Search
Search results for: BIAŁKA
-
Białka - budowa i właściwości
PublicationStruktura białek wpływa na ich wartość odżywczą, właściwości funkcjonalne wżywności oraz reakcje w surowcach i produktach żywnościowych. W czasie prze-chowywania i przetwarzania żywności białka ulegają przemianom, niepożądanymlub zamierzonym, wskutek reakcji chemicznych i biochemicznych. Poprzez celo-we, enzymatyczne i chemiczne modyfikowanie struktury białek można wpływać naich właściwości funkcjonalne w żywności i wartość biologiczną.
-
Białka - budowa i właściwości. Rozdział 5
PublicationStruktura i konformacja białek w żywności zmienia się wskutek przemian fizycznych, biochemicznych i chemicznych zachodzących w warunkach przechowywania i przetwarzania surowców. Duże znaczenie białek jako składników żywności polega na ich wartości biologicznej w żywieniu oraz udziale w tworzeniu pożądanych, sensorycznych właściwości produktów żywnościowych. Funkcjonalne cechy białek to rozpuszczalność w środowisku wodnym o różnej...
-
Optymalizacja biosyntezy białka X w bioreaktorze.
Publication.
-
Białka aktywne biologicznie obecne w soku pokrochmalnianym
PublicationPodczas przetwarzania 1 tony ziemniaków na skrobię powstaje od 5 do 12 m3 odpadów ciekłych, które zawierają 300-410 g białek na 1 kg suchej masy. Trzy główne grupy białek to: białka typu patatyny, inhibitory proteaz o charakterze zasadowym, grupa białek złożonych o wielkości 22 kDa. Białka te mogą zostać wyizolowane z soku pokrochmalnianego w formie natywnej, a następnie wykorzystane jako: środki ochrony roślin, dodatki do żywności...
-
Białka prokariotycznego systemu MMR: rola oraz interakcje
PublicationUszkodzenia komórkowego DNA w postaci błędnie sparowanych lub niesparowanych zasad azotowych są wynikiem niewłaściwie zachodzących procesów metabolizmu DNA, takich jak replikacja, rekombinacja oraz naprawa DNA. Utrwalenie tego rodzaju zmian prowadzi do powstania mutacji. System MMR (ang. DNA mismatch repair) usuwa te uszkodzenia przyczyniając się do zwiększenia wierności replikacji DNA oraz utrzymania stabilności genomu komórki....
-
Charakterystyka otoczki solwatacyjnej białka przeciwdziałającego zamarzaniu wody
PublicationWiele organizmów rozwinęło oryginalne sposoby na radzenie sobie z niebezpieczeństwami związanymi z narażaniem na niskie temperatury. Istnieje np. szczególna grupa białek powstrzymujących wzrost zarodków krystalizacji wody. W budowie analizowanego tu białka wskazać można trzy powierzchnie: jedną wiążącą się do lodu oraz dwie pozostające w kontakcie z wodą w stanie ciekłym. Przedmiotem tej pracy było opisanie struktury wody sąsiadującej...
-
Albuminy 2S - roślinne białka zapasowe o właściwościach alergennych
PublicationRoślinne albuminy 2S są znane jako białka zapasowe obecne w nasionach niektórych roślin jadalnych, takich jak: soja, słonecznik, gorczyca i orzech brazylijski. Białka te posiadają niezwykłą strukturę drugorzędową, będącą wynikiem obecności bogatych w cysteinę motywów C-Xn-CXn-CC-Xn-CXC-Xn-C-Xn-C oraz czterech wiązań disiarczkowych. Dzięki tej strukturze, albuminy 2S są odporne na obróbkę termiczną i proteolizę. Niektóre z tych...
-
UDP-glukuronylotransferazy - białka siateczki śródplazmatycznej. Struktura i mechanizm działania
PublicationIzoenzymy UDP-glukuronylotransferazy (EC. 2.4.1.17), UGT, katalizują w organizmach ssaków reakcję koniugacji grupy glikozylowej pochodzącej z nukleotydu UDPGA z aglikonem. UDPGA jest przyłączany do odpowiedniej grupy funkcyjnej metabolitu I fazy, rzadziej związku wyjściowego, przez co polarność aglikonu i zdolność jego wydalania z komórki zwiększa się, a to w konsekwencji obniża efekt toksyczny.Struktura UGT zawiera 2 domeny. Domena...
-
Rekombinowane białka fagowe - nowe narzędzie do wykrywania patogenów w żywności
PublicationArtykuł opisuje nowatorskie i rewolucyjne podejście do wykrywania patogenów w żywności, które polega na zastosowaniu w testach VIDAS specyficznych rekombinowanych białek pochodzących z bakteriofagów.
-
Zastosowanie immobilizowanego białka MutS do wychwytywania fragmentów DNA zawierających niesparowane zasady
PublicationBiałko MutS wiąże DNA zawierające błędnie sparowane oraz niesparowane zasady w DNA. Podjęto szereg prób wykorzystania tego białka jako narzędzia do detekcji nieznanych mutacji lub zagęszczania frakcji DNA z niesparowaną zasadą. Dotychczas żadna z metod oparta na użyciu białka MutS nie została wdrożona powszechnie do praktyki laboratoryjnej. Głównym powodem takiego stanu rzeczy jest stosunkowo silne powinowactwo MutS do DNA w pełni...
-
Concentration of proteins in the whey stream
PublicationZastosowano metodę separacji pianowej do odzyskiwania białka z serwatki. Wykazano silny wpływ prędkości powietrza w kolumnie, początkowego stężenia białka w serwatce i pH roztworu na przebieg i skuteczność flotacji. Współczynnik wzbogacenia maleje ze wzrostem prędkości przepływu powietrza oraz ze wzrostem początkowego stężenia białka serwatkowego. Najwyższą wartość współczynnika wzbogacenia uzyskano dla pH naturalnej serwatki.
-
Powierzchnia międzyfazowa gaz - ciecz w roztworach białka serwatkowego napowietrzanych we współprądowej kolumnie barbotażowej
PublicationBadano rozkłady wielkości pęcherzy oraz stopień zatrzymania gazu podczas ciągłej separacji pianowej białka serwatkowego we współprądowej kolumnie barbotażowej. Średnice pęcherzy wyznaczano metodą fotograficzną. posługując się przecietną powierzchniowo-objętościową średnicą pęcherzy oraz wartością stopnia zatrzymania gazu wyznaczano wielkość generowanej powierzchni międzyfazowej.
-
Nowe źródła lizostafyny Staphylococcus simulans - konstrukcja układów ekspresyjnych, oczyszczanie i badanie właściwości białka.
Publication.
-
Antioxidants and proteins in ethylene-treated kiwifruits
PublicationW pracy porównano właściwości przeciwutleniające i profil białek owoców kiwi poddanych działaniu etylenu i powietrza. Wysokie współczynniki korelacji między całkowitą zawartością fenoli i właściwościami przeciwutleniającymi uzyskano dla trzech metod określania właściwości przeciwutleniających: ABTS, TEAC i CUPRAC. W paśmie białek owoców kiwi rozdzielonych za pomocą elektroforezy stwierdzono różnice w paśmie siarczanu dodecylu sodu...
-
Two highly thermostable paralogous single-stranded DNA-binding proteins from Thermoanaerobacter tengcongensis
PublicationThe thermophilic bacterium Thermoanaerobacter tengcongensis has two single-stranded DNA-binding (SSB) proteins, designated TteSSB2 and TteSSB3. In a SSB complementation assay in Escherichia coli, only TteSSB3 took over the in vivo function of EcoSSB. We have cloned the ssb genes obtained by PCR and have developed E. coli overexpression systems. The TteSSB2 and TteSSB3 consist of 153 and 150 amino acids with a calculated molecular...
-
Bacterial SSB-like proteins of family Deinococcaceae - indentification, isolation, obtaining, purification and molecular characteristic
PublicationWiększość poznanych białek SSB jest aktywna w formie homotetramerycznej. Od 2002 roku znane są białka organizmów ekstremofilnych. Scharakteryzowano białka mikroorganizmów rodziny Deinococaceae. Uzyskane termostabilne białka stanowią atrakcyjną alternatywę w stosunku do znanych białek SSB w metodach diagnostyki molekularnej, technikach biologii molekularnej i analityce.
-
Przydatność białka rybiego w postaci kolagenu lub żelatyny oraz polisacharydu - kapa-karagenu do wytwarzania aktywnych opakowań biodegradowalnych = Usefulness of fish collagen, gelatin and carrageenan for preparation of active biodegradable packages
PublicationSummary - The possibility of use of protein films made of fish collagen or gelatin as well as polysaccharide carrageenan films as carriers of enzymes (lysozyme or lysostaphyne), for preparation of microbiologically active packages, was investigated. It was found that crosslinking of such systems with N-[3(dimethylamino)propyl]-N'-ethylcarboimide (EDC) does not influence the activity of lysozyme immobilized in the films (Table 1)....
-
Type II secretory pathway for surface secretion of DraD invasin from the uropathogenic Escherichia coli Dr+ strain
PublicationWłaściwości wirulentne uropatogennych szczepów Escherichia coli Dr+ IH11128 związane są z obecnością struktur fimbrialnych typu Dr i białka inwazyny DraD, które może na powierzchni komórki bakteryjnej pełnić rolę fimbrialnej podjednostki szczytowej. Ostatnie badania wykazały, że białko DraD jest eksponowane na powierzchni bakterii w dwóch formach: związanej ze strukturą fimbrialną i jako niezależna od fimbrii otoczka białkowa....
-
Identification, cloning, expression, and characterizationof a highly thermostable single-stranded-DNA-binding protein (SSB) from Deinococcus murrayi
PublicationZidentyfikowano i scharakteryzowano białko SSB-podobne, pochodzące z Deinococcus murrayi (DmuSSB). Otrzymany w reakcji PCR fragment zawierający kompletny gen ssb sklonowano w systemie ekspresyjnym Escherichia coli. Gen składa się z 826 nt, kodujących 276 reszt aminokwasowych z wyliczoną teoretycznie masą cząsteczkową monomeru równą 30,14 kDa. DmuSSB zawiera dwie domeny wiążące jednoniciowe DNA OBna monomer I funkcjonuje jako homodimer....
-
Novel method of expression and purification of hirudin based on pBAD TOPO, pTYB12 vectors and gene synthesis
PublicationW pracy przedstawiono nową, szybką i tanią metodę otrzymywania, ekspresji i oczyszczania białka hirudyny naturalnie izolowanego z ślinianek pijawki lekarskiej. Hirudyna pełni funkcje bezpośredniego inhibitora trombiny, głównego białka biorącego udział w tworzeniu skrzepów krwi. Właściwości te wykorzystywane są od wielu lat w klinice. Opracowana metoda pozwoliła uzyskać 17 mg/l hodowli E. coli białka o wysokiej czystości i aktywności...
-
Badania nad wykorzystaniem rekombinantowego białka MutS do wykrywania muta-cji punktowych.**2002, ????s. ???rys. ??? tab. bibliogr.???poz. maszyn. Rozprawa doktorska 10.04.2002, P. Gdań. Wydz. Chem. Promotor: prof. dr hab. J. Kur.
Publication.
-
Genetic inactivation and chemical inhibition of PARP-1 lead to increased cytotoxicity to antitumor triazoloacridone C-1305
PublicationOkreśliliśmy aktywność cytotoksyczną związku C-1305 wobec komórek z obniżoną aktywnością PARP-1 w wyniku działania inhibitora tego enzymu związku NU1025. Dane wskazują, że w zależności od rodzaju inhibitora topoizomerazy II obniżenie aktywności PARP-1 przez związek NU1025 prowadzi do zwiększenia bądź obniżenia cytotoksyczności tych leków. Działanie NU1025 prowadzi również do re-aktywacji szlaku p53 w komórkach HeLa, czego jak dotąd...
-
Toxoplasma gondii: Enzyme-Linked Immunosorbent Assay using different fragments of recombinant microneme protein 1 (MIC1) for detection of immunoglobulin G antibodies
PublicationTrzy rekombinantowe fragmenty białka antygenowego MIC1 Toxoplasma gondii (r-MIC1ex2, r-MIC1ex34 i r-MIC1) zostały wyprodukowane jako białka fuzyjne (zawierające dwie domeny oligohistydynowe na N- i C-końcu) w komórkach bakteryjnych Escherichia coli. Homogenne preparaty antygenów rekombinantowych otrzymane z zastosowaniem jednoetapowego oczyszczania metodą chromatografii metalopowinowactwa, wykorzystano następnie do immunoidentyfikacji...
-
Symulacje biomolekularne jako narzędzie do badania mechanizmów rozpoznania i wiązania pomiędzy białkami
PublicationBiałka pełnią wielorakie funkcje w organizmach żywych, jednak rzadko działają samodzielnie. W zdecydowanej większości przypadków współpracują one między sobą tworząc makrokompleksy o precyzyjnie zorientowanych podjednostkach. Oddziaływania międzybiałkowe wzbudzają więc duże zainteresowanie, jako że w istotny sposób odpowiadają za aktywność biologiczną białek. Choć do tej pory opracowano wiele metod doświadczalnych badania oddziaływań...
-
Wpływ grupy donorowej substancji rozpuszczonej na stabilność temperaturową białka
ProjectsProject realized in Department of Physical Chemistry according to DEC-2019/03/X/ST4/01021 agreement from 2019-12-04
-
Study of immunogenic and immunoprotective activity of DNA vaccines encoding multiantigenic chimeric and fusion proteins of Toxoplasma gondii
ProjectsProject realized in Department of Microbiology according to UMO-2018/31/D/NZ6/02839 agreement from 2019-07-01
-
RADIUM Assessment of the influence of variable parameter conditions on obtaining the protein crystal of saccharopine dehydrogenase (NADP(+), L-glutamate-forming) from Candida albicans
ProjectsProject realized in Department of Pharmaceutical Technology and Biochemistry according to DEC-11/RADIUM/2023 agreement from 2023-07-12
-
Characterization of a new essential TPR protein LapB and a new non-coding RNA, which together regulate the assembly of endotoxin.
ProjectsProject realized in Faculty of Chemistry according to UMO-2013/11/B/NZ2/02641 agreement from 2014-07-09
-
System ekspresyjny do wytwarzania heterologicznego białka, plazmidowe wektory ekspresyjne, sposób otrzymywania rekombinantowego szczepu psychrotolerancyjnych drożdży Debaryomyces macquariensis i sposób otrzymywania białka przez rekombinantowy szczep drożd
Inventions -
Relationship between seawater pollution and qualitative changes in the extracted proteins from mussels Mytilus galloprovincialis
PublicationCelem badań było znalezienie wiarygodnego bioznacznika dla oceny poziomu zanieczyszczenia wody morskiej. W tym celu porównano:-zawartość żelaza (Fe) oraz miedzi (Cu)-białek-poziomu aktywności przeciwutleniającejmałży (Mytilus galloprovincialis)zebranych z rejonów zanieczyszczonych i niezanieczyszczonych bułgarskiej strefy ekonomicznej Morza Czarnego.W badanich wykorzystano takie techniki analityczne jak: -spektroskopia w podczerwieni...
-
Zespół Katedry Równań Różniczkowych i Zastosowań Matematyki
Research Teams* topologiczne niezmienniki w teorii układów dynamicznych i ich zastosowania * teoria punktów stałych i periodycznych * metody matematyczne w kardiologii * miary złożoności i ich zastosowania * modele strukturalne z dyfuzją i warunkami brzegowymi Fellera * modelowanie ekspresji genu białka Hes1 * równania McKendrick-von Foerster z warunkiem odnowy * modelowanie termicznej ablacji za pomocą równania bio-przewodnictwa ciepła * soczewkowanie...
-
Investigating the coordinated regulation of lipopolysaccharide (LPS) and phospholipid amounts by the essential LPS assembly proteins LapB/LapC and the involvement of a new thioesterase
ProjectsProject realized in Laboratorium Genetyki Bakterii according to UMO-2023/49/B/NZ1/01986 agreement
-
synth_md_cg Simulation of conformational changes related to the interdomain communication in the eukaryotic GlcN-6-P synthase by means of a large-scale molecular dynamics of the coarse-grained protein model
ProjectsProject realized in Department of Pharmaceutical Technology and Biochemistry from 2014-03-14
-
Novel monovalent and multivalent recombinant proteins of Borrelia burgdorferi sensu lato as potential antigens for the detection of specific antibodies in the sera of Lyme patients
ProjectsProject realized in Department of Microbiology according to UMO-2023/49/B/NZ6/02881 agreement from 2024-03-01
-
Sposób otrzymywania rekombinantowego szczepu Escherichia coli Rosetta (DE3) pLysS oraz sposób wytwarzania białka syntazy trehalozy Deinococcus radiodurans DSMZ 20539
Inventions -
How should we teach cardiopulmonary resuscitation? Randomized multi-center study
Publication -
Sekwencje nukleotydowe wektorów, fuzyjne białka zawierające domeny MutS i GFP, sposób ich otrzymywania oraz sposób ich zastosowania do wykrywania niekomplementarności oraz mutacji w DNA
Inventions -
Fuzyjne białko zawierające domeny MutS i p-galaktozydazę, wektor plazmidowy, sposób otrzymywania fuzyjnego białka oraz sposób jego zastosowania do wykrywania mutacji i niekomplmentarności w DNA
Inventions -
Sposób otrzymywania rekombinantowego szczepu Escherichia coli TOP10F', sposób otrzymywania rekombinantowego szczepu Escherichia coli BL21 (DE3) pLysS i sposób wytwarzania białka syntazy trehalozy typu dzikiego Deinococcus geothermalis DSMZ 11300
Inventions -
Sekwencja DNA, startery oligonukleotydowe, sekwencja DNA wraz z miejscami rozpoznania dla enzymów restrykcyjnych NcoI i HindIII, wektor ekspresyjny, rekombinowany szczep Escherichia coli TOP10/F' i jego sposób otrzymywania oraz sposób wytwarzania termostabilnego białka SSB-podobnego Deinococcus radiopugnans DSMZ 12027
Inventions -
Sekwencja DNA, startery oligonukleotydowe, sekwencja DNA wraz z miejscami rozpoznania dla enzymów restrykcyjnych NcoI i HindIII, wektor ekspresyjny, rekombinowany szczep Escherichia coli TOP10/F' i jego sposób otrzymywania oraz sposób wytwarzania termostabilnego białka SSB-podobnego Deinococcus radiopugnans DSMZ 11303
Inventions -
Kinezyna w ruchu względem tubuliny - właściwości wody solwatacyjnej i oddziaływania pomiędzy białkami
ProjectsProject realized in Department of Physical Chemistry according to UMO-2013/09/D/NZ1/01087 agreement from 2014-02-10
-
Analiza supresorowa DsbA/DsbB szlaków tworzenia wiązań disiarczkowych w białkach. Identyfikacja oraz charakterystyka nowych katalizatorów fałdowania DsbF
ProjectsProject realized in Faculty of Chemistry according to 0275/DIA/2012/41 agreement from 2012-06-05
-
TOXODIAG New diagnostic tests for the detection of anti-Toxoplasma gondii antibodies in animal serum samples based on recombinant chimeric proteins
ProjectsProject realized in Department of Microbiology according to LIDER/34/0188/L-10/18/NCBR/2019 agreement from 2019-10-19
-
Nowe odczynniki do badań immunochemicznych na bazie indykatorów i znaczników akrydynowych połączonych z białkami
ProjectsProject realized in Faculty of Chemistry according to UMO-2012/05/B/ST5/01680 agreement from 2013-03-27
-
Molekularny mechanizm wpływu stresu oksydacyjnego na stabilność strukturalną i dynamikę kompleksów telomerowego DNA z białkami
ProjectsProject realized in Department of Physical Chemistry according to 0059/DIA/2014/43 agreement from 2014-09-18
-
BisMolMechZM2020 Specific interactions of new antitumor unsymmetrical bisacridines, UAs, with DNA and ABC proteins and their potential to modulate the enzymatic activity and trancription of nuclear receptor as the elements of their molecular mechanism of action.
ProjectsProject realized in Department of Pharmaceutical Technology and Biochemistry according to UMO-2019/33/B/NZ7/02534 agreement from 2020-04-02
-
Jarosław Wawer dr hab. inż.
People -
Agnieszka Bartoszek-Pączkowska prof. dr hab. inż.
People -
Molecular dynamics simulation and MM-PBSA analysis of Oxytricha nova TEBP ternary complex with ssDNA
PublicationPraca dotyczy badań metodami chemii obliczeniowej właściwości elektrostatycznych i termodynamicznych kompleksu telomerowego białka TEBP pochodzącego z organizmu Oxytricha z jednoniciowym telomerowym DNA (ssDNA).