinting has been examined using ray-tracing simulations. It has been simulated how spatial distribution of an RF signal strength change with the signal’s frequency. The results were used to show its’ impact on the behavior of localization algorithms that are employing RSS measurements to determine node’s position...
-
Structure and computationally-efficient simulation-driven design of compact UWB monopole antenna
PublicationIn this letter, a structure of a small ultra-wideband (UWB) monopole antenna, its design optimization procedure as well as experimental validation are presented. According to our approach, antenna compactness is achieved by means of a meander line for current path enlargement as well as the two parameterized slits providing additional degrees of freedom that help to ensure good impedance matching. For the sake of reliability, the...
-
Adsorption chiller in a combined heating and cooling system: simulation and optimization by neural networks
Publication -
Coal-derived conductive pavement for winter de-icing: prototype, modeling, and simulation
Publication -
Modelling and simulation analysis of process alternatives in the cellular manufacturing of axially symmetric parts
PublicationAnalizowano procesy technologiczne (PT) alternatywnego wytwarzania określonego spektrum przedmiotów (PO) w różnych systemach gniazdowych. Rozpatrzono warianty PT z operacjami zintegrowanej obróbki wiórowej kształtującej i obróbki wykańczającej poprzez nagniatanie, oraz wariantów z różnicowaniem operacji, w których obróbka wykańczająca realizowana jest w oddzielnych operacjach szlifowania. Dla potrzeb gniazdowej dekompozycji systemów...
-
Model and simulation tests of a squirrel-cage induction motor with oscillation of air gap
PublicationPrzedstawiono model matematyczny silnika, który pozwala na wprowadzanie ekscentryczności wirnika. Zaprezentowano obliczone widma prądu z wprowadzoną oscylacją wirnika, co z pewnym przybliżeniem odpowiada uszkodzeniu łożyska. Rezultaty symulacji pozwalają na określenie zależności pomiędzy oscylacją szczeliny powietrznej i składowych w widmie prądu.
-
Dynamic simulation as a tool for evaluation of the nitrogen removal capabilities at the "Gdańsk-Wschód" WWTP
PublicationCelem badań było przedstawienie możliwości zastosowania złożonego modelu biokinetycznych ASM2d do symulacji procesu usuwania azotu w oczyszczalni ścieków ''Wschód'' w Gdańsku. Szybkość procesów nitryfikacji i denitryfikacji została wyznaczona w warunkach laboratoryjnych za pomocą tzw. testów zlewkowych. Wyniki tych badań zostały wykorzystane do kalibracji modelu, w trakcie której zmieniano wartości tylko 5 parametrów kinetycznych....
-
Long-term simulation of the activated sludge process at the Hanover-Gümmerwald pilot WWTP
PublicationCelem badań było uzyskanie zweryfikowanego modelu ASM3P, który mógłby być wykorzystany jako narzędzie decyzyjne do wyznaczania maksymalnych przepływów w oczyszczalniach ścieków. Symulacje przeprowadzono w oparciu o wyniki badań obciążeń hydraulicznych w pilotowej oczyszczalni ścieków Hanower-Gummerwald. Wyniki symulacji zostały porównane z wynikami pomiarów on-line w komorach osadu czynnego (N-NH4, N-NO3) oraz w odpływie z osadnika...
-
Compatible DC and small-signal MOSFET models for radio and microwave frequency simulation
PublicationZaprezentowano nowy model stałoprądowy tranzystora MOS i kompatybilny z nim uogólniony nie-quasi-statyczny model małosygnałowy. Model stałoprądowy został eksperymentalnie zweryfikowany dla tranzystorów MOS o długości kanału od 75 nm do kilkunastu mikrometrów, a model małosygnałowy od zera herców do 30 GHz.
-
Detection of defects in PMMA beam using shear waves - numerical simulation and experiment
PublicationTest doświadczalny falami sprężystymi jest częścią systemu diagnostycznego belek. Autorzy badają pole przyspieszeń wywołane przepływem fal ultradźwiękowych i jego modyfikacje wynikające z wprowadzonych uszkodzeń belki. Artykuł porównuje wyniki eksperymentalne z symulacjami numerycznymi MES. The experimental test introduced in the paper is the part of the diagnostic system utilizing the elastic waves. The authors investigate the...
-
Modelling and simulation of vibration surveillance during ball end milling of flexible details
PublicationPraca dotyczy nadzorowania drgań w procesie frezowania szybkościowego przedmiotów podatnych za pomocą doboru optymalnej prędkości obrotowej wrzeciona. W niestacjonarnym układzie drgającym modelowanym dyskretnie wyodrębniono podukład modalny, podukład strukturalny oraz podukład łączący. Dynamikę procesu skrawania opisano we współrzędnych hybrydowych, przez co uzyskano znacznie mniejszy rząd niż w przypadku modelu strukturalnego....
-
Numerical simulation of damage detection in rectangular plate by two-dimensional wavelet transform.
PublicationW pracy przedstawiono metodę lokalizacji pęknięć w płytach przy zastosowaniu transformaty falkowej.
-
Implementation of didactic simulation models in Open Source and SCORM compliant LMS systems.
PublicationModele symulacyjne są cenną pomocą w procesie dydaktycznym. Ich zastosowanie w systemach komputerowego wspomagania nauczania znacząco podnosi ich efektywność oraz pozwala na przeprowadzanie wirtualnych ćwiczeń laboratoryjnych (na przykład podczas nauczania na odległość). Niestety stosowane obecnie systemy LMS (Lerning Management System) nie są zadowalająco przystosowane do obsługi symulacyjnej zawartości dydaktycznej. W artykule...
-
Experiences with computer simulation at two large wastewater treatment plants in northern Poland
PublicationPrzedstawiono wyniki symulacji pracy wielofazowych komór osadu czynnego w stanie ustalonym, uzyskanych za pomocą programu GPS-X. Jako dane wejściowe wykorzystano wyniki oznaczeń konwencjonalnych parametrów wykonywanych w trakcie eksploatacji oczyszczalni ścieków "Dębogórze" w Gdyni i "Wschód" w Gdańsku. Jako parametry kontrolne, służące do porównania wyników pomiarów i obliczeń, wykorzystano stężenie ChZT, azotu amonowego, azotanów...
-
Modelling and simulation of striated muscle and groups of muscles in arm-forearm system 2D
PublicationModel mięśnia szkieletowego poprzecznie prążkowanego został przedstawiony jako szeregowe połączenie aktywnych i pasywnych odcinków reologicznych. Zasymulowane zostały: skurcze pojedyncze, niecałkowity skurcz tężcowy, całkowity skurcz tężcowy. Model zespołu mięśni w układzie ramię-przedramię opisu-je zmianę kąta obrotu przedramienia względem nieruchomego ramienia. Pobudzając zginacze i prostowniki był zasymulowany obrót przedramienia.
-
Computer simulation of current voltage response of elektrocatalytic sensor.Optoelectronic and Electronic Sensors V.
PublicationW pracy przedstawiono wyniki symulacji komputerowej działania czujnika elektrokatalitycznego. Do badań wykorzystano program D. Gossera opierający się na metodzie różnic skończonych.
-
Advanced coating of interior of tanks for rising environmental safety - numerical simulation of grounding
PublicationZwiększanie bezpieczeństwa środowiska naturalnego podczas transportu materiałów ropopochodnych stale stanowi ważny i aktualny problem badawczy. W pracy prezentowane są wyniki badań innowacyjnych powłok ochronnych zmniejszających ryzyko rozlewu olejowego podczas kolizji środków transportu - w szczególności statków. Prace badawcze prowadzone były w ramach programu Eureka E!3614 CORET.
-
Low-fidelity model considerations for simulation-based optimisation of miniaturised wideband antennas
PublicationHere, variable-fidelity electromagnetic (EM)-based design optimisation of miniaturised antennas is discussed. The authors focus on an appropriate selection of discretisation density of the low-fidelity EM model, which results in good performance of the optimisation algorithm in terms of its computational complexity and reliability. Trust-region gradient search with low-fidelity model corrected by means of non-linear frequency scaling...
-
Efficient Multi-Objective Simulation-Driven Antenna Design Using Co-Kriging
PublicationA methodology for fast multi-objective antenna optimization is presented. Our approach is based on response surface approximation (RSA) modeling and variable-fidelity electromagnetic (EM) simulations. In the design process, a computationally cheap RSA surrogate model constructed from sampled coarse-discretization EM antenna simulations is optimized using a multi-objective evolutionary algorithm. The initially determined Pareto...
-
Microscopic traffic simulation models for connected and automated vehicles (CAVs) – state-of-the-art
PublicationResearch on connected and automated vehicles (CAVs) has been gaining substantial momentum in recent years. However, thevast amount of literature sources results in a wide range of applied tools and datasets, assumed methodology to investigate thepotential impacts of future CAVs traffic, and, consequently, differences in the obtained findings. This limits the scope of theircomparability and applicability and calls for a proper standardization...
-
Objective relaxation algorithm for reliable simulation-driven size reduction of antenna structure
PublicationThis letter investigates reliable size reduction of antennas through electromagnetic-driven optimization. It is demonstrated that conventional formulation of the design task by direct footprint miniaturization with imposing constraints on electrical performance parameters may not lead to optimum results. The reason is that—in a typical antenna structure—only a few geometry parameters explicitly determine the antenna footprint,...
-
Application of the Boundary Element Method for the Simulation of Two-dimensional Viscous Incompressible Flow
PublicationThe paper presents the application of an indirect variant of the boundary element method (BEM) to solve the two-dimensional steady flow of a Stokes liquid. In the BEM, a system of differential equations is transformed into integral equations. Thi smakes it possible to limit discretization to the border of the solution. Numerical discretization of the computational domain was performed with linear boundary elements, for which a...
-
Fast EM-Driven Nature-Inspired Optimization of Antenna Input Characteristics Using Response Features and Variable-Resolution Simulation Models
PublicationUtilization of optimization technique is a must in the design of contemporary antenna systems. Often, global search methods are necessary, which are associated with high computational costs when conducted at the level of full-wave electromagnetic (EM) models. In this study, we introduce an innovative method for globally optimizing reflection responses of multi-band antennas. Our approach uses surrogates constructed based on response...
-
Non-linearity of multibody dynamic equations with respect to Lagrange multipliers: application to railway dynamics
PublicationPraca koncentruje się na dynamice układów wieloczłonowych z zamkniętymi łańcuchami członów. Głównym punktem zainteresowania jest modelowanie układów z występującymi nieliniowymi zależnościami opisującymi wpływ siły mnożników Lagrange'a na dynamikę układu (nieliniowe modele siły tarcia.). Aby zbudować model dynamiki układu zawierającego zamknięte łańcuchy członów, wspomniane łańcuchy są "rozcinane" i budowana jest struktura drzewa...
-
Thermodynamics, size, and dynamics of zwitterionic dodecylphosphocholine and anionic sodium dodecyl sulfate mixed micelles
Publication -
Crystal structure, hydrogen bonds, and lattice dynamics in kanemite from first-principles calculations
Publication -
Dynamics of productivity in higher education. Cross-European evidence based on bootstrapped Malmquist indices
PublicationThis study presents patterns of productivity change in a large set of 266 public higher education institutions (HEIs) from 7 European countries across the time period 2001-2005. We adopt consistent bootstrap estimation procedures to obtain confidence intervals for Malmquist indices of HEI productivity and their components. Consequently, we are able to assess statistical significance of the changes in HEIs' productivity, efficiency...
-
Smart modeling support for managing complexities and dynamics of knowledge-based systems - part 2
PublicationPrzedstawiono i poddano analizie najnowsze trendy w zakresie kierunków badań dotyczących inteligentnego wspomagania zarządzania dynamiką i kompleksowością systemów opartych na wiedzy.
-
Influence of Protonation State on the Excited State Dynamics of a Photobiologically Active Ru(II) Dyad
PublicationThe influence of ligand protonation on the photophysics of a ruthenium (Ru) dyad bearing the 2-(1-pyrenyl)-1H-imidazo[4,5-f][1,10]-phenanthroline (ippy) ligand was investigated by time-resolved transient absorption spectroscopy. It was found that changes in the protonation state of the imidazole group led to changes in the electronic configuration of the lowest lying excited state. Formation of the fully deprotonated imidazole...
-
Dynamics analysis of footbridge mode shapes the s8 expressway on the basis of the results of in situ tests
PublicationNon-destructive diagnostics for structure may use dynamic measurements realized during vibrations of a facility induced by dynamic environmental impact, enforced by the use of inductors or impulse impact. Dynamic tests and the analysis were undertaken for a footbridge situated over the expressway S8. The studies in situ allowed for dynamic characteristics to be determined: frequency, shape modes and damping for respective frequency...