Filtry
wszystkich: 1118
wybranych: 1016
wyświetlamy 1000 najlepszych wyników Pomoc
Wyniki wyszukiwania dla: CHEMICAL STRUCTURE
-
Reverse vaccinology-based prediction of a multi-epitope SARS-CoV-2 vaccine and its tailoring to new coronavirus variants
Publikacja -
Conformational Studies of Two Bradykinin Antagonists by Using Two-dimensional NMR Techniques and Molecular Dynamics Simulations
Publikacja -
Intercalation complex of imidazoacridinone C-1311, a potential anticancer drug, with DNA helix d(CGATCG)2: stereostructural studies by 2D NMR spectroscopy.
PublikacjaImidazoacridinone C-1311 (Symadex®) is a powerful antitumor agent, which successfully made its way through the Phase I clinical trials and has been recommended for Phase II few a years ago. It has been shown experimentally that during the initial stage of its action C-1311 forms a relatively stable intercalation complex with DNA, yet it has shown no base-sequence specificity while binding to DNA. In this paper, the d(CGATCG)2:C-1311...
-
Density functional theory calculations on entire proteins for free energies of binding: Application to a model polar binding site
PublikacjaIn drug optimization calculations, the molecular mechanics Poisson-Boltzmann surface area (MM-PBSA) method can be used to compute free energies of binding of ligands to proteins. The method involves the evaluation of the energy of configurations in an implicit solvent model. One source of errors is the force field used, which can potentially lead to large errors due to the restrictions in accuracy imposed by its empirical nature....
-
Atomic resolution crystal structure of HV-BBI protease inhibitor from amphibian skin in complex with bovine trypsin
Publikacja -
Jahn-Teller and related conical intersections in the benzene radical cation and the monofluoro derivate
PublikacjaThe multi-state multi-mode vibronic interactions in the benzene radical cation and its monofluoro derivative have been investigated theoretically, based on high-level electronic structure calculations for the system parameters and a quantum treatment of the nuclear motion. The available experimental data are well reproduced. The interplay of different vibronic coupling mechanisms is pointed out leading to multiple nonadiabatic...
-
Modeling SARS‐CoV‐2 proteins in the CASP‐commons experiment
PublikacjaCritical Assessment of Structure Prediction (CASP) is an organization aimed at advancing the state of the art in computing protein structure from sequence. In the spring of 2020, CASP launched a community project to compute the structures of the most structurally challenging proteins coded for in the SARS-CoV-2 genome. Forty-seven research groups submitted over 3000 three-dimensional models and 700 sets of accuracy estimates on...
-
Influence of stabilizing osmolytes on hen egg white lysozyme fibrillation
Publikacja-
-
Reverse vaccinology-based prediction of a multi-epitope SARS-CoV-2 vaccine and its tailoring to new coronavirus variants
PublikacjaThe genome feature of SARS-CoV-2 leads the virus to mutate and creates new variants of concern. Tackling viral mutations is also an important challenge for the development of a new vaccine. Accordingly, in the present study, we undertook to identify B- and T-cell epitopes with immunogenic potential for eliciting responses to SARS-CoV-2, using computational approaches and its tailoring to coronavirus variants. A total of 47 novel...
-
Core–shell excitation of isoxazole at the C, N, and O K-edges – an experimental NEXAFS and theoretical TD-DFT study
PublikacjaThe near-edge X-ray absorption fine structure (NEXAFS) spectra of the gas-phase isoxazole molecule have been measured by collecting total ion yields at the C, N, and O K-edges. The spectral structures have been interpreted using time-dependent density functional theory (TD-DFT) with the short-range corrected SRC2-BLYP exchange–correlation functional. Experimental and calculated energies of core excitations are generally in good...
-
The effects of gas exposure on the graphene/AlGaN/GaN heterostructure under UV irradiation
PublikacjaThis work demonstrates a graphene/AlGaN/GaN sensing device with two-dimensional electron gas (2DEG) toward nitrogen dioxide (NO2), tetrahydrofuran, and acetone detection under UV light irradiation. We propose combining measurements of the DC characteristics with a fluctuation-enhanced sensing method to provide insight into the gas detection mechanisms in the synergistic structure of highly stable GaN and gas-sensitive graphene....
-
Tailoring properties of indium tin oxide thin films for their work in both electrochemical and optical label-free sensing systems
PublikacjaThis work is devoted to the identification properties of indium tin oxide (ITO) thin films responsible for their possible application in combined optical and electrochemical label-free sensing systems offering enhanced functionalities. Since any post-processing would make it difficult to identify direct relation between deposition parameters and properties of the ITO films, especially when deposition on temperature-sensitive substrates...
-
Anionic states of C6Cl6 probed in electron transfer experiments
PublikacjaThis is the first comprehensive investigation on the anionic species formed in collisions of fast neutral potassium (K) atoms with neutral hexachlorobenzene (C6Cl6) molecules in the laboratory frame range from 10 up to 100 eV. In such ion-pair formation experiments, we also report a novel K+ energy loss spectrum obtained in the forward scattering giving evidence of the most accessible electronic states. The vertical electron affinity...
-
Molecular dynamics study on the role of solvation water in the adsorption of hyperactive AFP to the ice surface
PublikacjaUsing computer simulations, the early stages of the adsorption of the CfAFP molecule to the ice surface were analyzed. We found that the ice and the protein interact at least as early as when the protein is about 1 nm away from the ice surface. These interactions are mediated by interfacial solvation water and are possible thanks to the structural ordering of the solvent. This ordering leads to positional preference of the protein...
-
Noble metal modified TiO2 microspheres: Surface properties and photocatalytic activity under UV-vis and visible light
PublikacjaComposite photocatalysts that consist of TiO2and noble metal nanostructures have been considered tobe the promising and pivotal material for accessible enhancement of the efficiency in the photocatalyticprocess carried out in the aqueous and gas phases. In this work we fabricated porous TiO2microspheresthrough a hydrothermal process followed by photochemical reduction of noble metal nanoparticles atthe TiO2surface. The morphology...
-
Preparation, characterization and photocatalytic activity of TiO2 microspheres decorated by bimetallic nanoparticles
PublikacjaComposite photocatalysts that consist of TiO2and noble metal nanostructures have been considered tobe the promising and pivotal material for accessible enhancement of the efficiency in the photocatalyticprocess carried out in the aqueous and gas phases. In this work we fabricated porous TiO2microspheresthrough a hydrothermal process followed by photochemical reduction of noble metal nanoparticles atthe TiO2surface. The morphology...
-
Magnetically recyclable TiO2/MXene/MnFe2O4 photocatalyst for enhanced peroxymonosulphate-assisted photocatalytic degradation of carbamazepine and ibuprofen under simulated solar light
PublikacjaIn this study, a novel TiO2/Ti3C2/MnFe2O4 magnetic photocatalyst with dual properties, enabling (i) improved photocatalytic degradation with PMS activation under simulated solar light and (ii) magnetic separation after the degradation process in an external magnetic field was developed and applied for the efficient photodegradation pharmaceutically active compounds (PhACs) frequently present in wastewater and surface waters worldwide. MXene...
-
Redetermination of bis(O,O′-diethyl dithiophosphato-κ2S,S′)nickel(II)
Publikacja -
<i>N,N,N</i>-Trimethyl-N-(methyl 5-deoxy-2,3-<i>O</i>-isopropylidene-β-D-ribofuranosid-5- yl)ammonium 4-methylbenzenesulfonate sesquihydrate.
PublikacjaThe structure of the title compound, [C12H24NO4][C7H7O3S]·1.5H2O, contains alternating layers parallel to (001) of hydrophobic and polar character, stabilized by C-H...O hydrogen bonding. The furan ring adopts an envelope conformation with the C(OMe) atom as the flap, and the dioxolane ring is twisted about one of the O-C(methine) bonds. A comparison to related compounds is presented. The tosylate-O atoms were disordered over two...
-
Bis(diisopropylammonium) thiosulfate and bis(tert-butylammonium) thiosulfate
PublikacjaTwo new dialkylammonium thiosulfates, namely bis(diisopropylammonium) thiosulfate, 2C6H16N+S2O3 2-, (I), and bis(tert-butylammonium) thiosulfate, 2C4H12N+S2O3 2-, (II), have been characterized. The secondary ammonium salt (I) crystallizes with Z = 4, while the primary ammonium salt (II), with more...
-
A study of chirality in bis(1,2-dimethoxyethane-κ^2 O,O')sodium bis(tri-tert-butoxysilanethiolato-κ2O,S)sodate
PublikacjaPraca prezentuje analizę samoorganizacji związku kompleksowego z prostszych jonów na przykładzie silanotiolanosodanu bis(dimetoksyetan)sodu. Stwierdzono, że w anionie (RS)2Na- obie grupy tri-tert-butoksysilanotiolanowe mają tę samą skręcalność - obie (P) lub obie (M). Zjawisko to występuje we wszystkich znanych sodanach i litanach zawierających grupę (tert-BuO)3SiS.
-
O-Pivaloyl diphenylselenophosphinate
PublikacjaTytułowy związek difenyloselenofosfinian O-piwaloilu krystalizuje w układzie jednoskośnym, w grupie P21/c. Jeden z pierścieni fenylowych jest w pozycji periplanarnej do płaszczyzny wiązań Se-P-C, podczas gdy kąt dwuścienny pomiędzy dwoma pierścieniami aromatycznymi wynosi ok. 73 stopni. Geometrię cząsteczki badanego związku porównano z opisanymi w literaturze chemicznej estrami O-alkilowymi i O-arylowymi kwasu difenyloselenofosfinowego.
-
Two pseudopolymorphs of licl trimers with semicubane structures
PublikacjaCząsteczki tytułowych związków w ciele stałym przyjmują strukturę semikubanów - jest to pierwsza tego typu struktura dla solwatowanego chlorku litu. Jej budowę można opisać jako kuban [Li4Cl4(OPEt3)4], w którym jedna z cząsteczek LiCl została usunięta. Brak tej cząsteczki, a dokładniej mostkującego atomu Li, powoduje deformację struktury kubanu. Naroża zdeformowanego kubanu stanowią trzy atomy litu pochodzące z LiCl oraz cztery...
-
Two isomorphic ZnII/CoII complexes with tri-tert-butoxysilanethiol and histamine, and (4-hydroxymethyl-1H-imidazole-κN)bis(tri-tert-butoxysilanethiolato-κ2O,S)zinc(II)
PublikacjaOtrzymano dwa izomorficzne kompleksy cynku(II) i kobaltu(II) z tri-tert-butoksysilanotiolem i histaminą oraz kompleks cynku(II) z tri-tert-butoksysilanotiolem i 4(5)-hydroksymetyloimidazolem. Scharakteryzowano strukturę otrzymanych kompleksów w ciele stałym.
-
μ-4,4'-bipyridyl-1:2κ2N:N'-methanol-2κO-tetrakis(tri-tert-butoxysilanethiolato)-1κ4O,S; 2κ2S-dizinc(II)
PublikacjaTytułowy związek jest dwujądrowym kompleksem, w którym atomy cynku są połączone poprzez mostkujący ligand 4,4'-bipirydyl. Jeden z atomów cynku jest pięcio-koordynowany za pośrednictwem dwóch chelatujących reszt silanotiolanowych oraz 4,4'-bipirydylu. Jako dodatkowy ligand na drugim atomie cynku występuje cząsteczka metanolu.
-
2,2,6,6-Tetramethylpiperidinium pentachlorobenzenethiolate
PublikacjaMetodą rentgenowskiej analizy strukturalnej wyznaczono strukturę krystaliczną i cząsteczkową tytułowego związku. Charakterystycznym motywem struktury determinowanej przez wiązania wodorowe N-H...S, jest izolowany dimer (silanotiol-amina)2.
-
(Di-tert-butylphosphanyl)bis(diphenylphosphanyl)phosphane
PublikacjaCentralny atom fosforu ma konfigurację piramidalną. Wiązania P-P w tytułowym związku wykazują charakter wiązania pojedynczego.
-
Bis(di-n-propylamine-κN)bis(tri-tert -butoxysilanethiolato-κS)chromium(II)
PublikacjaAtom chromu w tytułowym kompleksie jest czterokrotnie koordynowany: przez dwa atomy siarki grup tri-tert-butoksysilanotiolanowych oraz dwa atomy azotu z dwóch cząsteczek di-n-propyloaminy. Atom Cr leży w centrum inwersji w pozycji Wyckoffa a (1/2, 1/2, 1/2).
-
Dichlorido-1Cl,3Cl-hexakis[1,1,2,2,3,3(n5)-methylcyclopentadienyl]di-μ2-oxido-1:2κ2O:O;2:3κ2O:O-trihafnium(IV)
PublikacjaTytułowy związek jest trójrdzeniową cząsteczką. Dwie jednostki (MeCp)2HfCl połączone są z (MeCp)2Hf przez mostki tlenowe. Mostki Hf-O-Hf są prawie liniowe. Geometria trzech atomów Hf jest tetraedryczna.
-
(4-Hydroxymethyl-1H-imidazole-κN3)bis(tri-tert-butoxysilanethiolato-κ2O,S)cadmium(II)
PublikacjaAtom kadmu w tytułowym kompleksie jest koordynowany przez pięć atomów: 2 atomy tlenu i dwa atomy siarki z chelatujących ligandów silanotiolanowych oraz atom azotu pochodnej imidazolu. Kompleks ten jest izostrukturalny z opisanym wcześniej analogicznym związkiem cynku.
-
Chlorido(ethyldiphenylphosphine-P)(1-pyrrolidinecarbodithioato-S,S)nickel(II)
PublikacjaPrzedmiotem publikacji jest struktura krystaliczna tytułowego [NiCl{S2CN(CH2)4}Cl(C14H15P)]. Atom niklu jest w tym przypadku skoordynowany przez S,S-chelatującą resztę ditiokarbaminianową, cząsteczkę fosfiny, zaś geometrię koordynacyjną dopełnia atom chloru.
-
Tetra-n-butylammonium iodido(pyrrolidine-1-carbodithioato-κ2S,S')(tris-tert-butoxysilane-thiolato-κS)cadmate(II)
PublikacjaTytułowy (N,N tetrametylenoditiokarbaminiano)(tri-tert-butoksysilanotiolano)jodokadmian tetra-n-butyloamoniowy krystalizuje w układzie jednoskośnym, w grupie P21/c. W anionie [Cd{SSi(OtBu)3}(S2CNC4H9)I]() wyróżnić można centralny rdzeń o składzie CdS3I. Ułożenie atomów donorowych może być, w pierwszym przybliżeniu, opisane jako zniekształcony (ze względu na obecność S,S'-chelatującego liganda) tetraedr z największym kątem S1-Cd1-S2...
-
O-4-Chlorobenzoyl diphenylselenophosphinate
PublikacjaTytułowy związek difenyloselenofosfinian O-4-chlorobenzoilu krystalizuje w układzie jednoskośnym, w grupie P21/c. Upakowanie molekuł w krysztale wskazuje na oddziaływania van der Waalsa pomiędzy pierścieniami aromatycznymi reszt acylowych. Z kolei kąt dwuścienny pomiędzy pierścieniami fenylowymi reszty fosforowej wynosi 72.64 (14) stopni. Geometrię cząsteczki badanego związku porównano z opisanymi w litaraturze chemicznej estrami...
-
1,1,2,2-Tetrakis(diisopropylamino)diphosphane
PublikacjaTytułowy związek otrzymano w trakcie badań raktywności (i-Pr2N)2P-P(SiMe3)Li z Cp2ZrCl2 (Cp-cyklopentadienyl). Strukturę C24H56N4P2 wyznaczono metodą rentgenowskiej analizy strukturalnej. Wiązanie P-P należy do najdłuższych wśród tego typu wiązań wyznaczonych dla niekoordynowanych difosfanów. W sieci krystalicznej obserwuje się nieuporządkowanie...
-
catena-Poly[[(diethyl ether-kO)lithium(I)]-m-1,1,3,3-tetraisopropyltriphosphane-kP2: k2P1,P3-lithium(I)-m-1,1,3,3-tetraisopropyltriphosphane-k2P1,P3:kP2]
PublikacjaTytułowy związek został otrzymany jako produkt uboczny w reakcji [(Et2PhP)2PtCl2] z iPr2P-P(SiMe3)Li. Jest to drugi znany polimer koordynacyjny w grupie soli litowych trifosfanów. Strukturę związku wyznaczono za pomocą rentgenowskiej analizy strukturalnej.
-
Tetrakis(m2-methanol-k2O:O)bis(methanol-kO)-(m2-tri-tert-butoxysilane-thiolato-k3S:O,S)-bis(tri-tert-butoxysilanethiolato-k2O,S)-tetrasodium(i)
PublikacjaZwiązek [Na4(C12H27O3SSi)4(CH4O)6] jest rozpatrywany jako addukt trzech jonów - dwujądrowego kationu [Na2(MeOH)6]2+ oraz dwóch anionów [Na{SSi(OtBu)3}2] - utworzony dzięki istnieniu krótkich kontaktów pomiędzy tymi jonami.Obecność mostków siarczkowych i tlenkowych oraz wiązań wodorowych O-H...O and O-H...S, sprawia, że w rezultacie wszystkie atomy Na w czterojądrowym kompleksie są pięciokoordynacyjne.
-
Diamminebis(tri-tert-butoxysilanetiolato)cadmium(II) acetonitrile solvate
PublikacjaTytułowy związek jest cząsteczkowym, mieszanym kompleksem kadmu, zawierającym jako ligandy reszty tiolanowe i amoniak. Kadm w kompleksie jest koordynowany tetraedrycznie przez 2 atomy siarki i dwa atomy azotu. Wszystkie atomy wodoru koordynowanych cząsteczek amoniaku oraz jeden z atomów wodoru grupy metylowej acetonitrylu tworzą wiązania wodorowe, które łączą sąsiadujące cząsteczki kompleksu w łańcuchy.
-
Hexa(4-methylphenoxy)disiloxane
PublikacjaTytułowy związek otrzymano jako produkt uboczny w reakcji (p-Tol-O)3SiCl z [PhC(S)S]2Mg*2THF (p-Tol oznacza para-tolil, THF to tetrahydrofuran).Czasteczka posiada symetrię własną -3 i jest przykładem związku o kącie walencyjnym Si-O-Si równym 180 stopni. Omówiono i przedyskutowano rozkład wartości tego kąta w obrębie różnych disiloksanów.
-
Bis(dithiobenzoato-k2S,S')bis(tetrahydrofuran-kO)magnesium(II)
PublikacjaTytułowy związek [Mg(C7H5S2)2(C4H8O)2] został otrzymany w reakcji PhMgBr z nadmiarem CS2. Jest to pierwszy kompleks magnezu zawierający dwa ligandy ditiobenzoesanowe. Kompleks posiada zniekształconą geometrię oktaedryczną.
-
(3,5-Dimethylpyridine)bis(tri-tert-butoxysilanethiolato)cadmium(II)
PublikacjaTytułowy związek jest molekularnym, heteroleptycznym tiolanem kadmu zawierającym jako dodatkowy ligand 3,5-dimetylopirydynę. Jon kadmu(II) znajduje się w centrum bipiramidy o podstawie trójkątnej, utworzonej przez 5 atomów - 2 atomy siarki, 2 atomy tlenu i jeden atom azotu. Między cząsteczkami kompleksu upakowanymi w krysztale nie ma oddziaływań innych niż oddziaływania van der Waalsa.
-
Bromo(dithiobenzoato-k2S,S')tris(tetrahydrofuran-kO)magnesium(II): a redetermination
PublikacjaZwiązek [MgBr(C6H5CS2)(C4H8O)3]zawiera ligand ditiobenzoesowy. Dzięki pomiarom rentgenograficznym w niskiej temperaturze została określona struktura tego związku. Kompleks posiada zniekształconą geometrię oktaedryczną.
-
Bis(tri-tert-butoxysilanethiolato-kS)bis(pyrrolidine-kN)cobalt(II)
PublikacjaReakcja [Co{SSi(OtBu)3}2(NH3)]2 z pyrrolidyną prowadzi do otrzymania kompleksu [Co(C12H27O3SSi)2(C4H9N)2], gdzie atom kobaltu(II) jest koordynowany przez dwie reszty silanotiolanowe i dwie reszty pyrrolidyny. Specyficzne przestrzenne ułożenie wszystkich ligandów dodatkowo daje możliwość utworzenia dwóch wewnątrzcząsteczkowych wiązań wodorowych N-H***O.
-
The 2:1 cocrystal of benzamide and pentafluororbenzoic acid
PublikacjaKrystaliczna struktura centrosymetrycznej supermolekuły składa się z czterech cząsteczek benzamidu oraz dwóch kwasu karboksylowego, które powiązane są ze sobą za pomocą wiązań wodorowych typu O-H...O oraz N-H...O.
-
(2,2'-bipyridine)bis(tri-tert-butoxysilanethiolato-κ2O,S)cadmium(II)
PublikacjaW pracy przedstawiono strukturę heteroleptycznego kompleksu silanotiolanu kadmu(II) z bipirydylem, który krystalizuje w układzie jednoskośnym, w grupie przestrzennej C2/c. Rdzeń kompleksu CdS2O2N2 ze względu na chelatujący charakter reszt silanotiolanowych posiada zniekształconą geometrię oktaedryczną.
-
The first compound with an unusual type of anion, [Li(SR)2]-:bis(µ2-aqua-d2)tetrakis(aqua-d2)]dilithium(I)bis[bis(tri-tert-butoxysilanethiolato-k2O,S)lithate(I)]dihydrate-d2
PublikacjaTytułowy związek [Li2(D2O)6][Li(C9H27SSiO3)2]2*2D2O, jest pierwszym związkiem z wiązaniem S-M (M-metal alkaliczny), zawierającym niespotykany typ anionu litanowego: [Li(SR)2]-,gdzie R=Si{OC{CH3)3}3. Centrum symetrii związku znajduję się pośrodku pierścienia Li2O2 wchodzącego w skład kationu. Wszystkie atomy litu budujące rdzenie kationów - LiO4 i anionów - LiO2S2, są czterokoordynacyjne. Jednoujemne aniony [Li(SR)2]- są dobrze...
-
Hexakis(1-methylimidazole-kN3)iron(II) dichloride dihydrate
PublikacjaTytułowy związek, [Fe(C4H6N2)6]Cl2.2H2O jest izostrukturalny z odpowiednimi związkami Co, Ni i Ru. W kompleksowym kationie żelazo(II) jest koordynowane oktaedrycznie przez sześć ligandów 1-metyloimidazolowych. Jon ujemny jest agregatem dwóch jonów chlorkowych i dwóch cząsteczek wody połączonych wiązaniami wodorowymi.
-
2,2'-(p-Phenylenediimino)dipyridinium dichloride hexahydrate
PublikacjaW krysztale tytułowego związku jony chlorkowe oraz cząsteczki wody oddziałują ze sobą poprzez tworzenie wiązań wodorowych (O-H...O oraz O-H...Cl). Kationy pirydyniowe są czterokrotnym donorem wiązania wodorowego i oddziałują z komponentem anionowym, tworząc polimeryczne, trójwymiarowe struktury.
-
Bis(2-methylquinolinium) tetrachloroferrate(III) chloride
PublikacjaW krysztale współkrystalizują tetrachlorożelazian i chlorek 2-metylochinoliny. Anion tetrachlorożelazianowy wykazuje nieuporządkowanie. W strukturze występują wiązania wodorowe N-H...Cl oraz oddziaływania Fe-Cl...π oraz π...π.
-
Quinolinium tetrachloroferrate(III)
PublikacjaZbadano strukturę krystaliczną tetrachlorożelazianu chinoliny. Jon tetrachlorożelazianowy leży na płaszczyźnie symetrii, a kation chinolinowy wykazuje orientacyjne nieuporządkowanie. W strukturze występują oddziaływania C-H...Cl oraz Fe-Cl...π.
-
(2R)-N-{3-[Bis(methylsulfanyl)methyleneamino]-propionoyl}bornane-10,2-sultam
PublikacjaW strukturze związku tytułowego występują słabe oddziaływania C-H...S oraz C-H...O.