Filtry
wszystkich: 4751
-
Katalog
- Publikacje 4020 wyników po odfiltrowaniu
- Czasopisma 314 wyników po odfiltrowaniu
- Konferencje 43 wyników po odfiltrowaniu
- Osoby 134 wyników po odfiltrowaniu
- Projekty 5 wyników po odfiltrowaniu
- Zespoły Badawcze 1 wyników po odfiltrowaniu
- Kursy Online 82 wyników po odfiltrowaniu
- Wydarzenia 3 wyników po odfiltrowaniu
- Dane Badawcze 149 wyników po odfiltrowaniu
wyświetlamy 1000 najlepszych wyników Pomoc
Wyniki wyszukiwania dla: moleular modelling
-
Separation of zinc from aqueous samples using a molecular imprinting technique
Publikacja -
Molecular differences in mitochondrial DNA genomes of dogs with malignant mammary tumours
Publikacja -
Analysis of molecular structure of starch citrate obtained by a well-stablished method
Publikacja -
Molecular action of isoflavone genistein in the human epithelial cell line HaCaT
Publikacja -
The molecular mechanism of genistein action in lysosomal storage diseases: A transcriptomic approach
Publikacja -
Structure of liquid gold from tight-binding driven molecular-dynamics
PublikacjaPraca przedstawia wyniki symulacji ciekłego złota w nadkomórce periodycznej przy użyciu stworzonego przez autorów programu komputerowego, za pomocą połączonych metod dynamiki molekularnej (MD) i ciasnego wiązania (TB). Omówiono strukturę tak symulowanej cieczy, porównując ją z dostępnymi danymi doświadczalnymi oraz wynikami innych symulacji, pod kątem radialnej i kątowej funkcji rozkładu i elektronowej gęstości stanów.A tight-binding...
-
The FMO analysis of the molecular interaction of fentanyl derivatives with the μ-opioid receptor
Publikacja -
Effect of Nanohydroxyapatite on Silk Fibroin–Chitosan Interactions—Molecular Dynamics Study
PublikacjaFibroin–chitosan composites, especially those containing nanohydroxyapatite, show potential for bone tissue regeneration. The physicochemical properties of these biocomposites depend on the compatibility between their components. In this study, the intermolecular interactions of fibroin and chitosan were analyzed using a molecular dynamics approach. Two types of systems were investigated: one containing acetic acid and the other...
-
Study of the transport properties of a molecular junction as a function of the distance between the leads
Publikacja -
Molecular epidemiology of chronic hepatitis B virus infection in northern Poland
Publikacja -
Molecular dynamics simulations of the growth of poly(chloro-para-xylylene) films
Publikacja -
Theory and Practice of Coarse-Grained Molecular Dynamics of Biologically Important Systems
Publikacja -
Selected molecular and microfluidic aspects of mammalian oocyte maturation-perspectives: a review
Publikacja -
Simulation of the Opening and Closing of Hsp70 Chaperones by Coarse-Grained Molecular Dynamics
Publikacja -
The immunological, biochemical and molecular bases of canine senescence and carcinogenesis: a review
Publikacja -
Albumin–Hyaluronan Interactions: Influence of Ionic Composition Probed by Molecular Dynamics
PublikacjaThe lubrication mechanism in synovial fluid and joints is not yet fully understood. Nevertheless, intermolecular interactions between various neutral and ionic species including large macromolecular systems and simple inorganic ions are the key to understanding the excellent lubrication performance. An important tool for characterizing the intermolecular forces and their structural consequences is molecular dynamics. Albumin...
-
Molecular self-assembly and optical activity of chiral thionooxalamic acid esters
PublikacjaZsyntezowano kilka optycznie czynnych estrów dietylowych kwasu bis(tiooksamowego). Związki te, z powodu ich zdolności do tworzenia ze sobą komplementarnych cyklicznych wiązań wodorowych, są potencjalnie użytecznym materiałem budulcowym większych układów supramolekularnych. Odpowiednie układy modelowe otrzymano z optycznie czynnych 1,2-diamin, które poddano acylowaniu chlorooksooctanem etylu, a następnie otrzymane półprodukty tionowano...
-
Interactions of amphotericin B derivatives with lipid membranes - a molecular dynamics study
PublikacjaW pracy analizowano oddziaływanie dwóch nisko-toksycznych pochodnych amfoterycyny B (związki SAmE i PAmE) z modelami błon lipidowych. Badania wykonane zostały za pomocą dynamiki molekularnej. Modele błon oprócz fosfolipidów DMPC zawierały odpowiednio cholesterol (model błony zwierzęcej) lub ertosterol (model błony grzybowej). Analiza wyników wykazała, że obie pochodne amfoterycyny B zachowują się inaczej w błonie cholesterolowej...
-
Molecular and structural characteristics of cod gelatin films modifiedwith EDC and TGase
PublikacjaCod gelatin films before and after cross-linking of gelatin with 1-ethyl-3-(3-dimethylaminopropyl) carbodiimide (EDC) or transglutaminase (TGase) have been characterized by FT-IR spectroscopy and DSC analysis. For comparison, a film prepared from unmodified pig gelatin has been also analysed. The difference spectra showed that cod gelatin during the film formation involved first of all water-to-amide hydrogen bonds, and the film...
-
Structure and Molecular Dynamics in Renewable Polyamides from Dideoxy-Diamino Isohexide
PublikacjaThe chemical structure, the conformation, andthe flexibility of the polymer chain fragments present in thepolyamides synthesized from 2,5-diamino-2,5-dideoxy-1,4;3,6-dianhydrosorbitol, 1,4-diaminobutane, and either sebacic orbrassylic acid have been studied by liquid-state 2D NMRspectroscopy viz. correlation spectra (COSY) and heteronuclearmultiple-bond correlation spectra (gHMBC), by 13Ccross-polarization/magic-angle spinning...
-
Molecular features of thymidine analogues governing the activity of human thymidine kinase
Publikacja -
Transport deficiency is the molecular basis of Candida albicans resistance to antifungal oligopeptides
Publikacja(FMDP), an inhibitor of glucosamine-6-phosphate synthase, exhibited growth inhibitory activity against Candida albicans, with minimal inhibitory concentration values in the 0.05–50 mg/L range. Uptake by the peptide permeases was found to be the main factor limiting an anticandidal activity of these compounds. Di- and tripeptide containing FMDP (F2 and F3) were transported by Ptr2p/Ptr22p peptide transporters (PTR) and FMDP-containing...
-
The structure of Pb-PbO-SiO2 glass via molecular dynamics simulation
PublikacjaPraca poświęcona jest badaniom struktury blisko i średniozasięgowej częściowo zredukowanego szkła ołowiowo-krzemianowego o stechiometrii 1Pb1PbO1SiO2 uzyskanego na drodze symulacji dynamiczno-molekularnych. Otrzymane rezultaty porównamy z danymi otrzymanymi dla szkła niemodyfikowanego (2PbO1SiO2) i całkowicie zredukowanego (2Pb1SiO2).
-
Ab initio molecular treatment for charge transfer by S3+ ion on hydrogen.
PublikacjaPoliczono adiabatyczne potencjały oddziaływania między jonem siarki i wodoru. Dokonano obliczeń nieadiabatycznych sprzężeń pomiędzy tymi potencjałami. Obliczenia wykazały, że należy wziąć pod uwagę niezbadany wcześniej poziom energetyczny jonu siarki aby dokładnie wyjaśnić mechanizm przechwytu ładunku.
-
Hydration of N-Hydroxyurea from Ab Initio Molecular Dynamics Simulations
PublikacjaN-Hydroxyurea (HU) is an important chemotherapeutic agent used as a first-line treatment in conditions such as sickle cell disease and β-thalassemia, among others. To date, its properties as a hydrated molecule in the blood plasma or cytoplasm are dramatically understudied, although they may be crucial to the binding of HU to the radical catalytic site of ribonucleotide reductase, its molecular target. The purpose of this work...
-
A Molecular dynamics study of the influence of chemical reduction on the structure of amorphous germania
PublikacjaPraca poświęcona jest badaniom struktury blisko- i średniozasięgowej redukowanego amorficznego tlenku germanu o składzie 1Ge 1GeO2 za pomocą symulacji dynamiczno-molekularnych. Symulacje MD realizowano w zespole mikrokanonicznym (NVE), z wykorzystaniem dwuciałowego potencjału oddziaływania miedzyatomowego Borna-Mayera-Hugginsa. Wyraźnie widoczna tendencja do aglomeracji neutralnych atomów Ge została porównana z tendencją do aglomeracji...
-
On the possibility of molecular recognition of taste substances studied by Gabor analysis of oscillations
PublikacjaBadano wpływ substancji odpowiedzialnych za wrażenia smakowe należące do czterech klas smaku (słodki, słony, gorzki i kwaśny) na charakterystyki oscylacyjne w nitrometanowym oscylatorze zawierającym kationowy surfaktant: chlorek benzylodimetylotetradecyloamoniowy. Zapropnowano nowe podejście oparte o transformację Gabora za pomocą której otrzymano widma mocy dla posczególnych układów. Wykazano, że dwuwymiarowa forma tych widm może...
-
The structure of porous and spontaneously densified amorphous PbSiO3: a Molecular Dynamics study.
PublikacjaW pracy zaproponowano nową metodę numerycznego otrzymywania strukturporowatych metodą dynamiki molekularnej. Metoda polega na rozpoczęciu symulacji z ładunkami ekranowanymi i stopniowym zwiększaniu ich do pełnych ładunków jonowych. Metodę zastosowano do układu PbSiO3.
-
Interaction of amphotericin B with phospholipids in the model membrane - molecular dynamics study.
PublikacjaAmfoterycyna B jest antybiotykiem używanym w leczeniu układowych infekcji grzybowych. Jej mechanizm działania polega na tworzeniu kanałów wewnątrz błon lipidowych. W przedstawianej pracy publikowane są wyniki symulacji przeprowadzonej dynamiką molekularną monomerycznej i dimerycznej formy antybiotyku wewnątrz błony lipidowej zbudowanej z cząsteczek DMPC. Wyniki te wskazują, że powinowactwo cząsteczek amfoterycyny wewnątrz dimeru...
-
Molecular differences in mitochondrial DNA (mtDNA) genomes of dogs with malignant mammary tumours
Dane BadawczeThe aim of this study was to determine molecular defects in mitochondrial DNA with the use of large-scale genome analysis in malignant canine mammary gland tumours and indicate whether these changes were linked with the carcinogenesis process. With the use of the NGS technology, we sequenced 27 samples of mtDNA isolated from blood and tumours obtained...
-
Influence of bio-polyols with different molecular weight on properites of PUR-PIR foams
Dane BadawczeThis work attempts to validate the possibility of replacing petrochemical polyols with previously synthesized bio-polyols and their impact on the structure and properties of rigid polyurethane-polyisocyanurate (PUR-PIR). The influence of bio-polyols addition on foam properties was investigated by mechanical testing, Fourier transform infrared spectroscopy...
-
Krzysztof Jan Kaliński prof. dr hab. inż.
OsobyUkończył studia magisterskie na Wydziale Mechanicznym Technologicznym (MT) PG (1980, dyplom z wyróżnieniem). Stopień doktora otrzymał na Wydziale Budowy Maszyn PG (1988, praca wyróżniona), stopień doktora habilitowanego na Wydziale Mechanicznym (WM) PG (2002, praca wyróżniona), a tytuł profesora nauk technicznych – w 2013 r. Od 2015 r. jest profesorem zwyczajnym, a od 2019 r. - profesorem. Obszar jego badań naukowych obejmuje:...
-
Performance-Based Nested Surrogate Modeling of Antenna Input Characteristics
PublikacjaUtilization of electromagnetic (EM) simulation tools is mandatory in the design of contemporary antenna structures. At the same time, conducting designs procedures that require multiple evaluations of the antenna at hand, such as parametric optimization or yield-driven design, is hindered by a high cost of accurate EM analysis. To certain extent, this issue can be addressed by utilization of fast replacement models (also referred...
-
Comparative analysis of various transformation techniques for voiceless consonants modeling
PublikacjaIn this paper, a comparison of various transformation techniques, namely Discrete Fourier Transform (DFT), Discrete Cosine Transform (DCT) and Discrete Walsh Hadamard Transform (DWHT) are performed in the context of their application to voiceless consonant modeling. Speech features based on these transformation techniques are extracted. These features are mean and derivative values of cepstrum coefficients, derived from each transformation....
-
Thermodynamic modeling of combustion process of the internal combustion engines – an overview
PublikacjaThe mathematical description of combustion process in the internal combustion engines is a very difficult task, due to the variety of phenomena that occurring in the engine from the moment when the fuel-air mixture ignites up to the moment when intake and exhaust valves beginning open. Modeling of the combustion process plays an important role in the engine simulation, which allows to predict incylinder pressure during the combustion,...
-
Open Data Capability Architecture - An Interpretive Structural Modeling Approach
PublikacjaDespite of increasing availability of open data as a vital organizational resource, large numbers of startups and organizations fail when it comes to utilizing open data effectively. This shortcoming is attributable to the poor understanding of what types of capabilities are required to successfully conduct data related activities. At the same time, research on open data capabilities and how they relate to one another remains sparse....
-
Modeling the Structure, Dynamics, and Transformations of Proteins with the UNRES Force Field
PublikacjaThe physics-based united-residue (UNRES) model of proteins ( www.unres.pl ) has been designed to carry out large-scale simulations of protein folding. The force field has been derived and parameterized based on the principles of statistical-mechanics, which makes it independent of structural databases and applicable to treat nonstandard situations such as, proteins that contain D-amino-acid residues. Powered by Langevin dynamics...
-
POM/EVA Blends with Future Utility in Fused Deposition Modeling
PublikacjaPolyoxymethylene (POM) is one of the most popular thermoplastic polymers used in the industry. Therefore, the interest in its potential applications in rapid prototyping is understandable. Nevertheless, its low dimensional stability causes the warping of 3D prints, limiting its applications. This research aimed to evaluate the effects of POM modification with ethylene-vinyl acetate (EVA) (2.5, 5.0, and 7.5 wt.%) on its processing...
-
Modeling and Evaluation of Electric Treeing Phenomena in Polymeric Cable Insulation
PublikacjaThis paper investigates the treeing phenomenon in polymeric materials such as crosslinked polyethylene (XLPE) that is widely used in medium and high voltage power cables as primary insulation. The modeling of electrical tree growth in the insulation from its initiation to breakdown is significant research work that illustrates the discharge dynamics and its impact on aging process in polymeric insulation. This study utilizes pulse...
-
Global Surrogate Modeling by Neural Network-Based Model Uncertainty
PublikacjaThis work proposes a novel adaptive global surrogate modeling algorithm which uses two neural networks, one for prediction and the other for the model uncertainty. Specifically, the algorithm proceeds in cycles and adaptively enhances the neural network-based surrogate model by selecting the next sampling points guided by an auxiliary neural network approximation of the spatial error. The proposed algorithm is tested numerically...
-
Mainstream shortcut N removal modeling current status and perspectives
PublikacjaThis work gives an overview of the state-of-the-art in modelling of short-cut processes for nitrogen removal in mainstream wastewater treatment and presents future perspectives for directing research efforts in line with the needs of practice. The modelling status for deammonification (i.e., anammox-based) and nitrite-shunt processes is presented with its challenges and limitations. The importance of mathematical models for considering...
-
Systems, Environments, and Soliton Rate Equations: Toward Realistic Modeling
PublikacjaIn order to solve a system of nonlinear rate equations one can try to use some soliton methods. The procedure involves three steps: (1) find a ‘Lax representation’ where all the kinetic variables are combined into a single matrix ρ, all the kinetic constants are encoded in a matrix H; (2) find a Darboux–Bäcklund dressing transformation for the Lax representation iρ˙=[H,f(ρ)], where f models a time-dependent environment; (3) find...
-
SIMPLIFIED MODELING OF STRESS AND DEFLECTION LIMIT STATES OF UNDERGROUND TANKS
PublikacjaFuel tanks are designed with regard to standard actions and operating conditions. The work analyses the impact of corrosion and other means to variation of stresses and deformation of a horizontal underground tank shell. The computations are preliminary. Due to the long computational time of the entire tank the analysis is restricted to its part only. The full analysis is bound to assess structural reliability, further allowing...
-
Two-Stage Variable-Fidelity Modeling of Antennas with Domain Confinement
PublikacjaSurrogate modeling has become the method of choice in solving an increasing number of antenna design tasks, especially those involving expensive full-wave electromagnetic (EM) simulations. Notwithstanding, the curse of dimensionality considerably affects conventional metamodeling methods, and their capability to efficiently handle nonlinear antenna characteristics over broad ranges of the system parameters is limited. Performance-driven...
-
Numerical modeling of force and contact networks in fragmented sea ice
Publikacja -
Modeling of broadband light source to use with optical coherenttomography system
PublikacjaW pracy przedstawiono modelowanie źródeł szerokopasmowych na potrzeby systemów koherentnej tomografii optycznej z punktu widzenia uzyskiwanej zdolności podłużnej i jakości otrzymywanych obrazów. Pokazano na przykładzie źródła szerokopasmowego wykorzystującego światłowód fotoniczny do generacji w wyniku zjawisk nieliniowych ''supercontinuum'' wpływ kształtowania wiązki na możliwości pomiarowe systemu OCT.
-
Modeling of production planning and control process consistent with theory of constraint
PublikacjaArtykuł dotyczy problematyki zastosowania metody werbel-bufor-lina do planowania produkcji w systemach produkcyjnych z wielokrotnymi buforami. W artykule przedstawiono algorytm - jego funkcje, dane wejściowe i wyjściowe - który może mieć zastosowanie do modelowania procesu planowania i sterowania produkcją. Algorytm umożliwia określenie wielkości czasowych buforów w systemie oraz terminów rozpoczęcia i zakończenia realizacji zadań....
-
Carotenoid binding to proteins: Modeling pigment transport to lipid membranes
Publikacja -
Modeling Heat Transfer in Heterogeneous Media Using Fractional Calculus
Publikacja -
Anomalous diffusion modeling using ultracapacitors in domino ladder circuit
Publikacja