Search
Search results for: gen analysis
-
REPORT Verification expertise of Detroit Diesel engines 16V149TI on the vessel ORP GEN. PUŁASKI
PublicationVerification expertise of propulsion engines for generating sets of the ORP GEN. PUŁASKI - type 16V149TI related to a complaint sent by the shipowner to Shiprepair Yard NAUTA S.A.
-
MOST IM. GEN. GROTA-ROWECKIEGO W WARSZAWIE – ANALIZY POMOSTU TECHNIKĄ ,,TREPANACJI”
PublicationW pracy przedstawione są wybrane zagadnienia związane z analizą obliczeniową modernizowanego mostu przez Wisłę im. gen Stefana Grota-Roweckiego w Warszawie. Obiekt jest stalową konstrukcją o schemacie belki ciągłej i całkowitej długości 646 m. Po przebudowie most ma być przeznaczony dla ruchu drogowego i pieszo-rowerowego o parametrach drogi ekspresowej S-8. W programie funkcjonalno–użytkowym założono znaczne poszerzenie obiektu,...
-
MOST IM. GEN. GROTA-ROWECKIEGO W WARSZAWIE – ANALIZY POMOSTU TECHNIKĄ ,,TREPANACJI”
PublicationW pracy przedstawione są wybrane zagadnienia związane z analizą obliczeniową modernizowanego mostu przez Wisłę im. gen Stefana Grota-Roweckiego w Warszawie. Obiekt jest stalową konstrukcją o schemacie belki ciągłej i całkowitej długości 646 m. Po przebudowie most ma być przeznaczony dla ruchu drogowego i pieszo-rowerowego o parametrach drogi ekspresowej S-8. W programie funkcjonalno–użytkowym założono znaczne poszerzenie obiektu,...
-
Ekspertyza techniczna Pomiary dynamiczne południowej nitki mostu przez rz. Wisłę im. Gen. Grota-Roweckiego w Warszawie wykonane przed przebudową obiektu
PublicationPrzedmiotem ekspertyzy było wykonanie badań określających wartości częstotliwości drgań własnych przęseł południowej nitki mostu pod obciążeniem ruchem samochodowym z uwzględnieniem drgań dolnej półki dźwigara.
-
OPINIA DOTYCZĄCA ZASTOSOWANEGO ROZWIĄZANIA PROJEKTOWEGO W STREFIE PRZYSZYNOWEJ W KONTEKŚCIE DEGRADACJI NAWIERZCHNI DROGOWO-TOROWEJ W TRAKCIE JEJ EKSPLOATACJI NA SKRZYŻOWANIU ULIC: AL. GEN. J. HALLERA - DROGA ZIELONA - CZARNY DWÓR W GDAŃSKU
PublicationW wyniku wzrostu ruchu drogowego przejazd przez tory tramwajowe okazał się konstrukcyjnie zbyt słaby. Zidentyfikowany wady i wskazano przyczyny uszkodzeń
-
Quality of Cryptocurrency Mining on Previous Generation NVIDIA GTX GPUs
PublicationCurrently, there is a lot of previous generation NVIDIA GTX graphical processing units (GPUs) available on the market, which were ousted from by next-gen RTX units. Due to this fact, numerous fully-operational devices remain underused, which are available at an affordable price. First, this paper presents an analysis of the cryptocurrency market. Next, in this context, the results of research on the performance of NVIDIA graphics...
-
Glyceraldehyde - 3 - phosphate dehydrogenase gen from Amanita citrina. Ac-cession AJ532582, 2002 GenBank NCBI [on line].**2002 [cytowany 07.01.03]. Dostępny: http://www.ncbi.nml.nih.gov Sekwencja genu kodującego dehydrogenzę aldehydu - 3 - fsfoglicerynowego dla muchomora cytrynowego (Amanita citrina).
PublicationPo raz pierwszy ustalono sekwencję nukleotydową fragmentu genu gpd (dehydro-genazy aldehydu - 3 - fosfoglicerynowego) dla muchomora cytrynowego (Amanitacitrina), pozwoli to na ustalenie sekwencji starterów umożliwiających wykry-wanie grzybów tego gatunku za pomocą techniki PCR.
-
Short-Term Price Reaction to Filing for Bankruptcy and Restructuring Proceedings—The Case of Poland
PublicationThis study aims to check market reaction to filing for bankruptcy and restructuring proceedings and to verify the short-term effect of a price reversal in the Polish market in the years 2004–2019. The research was conducted by dividing the analysed companies according to the procedure (bankruptcy and restructuring) and market (the main market and the NewConnect market). The research methodology used in the study is the event analysis...
-
The immune responses of sheep after DNA immunization with Toxoplasma gondii MAG1 antigen - with and without co-expression of ovine interleukin 6
PublicationW niniejszej pracy porównano odpowiedź immunologiczną owiec, którym podano domięśniowo plazmid DNA zawierający gen kodujący białko macierzy cyst tkankowych (MAG1) Toxoplasma gondii - pojedynczo bądź z DNA plazmidu kodującego owczą interleukinę 6 (IL-6). Dzięki wykorzystaniu plazmidu zawierającego gen mag1 odnotowano podwyższony poziom przeciwciał IgG1 oraz IgG2 w surowicach szczepionych zwierząt.
-
Modulation of immune response to Toxoplasma gondii in sheep by immunization with a DNA vaccine encoding ROP1 antigen as a fusion protein with ovine CD154
PublicationNiniejszy artykuł prezentuje porównanie skuteczności działania w immunizacji owiec dwóch antytoksoplazmozowych szczepionek DNA: kodującej białko ROP1 Toxoplasma gondii oraz kodującej w/w antygen i owczą cząsteczkę CD154 lokalizowaną na powierzchni aktywowanych komórek T. Otrzymane wyniki badań pokazały, iż domięśniowe podanie szczepionki DNA zawierającej gen kodujący ROP1 i CD154 znacząco wzmacnia odpowiedź immunologiczną szczepionych...
-
Isolation and some properties of the thermostable beta-galactosidase of Pyrococcus woesei expressed in Escherichia coli
PublicationOpracowano metodę izolowania oraz zbadano właściwości enzymu otrzymanego ze szczepu Escherichia coli zawierającego gen kodujący termostabilną beta-ga-laktozydazę z Pyrococcus woesei.
-
On the dervative of the Legendre function of the first kind with respect to its degree [Corrigendum]
PublicationSkorygowano błąd matematyczny w pracy: R. Szmytkowski, On the derivative of the Legendre function of the first kind with respect to its degree, J. Phys. A: Math. Gen. Vol. 39(2006) s. 15147-15172 [744014]
-
A freeze-thaw method for desintegration of Escherichia coli cells producing T7 lysozyme used in pBAD expression systems
PublicationPlazmid pLysN zawierający gen kodujący lizozym T7 pod kontrolą promotora lac został skonstruowany w celu ułatwienia dezintegracji komórek po ekspresji rekombinantowych białek w systemach ekspresji indukowanych arabinozą. Użyteczność plazmidu została przetestowana w komórkach Escherichia coli TOP10 i E. coli LMG194, niosących plazmid pBADMHADgeSSB, zawierający gen kodujący białko SSB Deinococcus geothermalis pod kontrolą promotora...
-
Novel thermostable ssDNA-binding proteins from Thermus thermophilus and T. aquaticus-expression and purification
PublicationSklonowano w system ekspresyjny pET-30LIC Escherichia coli gen kodujący białka SSB-podobne Thermus thermophilus i T. aquaticus. Oczyszczono do homogenności białka SSB-podobne, a uzyskane preparaty umożliwiają wykonanie badań strukturalnych w/w białek.
-
4-methyl-1-nitroacridine derivative C-1748 induces apoptosis, mitotic catastrophe or senescence in human colon carcinoma HCT116 cells depending on p53 status
PublicationPrzeprowadzone badania miały na celu określenie zdolności pochodnej 4-metylo-1-nitroakrydyny C-1748 do uruchomienia apoptozy, katastrofy mitotycznej lub procesu starzenia komórek ludzkiego raka okrężnicy HCT116 posiadających dziki gen p53 oraz podlinii nie posiadającej tego genu. Wykazano, że pochodna C-1748 indukuje apoptozę w komórkach obu linii HCT116 w sposób zależny od czasu inkubacji, przy czym komórki HCT116 p53+/+ wykazują...
-
Algorytmy genetyczne i ewolucyjne
PublicationAlgorytmy ewolucyjne istnieją dzięki wieloletnim obserwacją procesów zachodzących wśród żywych organizmów. Korzystają one z nazw i określeń występujących w genetyce np.: gen, chromosom. Algorytmy genetyczne oraz ewolucyjne używa się w procesach optymalizacyjnych w celu poszukiwania ekstremów.
-
Charakterystyka oporności Klebsiella pneumoniae New Delhi na karbapenemy
PublicationBakterie Klebsiella pneumoniae New Delhi, posiadające gen oporności na karbapenemy (blaNDM) zostały po raz pierwszy wyizolowane w 2008 roku w Szwecji od pacjenta wcześniej hospitalizowanego w Indiach. Bakterie te szybko rozprzestrzeniają się po całym świecie, a od 2011 roku występują również w Polsce. Stanowią one wysokie ryzyko epidemiologiczne, ponieważ gen oporności na karbapenemy przekazywany jest pomiędzy bakteriami poprzez...
-
Addendum to ''On the derivative of the Legendre function of the first kind with respect to its degree''
PublicationPraca stanowi uzupełnienie wcześniejszej publikacji autora [J. Phys. A: Math. Gen. 39(2006) 15147-15172]. Przedstawiono w niej nowe wyrażenia dla pochodnej funkcji Legendre'a względem jej indeksu i zastosowano je do konstrukcji dwóch nowych reprezentacji funkcji Legendre'a drugiego rodzaju z całkowitym indeksem.
-
GRA1 protein vaccine confers better immune response compared to codon-optimized GRA1 DNA vaccine
PublicationW publikacji oszacowano immunogenność i właściwości protekcyjne szczepionki anty-Toxoplasma gondii opartej na białku rekombinantowym GRA1 oraz dwóch rodzajach szczepionek DNA (plazmidu zawierającego gen kodujący białko GRA1 dzikiego typu oraz modyfikowanego genu kodującego białko GRA1). Uzyskane wyniki sugerują lepsze właściowści immunoprotekcyjne rekombinantowego białka antygenowego niż szczepionek DNA.
-
Homocitrate synthase gene as a new molecular target in diagnostics of Candida spp. infections
PublicationNew potential molecular target which will be investigated during this research (homocitrate synthase gen) is the innovative target other than ribosomal DNA. This gene encodes enzyme present only in fungi and some Archaea what significantly increases specificity. It also reduces risk of contamination or influence of other factors (reaction with other DNA present in sample derived from bacteria or host cells) what excludes false...
-
Thermostable Pyrococcus woesei beta-D-galactosidase - high level expression, purification and biochemical properties
PublicationGen kodujący termostabilną beta-D-galaktozydazę Pyrococcus woesei zamplifikowano z zastosowaniem techniki PCR i klonowano w komórkach Escherichia coli. Skonstruowany system ekspresji genu pozwolił na uzyskanie znacznej ilości termostabilnego białka w komórkach mezofilnego gospodarza. Enzym oczyszczono z zastosowaniem chromatografii powinowactwa po wcześniejszej denaturacji termicznej białek Escherichia coli i scharakteryzowano...
-
Cloning of the thermostable alpha-amylase gene from Pyrococcus woesei in Escherichia coli.
PublicationGen kodujący alfa-amylazę z Pyrococcus woesei klonowano do plazmidów pET21d(+)lub pYTB2, którymi transformowano komórki Escherichia coli. Otrzymana rekombinantowa alfa amylaza wykazuje maksymalną aktywność przy pH 5.6 w temperaturze 95 stC i przejawia około 24 % początkowej aktywności nawet po 2 godz. inkubacji w 120 stC. Duża termostabilność otrzymanego preparatu świadczy o jego przydatności do enzymatycznego upłynniania skrobi.
-
Identification, cloning, expression, and characterizationof a highly thermostable single-stranded-DNA-binding protein (SSB) from Deinococcus murrayi
PublicationZidentyfikowano i scharakteryzowano białko SSB-podobne, pochodzące z Deinococcus murrayi (DmuSSB). Otrzymany w reakcji PCR fragment zawierający kompletny gen ssb sklonowano w systemie ekspresyjnym Escherichia coli. Gen składa się z 826 nt, kodujących 276 reszt aminokwasowych z wyliczoną teoretycznie masą cząsteczkową monomeru równą 30,14 kDa. DmuSSB zawiera dwie domeny wiążące jednoniciowe DNA OBna monomer I funkcjonuje jako homodimer....
-
C421 allele-specific ABCG2 gene amplification confers resistance to the antitumor triazoloacridone C-1305 in human lung cancer cells
PublicationGen ABCG2 charakteryzuje polimorficzność pozycji C341, która jest związana ze znacznym obniżeniem ekspresji tego genu i zdolności do transportu przez błonę komórkową. W pracy wykazaliśmy, że komórki raka płuc, które nabyły oporności na związek C-1305, zmieniły fenotyp z heterozygotycznego w odniesieniu do genu ABCG2 i wykazują amplifikację jedynie allelu C341 genu oraz zwiększoną zawartość mRNA i zmutowanego białka pompy ABCG2...
-
Unieruchamianie rekombinowanej beta-galaktozydazy w reakcjach katalizowanych transglutaminazą
PublicationTermostabilną beta-galaktozydazę wyizolowaną z Escherichia coli zawierającej gen enzymu z Pyrococcus woesei, sieciowano transgluta-minazą na żelu krzemionkowym. Otrzymany preparat wykazuje w 70 st.C aktywność hydrolizy ONPG wynoszącą 11,573 U/g nośnika. Optymalne pH i temperatura działania enzymu wynosi odpowiednio 5,5 oraz 95 st.C. Preparat unieruchomionego enzymu zachowuje około 70 % początkowej aktywności po 1 godzinie inkubacji...
-
Novel thermostable single-stranded DNA-binding protein (SSB) from Deinococcus geothermalis
PublicationW celu zbadania właściwości biochemicznych białka wiążącego się do jednoniciowego DNA (SSB) pochodzącego z Deinococcus geothermalis (DgeSSB), sklonowano gen ssb otrzymany w reakcji PCR, a następnie uzyskano wydajną biosyntezę białka DgeSSB. Gen składa się z 900 par zasad, kodujących białko złożone z 300 reszt aminokwasowych, o wyliczonej masie molekularnej równej 32.45 kDa. Sekwencja aminokwasowa wykazuje 43, 44% i 75% identyczności...
-
Konstrukcja nowych układów do diagnostyki molekularnej zakażeń o etiologii Candida spp.
PublicationDrożdżaki z rodzaju Candida należą do jednych z najczęściej izolowanych czynników etiologicznych zakażeń krwi. Szybka i bezbłędna identyfikacja gatunkowa pozwala na wdrożenie odpowiedniego leczenia i zwiększa szansę na powodzenie terapii. Celem badań była konstrukcja nowych układów wykorzystujących narzędzia diagnostyki molekularnej do specyficznej identyfikacji gatunkowej i rodzajowej drożdżaków Candida. Poszukiwano również nowych...
-
Construction and purification of his6-Thermus thermophilus MutS protein.
PublicationGen mutS z termofilnej bakterii Thermus thermophilus zamplifikowano przy użyciu PCR, sklonowano i przeprowadzono jego ekspresję w E. coli. Rekombinantowe białko MutS zawierające oligohistydynową domenę na N-końcu oczyszczono w jednoetapowej procedurze przy wykorzystaniu chromatografii powinowactwaNi(2+). Zdolność do rozpoznania niekomplementarności białka his(6)-MutS potwierdzono w eksperymentach ochrony DNA przed trawieniem...
-
Postulates for measures of genuine multipartite correlations
PublicationA lot of research has been done on multipartite correlations. However, it seems strange thatthere is no denition of so called genuine multipartite correlations. In this paper we propose threereasonable postulates which each measure or indicator of genuine multipartite correlations (or gen-uine multipartite entanglement) should satisfy. We also introduce degree of correlations which givespartial characterization of multipartite...
-
A novel genetic approach to provide differentiated levels of service resilience in IP-MPLS/WDM networks
PublicationThis paper introduces a novel class-based method of survivable routing for connection-oriented IP-MPLS/WDM networks, called MLS-GEN-H. The algorithm is designed to provide differentiated levels of service survivability in order to respond to varying requirements of end-users. It divides the complex problem of survivable routing in IP-MPLS/WDM networks into two subproblems, one for each network layer, which enables finding the...
-
The induction of autophagy in human colon wt p53 and p53-null HCT116 cells by 4-methyl-1-nitroacridine derivative C-1748
PublicationPrzeprowadzone badania miały na celu określenie zdolności pochodnej 4-metylo-1-nitroakrydyny C-1748 do uruchomienia autofagii komórek ludzkiego raka okrężnicy HCT116 posiadających dziki gen p53 oraz podlinii nie posiadającej tego genu. Wszystkie eksperymenty przeprowadzone zostały przy stężeniu hamującym proliferację komórek nowotworowych w 90%. Wykazano, że indukowana przez C-1748 autofagia w komórkach raka okrężnicy jest zależna...
-
Metody metagenomiczne w badaniu mikrobiomu jelitowego człowieka
PublicationMikroorganizmy zamieszkujące ciało człowieka to nie tylko komensale i groźne patogeny, ale także organizmy symbiotyczne pełniące kluczową rolę w zachowaniu homeostazy gospodarza. Badania metagenomiczne wykorzystujące techniki sekwen-cjonowania nowej generacji i metody bioinformatyczne pozwalają na dogłębne po-znanie mikrobiomu ludzkiego i poszukiwanie jego związku ze stanem zdrowia czło-wieka. Celem pracy jest omówienie różnych...
-
Cloning, expression, and purification of a recombinant cold-adapted β-galactosidase from antarctic bacterium Pseudoalteromonas sp. 22b
PublicationAntarktyczny szczep, gram-ujemnych bakterii Pseudoalteromonas sp. 22b, wyizolowanych z przewodu pokarmowego kryla z gatunku Thyssanoessa macrura, jest producentem wewnątrzkomórkowej zimnolubnej beta-galaktozydazy. Białko to jest homotetramerem, w którym każda z jednostek monomeru zbudowana jest z 1028 reszt aminokwasowych. Gen kodujący ten enzym został sklonowany i eksprymowany w komórkach E. coli. Następnie z zastosowaniem procedury...
-
Theoretical Investigation of the Electron-Transfer Dynamics and Photodegradation Pathways in a Hydrogen-Evolving Ruthenium-Palladium Photocatalyst
PublicationTime-dependent density functional theory calcula- tions combinedwith the Marcus theory of electron transfer (ET) were app lied on the molecular photocatalys t [(tbbpy) 2 Ru(tpph z)PdC l 2 ] 2 + in order to elucidate thelight-in- duced relaxation pathways populated upon excitation in the longer wavelength range of its absorption spectrum. The computational resultsshow that after the initial excitation, metal (Ru) to ligand (tpphz)chargetransfer...
-
Marek Czachor prof. dr hab.
People -
Creating a Realible Music Discovery and Recomendation System
PublicationThe aim of this paper is to show problems related to creating a reliable music dis-covery system. The SYNAT database that contains audio files is used for the purpose of experiments. The files are divided into 22 classes corresponding to music genres with different cardinality. Of utmost importance for a reliable music recommendation system are the assignment of audio files to their appropriate gen-res and optimum parameterization...
-
Identyfikacja i izolacja genu kodującego zaadaptowaną do zimna β-galaktozydazę Paracoccus sp. = Identification and izolation of the gene encoding cold-active β-galactosidase from paracoccus sp.
PublicationZaprezentowane badania były prowadzone u eehi wyizolowania ze środo¬wiska organizmu psychrofilnego, zdolnego do hydrolizy laktozy w niskiej tempe¬raturze, oraz zidentyfikowania genu kodującego (i-galaktozydazę zaadaptowaną do zimna.Poszukiwan gen został w izolowany z psychrofilnego szczepu autarkicz¬nego Paracoccus sp. 321). Na podstawie sekwencji nukleotydowej genu kodują¬cego fS-galaktozdaze ustalono skład aminokwasów),...
-
Increased susceptibility of PARP-1 KO cells to antitumor triazoloacridone C-1305 is associated with permanent G2 cell cycle arrest.
PublicationTriazoloakrydon C-1305 jest nowym inhibitorem topoizomerazy II wykazującym wysoką aktywność przeciwnowotworową. W tej pracy badaliśmy działanie cytotoksyczne pochodnej C-1305 i jej analogu strukturalnego C-1533 wobec komórek fibroblastów mysich i dwóch mutantów, w których uszkodzono gen PARP-1. Jak wykazaliśmy, komórki z uszkodzonym genem PARP-1 są nadwrażliwe na działanie związku C-1305 w porównaniu z komórkami PARP-1 +/+ podczas...
-
White light thermoplasmonic activated gold nanorod arrays enable the photo-thermal disinfection of medical tools from bacterial contamination
PublicationThe outspread of bacterial pathogens causing severe infections and spreading rapidly, especially among hospitalized patients, is worrying and represents a global public health issue. Current disinfection techniques are becoming insufficient to counteract the spread of these pathogens because they carry multiple antibiotic-resistance genes. For this reason, a constant need exists for new technological solutions that rely on physical...
-
Przyszłość energetyki jądrowej na świecie
PublicationProblemy dostępności paliwa jądrowego i składowania odpadów radioaktywnych skłaniają do przemian w technologii reaktorów jądrowych w kierunku generacji IV. Równolegle obserwuje się rozwój reaktorów małej i średniej mocy. Obie ścieżki wydają się być słuszne i obiecujące. W przypadku małych reaktorów jądrowych, pierwsze instalacje mogą powstać w najbliższych pięciu latach, niektóre z nich mogą zaliczać się do reaktorów IV generacji....
-
A two-plasmid Escherichia coli system for expression of Dr adhesins
PublicationPraca opisuje konstrukcję wydajnego systemu produkcji fimbrii Dr. System składa się z dwóch plazmidów. Plazmid pACYCpBAD-DraC-C-His zawiera pod kontrolą promotora arabinozowego gen draC kodujący białko kanałotwórcze DraC. Plazmid pET-30b-sygDraBE zawiera pod kontrolą promotora T7lac geny draB i draE kodujące odpowiednio białko opiekuńcze DraB oraz adhezynę DraE. Oba plzamidy posiadają różne ori replikacji co pozwala na ich jednoczesne...
-
ArchBGal32cB 441Glu mutein gene analysis dataset
Open Research Data