Filtry
wszystkich: 2601
-
Katalog
- Publikacje 2177 wyników po odfiltrowaniu
- Czasopisma 219 wyników po odfiltrowaniu
- Konferencje 3 wyników po odfiltrowaniu
- Osoby 29 wyników po odfiltrowaniu
- Projekty 7 wyników po odfiltrowaniu
- Laboratoria 1 wyników po odfiltrowaniu
- Zespoły Badawcze 1 wyników po odfiltrowaniu
- Kursy Online 34 wyników po odfiltrowaniu
- Wydarzenia 2 wyników po odfiltrowaniu
- Dane Badawcze 128 wyników po odfiltrowaniu
wyświetlamy 1000 najlepszych wyników Pomoc
Wyniki wyszukiwania dla: 2D molecular descriptors
-
Molecular mechanism(s) of regulation(s) of c-MET/HGF signaling in head and neck cancer
Publikacja -
Molecular identification and genotyping of Staphylococci: genus, species, strains, colnes, lineages, and interspecies exchanges
PublikacjaStaphylococci are increasingly recognized as etiological agents of many opportunistic human and animal infections, emphasizing the need for a rapid and accurate identification, even to a genotypical level of these bacteria. In the recent years, there has been a significant progress in typing and phylogenetic study of Staphylococcus species. Here, we describe molecular methods used in taxonomy as well as staphylococci characterization....
-
Molecular picture of hydroxide anion hydration in aqueoussolutions studied by FT-IR ATR spectroscopy
PublikacjaHydratacja anionu hydroksylowego w wodnych roztworach wodorotlenków metali alkalicznych (LiOH, NaOH, KOH) została zbadana metodą spektroskopii oscylacyjnej FT-IR całkowitego wewnętrznego odbicia (ATR). Widma oscylacyjne wody dostarczają cennych informacji na temat stanu strukturalnego cząsteczek wody w sferach hydratacyjnych, wynikających ze sprzężeń oscylatorów w układzie. Wykazano, że drganie normalne rozciągające cząsteczki...
-
Drug affinity to human serum albumin prediction by retention of cetyltrimethylammonium bromide pseudostationary phase in micellar electrokinetic chromatography and chemically advanced template search descriptors
Publikacja -
New PCR test for detection of Candida glabrata based on the molecular target chosen by the RAPD technique
PublikacjaRapid, reliable diagnosis is a necessary condition for the successful treatment of infections. Such diagnostic assays are continually being developed. #e paper presents a method for selecting the molecular target for PCR-based diagnostics based on the comparison of RAPD patterns. A sequence encoding Candida glabrata CBS138 hypothetical protein was selected. The limit of detection for PCR and real-time PCR reactions with DNA extracted...
-
Time-of-flight electron scattering from molecular hydrogen: Benchmark cross sections for excitation of the X1Σ+g→b3Σ+u transition
PublikacjaThe electron impact X1Σ+g to b3Σ+u transition in molecular hydrogen is one of the most important dissociation pathways to forming atomic hydrogen atoms, and is of great importance in modeling astrophysical and industrial plasmas where molecular hydrogen is a substantial constituent. Recently it has been found that the convergent close-coupling (CCC) cross sections of Zammit et al. [Phys. Rev. A 95, 022708 (2017)] are up to a factor...
-
The Product of Matrix Metalloproteinase Cleavage of Doxorubicin Conjugate for Anticancer Drug Delivery: Calorimetric, Spectroscopic, and Molecular Dynamics Studies on Peptide–Doxorubicin Binding to DNA
PublikacjaMatrix metalloproteinases (MMPs) are extracellular matrix degradation factors, promoting cancer progression. Hence, they could provide an enzyme-assisted delivery of doxorubicin (DOX) in cancer treatment. In the current study, the intercalation process of DOX and tetrapeptide-DOX, the product of the MMPs' cleavage of carrier-linked DOX, into dsDNA was investigated using stationary and time-resolved fluorescence spectroscopy, UV-Vis...
-
Comparative study of high‑pressure fluid flow in densely packed granules using a 3D CFD model in a continuous medium and a simplified 2D DEM‑CFD approach. Granular Matter
PublikacjaIzotermiczny ściśliwy jednofazowy przepływ cieczy przez niejednorodną masę ziarnistą składającą się z gęsto upakowanych zachodzących na siebie kul imitujących skałę pod wysokim ciśnieniem zbadano numerycznie przy użyciu dwóch różnych podejść. Pierwsze podejście zwane pełnym modelem 3D CFD stosowało metodę skończonych objętości (FVM) do rozwiązania uśrednionego równania Naviera-Stokesa zakładając model naprężeń Reynoldsa (BSL) w...
-
Furan Fragmentation in the Gas Phase: New Insights from Statistical and Molecular Dynamics Calculations
PublikacjaWe present a complete exploration of the different fragmentation mechanisms of furan (C4H4O) operating at low and high energies. Three different theoretical approaches are combined to determine the structure of all possible reaction intermediates, many of them not described in previous studies, and a large number of pathways involving three types of fundamental elementary mechanisms: isomerization, fragmentation, and H/H2 loss...
-
Novel 2-alkythio-4-chloro-N-[imino(heteroaryl)methyl]benzenesulfonamide Derivatives: Synthesis, Molecular Structure, Anticancer Activity and Metabolic Stability
PublikacjaA series of novel 2-alkythio-4-chloro-N-[imino-(heteroaryl)methyl]benzenesulfonamide derivatives, 8–24, were synthesized in the reaction of the N-(benzenesulfonyl)cyanamide potassium salts 1–7 with the appropriate mercaptoheterocycles. All the synthesized compounds were evaluated for their anticancer activity in HeLa, HCT-116 and MCF-7 cell lines. The most promising compounds, 11–13, molecular hybrids containing benzenesulfonamide...
-
Modeling the photodynamic effect in 2D versus 3D cell culture under normoxic and hypoxic conditions
Publikacja -
Electrochemical performance of MOF-5 derived carbon nanocomposites with 1D, 2D and 3D carbon structures
Publikacja -
An Optimized Ka-Band Low Profile Dual-Polarized Transmitarray Antenna With 2D Beam Switching
PublikacjaThis article presents an optimized dual-polarized transmitarray antenna (TA) designed for MIMO applications at the Ka-band, capable of switching beams in two directions. The antenna aperture uses a small unit cell with three layers of Taconic RF-35 dielectric substrates, which can be easily fabricated using PCB technology. The unit cell achieved a 360-degree phase shift and a transmission magnitude exceeding –0.4 dB at 28 GHz....
-
Stochastic FE-analysis of shear localization in 2D granular material within a micro-polar hypoplascity
PublikacjaW artykule przedstawiono wyniki numerycznej stochastycznej analizy wpływu rozkładu początkowego wskaźnika porowatości w materiałach granulowanych na powstawanie lokalizacji odkształceń. Obliczenia wykonano dla ścinania warstwy piasku stosując metodę elementów skończonych na bazie mikropolarnego prawa hipoplastycznego.
-
Catalytic Mechanism of Non-Target DNA Cleavage in CRISPR-Cas9 Revealed by Ab Initio Molecular Dynamics
PublikacjaCRISPR-Cas9 is a cutting-edge genome editing technology, which uses the endonuclease Cas9 to introduce mutations at desired sites of the genome. This revolutionary tool is promising to treat a myriad of human genetic diseases. Nevertheless, the molecular basis of DNA cleavage, which is a fundamental step for genome editing, has not been established. Here, quantum–classical molecular dynamics (MD) and free energy methods are used...
-
The molecular function of kallikrein‐related peptidase 14 demonstrates a key modulatory role in advanced prostate cancer
Publikacja -
Intercalation complex of imidazoacridinone C-1311, a potential anticancer drug, with DNA helix d(CGATCG)2: stereostructural studies by 2D NMR spectroscopy.
PublikacjaImidazoacridinone C-1311 (Symadex®) is a powerful antitumor agent, which successfully made its way through the Phase I clinical trials and has been recommended for Phase II few a years ago. It has been shown experimentally that during the initial stage of its action C-1311 forms a relatively stable intercalation complex with DNA, yet it has shown no base-sequence specificity while binding to DNA. In this paper, the d(CGATCG)2:C-1311...
-
Excited state properties of a series of molecular photocatalysts investigated by time dependent density functional theory.
PublikacjaTime dependent density functional theory calculations are applied on a series of molecular photocatalysts of the type [(tbbpy)2M1(tpphz)M2X2]2+ (M1 = Ru, Os; M2 = Pd, Pt; X = Cl, I) in order to provide information concerning the photochemistry occurring upon excitation of the compounds in the visible region. To this aim, the energies, oscillator strengths and orbital characters of the singlet and triplet excited states are investigated....
-
A Proposed Molecular Mechanism of High-Dose Vitamin D3 Supplementation in Prevention and Treatment of Preeclampsia
Publikacja -
Simulations of high-pressure fluid flow in a pre-cracked rock specimen composed of densely packed bonded spheres using a 3D CFD model and simplified 2D coupled CFD-DEM approach
PublikacjaW artykule zastosowano dwa różne podejścia do opisu jednofazowego przepływu płynu w wstępnie spękanej próbce skały o niskiej porowatości pod wysokim ciśnieniem. Głównym celem pracy było bezpośrednie porównanie rozkładu ciśnień, gęstości i prędkości płynów we wstępnie pękniętej próbce. Zachowanie próbki imitującej skałę zostało opisane przez gęsto upakowane połączone kohezją kulki z nakładającymi się na siebie elementami. Pierwsze...
-
Application of 2D RST method for spatial distribution of annual precipitation determination in the Upper Vistula Basin | Zastosowanie metody 2D RST do opracowania rozkładu przestrzennego rocznych sum opadów atmosferycznych w Dorzeczu Górnej Wisły
Publikacja -
Mechanism of recognition of parallel G-quadruplexes by DEAH/RHAU helicase DHX36 explored by molecular dynamics simulations
PublikacjaBecause of high stability and slow unfolding rates of G-quadruplexes (G4), cells have evolved specialized helicases that disrupt these non-canonical DNA and RNA structures in an ATP-dependent manner. One example is DHX36, a DEAH-box helicase, which participates in gene expression and replication by recognizing and unwinding parallel G4s. Here, we studied the molecular basis for the high affinity and specificity of DHX36 for parallel-type...
-
Molecular Classification of Low-Grade Diffuse Gliomas
Publikacja -
Coherent electron transport in hydrocarbon molecular devices
Publikacja -
Hubbard operators approach to the transport in molecular junctions
Publikacja -
Molecular basis of TRF proteins and their interactions with peptides
Publikacja -
Molecular Modeling of the Neurohypophyseal Receptor/Atosiban Complexes
Publikacja -
Multigap superconducting state in molecular metallic hydrogen
Publikacja -
MOLECULAR SIMULATIONS OF NEOCARZINOSTATIN CHROMOPHORE RELEASE MECHANISM
Publikacja -
A ferrocene-templated Pd-bearing molecular reactor
Publikacja -
Molecular Modelling of the Neurophysin II/Vasopressin Complex
Publikacja -
Molecular dynamics simulation of polymerization of p-xylylene
Publikacja -
Comment on “Molecular Origin of Anticooperativity in Hydrophobic Association”
Publikacja -
Molecular simulation study of cooperativity in hydrophobic association
Publikacja -
Do positrons measure atomic and molecular diameters?
PublikacjaWe report on density functional calculations (DFT) of elastic integral scattering cross-sections for positron collisions with argon, krypton, nitrogen and methane. The long-range asymptotic polarization potential is described using higher-order terms going much beyond an induced dipole potential (−α / r 4) while the short-range interaction is modeled by two different forms of electron – positron correlation potential (Boroński-Nieminen...
-
Professor Edward Borowski and molecular aspects of chemotherapy.
PublikacjaPrzedstawiono sylwetkę naukową i krótkie podsumowanie najważniejszych osiągnięć badawczych profesora Edwarda Borowskiego. Profesor Borowski jest autorem lub współautorem około 800 publikacji naukowych oraz 70 patentów, a jego prace były cytowane ponad 1100 razy. Do najważniejszych osiągnięć prof. Borowskiego i Jego zespołu naukowego należy zaliczyć: izolację i charakterystykę antybiotyków peptydowych, tetainy i edeiny oraz antybiotyków...
-
Effect of Chitosan Deacetylation on Its Affinity to Type III Collagen: A Molecular Dynamics Study
PublikacjaThe ability to form strong intermolecular interactions by linear glucosamine polysaccharides with collagen is strictly related to their nonlinear dynamic behavior and hence bio-lubricating features. Type III collagen plays a crucial role in tissue regeneration, and its presence in the articular cartilage affects its bio-technical features. In this study, the molecular dynamics methodology was applied to evaluate the effect of...
-
Thermodynamics and kinetics of amphotericin B self-association in aqueous solution characterized in molecular detail
PublikacjaAmphotericin B (AmB) is a potent but toxic drug commonly used to treat systemic mycoses. Its efficiency as a therapeutic agent depends on its ability to discriminate between mammalian and fungal cell membranes. The association of AmB monomers in an aqueous environment plays an important role in drug selectivity, as oligomers formed prior to membrane insertion – presumably dimers – are believed to act differently on fungal (ergosterol-rich)...
-
Formation of Protein Networks between Mucins: Molecular Dynamics Study Based on the Interaction Energy of the System
PublikacjaMolecular dynamics simulations have been performed for a model aqueous solution of mucin. As mucin is a central part of lubricin, a key component of synovial fluid, we investigate its ability to form cross-linked networks. Such network formation could be of major importance for the viscoelastic properties of the soft-matter system and crucial for understanding the lubrication mechanism in articular cartilage. Thus,the inter- and...
-
Silica In Silico: A Molecular Dynamics Characterization of the Early Stages of Protein Embedding for Atom Probe Tomography
PublikacjaA novel procedure for the application of atom probe tomography (APT) to the structural analysis of biological systems, has been recently proposed, whereby the specimen is embedded by a silica matrix and ablated by a pulsed laser source. Such a technique, requires that the silica primer be properly inert and bio-compatible, keeping the native structural features of the system at hand, while condensing into an amorphous, glass-like...
-
Spectroscopic studies on physicochemical properties of selected unsymmetrical bisacridine derivatives and NMR analysis of their interactions with the model sequence Pu22 aided by molecular dynamics
PublikacjaIn recent years, new promising acridine derivatives have appeared, belonging to the unsymmetrical bisacridines (UAs) family with high anticancer activity. Both their physicochemical properties and their mechanism of action at the molecular level have not been thoroughly analyzed so far. Four derivatives were selected for the study, termed as: C-2028, C-2041, C-2045 and C-2053. The first aim of this work was to determine the protonation...
-
Spatially Resolved Degradation in Heterophasic Polymers From 1D and 2D Spectral–Spatial ESR Imaging Experiments
Publikacja -
Impact of diffusion coefficient averaging on solution accuracy of the 2D nonlinear diffusive wave equation for floodplain inundation
PublikacjaIn the study, the averaging technique of diffusion coefficients in the two-dimensional nonlinear diffusive wave equation applied to the floodplain inundation is presented. As a method of solution, the splitting technique and the modified finite element method with linear shape functions are used. On the stage of spatial integration, it is often assumed that diffusion coefficient is constant over element and equal to its average...
-
Inverse method for 2D viscous flow design problem using stream-function coordinates for axisymmetric model
PublikacjaOpracowano metodę odwrotną dla przepływów lepkich nieściśliwych w osiowosymetrycznej konfiguracji. Użyto współrzędnych funkcji prądu mających tą właściwość, iż możliwe jest zastapienie jednej współrzędnej geometrycznej zmienną zależną od prędkości przepływu. W związku z czym możliwe jest rozwiązanie zadania projektowego. Metodę rozwiązano numerycznie dla przypadku testowego jak i pokazano możliwości metody dla bardziej skomplikowanego...
-
Budowa repozytorium trójwymiarowych póz postaci i metoda estymacji pozy na podstawie obserwacji 2D
PublikacjaW referacie przedstawiono metodykę badania algorytmów estymacji układu ciała człowieka w przestrzeni trójwymiarowej na podstawie pojedynczej obserwacji dwuwymiarowej - zdjęcia lub obrazu z kamery. Opisano sposób tworzenia danych odniesienia, zorganizowanych w formie bazy danych zsynchronizowanych nagrań wizyjnych oraz trójwymiarowych danych ruchu. W celu badania algorytmów estymacji pozy wykorzystano trójwymiarowy model ciała ludzkiego...
-
Vision-based parking lot occupancy evaluation system using 2D separable discrete wavelet transform
PublikacjaA simple system for rough estimation of the occupancy of an ad-hoc organized parking lot is presented. A reasonably simple microprocessor hardware with a low resolution monochrome video camera observing the parking lot from the location high above the parking surface is capable of running the proposed 2-D separable discrete wavelet transform (DWT)-based algorithm, reporting the percentage of the observed parking area occupied by...
-
Nonlinear FEM 2D failure onset prediction of composite shells based on 6-parameter shell theory
PublikacjaWithin the framework of the nonlinear 6-parameter shell theory with the drilling rotation and asymmetric stress measures, the modifications of Tsai-Wu and Hashin laminate failure initiation criteria are proposed. These improvements enable to perform first ply failure estimations taking into account the non-symmetric stress measures. In order to check the validity of the proposed criteria, finite element analyses are performed with...
-
Przegląd programów 2D oraz 3D do fotogrametrii na przykładzie PC- Rect oraz PhotoModeler
PublikacjaW pracy został podjęty temat przeglądu programów do fotogrametrii. Stwierdzono, że lawinowy rozwój informatyki sprawił, że eksperci zajmujący się zawodowo tematem zdarzeń drogowych pozyskali dostęp do specjalistycznego oprogramowania wspomagającego rekonstrukcję wypadków komunikacyjnych. Różnorodność problematyki rekonstruowania zdarzeń drogowych narzuciła konieczność stworzenia eksperckiego oprogramowania specjalnej grupy aplikacji....
-
Molecular biaxiality determines the helical structure – infrared measurements of the molecular order in the nematic twist-bend phase of difluoro terphenyl dimer
Publikacja -
Intramolecular transformation of an antifungal antibiotic nystatin A1 into its isomer, iso-nystatin A1 - structural and molecular modeling studies
PublikacjaNystatin A1, a polyene macrolide antifungal antibiotic, in a slightly basic or acidic solution undergoes an intramolecular transformation, yielding a structural isomer, the translactonization product, iso-nystatin A1 with lactone ring diminished by two carbon atoms. Structural evidence is provided by advanced NMR and Mass Spectrometry (MS) studies. Molecular dynamics simulations and quantum mechanics calculations gave the insight...