Filtry
wszystkich: 4375
-
Katalog
- Publikacje 3566 wyników po odfiltrowaniu
- Czasopisma 121 wyników po odfiltrowaniu
- Konferencje 21 wyników po odfiltrowaniu
- Osoby 74 wyników po odfiltrowaniu
- Projekty 17 wyników po odfiltrowaniu
- Zespoły Badawcze 8 wyników po odfiltrowaniu
- Kursy Online 122 wyników po odfiltrowaniu
- Wydarzenia 3 wyników po odfiltrowaniu
- Dane Badawcze 443 wyników po odfiltrowaniu
wyświetlamy 1000 najlepszych wyników Pomoc
Wyniki wyszukiwania dla: neuronal dynamics
-
Application of the dynamic EIS to investigation of transport within organic coatings
PublikacjaW pracy przedstawiono wyniki badań nad gwałtownym niszczeniem organicznych powłok ochronnych. Zastosowano technikę Dynamicznej Elektrochemicznej Spektroskopii Impedancyjnej (DEIS). Przez 60 sekund powłoka poliwinylowa poddawana była działaniu chlorku metylenu. W tym czasie rejestrowano chwilowe widma impedancyjne, co pozwoliło na prześledzenie dynamiki procesu degradacji powłoki. Potwierdzono przydatność techniki DEIS w badaniu...
-
Appraisement of modifications in dynamic routing protocols to support the IPng Protocol
PublikacjaW pracy, biorąc pod uwagę dynamiczny proces migracji sieci IPv4 do nowej wersji protokołu IP, przedstawiono konieczność realizacji w Internecie nowych protokołów routingu dynamicznego lub adaptacji już istniejących do nowego protokołu IPng. W artykule przedstawiono sposoby dostosowania protokołów routingu dynamicznego RIP, OSPF, BGP do nowego protokołu IP. Oceniono wpływ w/w dostosowywania na zbieżność i skalowalność protokołów...
-
Application of time-frequency methods for analysis of dynamic silo flow
PublikacjaW artykule przedstawiono możliwość stosowania metod czasowo-częstotliwościowych w analizie dynamicznego przepływu materiału sypkiego w silosie. W pracy omówiono wyniki FT (Fourier Transform), STFT (Short Time Fourier Transform) oraz WT (Wavelet Transform)
-
Dynamic hand-written signature verification using a matched filter
PublikacjaW pracy zaproponowano nowe podejście do weryfikacji dynamicznego podpisu odręcznego. Podpis jest traktowany jako sygnał telekomunikacyjny, który można wykryć i zwerfikować za pomocą odbiornika optymalnego z filtrem dopasowanym. Wymaga to uprzedniej unifikacji i normalizacji parametrów biernych podpisu aktualnego, jak również podpisów zgromadzonych w bazie, celem ułatwienia podejmowania decyzji. Normalizację długości podpisu uzyskano...
-
Understanding homogenous nucleation: the recent phenomenological and molecular dynamic approaches
PublikacjaPraca przedstawia dwa podejścia do problemu homogenicznej nukleacji. Pierwsze jest podejściem fenomenologicznym. Nukleacja jest tu rozumiana jako wzrost kropel krytycznych, które po przejściu określonego wymiaru, warunku równowagi termodynamicznej, mają tendencje do wzrostu. W tym podejściu problem wzrostu kropel oraz problem populacji kropel jest określany poprzez parametry makroskopowe. Przedstawiono nowe rozwiązania uzyskane...
-
Computational modelling of concrete behavior under static and dynamic conditions
PublikacjaW artykule zaproponowano wyniki obliczeń MES dla betonu podczas dynamicznego obciążenia. Przyjęto model sprężysto-plastyczno-lepki z nielokalnym osłabieniem. Obliczenia MES dla elementów betonowych pod obciążeniem dynamicznym o różnej prędkości obciążenia porównano bezpośrednio z doświadczeniami.
-
Aerodynamic shape optimization by variable-fidelity computational fluid dynamics models: a review of recent progress
PublikacjaA brief review of some recent variable-fidelity aerodynamic shape optimization methods is presented.We discuss three techniques that—by exploiting information embedded in low-fidelity computationalfluid dynamics (CFD) models—are able to yield a satisfactory design at a low computational cost, usu-ally corresponding to a few evaluations of the original, high-fidelity CFD model to be optimized. Thespecific techniques considered here...
-
The importance of the shape of the protein-water interface of a kinesin motor domain for dynamics of the surface atoms of the protein
PublikacjaSingle kinesin motor domain immersed in water has been investigated using molecular dynamics. It has been found that local properties of water in solvation shell change along with the nature of neighboring protein surface. However, a detailed analysis leads to the conclusion that the geometrical features of hydrogen bonds and overall structure of kinesin hydration water is not very different from bulk water. The local values of...
-
Anion–water interactions of weakly hydrated anions: molecular dynamics simulations of aqueous NaBF4 and NaPF6
PublikacjaIn aqueous ionic solutions, both the structure and the dynamics of water are altered dramatically with respect to the pure solvent. The emergence of novel experimental techniques makes these changes accessible to detailed investigations. At the same time, computational studies deliver unique possibilities for the interpretation of the experimental data at the molecular level. Here, using molecular dynamics simulations, we demonstrate...
-
The importance of the shape of the protein–water interface of a kinesin motor domain for dynamics of the surface atoms of the protein
PublikacjaA single kinesin motor domain immersed in water has been investigated using molecular dynamics. It has been found that local properties of water in the solvation shell change along with the nature of the neighboring protein surface. However, a detailed analysis leads to the conclusion that the geometrical features of hydrogen bonds and overall structure of kinesin hydration water are not very different from bulk water. The local...
-
UNRES server for physics-based coarse-grained simulations and prediction of protein structure, dynamics and thermodynamics
Publikacja -
Molecular dynamics simulation of human neurohypophyseal hormone receptors complexed with oxytocin—modeling of an activated state
Publikacja -
Orientational Order and Dynamics of Nematic Multipodes Based on Carbosilazane Cores Using Optical and Dielectric Spectroscopy
Publikacja -
Band structure, Born effective charges, and lattice dynamics of CuInS2 from ab initio calculations
Publikacja -
Editorial: smart modeling support for managing complexities and dynamics of knowledge-based systems-part 1
Publikacja -
Combining Computational Fluid Dynamics with a Biokinetic Model for Predicting Ammonia and Phosphate Behavior in Aeration Tanks
PublikacjaThe aim of this study was to use computational fluid dynamics for predicting the behavior of reactive pollutants (ammonia and phosphate) in the aerobic zone of the bioreactor located at the Wschod wastewater treatment plant in Gdansk, Poland. The one-dimensional advection-dispersion equation was combined with simple biokinetic models incorporating the Monod-type expressions as source terms for the two pollutants. The problem was...
-
Adsorption dynamics of chlorinated hydrocarbons from multi-component aqueous solution onto activated carbon
Publikacja -
Improvements and new functionalities of UNRES server for coarse-grained modeling of protein structure, dynamics, and interactions
PublikacjaIn this paper we report the improvements and extensions of the UNRES server (https://unres-server.chem.ug.edu.pl) for physics-based simulations with the coarse-grained UNRES model of polypeptide chains. The improvements include the replacement of the old code with the recently optimized one and adding the recent scale-consistent variant of the UNRES force field, which performs better in the modeling of proteins with the β and the...
-
Theoretical Investigation of the Electron-Transfer Dynamics and Photodegradation Pathways in a Hydrogen-Evolving Ruthenium-Palladium Photocatalyst
PublikacjaTime-dependent density functional theory calcula- tions combinedwith the Marcus theory of electron transfer (ET) were app lied on the molecular photocatalys t [(tbbpy) 2 Ru(tpph z)PdC l 2 ] 2 + in order to elucidate thelight-in- duced relaxation pathways populated upon excitation in the longer wavelength range of its absorption spectrum. The computational resultsshow that after the initial excitation, metal (Ru) to ligand (tpphz)chargetransfer...
-
Pre‐exascale HPC approaches for molecular dynamics simulations. Covid‐19 research: A use case
PublikacjaExascale computing has been a dream for ages and is close to becoming a reality that will impact how molecular simulations are being performed, as well as the quantity and quality of the information derived for them. We review how the biomolecular simulations field is anticipating these new architectures, making emphasis on recent work from groups in the BioExcel Center of Excellence for High Performance Computing. We exemplified...
-
Solvent Exchange around Aqueous Zn(II) from Ab Initio Molecular Dynamics Simulations
PublikacjaHydrated zinc(II) cations, due to their importance in biological systems, are the subject of ongoing research concerning their hydration shell structure and dynamics. Here, ab initio molecular dynamics (AIMD) simulations are used to study solvent exchange events around aqueous Zn2+, for which observation in detail is possible owing to the considerable length of the generated trajectory. While the hexacoordinated Zn(H2O)62+ is the...
-
Computational Fluid Dynamics Simulation of Gas–Liquid Multiphase Flow in T-junction for CO2 Separation
PublikacjaThe article presents the results of a computational fluid dynamics (CFD) analysis of gas-liquid multiphase flow. The simulation was conducted using CFD code and the Euler–Euler approach. The presented study relates to the non–reactive, steady-state, turbulent flow of water and carbon dioxide mixture in a 3D pipe. Separation phenomenon between phases is observed. The solution was obtained using a mixture model. Different values...
-
Encapsulation of an anticancer drug Isatin inside a host nano-vehicle SWCNT: a molecular dynamics simulation
PublikacjaThe use of carbon nanotubes as anticancer drug delivery cargo systems is a promising modality as they are able to perforate cellular membranes and transport the carried therapeutic molecules into the cellular components. Our work describes the encapsulation process of a common anticancer drug, Isatin (1H-indole-2,3-dione) as a guest molecule, in a capped single-walled carbon nanotube (SWCNT) host with chirality of (10,10). The...
-
Free volume in physical absorption of carbon dioxide in ionic liquids: Molecular dynamics supported modeling
PublikacjaUnderstanding the mechanisms underlying the carbon dioxide (CO2) absorption in ionic liquids (ILs) is the key to their efficient utilization in industrial flue gas treatment. One of the parameters considered substantially important in the process is the Free Volume. In this study, the Fractional Free Volume (FFV) of 73 ILs was calculated using Molecular Dynamics (MD). A quantitative Structure-Property Relationship (QSPR) study...
-
Molecular Dynamics to Predict Cryo-EM: Capturing Transitions and Short-Lived Conformational States of Biomolecules
PublikacjaSingle-particle cryogenic electron microscopy (cryo-EM) has revolutionized the field of the structural biology, providing an access to the atomic resolution structures of large biomolecular complexes in their near-native environment. Today’s cryo-EM maps can frequently reach the atomic-level resolution, while often containing a range of resolutions, with conformationally variable regions obtained at 6 Å or worse. Low resolution...
-
Formation of Protein Networks between Mucins: Molecular Dynamics Study Based on the Interaction Energy of the System
PublikacjaMolecular dynamics simulations have been performed for a model aqueous solution of mucin. As mucin is a central part of lubricin, a key component of synovial fluid, we investigate its ability to form cross-linked networks. Such network formation could be of major importance for the viscoelastic properties of the soft-matter system and crucial for understanding the lubrication mechanism in articular cartilage. Thus,the inter- and...
-
Silica In Silico: A Molecular Dynamics Characterization of the Early Stages of Protein Embedding for Atom Probe Tomography
PublikacjaA novel procedure for the application of atom probe tomography (APT) to the structural analysis of biological systems, has been recently proposed, whereby the specimen is embedded by a silica matrix and ablated by a pulsed laser source. Such a technique, requires that the silica primer be properly inert and bio-compatible, keeping the native structural features of the system at hand, while condensing into an amorphous, glass-like...
-
Mechanical Properties of Twisted Carbon Nanotube Bundles with Carbon Linkers from Molecular Dynamics Simulations
PublikacjaThe manufacturing of high-modulus, high-strength fibers is of paramount importance for real-world, high-end applications. In this respect, carbon nanotubes represent the ideal candidates for realizing such fibers. However, their remarkable mechanical performance is difficult to bring up to the macroscale, due to the low load transfer within the fiber. A strategy to increase such load transfer is the introduction of chemical linkers...
-
On dynamics of flexible branched shell structures undergoing large overall motion using finite elements
PublikacjaZaprezentowano autorski algorytm do analizy dynamicznej powłok sprężystych oparty na niejawnym schemacie Newmarka. Rozważania dotyczą całkowania po czasie dynamicznych równań ruchu sformułowanych w ramach nieliniowej sześcioparametrowej teorii powłok. Opracowanie zawiera pewne elementy analizy statycznej, poprzedzającej badania dynamiczne. Przykłady numeryczne prezentują zastosowanie algorytmu stanowią podstawową część pracy.
-
Early stages of condensation from the gaseous phase in a H2O-N2 system: a molecular dynamics study.
PublikacjaW pracy przedstawiono wyniki symulacji wczesnych etapów kondensacji z fazy gazowej w układzie xH2O (1-x)N2. Przeanalizowano całkowitą liczbę klastrów, średni rozmiar klastra i rozmiar klastra maksymalnego w funkcji czasu.
-
Molecular dynamics simulation and MM-PBSA analysis of Oxytricha nova TEBP ternary complex with ssDNA
PublikacjaPraca dotyczy badań metodami chemii obliczeniowej właściwości elektrostatycznych i termodynamicznych kompleksu telomerowego białka TEBP pochodzącego z organizmu Oxytricha z jednoniciowym telomerowym DNA (ssDNA).
-
Degradation of a nano-cutting tool: an MD simulation
PublikacjaW pracy przedstawiono wyniki symulacji wielokrotnego oddziaływania realistycznie ukształtowanego ostrza tnącego z modelowym, nieskończenie twardym ziarnem, przy zastosowaniu metody dynamiki molekularnej. Ostrze składało się z kilkuset tysięcy atomów metalu fcc, traktowanego za pomocą potencjału Suttona-Chena, przesuwane było ze stałą prędkością 20 m/s. Obserwowane deformacje plastyczne pojawiające się na skutek kontaktu ostrza...
-
Spike patterns and chaos in a map-based neuron model
PublikacjaThe work studies the well-known map-based model of neuronal dynamics introduced in 2007 by Courbage, Nekorkin and Vdovin, important due to various medical applications. We also review and extend some of the existing results concerning β-transformations and (expanding) Lorenz mappings. Then we apply them for deducing important properties of spike-trains generated by the CNV model and explain their implications for neuron behaviour....
-
Topological-numerical analysis of a two-dimensional discrete neuron model
PublikacjaWe conduct computer-assisted analysis of a two-dimensional model of a neuron introduced by Chialvo in 1995 [Chaos, Solitons Fractals 5, 461–479]. We apply the method of rigorous analysis of global dynamics based on a set-oriented topological approach, introduced by Arai et al. in 2009 [SIAM J. Appl. Dyn. Syst. 8, 757–789] and improved and expanded afterward. Additionally, we introduce a new algorithm to analyze the return times...
-
JOURNAL OF MUSCULOSKELETAL & NEURONAL INTERACTIONS
Czasopisma -
Wybrane elementy nieliniowej dynamiki struktur kratowych
PublikacjaW pracy jest dyskutowany problem nieliniowej dynamiki struktur kratowych. Zastosowano stacjonarny opis Lagrange'a (ang. Total Lagrange), pokazano silne i słabe sformułowanie dla pręta kratowego, jego aplikację do MES. W zakresie całkowania równań ruchu przedstawiono metodę Newmarka i metodę-a dla problemów liniowych i nieliniowych. Załączony przykład numeryczny ilustruje cechy przedstawionych metod.
-
Connection matrix theory for discrete dynamical systems
Publikacja -
Dynamical properties of ordered Fe–Pt alloys
Publikacja -
Dynamika piły tarczowej i wrzeciona przecinarki
PublikacjaOpisano metodykę określania właściwości dynamicznych układu wrzecionowego pilarki tarczowej w sposób eksperymentalny. Opisana metoda pozwala wykazać, że w określonych przypadkach o zachowaniu piły decydującą rolę może odgrywać wrzeciono pilarki i sposób jego napędu.
-
Zatrudnienie i bezrobocie a dynamika wzrostu gospodarczego
PublikacjaW pierwszej części artykułu przedstawiono koncepcję teoretyczną opisującaą związki pomiędzy dynamiką wzrostu produktu krajowego a stopą wzrostu zatrudnienia i stopą bezrobocia w warunkach zmian nakładów kapitałowych i postępu technicznego. W następnej kolejności przedstawiono model teoretyczny opisujący te związki i sformułowano założenia leżące u jego podstaw. W końcowej części artykułu, na podstawie informacji kwartalnych z lat...
-
Connection matrix theory for discrete dynamical systems
PublikacjaIn [C] and [F1] the connection matrix theory for Morse decomposition is developedin the case of continuous dynamical systems. Our purpose is to study the case of discrete timedynamical systems.
-
Metody sprzęgania modeli dynamiki rurociągów przemysłowych
PublikacjaArtykuł opisuje dwie metody sprzęgania modeli dynamiki rurociągów przesyłowych. Stanowią one niezbędny element przy budowie efektywnych systemów symulacji rozległych i złożonych instalacji rurociągów stosowanych w przemyśle. Pierwsza z proponowanych metod (globalna metoda sprzęgania - GMS) wykorzystuje 'globalne' (w skali modelu) zależności (oraz fizyczne przybliżone zależności) pomiędzy ciśnieniem i przepływem masowym medium w...
-
Badania dynamiki wybranych morskich obiektów pływających
PublikacjaPraca zawiera - w ujęciu skróconym materiał z zakresu ogólnych badań dynamiki morskich obiektów pływających - w ujęciu rozszerzonym i pogłębionym - materiał z badań dynamiki morskich obiektów pływających, należących do klasy pływakowych obiektów segmentowych. Dla obiektów segmentowych reprezentujących katamarany i trimarany załączone są wyniki obliczeń i badań modelowych.
-
Problem opisu dynamiki recyrkulacji w reaktorach.
PublikacjaOmówiono aktualne problemy związane z kwestią recyrkulacji w obiektach oczyszczalni ścieków. Wskazano na znaczny wzrost stosowanych stopni recyrkulacji w ostatnim czasie i przeanalizowano jego przypuszczalne przyczyny oraz konsekwencje. Omówiono wyniki badań przeprowadzonych w laboratoryjnym modelu osadnika.
-
Laboratorium Dynamiki i Automatyzacji Maszyn Technologicznych
PublikacjaW dokumencie zawarto opis profilu działalności Laboratorium Dynamiki i Automatyzacji Maszyn Technologicznych utworzonego w ramach Katedry Technologii Maszyn i Automatyzacji Produkcji. Na dołączonych ilustracjach przedstawiono najważniejsze stanowiska badawczo- dydaktyczne oraz kilka przykładowych wyników testów zautomatyzowanych napędów.
-
Concept of Neural Model of the Sea Bottom Surface
Publikacja -
Effects of Sleep Deprivation on Neural Circulatory Control
Publikacja -
Sympathetic neural responses to smoking are age dependent
Publikacja -
An improved adaptive neural voltage controller for turbogenerator
PublikacjaOpracowano model adaptacyjnego neuronowego regulatora napięcia z nastrojonym współczynnikiem wzmocnienia funkcji przynależności i z nastrojonym współczynnikiem uczenia sieci neuronowej w zależnosci od stanu obciążenia turbogeneratora. Przedstawiono wyniki symulacji mające na celu badania efektywności proponowanego regulatora. Te wyniki porównano z wynikami uzyskanymi z regulatorem o stałym współczynnikiem wzmocnienia funkcji przynależności...
-
Differential models versus neural models in optimisation
PublikacjaW pracy porównano zastosowanie modeli różniczkowych i modeli neuronowych dla celów optymalizacji.