Filters
total: 3827
filtered: 1849
-
Catalog
- Publications 1849 available results
- Journals 43 available results
- Conferences 3 available results
- Publishing Houses 1 available results
- People 102 available results
- Inventions 17 available results
- Projects 23 available results
- Laboratories 3 available results
- Research Teams 3 available results
- Research Equipment 3 available results
- e-Learning Courses 78 available results
- Events 7 available results
- Open Research Data 1695 available results
Chosen catalog filters
displaying 1000 best results Help
Search results for: RAPD-PCR
-
Principles and applications of Ligation Mediated PCR methods for DNA-based typing of microbial organisms
PublicationA significant number of DNA-based techniques has been introduced into the field of microorganisms’ characterization and taxonomy. These genomic fingerprinting methods were developed to detect DNA sequence polymorphisms by using general principles, such as restriction endonuclease analysis, molecular hybridization, and PCR amplification. In recent years, some alternative techniques based on ligation of oligonucleotide adapters before...
-
Typing of Scopulariopsis and Microascus fungi by Random Amplified Polymorphic DNA (RAPD)
PublicationOBJECTIVES Scopulariopsis species and their teleomorphs of the genus Microascus are commonly isolated from soil, decaying plant material and indoor environments. Moreover, certain Scopulariopsis and Microascus species are recognised as opportunistic human pathogens. Although most species can be identified by detailed morphological study, phenotypic characters appear to overlap in several cases and morphology seems to be insufficient...
-
A hypothesis for GPCR activation
Publication -
Zakażenia bakteryjne w przewlekłym zapaleniu ucha środkowego - ocena przydatności diagnostyki molekularnej opartej o technikę PCR. Bacterial infection in chronic otitis media - assessment of usefulness of molecular diagnostic based in PCR method.
PublicationIdentyfikacja zakażeń w przewlekłym zapaleniu ucha środkowego jest trudna, o czym świadczą wysokie odsetki ujemnych wyników badań bakteriologicznych. Przyczyną tego jest trudność w uzyskiwaniu wiarygodnego materiału do badań oraz stosunkowo niska czułość klasycznych metod diagnostycznych. Amplifikacja bakteryjnego DNA techniką PCR jest badaniem, które może przyczynić się do zwiększenia efektywności i czułości badań bakteriologicznych....
-
System do diagnostyki dermatofitowych zakażeń powierzchniowych oparty na technice Real-Time PCR
PublicationDermatofity należą do blisko spokrewnionej grupy grzybów, które wykazują wysokie powinowactwo do skeratynizowanych tkanek. Cecha ta czyni je odpowiedzialnymi za powierzchniowe grzybice skóry, paznokci oraz włosów. Szacuje się, iż nawet do 20% ludzi na całym świecie dotkniętych jest infekcjami powodowanymi przez dermatofity. Ich leczenie wymaga długotrwałego zastosowania leków przeciwgrzybiczych. W celu dobrania odpowiedniego leczenia...
-
DNA Methylation Changes Induced by Redox-Active Compounds—Choosing the Right PCR-Based Method
PublicationThe impact of catechins on the expression profile of redox-related genes in HT29 cell line has been studied recently by our group using Oxidative Stress RT2 Profiler PCR Array. Within the examined panel of 84 genes, the down-regulation of SRXN1 gene was unique among other up-regulated genes. We hypothesized that the observed down-regulation resulted from DNA methylation and have exploited this observation to choose the proper strategy...
-
The use of a one-step PCR method for the identification of Microsporum canis and Trichophyton mentagrophytes infection of pets
PublicationIntroduction: Dermatophytes are a closely related group of keratinophilic fungi. They encompass important etiological agents of superficial fungal infections. These fungi are able to invade keratinized tissues of humans and animals, causing dermatophytosis (ringworm) of hair, nails or skin. The aim: Traditional diagnostics of ringworm is based on morphological identification of cultured fungi and is time-consuming. Materials and methods:...
-
Application of PCR-HRM method for microsatellite polymorphism genotyping in the LDHA gene of pigeons (Columba livia)
Publication -
Evaluation of a PCR Melting Profile method for intra-species differentiation of Trichophyton rubrum and Trichophyton interdigitale
PublicationW celu identyfikacji źródła infekcji spowodowanych przez dermatofity, jak i drogi ich transmisji, istnieje potrzeba szukania nowych metod, które pozwolą na głębokie zróżnicowanie genetyczne szczepów w obrębie rodzaju. W pracy po raz pierwszy pokazano zastosowanie techniki PCR MP opartej o adaptory oligonukleotydowe i różnice w temperaturze topnienia fragmentów restrykcyjnych DNA w reakcji PCR do wewnątrzgatunkowego typowania dermatofitów....
-
Usefulness of the PCR technique for bacterial DNA detection in blood of the patients after ''oppened heart'' operations.
PublicationOperacje kardiochirurgiczne w krążeniu pozaustrojowym (KPU) poprzez ogromny uraz, powodowanie występowania zaburzeń odporności oraz uszkodzenie barier anatomicznych stwarzają sytuację wybitnie sprzyjającą rozwojowi powikłań infekcyjnych u tych chorych. Prowadzenie terapii antybiotykowej profilaktycznej i leczniczej, a także selektywna dekontaminacja przewodu pokarmowego może utrudniać i przedłużać czas rozpoznania obecności bakterii...
-
Recombinant !ermostable AP Exonuclease from Thermoanaerobacter tengcongensis: Cloning, Expression, Purification, Properties and PCR Application
PublicationApurinic/apyrimidinic (AP) sites in DNA are considered to be highly mutagenic and must be corrected to preserve genetic integrity, especially at high temperatures. !e gene encoding a homologue of AP exonuclease was cloned from the thermophilic anaerobic bacterium Thermoanaerobacter tengcongensis and transformed into Escherichia coli. The protein product showed high identity (80%) to human Ape1 nuclease, whereas to E. coli exonuclease...
-
PCR amplification with primers based on IS2404 and GC-rich repeated sequence reveals polymorphism in Mycobacterium ulcerans
PublicationOpracowano prostą w wykonaniu metodę genotypowania szczepów bakterii z gatunku Mycobacterium ulcerans. Polimorfizm genetyczny 32 badanych izolatów Mycobacterium ulcerans odzwierciedla ich geograficzne pochodzenie z rejonów Afryki Centralnej, Ameryki Południowej i Łacińskiej, Azji Południowo-Wschodniej, Malezji oraz Australii.
-
Stability investigation of the PCM nanocomposites
PublicationIn present study was showed the results of research the stability of nanoPCMs in terms of types and concentrations of surfactant used. For stearic acid has been added PVP or oleic acid in concentrations of 0%, 5% and 10%. Nanoparticles TiO2 and Al-2O3 in concentration of 1% were chosen to be researched in this test. The mixing of nanocomposites has been done in an ultrasonic scrubber in which the samples were placed for 45 mins....
-
Stability Investigation of the PCM Nanocomposites
PublicationEnsuring the stability is a key issue to be solved for the technical application of nanocomposites. In this work, fatty acid P1801 served as base phase change material (PCM)P1801, and its main ingredients are palmitic acid (58%) and stearic acid (38%). Titania (TiO2) and alumina (Al2O3) with mass concentrations of 1% and 5% were selected as nanoparticles, while polyvinylpyrrolidone (PVP) or oleic acid (OA) with mass concentrations...
-
Analiza właściwości emiterów LCR
PublicationOd wielu lat pojawiają się publikacje dotyczące konstrukcji emiterów służących do wypromieniowania energii pola elektromagnetycznego z układów, w których są wytwarzane impulsy prądowe o krótkim czasie trwania (rzędu ns lub µs) i znaczącej wartości szczytowej (rzędu MA). Tego rodzaju emitery nazywane są w języku angielskim Large Current Radiators (LCR). Budowa emitera LCR powinna zapewniać możliwie niewielką indukcyjność (rzędu...
-
Highly thermostable RadA protein from the archaeon Pyrococcus woesei enhances specificity of simplex and multiplex PCR assays
Publication -
Application of SSB-like protein from Thermus aquaticus in multiplex PCR of human Y-STR markers identification
PublicationW tej publikacji prezentujemy zastosowanie białka SSB-podobnego Thermus aquaticus (TaqSSB) w reakcji multiplex PCR w celu identyfikacji markerów ludzkiego Y-STR. Wykorzystanie termostabilnego białka TaqSSB chroni lub redukuje tworzenie przez startery struktur dimerycznych, które powodują hamowanie hybrydyzacji starterów do badanego DNA i redukują ilość starterów dostępnych w reakcji PCR.
-
Species - specific detection of the toxic mushrooms Amanita virosa and Amanita verna by PCR amplification of the gpd gene fragment
PublicationZaprojektowano dwie pary starterów do reakcji PCR, które umożliwiają gatunkowo specyficzną amplifikację unikalnych fragmentów genów gpd dla dwóch grzybów kapeluszowych: muchomora wiosennego (Amanita verna) i muchomora jadowitego (Amanita virosa).
-
Isolation of Human Progenitor Epidermal Cells on Collagen Type IV and Analysis of Their Markers with Flow Cytometry and PCR Methods
PublicationEpidermal stem cells, located in the skin, together with keratinocytes are transplanted in regenerative therapies, e.g., for the treatment of burns or other wounds. Here, we describe the protocol of their enzymatic isolation from human skin. It includes separation of the epidermis form the dermis by incubation with dispase followed by cell isolation for epidermis by digestion with trypsin. Cell isolated with this method can be...
-
Rapid Screening of Antimicrobial Synthetic Peptides
Publication -
Regularization as quantization in reducible representations of CCR
PublicationOpis kwantowego pola elektromagnetycznego przy pomocy redukowalnych reprezentacji CCR prowadzi do automatycznej regularyzacji teorii. Sformułowanie jest jawnie relatywistycznie współzmiennicze. Przeanalizowano - jako przykład - pola kwantowe wytwarzane przez klasyczne źródła.
-
Metal dusting in Platforming CCR furnaces
PublicationPrzedstawiono charakterystykę zjawiska spylania metalu w stali chromowo-molibdenowej 9Cr-1Mo eksploatowanej w piecach instalacji Platformingu CCR w środowisku odsiarczonej benzyny cięzkiej i gazu wodorowego o temperaturze 500C, przy temperaturze metalu 600C.
-
PCA based Fault Tolerant MPC
PublicationThis chapter presents a Fault Tolerant - Model Predictive Control (FT-MPC) schemes for sensor faults accommodation. A Fault Detection and Isolation (FDI) Unit, which is an integral part of FT-MPC system, is based on the Principal Component Analysis (PCA) method. Introduced approach enables efficient bias and drift faults accommodation in single, as well as simultaneous faults case. Simple simulation exercise is presented.Rozdział...
-
Metal dusting in CCR platforming unit
PublicationPrzedstawiono mechanizm pylenia metalu w stali 9Cr-1Mo w instalacji platformingu CCR, na postawie badań rury podgrzewacza wsadu po 10 latach pracy, przy temperaturze metalu koło 600C. W badaniach wykorzystano techniki elektronowej mikroskopii skaningowej, dyfrakcji rentgenowskiej i mikroanalizy rentgenowskiej. Wykazano, że dyfuzji wegla w głąb stali toarzyszy odrdzeniowa dyfuzja pierwiastków węglikotwórczych - chromu i molibdenu....
-
Metal dusting in CCR platforming unit
PublicationPrzedstawiono mechanizm pylenia metalu w stali 9Cr-1Mo w instalacji platformingu CCR, na postawie badań rury podgrzewacza wsadu po 10 latach pracy, przy temperaturze metalu koło 600C. W badaniach wykorzystano techniki elektronowej mikroskopii skaningowej, dyfrakcji rentgenowskiej i mikroanalizy rentgenowskiej. Wykazano, że dyfuzji wegla w głąb stali toarzyszy odrdzeniowa dyfuzja pierwiastków węglikotwórczych - chromu i molibdenu....
-
Usefulness of PCR Melting Profile Method for Genotyping Analysis of Klebsiella oxytoca Isolates from Patients of a Single Hospital Unit
PublicationOpracowanie szybkich i prostych metod typowania jest wymagane w celu identyfikacji potencjalnych źródeł zakażenia ludzi drobnoustrojami oportunistycznymi. Klebsiella spp. należą do grupy bakterii oportunistycznych odpowiedzialnych za wzrost liczby wieloopornych zakażeń szpitalnych. Ostatnio pokazaliśmy wysoką różnorodność genetyczną K. oxytoca używając dużej kolekcji szczepów izolowanych przez 50 lat od pacjentów z kilku szpitali...
-
PCR Melting Profile method for genotyping analysis of vancomycin-resistant Enterococcus faecium isolates from Hematological Unit patients
PublicationW ostatnich latach znacząco wzrasta liczba szczepów Enterococcus opornych na wankomycynę. Stwarzają one problemy medyczne u pacjentów skolonizowanych czy zainfekowanych tymi drobnoustrojami. W przedstawionych badaniach, określiliśmy genetyczne podobieństwo pomiędzy izolatami E. faecium VRE, pozyskiwanymi w okresie od kwietnia 2003 do kwietnia 2005 od pojedynczych pacjentów oddziału Hematologicznego Specjalistycznego Publicznego...
-
PCR-Based Genotyping of Mycobacterium tuberculosis with New GC-Rich Repeated Sequences and IS6110 Inverted Repeats Used as Primers.
PublicationW pracy przedstawiono nową metodę genotypowania Mycobacterium tuberculosis. Zastosowanie oligonukleotydu Mtb1 5'-CCG-GCG-GGG-CCG-GCG-G lub Mtb2 5'-CGG-CGG-CAA-CGG-CGG-C wraz z oligonukleotydami specyficznymi do terminalnych sekwencji elementu insercyjnego IS6110 pozwala na różnicowanie szczepów Mycobacterium tuberculosis w metodzie PCR. Opracowana metoda może być wykorzystana w badaniach epidemiologicznych gruźlicy.
-
Fusion of DNA-binding domain of Pyrococcus furiosus ligase with TaqStoffel DNA polymerase as a useful tool in PCR with difficult targets
PublicationThe DNA coding sequence of TaqStoffel polymer- ase was fused with the DNA-binding domain of Pyrococcus furiosus ligase. The resulting novel recombinant gene was cloned and expressed in E. coli. The recombinant enzyme was purified and its enzymatic features were studied. The fusion protein (PfuDBDlig-TaqS) was found to have enhanced processivity as a result of the conversion of the Taq DNA polymerase from a relatively low processive...
-
Residence time distribution in rapid multiphase reactors
PublicationResidence time distribution (RTD) provides information about average hydraulic residence time and the distribution of material in the reactor. A method for determining RTD for reactors with very short hydraulic residence times is deconvolution based on extraction of real RTD by the analysis of a non-ideal input signal. The mean residence time and dispersion were determined for the spinning fluids reactor (SFR). For the first time...
-
Modeling of event trees for the rapid scenario development
PublicationThe paper concerns the safety of ships in abnormal/damage conditions. Some conclusions following from the research associated with development of a method for safety assessment of ships in abnormal/damage conditions is presented in the paper. The method called SSAMADC (Ship Safety Assessment Method in Abnormal/Damage Conditions) is a risk-based method and is connected with application of the quantitative risk assessment QRA approach....
-
Rapid test for ionic liquids toxicity evaluation
PublicationW literaturze przedmiotu dostępne są dane na temat toksyczności cieczy jonowych, szczególności tych mających zastosowanie przemysłowe, gdzie toksyczność wyrażana jest jako EC50 mierzone względem konkretnego organizmu np. Vibrio fischeri, Daphnia magna itp. Z uwagi na taksonomiczne zróżnicowanie osadu czynnego nie jest możliwe bezpośrednie wnioskowanie na temat toksyczności cieczy jonowych w stosunku do osadu czynnego na podstawie...
-
A rapid assay of human thyroid peroxidase activity
Publication -
Przegląd metod oznaczania pestycydów i PCB w żywności. Methods of determination of pesticides and PCB´s in food - review
PublicationPestycydy i PCB występują w różnych elementach środowiska w dość małych stężeniach, ale związki te ulegają kumulacji i stąd są bardzo niebezpieczne dla zdrowia i życia ludzi i zwierząt. Różnorodność matryc i właściwości fizyko-chemicznych tych związków wymaga stosowania wielu metod przygotowania próbek do analizy i oznaczania. Procedura analityczna składa się z kolejnych bardzo ważnych etapów: pobrania i przygotowania próbki do...
-
Identification of Powdery Mildew Blumeria graminis f. sp. tritici Resistance Genes in Selected Wheat Varieties and Development of Multiplex PCR
Publication -
Enterococci from ready-to-eat food - horizontal gene transfer of antibiotic resistance genes and genotypic characterization by PCR melting profile
Publication -
One-tube cell lysis and DNA extraction procedure for PCR based detection of Mycobacterium ulcerans in aquatic insects, molluscs and fish.
PublicationMycobacterium ulcerans jest bakterią wywołującą choroby skóry u ludzi i zwierząt. W trakcie prowadzonych badań opracowano prostą w wykonaniu metodę ekstrakcji DNA Mycobacterium ulcerans z próbek środowiskowych oraz klinicznych. Opracowana metoda izolacji DNA może być przydatna w badaniu źródeł infekcji oraz dróg szerzenia się Mycobacterium ulcerans.
-
Evaluating Performance and Accuracy Improvements for Attention-OCR
PublicationIn this paper we evaluated a set of potential improvements to the successful Attention-OCR architecture, designed to predict multiline text from unconstrained scenes in real-world images. We investigated the impact of several optimizations on model’s accuracy, including employing dynamic RNNs (Recurrent Neural Networks), scheduled sampling, BiLSTM (Bidirectional Long Short-Term Memory) and a modified attention model. BiLSTM was...
-
Badania nad identyfikacją produktów korozji w instalacji Platformingu CCR = Studies on identification of corrosion products in Platforming CCR unit
PublicationPrzedstawiono badania dotyczące identyfikacji produktów korozji w instalacji Platformingu CCR. Badano próbki pyłów pobrane z wewnętrznej powierzchni rury pieca, z kolektora pieca i katalizatora przeznaczonego do regeneracji. Badania przeprowadzono posługując się techniką dyfrakcji rentgenowskiej i skaningowej mikroskopii elektronowej.
-
Degradacja stali 9CR-1Mo pod wpływem podwyższonej temperatury. Degradation of 9Cr-1Mo steel under the influence of elevated temperature
PublicationBadano charakterystyczne cechy degradacji mikrostruktury i właściwości mechanicznych stali 9Cr-1Mo gat. P9 ASTM SA-335 po eksploatacji w piecu rafineryjnym w temperaturze 390-500 stopni C. Wykazano, że po 30 000 godzin wydłużenie obniżyło się o około 30%. Przyczyną spadku wydłużenia były zmiany mikrostruktury związane z umocnieniem osnowy metalicznej przez chrom oraz wynikające z kruchości odpuszczania stali. Większy spadek wydłużenia...
-
Discovery and characterization of RecA protein of thermophilic bacterium Thermus thermophilus MAT72 phage Tt72 that increases specificity of a PCR-based DNA amplification
Publication -
A New Double Digestion Ligation Mediated Suppression PCR Method for Simultaneous Bacteria DNA-Typing and Confirmation of Species: An Acinetobacter sp. Model
PublicationWe have designed a new ddLMS PCR (double digestion Ligation Mediated Suppression PCR) method based on restriction site polymorphism upstream from the specific target sequence for the simultaneous identification and differentiation of bacterial strains. The ddLMS PCR combines a simple PCR used for species or genus identification and the LM PCR strategy for strain differentiation. The bacterial identification is confirmed in the...
-
Photonic sensor to detect rapid changes in CRP levels
PublicationOne of the most important biomarkers used to determine inflammation is C-reactive protein (CRP). Its level, when it is within the range that does not define inflammation, informs about the risk of cardiovascular events. If the norm is exceeded and inflammation is detected in the body, CRP level can increase 1000 times within a few hours. The type of infection can also be determined based on the level of elevated CRP. All this makes...
-
Electric chips for rapid detection and quantification of nucleic acids
Publication -
Rapid cardiac ischemia detection with an epicardial graphene probe
Publication -
Impeller pump development using rapid prototyping methods
PublicationMetody szybkiego prototypowania przy wspomaganiu komputerowym projektowania 3D wraz z systemami wspomagania inżynierskiego pozwalają uzyskać wyrób o prognozowanych właściwościach technologicznych i użytkowych.W artykule przedstawiono studium przypadku zastosowania metod szybkiego prototypowania w rozwoju elementów pomp wirowych.
-
Hip endhoprothesis development using rapid prototyping methods
PublicationIntegrated product development based on Rapid Prototyping methods, connected with computer aided 3D design and computer aided engineering enables fast and full new product verification and validation. A case study derived from clinical and technological practice using hip implant construction is also included.
-
Product development using rapid prototyping for pump rotors
PublicationW artykule zaprezentowano zastowanie techniki szybkiego prototypowania do wytwarzania fizycznych modeli produktów i ich części składowych oraz prototypów funkcjonalnych, technicznych i wizualnych z pominięciem tradycyjnych technologii mechanicznych jak odlewanie, skrawanie czy też obróbko elektroerozyjna. Przedstawione studium przypadku oparto na rozwoju konstrukcji wirnika pompy począwszy od etapu projektowania poprzez wytwarzanie...
-
ECG-based prediction of ventricular fibrillation by means of the PCA
PublicationA Sudden Cardiac Death (SCD) is a death resulting from cardiac failure with no significant symptoms earlier than one hour before occurrence. It is the cause of for approximately 400000 deaths per year in United States and millions of deaths worldwide. The proposed system, including two-stage algorithm and wearable diagnostic device allows for SCD risk estimation and continuous monitoring of high risk patients. A single channel...
-
Ultradźwiękowy moduł antymaskingu dla czujek ruchu PIR
PublicationPrzedstawiono podstawowe założenia, jakie powinien spełniać moduł funkcji antymaskingu, stosowany wraz z czujnikami ruchu opartymi o technologię PIR, umożliwiający spełnienie podstawowych wymagań zawartych w normach serii EN50131. W oparciu o wymagania, stworzono układ spełniający wszystkie wymagania zawarte w normach i dostosowano go do zainstalowania w istniejących obudowach czujek. W pracy przybliżone zostaną podstawy teoretyczne...