Filtry
wszystkich: 1170
-
Katalog
- Publikacje 959 wyników po odfiltrowaniu
- Czasopisma 14 wyników po odfiltrowaniu
- Konferencje 1 wyników po odfiltrowaniu
- Wydawnictwa 1 wyników po odfiltrowaniu
- Osoby 50 wyników po odfiltrowaniu
- Wynalazki 12 wyników po odfiltrowaniu
- Projekty 19 wyników po odfiltrowaniu
- Laboratoria 2 wyników po odfiltrowaniu
- Zespoły Badawcze 5 wyników po odfiltrowaniu
- Aparatura Badawcza 1 wyników po odfiltrowaniu
- Kursy Online 36 wyników po odfiltrowaniu
- Wydarzenia 8 wyników po odfiltrowaniu
- Dane Badawcze 62 wyników po odfiltrowaniu
wyświetlamy 1000 najlepszych wyników Pomoc
Wyniki wyszukiwania dla: ROZPOZNAWANIE DNA MORSKIEGO
-
Real-time isothermal DNA amplification monitoring in picoliter volumes using an optical fiber sensor
PublikacjaRolling circle amplification (RCA) of DNA can be considered as a great alternative to the gold standard polymerase chain reaction (PCR), especially during this pandemic period, where rapid, sensitive, and reliable test results for hundreds of thousands of samples are required daily. This work presents the first research to date on direct, real-time and label-free isothermal DNA amplification monitoring using a microcavity in-line...
-
Unraveling the Interplay between DNA and Proteins: A Computational Exploration of Sequence and Structure-Specific Recognition Mechanisms
PublikacjaMy PhD dissertation focused on DNA-protein interactions and the recognition of specific DNA sequences and structures. I discovered that acidic amino acid residues (Asp/Glu) play a crucial role by exhibiting a preference for cytosine. Their contribution to binding affinity depends on nearby cytosines, balancing electrostatic repulsion with specific interactions. Acidic residues act as negative selectors, discouraging non-cytosine...
-
Decisional DNA based intelligent knowledge model for flexible manufacturing system
PublikacjaModeling an effective mechanism for design and control strategies for the implementation of a flexible manufacturing system (FMS) has been a challenge. Consequently, to overcome this issue various techniques have applied in the past but most of these models are effective only for some specific situation or an element of FMS. In this study, the knowledge representation technique of Decisional DNA (DDNA) is applied to FMS to develop...
-
Aplikacja wspomagająca przetwarzanie sekwencji dna: moduł dopasowań
PublikacjaBiologia molekularna jest obecnie bardzo dynamicznie rozwijającą się dziedziną nauki. Wzrost mocy obliczeniowej komputerów pozwala na coraz szybszą i dokładniejszą analizę wielocząsteczkowych biologicznych polimerów. Poniższy artykuł przedstawia jeden z modułów programu AlignGator - modułowego systemu przeznaczonego do analizy DNA. Omawiany moduł pozwala na tworzenie, oraz edycję wielodopasowań. W początkowej części artykułu opisane...
-
Profesor Stanisław Hueckel. Współtwórca polskiej szkoły budownictwa morskiego i geotechniki
PublikacjaW artykule przedstawiono działalność dydaktyczną i naukową Prof. St. Hueckla prowadzoną w Politechnice Gdańskiej i Instytucie Budownictwa Wodnego Polskiej Akademii Nauk w Gdańsku. Działalność ta obejmuje szeroko pojętą geoinżynierię i budownictwo morskie. Ponadto omówiono w artykule działalność wydawniczą w redakcjach czasopism naukowych i organizacyjną w Politechnice Gdańskiej, Akademii Nauk oraz w instytutach i organizacjach...
-
Rewitalizacja Dworca Morskiego w Gdyni : rekomendacje dla kształtowania programu funkcjonalnego
PublikacjaReferat analizujący historię funkcjonowania i przemiany przestrzenne jakim podlegał gdyński Dworzec Morski. Wytyczne dla określenia przyszłych funkcji użytkowych jakie Dworzec Morski ma szansę pełnić w przyszłości w kontekście modernizacji Portu Wschodniego w Gdyni.
-
Dominant Pathways of Adenosyl Radical-Induced DNA Damage Revealed by QM/MM Metadynamics
PublikacjaBrominated nucleobases sensitize double stranded DNA to hydrated electrons, one of the dominant genotoxic species produced in hypoxic cancer cells during radiotherapy. Such radiosensitizers can therefore be administered locally to enhance treatment efficiency within the solid tumor while protecting the neighboring tissue. When a solvated electron attaches to 8-bromoadenosine, a potential sensitizer, the dissociation of bromide...
-
Selected problems of estimation of road and marine transport resources operation fuel consumption = Wybrane problemy oceny eksploatacyjnego zużycia paliwa w środkach transportu drogowego i morskiego
PublikacjaW referacie przedstawiono metody oceny eksploatacyjnego zużycia paliwa w środkach transportu drogowego. Omówiono testy zużycia paliwa prowadzone przez producentów pojazdów oraz zaprezentowano problematykę ich reprezentatywności dla dzisiejszych warunków ruchu. W drugiej części referatu przedstawiono problematykę prognozowania zużycia paliwa statków towarowych ze szczególnym uwypukleniem odmienności opisu warunków eksploatacji środków...
-
Decisional DNA with embedded Relief-F linear regression for knowledge and experience management
PublikacjaOmowiono zastowania Decyzyjnego DNA, regresji liniowej oraz funkcji RELIEF-F w procesach formalnego modelowania i wspomagania zarzadzania wiedza oraz zarzadzania doswiadczeniem.
-
DNA repair is responsible for the presence of oxidatively damaged DNA lesions in urine
Publikacja -
Low-Molecular Pyrazine-Based DNA Binders: Physicochemical and Antimicrobial Properties
PublikacjaPyrazine and its derivatives are a large group of compounds that exhibit broad biological activity, the changes of which can be easily detected by a substituent effect or a change in the functional group. The present studies combined theoretical research with the density functional theory (DFT) approach (B3LYP/6-311+G**) and experimental (potentiometric and spectrophotometric) analysis for a thorough understanding of the structure...
-
Molecular basis for the DNA damage induction and anticancer activity of asymmetrically substituted anthrapyridazone PDZ-7
Publikacjanthrapyridazones, imino analogues of anthraquinone, constitute a family of compounds with remarkable anti-cancer activity. To date, over 20 derivatives were studied, of which most displayed nanomolar cytotoxicity towards broad spectrum of cancer cells, including breast, prostate and leukemic ones. BS-154, the most potent derivative, had IC50 values close to 1 nM, however, it was toxic in animal studies. Here, we characterize another...
-
The Neural Knowledge DNA Based Smart Internet of Things
PublikacjaABSTRACT The Internet of Things (IoT) has gained significant attention from industry as well as academia during the past decade. Smartness, however, remains a substantial challenge for IoT applications. Recent advances in networked sensor technologies, computing, and machine learning have made it possible for building new smart IoT applications. In this paper, we propose a novel approach: the Neural Knowledge DNA based Smart Internet...
-
Decisional DNA based framework for representing Virtual Engineering Objects
PublikacjaIn this paper, we propose a frame-work to represent the Virtual Engineering Objects (VEO) utilizing Set of Knowledge Experience Structure (SOEKS) and Decisional DNA. A VEO will enable the discovery of new knowledge in a manufacturing unit and the generation of new rules that drive reasoning. The proposed VEO framework will not only be knowledge based representation but it will also have its associated experience embedded within...
-
Effects of metallic silver particles on resonance energy transfer between fluorophores bound to DNA.
PublikacjaZbadano wpływ filmów wysepek metalicznego srebra na rezonansowe przekazywanie energii między fluoroforami związanymi z DNA. Donorem i akceptorem były odpowiednio 4´,6 diamidyno-2-fenylindon i jodek propydyny. Zmierzone dla tego układu czasy zaniku i widma fluorescencji pokazują, że sąsiedztwo cząstek srebra dramatycznie zwiększa promień Forstera, a tym samym i przekazywanie energii w znakowanym DNA.
-
How acidic amino acid residues facilitate DNA target site selection
PublikacjaDespite the negative charge of the DNA backbone, acidic residues (Asp/Glu) commonly participate in the base readout, with a strong preference for cytosine. In fact, in the solved DNA/protein structures, cytosine is recognized almost exclusively by Asp/Glu through a direct hydrogen bond, while at the same time, adenine, regardless of its amino group, shows no propensity for Asp/Glu. Here, we analyzed the contribution of Asp/Glu...
-
Two-photon induced fluorescence of Cy5-DNA in buffer solution and on silver island film
PublikacjaOpisano fluorescencję barwnika CY5 połączonego z DNA w roztworze buforowym na wysepkach srebrowych.
-
DNA and its Metaphors
Publikacja -
Principles and applications of Ligation Mediated PCR methods for DNA-based typing of microbial organisms
PublikacjaA significant number of DNA-based techniques has been introduced into the field of microorganisms’ characterization and taxonomy. These genomic fingerprinting methods were developed to detect DNA sequence polymorphisms by using general principles, such as restriction endonuclease analysis, molecular hybridization, and PCR amplification. In recent years, some alternative techniques based on ligation of oligonucleotide adapters before...
-
Metoda diagnostyki cieplno-przepływowej umożliwiająca rozpoznawanie miejsca i stopnia degradacji turbozespołów energetycznych
PublikacjaPrzedyskutowano problem rozpoznawania degradacji urządzeń składowych turbozespołów energetycznych dużej mocy. Scharakteryzowano systemy DCS dużych obiektów energetycznych dostarczające dane eksperymentalne o występowaniu degradacji eksploatacyjnej urządzeń składowych tych obiektów. Zastosowano sieci neuronowe (SSN) o skokowych i ciągłych funkcjach przejścia do zbudowania relacji diagnostycznych opartych o modułowy system diagnostyczny....
-
Rozpoznawanie urządzeń i wykrywanie nieautoryzowanego poboru energii elektrycznej na podstawie pomiaru napięcia
PublikacjaW pracy rozpatrywany jest problem wykrywania nieautoryzowanego poboru energii z sieci elektrycznej przez identyfikację podłączonych urządzeń. Estymacja stanu sieci, rozumianej jako zbiór podpiętych układów, wraz z ustaloną listą urządzeń dopuszczonych, pozwala określić, czy w danej chwili ma miejsce pobór nieautoryzowany. W celu wykrywania urządzeń, proponuje się wykorzystać prostą metodę opartą na analizie wysokoczęstotliwościowego...
-
Rozpoznawanie dynamicznych i statycznych gestów rąk w zastosowaniu do sterowania aplikacjami komputerowymi
PublikacjaW referacie przedstawiono interfejs, metody oraz algorytmy sterowania komputerem za pomocą dynamicznych i statycznych gestów rąk. Komponentami opracowanego rozwiązania są komputer klasy PC wraz z opracowanym interfejsem i oprogramowaniem, kamera internetowa oraz projektor multimedialny. Gesty rozpoznawane są w procesie analizy obrazu wizyjnego pozyskanego z kamery internetowej przymocowanej do projektora oraz analizy obrazu wyświetlanego...
-
AUTOMATYCZNE ROZPOZNAWANIE GATUNKÓW MUZYCZNYCH W APLIKACJI SYNTEZUJĄCEJ NISKIE CZĘSTOTLIWOŚCI W URZĄDZENIACH MOBILNYCH
PublikacjaW pracy został opisany inteligentny algorytm syntezy niskich częstotliwości w urządzeniach mobilnych (Smart VBS). Algorytm Smart VBS rozpoznaje gatunek muzyczny i w zależności od wskazania dobiera optymalne parametry syntezy niskich częstotliwości. Synteza niskich częstotliwości odbywa się z wykorzystaniem metody funkcji nieliniowych (NLD). Modyfikacji podlega wykorzystywana funkcja nieliniowa, liczba oraz poziom wzmocnienia dodawanych...
-
Increased concentration of Taq DNA polymerase as a solution for GC-rich templates from clinical and environmental samples
PublikacjaDNA polymerase is an enzyme which plays crucial role in replication and DNA repair. It found application in PCR (polymerase chain reaction) where catalyses process of in vitro DNA synthesis. To meet the demands posed by mod- ern diagnostic, molecular biology or genetic engineering it is necessary to improve DNA polymerases to obtain new or better features useful in these fields. So far implemented modifications in majority are...
-
Silver nanoparticles induce premutagenic DNA oxidation that can be prevented by phytochemicals from Gentiana asclepiadea
PublikacjaAmong nanomaterials, silver nanoparticles (AgNPs) have the broadest and most commercial applications due to their antibacterial properties, highlighting the need for exploring their potential toxicity and underlying mechanisms of action. Our main aim was to investigate whether AgNPs exert toxicity by inducing oxidative damage to DNA in human kidney HEK 293 cells. In addition, we tested whether this damage could be counteracted...
-
How proteins bind to DNA: target discrimination and dynamic sequence search by the telomeric protein TRF1
PublikacjaTarget search as performed by DNA-binding proteins is a complex process, in which multiple factors contribute to both thermodynamic discrimination of the target sequence from overwhelmingly abundant off-target sites and kinetic acceleration of dynamic sequence interrogation. TRF1, the protein that binds to telomeric tandem repeats, faces an intriguing variant of the search problem where target sites are clustered within short fragments...
-
The influence of the substrate temperature on the preparation of DNA films for studies under vacuum conditions
PublikacjaPrzeanalizowano wpływ temperatury na formowanie warstw DNA. Sprawdzono wpływ stabilizatorów na jakość otrzymanych próbek. Stwierdzono, że optymalnymi warunkami przygotowywania filmów do badań w warunkach próżniowych jest - 10 st. C przy minimalnej zawartości NaOH.
-
Photostability pf Cy3 and Cy5-labeled DNA in the presence of metallic silver particles
PublikacjaZbadano wpływ cząstek metalicznego srebra na fotostabilność oligomerów DNA kowalencyjnie związanych z Cy3 lub Cy5. Zbliżenie fluoroforów do cząstek srebra powodowało zwiększenie intensywności fluorescencji i pojawienie się frakcji emisji bardziej odpornej na wybielanie.
-
DNA adduct formation by C-1748, a potent antitumor 4-methyl-1-nitroacridine of lowered toxicity.
Publikacja4-podstawione 1-nitroakrydyny reprezentują nową grupę pochodnych zsyntetyzowanych na Politechnice Gdańskiej. W porównaniu do macierzystych 1-nitroakrydyn związki te wykazują obniżoną toksyczność i podwyższoną aktywność przeciwnowotworową. Wiodąca pochodna 4-metylo-1-nitroakrydyna o symbolu C-1748 jest obecnie w przygotowaniu do I fazy badań klinicznych w leczeniu raka okrężnicy. Wprowadzenie elektrodonorowej grupy metylowej w...
-
Toward Smart Innovation Engineering: Decisional DNA-Based Conceptual Approach
PublikacjaABSTRACT Knowledge and experience are essential requirements for product innovation. The presented paper proposes a systematic approach for product innovation support using a Smart Knowledge Management System comprising a Set of Experience Knowledge Structure (SOEKS) and Decisional DNA (DDNA). This proposed system is dynamic in nature because it updates itself every time a new decision related to innovation is made. Through this...
-
Aplikacja wspomagająca przetwarzanie sekwencji dna: moduł edycji chromatogramu
PublikacjaModuł edycji chromatogramu jest częścią większej aplikacji, służącej do wspomagania przetwarzania danych pochodzących z sekwencjonowania DNA. Aplikacja skonstruowana jest z odrębnych, samodzielnych programów, które współpracują dwiema drogami - poprzez popularne formaty plików, co umożliwia wprowadzenie do modułów danych opracowanych częściowo w aplikacjach zewnętrznych, oraz poprzez przesyłanie danych pomiędzy modułami, co usprawnia...
-
Decisional-DNA Based Smart Production Performance Analysis Model
Publikacjan order to allocate resources effectively according to the production plan and to reduce disturbances, a framework for smart production performance analysis is proposed in this article. Decisional DNA based knowledge models of engineering objects, processes and factory are developed within the proposed framework. These models are the virtual representation of manufacturing resources, and with help of Internet of Things, are capable...
-
DNA methylation in cancer development, diagnosis and therapy-multiple opportunities for genotoxic agents to act as methylome disruptors or remediators
PublikacjaThe role of DNA methylation and recently discovered hydroxymethylation in the function of the human epigenome is currently one of the hottest topics in the life sciences. Progress in this field of research has been further accelerated by the discovery that alterations in the methylome are not only associated with key functions of cells and organisms, such as development, differentiation and gene expression, but may underlie a number...
-
Total DNA Methylation Changes Reflect Random Oxidative DNA Damage in Gliomas
Publikacja -
Total DNA methylation as a biomarker of DNA damage and tumor malignancy in intracranial meningiomas
Publikacja -
From Individual to Collective: Intelligence Amplification with Bio-Inspired Decisional DNA and its Extensions
PublikacjaIn nature, deoxyribonucleic acid (DNA) contains the genetic instructions used in the development and functioning of all known living organisms. The idea behind our vision is to develop an artificial system, an architecture that would support discovering, adding, storing, improving and sharing information and knowledge among agents and organizations through experience. We propose a novel Knowledge Representation (KR) approach in...
-
Nowoczesne obiekty budownictwa lądowego i budownictwa morskiego XXI wieku w Trójmieście
PublikacjaPrzedstawiono charakterystykę konstrukcyjna i funkcjonalną 17 obiektów budowlanych w Trójmieście. Uwypuklono nowoczesność rozwiązań konstrukcyjnych i technologii wykonawstwa, a poszczególne obiekty przedstawiono na licznych rysunkach. Podano informację o przyznaniu części z wymienionych obiektów nagród ''Budowa Roku'' lub ''Zabytek Zadbany''.
-
Zaopatrzenie w wodę mieszkańców Orłowa Morskiego wraz z Witominem (1930-1960)
PublikacjaW pracy odtworzono trzydziestoletni proces budowy i eksploatacji grupowego wodociągu miejskiego na przedwojennym obszarze administracyjnym Witomina, Małego Kacka, Orłowa, Kolibek i Redłowa. W analizowanym czasokresie ustalono chronologię zdarzeń inwestycyjnych uwarunkowanych lokalnymi czynnikami, parametry techniczne urządzeń w wybudowanych obiektach i przebieg rozbudowy sieci wodociągowej. W efekcie udokumentowano zachodzące przemiany...
-
Projektowanie systemów radiokomunikacyjnych opartych na metodzie OFDMA na potrzeby transportu morskiego
PublikacjaW referacie przedstawiono podstawy projektowania systemów radiokomunikacyjnych do szybkiej transmisji danych, opartych na metodzie OFDMA, na potrzeby morskich systemów transportowych. W pierwszej części scharakteryzowano podstawowe właściwości kanału radiokomunikacyjnego w morskiej strefie przybrzeżnej A1, mające wpływ na proces projektowania interfejsu radiowego OFDMA. Następnie opisano podstawowe charakterystyki systemu oraz...
-
Stan identyfikacji ryzyka i jego ocena w przedsiębiorstwach budownictwa inżynieryjno-morskiego
PublikacjaPrzedstawiono charakterystykę ryzyka w budownictwie inżynieryjno-morskim i omówiono sposoby zarządzania nim. W dalszej części przedstawiono wyniki badań nad metodami oceny i zarządzania ryzykiem w kilku wybranych przedsiębiorstwach. Stwierdzono, iż brakuje profesjonalnego podejścia do zarządzania ryzykiem. Powszechnie stosowaną metodą jest unikanie go lub ubezpieczenie.
-
Wpływ warunków naturalnych na zobrazowanie dna Zatoki Gdańskiej przy użyciu sonaru bocznego
PublikacjaGłównym celem artykułu jest przedstawienie wpływu warunków środowiskowych na dokładność zobrazowania dna morza za pomocą systemów hydroakustycznych. Czynniki naturalne, przede wszystkim falowanie powierzchni morza i niejednorodny rozkład prędkości dźwięku w wodzie, mają wpływ na zmianę toru promieni akustycznych. Choć w obu przypadkach mechanizm zjawisk jest zupełnie odmienny, odgrywają one decydującą rolę w odwzorowaniu dna i...
-
Mitochondrial DNA Part B-Resources
Czasopisma -
Recent Advances in DNA and Gene Sequences
Czasopisma -
Recognition, understanding and aestheticization of freehand drawing flowcharts
PublikacjaIn this paper a concept of FCA, a system for recognizing, understanding and aestheticization of freehand drawing flow charts is described. The system is based on a proposed by the author FlowGram graph grammar describing flow charts drawing. An open format FlowChartML for flow charts description is also proposed. The aestheticization criterion is formulated that allows for automatic beautification of flow charts. First experiments...
-
Diagnostyka zakażeń Candida spp. oparta o amplifikację DNA techniką PCR
PublikacjaZakażenia wywoływane przez oportunistyczne grzyby z rodzaju Candida są poważnym problemem klinicznym. Niezbędne jest poszukiwanie nowych szybkich, czułych i pewnych metod do identyfikacji gatunkowej tych drobnoustrojów. W artykule przedstawiono opisane w literaturze metody diagnostyki molekularnej drożdżaków z rodzaju Candida oparte o amplifikację DNA techniką PCR.
-
Typing of Scopulariopsis and Microascus fungi by Random Amplified Polymorphic DNA (RAPD)
PublikacjaOBJECTIVES Scopulariopsis species and their teleomorphs of the genus Microascus are commonly isolated from soil, decaying plant material and indoor environments. Moreover, certain Scopulariopsis and Microascus species are recognised as opportunistic human pathogens. Although most species can be identified by detailed morphological study, phenotypic characters appear to overlap in several cases and morphology seems to be insufficient...
-
32P-postabeling detection of DNA adducts formed by 4-methyl-1-nitro-9-aminoacridine C-1748
PublikacjaWykazano zdolność do tworzenia przez nową pochodną 1-nitroakrydyny o symbolu C-1748, adduktów z DNA komórek nowotworowych oraz z DNA w systemie bezkomórkowym.
-
Low-energy positron scattering from DNA nucleobases: the effects from permanent dipoles
PublikacjaAb initio quantum calculations for low-energy positron scattering from gas-phase isolated molecular nucleobases which are part of the DNA structure are presented and discussed over the range of 1 eV to 25 eV. The calculations report the integral cross sections (ICSs) and the momentum-transfer cross sections (MTCSs) for Adenine, Guanine, Thymine and Cytosine. The calculations show very clearly the important role of the dominant...
-
A Framework for Enhancing Supplier Selection Process by Using SOEKS and Decisional DNA
PublikacjaAbstract. Supplier selection process is one of the significant stages in supply chain management for industrial manufactured products. It plays an integral role in the success of any manufacturing organization and is an important part starting right from selecting raw material to dispatch of finished products. This paper contributes to enhance the supplier selection process by proposing a multi-criteria decision making framework...
-
Cross sections for electron scattering from selected components of DNA and RNA
PublikacjaWykorzystując metodę atomów niezależnych obliczono różniczkowe i całkowite przekroje czynne na sprężyste rozproszenie elektronów na wybranych drobinach, będących analogami składników DNA i RNA. Przekroje te obliczono w zakresie energii zderzenia od 50eV do 200 eV dla następujących drobin: C4H8O, C4H8O2, C5H10O2 oraz H3PO4. Przy użyciu metody BEB (binary-ecounter Bethe method) dla powyższych związków obliczono również przekroje...