Filters
total: 25659
filtered: 20488
-
Catalog
- Publications 20488 available results
- Journals 51 available results
- Conferences 3 available results
- Publishing Houses 5 available results
- People 721 available results
- Inventions 102 available results
- Projects 288 available results
- Laboratories 18 available results
- Research Teams 43 available results
- Research Equipment 8 available results
- e-Learning Courses 1963 available results
- Events 610 available results
- Open Research Data 1359 available results
Chosen catalog filters
displaying 1000 best results Help
Search results for: RNA SEQUENCING
-
Influence of Selected Factors on the Survival Assessment and Detection of Giardia intestinalis DNA in Axenic Culture
Publication -
A highly thermostable, homodimeric single-stranded DNA-binding protein from Deinococcus radiopugnans
PublicationWe report the identification and characterization of the single-stranded DNA-binding protein (SSB) from the mesophile and highly radiation-resistant Deinococcus radiopugnans (DrpSSB). PCR-derived DNA fragment containing the complete structural gene for DrpSSB protein was cloned and expressed in Escherichia coli. The gene consisting of an open reading frame of 900 nucleotides encodes a protein of 300 amino acids with a calculated...
-
Smart Decisional DNA Technology to Enhance Industry 4.0 Environment in Conjunction with Conventional Manufacturing
PublicationKnowledge-based support has become an indispensable part not only to the traditional manufacturing set-ups but also to the new fast-emerging Industry 4.0 scenario. In this regard, successful research has been performed and extensively reported to develop Decisional DNA based knowledge representation models of engineering object and engineering process called Virtual engineering object (VEO), Virtual engineering process (VEP) and...
-
DNA restriction analysis as a supportive tool in mechanistic studies carried out by 32P-postlabelling
PublicationNumerous antitumor and carcinogenic compounds are able to modify DNA by forming covalent bonds with its constituents, while some anticarcinogenic compounds are known to prevent such a modification. All these processes are of vital biological import_ance, though deeper inside into factors influencing formation of DNA adducts is difficult due to the low level of their occurrence. 32P-Postlabelling approach ensures very sensitive...
-
DNA methylation as a mediator of HLA-DRB1*15:01 and a protective variant in multiple sclerosis
PublicationThe human leukocyte antigen (HLA) haplotype DRB1*15:01 is the major risk factor for multiple sclerosis (MS). Here, we find that DRB1*15:01 is hypomethylated and predominantly expressed in monocytes among carriers of DRB1*15:01. A differentially methylated region (DMR) encompassing HLA-DRB1 exon 2 is particularly affected and displays methylation-sensitive regulatory properties in vitro. Causal inference and Mendelian randomization...
-
Effect of osmolytes of different type on DNA behavior in aqueous solution. Experimental and theoretical studies
PublicationOsmolytes, the small organic molecules accumulated in cells under environmental stress, can modulate the stability of biopolymers such as proteins and DNA. In spite of many years of research, there is no established molecular mechanism of the influence of osmolytes on DNA structure. Here, we used two model osmolytes that denature (urea) or stabilize (trimethylglycine, TMG) proteins to study their effect on DNA in aqueous solutions...
-
Synthesis, structure, DNA binding and anticancer activity of mixed ligand ruthenium(II) complex
PublicationIn order to obtain a potential chemotherapeutic which is not affected on the normal BALB/3T3 cell line, a new arene ruthenium(II) complex {[RuCl(L1)(η6-p-cymene)]PF6}2 · H2O has been synthesized by a direct reaction of precursor, [{(η6-p-cymene)Ru(μ-Cl)}2Cl2], with N,N-chelating ligand (L1 - 2,2′-bis(4,5-dimethylimidazole). The compound has been fully characterized by elemental analysis, X-ray diffraction, IR, UV–Vis and 1H, 13C...
-
Quantitative fluorescent determination of DNA – Ochratoxin a interactions supported by nitrogen-vacancy rich nanodiamonds
PublicationOchratoxin A (OTA) is a hazardous contaminant of a large variety of plant and animal originated food. Herein, we report an interaction of OTA with calf thymus DNA (ct DNA) on the nanodiamond surface. We employed multispectroscopic techniques to elucidate the binding mechanism of OTA with ct DNA. The fluorescence and UV–Vis spectroscopy results show that OTA binds to ds ct DNA and forms complexes. We obtained the binding constants...
-
From Individual to Collective: Intelligence Amplification with Bio-Inspired Decisional DNA and its Extensions
PublicationIn nature, deoxyribonucleic acid (DNA) contains the genetic instructions used in the development and functioning of all known living organisms. The idea behind our vision is to develop an artificial system, an architecture that would support discovering, adding, storing, improving and sharing information and knowledge among agents and organizations through experience. We propose a novel Knowledge Representation (KR) approach in...
-
Principles and applications of Ligation Mediated PCR methods for DNA-based typing of microbial organisms
PublicationA significant number of DNA-based techniques has been introduced into the field of microorganisms’ characterization and taxonomy. These genomic fingerprinting methods were developed to detect DNA sequence polymorphisms by using general principles, such as restriction endonuclease analysis, molecular hybridization, and PCR amplification. In recent years, some alternative techniques based on ligation of oligonucleotide adapters before...
-
Set of Experience Knowledge Structure (SOEKS) and Decisional DNA (DDNA): Past, Present and Future
PublicationThis article reviews research work on set of experience knowledge structure (SOEKS)-decisional DNA (DDNA) done in the past, ongoing, and planned for the future. Firstly, the concept of the knowledge representation technique of SOEKS-DDNA is discussed, and then an attempt is made to organize the past research related with it in chronological order. This work focuses on the review on SOEKS-DDNA, its application in different domains,...
-
Manufacturing collective intelligence by the means of Decisional DNA and virtual engineering objects, process and factory
PublicationEngineering collective intelligence is paramount in current industrial times. This research proposes and presents case studies for collective knowledge structures required in the industry field. Knowledge structures such as Set of Experience and Decisional DNA are extended into more advanced knowledge structures for manufacturing processes. These structures are called Virtual Engineering Object, Virtual Engineering Process and...
-
Decisional DNA for modeling and reuse of experiential clinical assessments in breast cancer diagnosis and treatment
PublicationClinical Decision Support Systems (CDSS) are active knowledge resources that use patient data to generate case specific advice. The fast pace of change of clinical knowledge imposes to CDSS the continuous update of the domain knowledge and decision criteria. Traditional approaches require costly tedious manual maintenance of the CDSS knowledge bases and repositories. Often, such an effort cannot be assumed by medical teams, hence...
-
Low-energy positron scattering from DNA nucleobases: the effects from permanent dipoles
PublicationAb initio quantum calculations for low-energy positron scattering from gas-phase isolated molecular nucleobases which are part of the DNA structure are presented and discussed over the range of 1 eV to 25 eV. The calculations report the integral cross sections (ICSs) and the momentum-transfer cross sections (MTCSs) for Adenine, Guanine, Thymine and Cytosine. The calculations show very clearly the important role of the dominant...
-
Bio-inspired Decisional DNA in Machinas and other Man-made Systems: The Way Forward
PublicationArtificial bio-inspired intelligent techniques and systems supporting smart, knowledge-based solutions of real world problems which are currently researched very extensively by research teams around the world, have enormous potential to enhance automation of decision making and problem solving for a number of diverse areas including design, manufacturing, Information Technology (IT), social communities of practice, and economics...
-
Covalent DNA modification by products of myrosinase catalysed glucosinolate degradation in cell-free system
PublicationThe bioactive phytochemicals found in Brassica vegetables belonging to glucosinolates (GLS) and especially the products of their degradation isothiocyanates (ITC) and indoles are regarded as the most promising cancer chemopreventive compounds. These secondary metabolites constitute defence system repelling or preventing the development of agrophages attacking brassica plants. The antibiological properties of these compounds suggest...
-
Novel single-stranded DNA-binding protein from psyvhrophilic bacterium Psychrobacter arcticus
PublicationTo study the biochemical properties of SSB from Psychrobacter arcticus (ParSSB), we have cloned the ssb genes obtained by PCR and have developed Escherichia coli overexpression systems. The gene consists of an open reading frame of 642 nucleotides encoding SSB protein of 213 amino acids with a calculated molecular mass of 22.8 kDa. The amino-acid sequence of ParSSB exhibits 49% identity and 57% similarity to Escherichia coli SSB....
-
Thermodynamic, Anticoagulant, and Antiproliferative Properties of Thrombin Binding Aptamer Containing Novel UNA Derivative
PublicationThrombin is a serine protease that plays a crucial role in hemostasis, fibrinolysis, cell proliferation, and migration. Thrombin binding aptamer (TBA) is able to inhibit the activity of thrombin molecule via binding to its exosite I. This 15-nt DNA oligonucleotide forms an intramolecular, antiparallel G-quadruplex structure with a chair-like conformation. In this paper, we report on our investigations on the influence of certain...
-
Zastosowanie immobilizowanego białka MutS do wychwytywania fragmentów DNA zawierających niesparowane zasady
PublicationBiałko MutS wiąże DNA zawierające błędnie sparowane oraz niesparowane zasady w DNA. Podjęto szereg prób wykorzystania tego białka jako narzędzia do detekcji nieznanych mutacji lub zagęszczania frakcji DNA z niesparowaną zasadą. Dotychczas żadna z metod oparta na użyciu białka MutS nie została wdrożona powszechnie do praktyki laboratoryjnej. Głównym powodem takiego stanu rzeczy jest stosunkowo silne powinowactwo MutS do DNA w pełni...
-
Zastosowanie zmodyfikowanej metody Prony'ego do detekcji dna morskiego i obiektów podwodnych
PublicationW artykule zaprezentowano zastosowanie nowej (zaproponowanej przez autorów) modyfikacji metody Prony'ego do określenia kierunku przyjścia sygnału echa fali akustycznej docierającego do odbiorczego przetwornika hydroakustycznego. Wykorzystanie zaproponowanej metody, umożliwia lepsze, niż za pomocą dotychczas znanych metod, określenie położenia wielu źródeł rewerberacji jednocześnie, zapewniając tym samym niezakłócone działanie w...
-
Dominant Pathways of Adenosyl Radical-Induced DNA Damage Revealed by QM/MM Metadynamics
PublicationBrominated nucleobases sensitize double stranded DNA to hydrated electrons, one of the dominant genotoxic species produced in hypoxic cancer cells during radiotherapy. Such radiosensitizers can therefore be administered locally to enhance treatment efficiency within the solid tumor while protecting the neighboring tissue. When a solvated electron attaches to 8-bromoadenosine, a potential sensitizer, the dissociation of bromide...
-
Set of Experience and Decisional DNA: Toward Brains for Cyber-physical Systems and Industry of the Future
PublicationThe concept of Decisional DNA is decade old. This article introduces the initial idea of Set of Experience Knowledge Structure, its advancement into Decisional DNA, and its potential for real life applications in divers domains. The most current and future research steps into Industry 4.0 are also presented and discussed
-
Tecnología y Democracia ¿Un amor de pandemia o una relación estable?
PublicationPrologar una obra como esta es un privilegio y una responsabilidad. Es un privilegio en tanto que da paso a un seguido de contribuciones de gran calado y relevancia académica que contribuyen a la mejora del conocimiento existente acerca de la relación entre la tecnología y el funcionamiento de la democracia. Es una responsabilidad en el sentido que debe poner sobre la mesa algunas de las cuestiones abiertas de la disciplina y como...
-
Effects of metallic silver particles on resonance energy transfer between fluorophores bound to DNA.
PublicationZbadano wpływ filmów wysepek metalicznego srebra na rezonansowe przekazywanie energii między fluoroforami związanymi z DNA. Donorem i akceptorem były odpowiednio 4´,6 diamidyno-2-fenylindon i jodek propydyny. Zmierzone dla tego układu czasy zaniku i widma fluorescencji pokazują, że sąsiedztwo cząstek srebra dramatycznie zwiększa promień Forstera, a tym samym i przekazywanie energii w znakowanym DNA.
-
Electrochemical formation of the adduct between antitumor agent C_1311 and DNA nucleoside dG. 75.
PublicationPrzyjmuje się, że metaboliczna aktywacja przeciwnowotworowej pochodnej C_1311 jest procesem koniecznym dla jej aktywności przeciwnowotworowej. Wykazano wcześniej, że taka aktywacja prowadzi do kowalencyjnego wiązania się leku z DNA w komórce nowotworowej. Aby zbadać molekularny mechanizm powyższej reakcji metabolicznej przeprowadzono badania elektrochemicznego utleniania pochodnej C_1311. Wykazano w pracy, że dwa produkty elektrochemicznego...
-
Transcriptomic landscape of blood platelets in healthy donors
PublicationBlood platelet RNA-sequencing is increasingly used among the scientific community. Aberrant platelet transcriptome is common in cancer or cardiovascular disease, but reference data on platelet RNA content in healthy individuals are scarce and merit complex investigation. We sought to explore the dynamics of platelet transcriptome. Datasets from 204 healthy donors were used for the analysis of splice variants, particularly with...
-
Transcriptomic landscape of blood platelets in healthy donors
PublicationBACKGROUND Blood platelet RNA-sequencing is increasingly used among the scientific community. Aberrant platelet transcriptome is common in cancer or cardiovascular disease, but reference data on platelet RNA content in healthy individuals are scarce and merit complex investigation. METHODS We sought to explore the dynamics of platelet transcriptome. Datasets from 204 healthy donors were used for the analysis of splice variants,...
-
Badania modelowe wpływu zbrojenia gruntu na stateczność fundamentów bezpośrednich posadowionych na koronie zbocza
PublicationW artykule scharakteryzowano stanowisko badawcze, metodykę własnych badań modelowych, oraz zastosowane w nich grunt i zbrojenie. Przedstawiono również wstępne wyniki jakościowe i ilościowe przeprowadzonych badań modelowych wraz z ich analizą
-
Chirurgiczne leczenie chorych na raka pęcherzyka żółciowego: doświadczenia własne na podstawie 16 przypadków
Publication -
Mocz ludzki jako źródło informacji na temat narażenia człowieka na różnorodne czynniki chemiczne
PublicationMocz - jest to wydzielina wytwarzana przez nerki w ilości ok. 1500 ml na dobę; płyn zawierający oprócz wody (95%) szkodliwe i zbędne produkty przemiany materii. Mocz jest materiałem biologicznym niezwykle bogatym w niezbędne informacje na temat funkcjonowania organizmu człowieka i efektów narażenia na szkodliwe substancje pochodzące z otaczającego środowiska. Ze względu na swoje właściwości, prosty sposób pobierania próbki, który...
-
Architektura drewniana na Żuławach : na marginesie polsko - holenderskich warsztatów Wydziału Architektury Politechniki Gdańskiej
Publication -
Hydrogeochemia strefy kontaktu wód słono-słodkich na wybrzeżu Bałtyku na przykładzie rejonu Ustki
PublicationOpisana strefa kontaktu wód słodkich ze słonymi w rejonie Ustki zachodzi w warunkach wnikania zasolonych wód kanału rzeki Słupi do płytkiej warstwy wodonośnej. Ta sytuacja zachodzi głownie w okresie podpiętrzenia wód kanału przez morze w czasie jesienno-zimowych sztormów. W Ustce stwierdzono wyraźną zmienność czasową i przestrzenną składu chemicznego wód podziemnych płytkiej warstwy wodonośnej. Wzrost stężeń mineralizacji ogólnej...
-
Wpływ rodzaju fazy zdyspergowanej na właściwości tribologiczne smarów plastycznych wytworzonych na oleju lnianym
Publication -
Wpływ wymuszeń mechanicznych na zmianę właściwości tribologicznych smarów plastycznych wytworzonych na bazie mineralnej
Publication -
Formułowanie strategii rozwoju przedsiębiorstw działających na rynku międzynarodowym na przykładzie polskiej żeglugi promowej
PublicationCelem artykułu jest prezentacja sytuacji polskich przedsiębiorstw żeglugi promowej na tle rynku bałtyckiego oraz sformułowanie strategii marketingowych umożliwiających ich rozwój a także funkcjonowanie na trudnym rynku międzynarodowym.
-
Odpowiedzi na najczęściej zadawane pytania na temat norm ISO serii 9000. Zagadnienia ogólne
PublicationPrzedstawiono odpowiedzi na często zadawane pytania dotyczące ogólnych zagadnień związanych z systemami zarządzania jakością wg norm ISO serii 9000.
-
Analiza redystrybucji środków finansowych przeznaczonych na działalność B+R (na przykładzie wybranej uczelni)
PublicationAutor zwraca uwagę na wyjątkowo niskie finansowanie działalności B+R w Polsce na tle innych krajów nowo przyjętych do UE. Przeprowadza analizę redystrybucji tych skromnych środków w skali Polski oraz na przykładzie konkretnej uczelni. Dostrzega dwa charakterystyczne zjawiska, określona jako asymetrie. Pierwsze-dotyczące podziału tych środków między szkoły wyższe, jednostki badawczo-rozwojowe i placówki PAN. Drugie - dotyczące struktury...
-
Strojenie modeli rozmytych z wykorzystaniem metod opartych na klastervzacii na przykładzie problemu zarządzania.
PublicationW artykule rozważa się zagadnienie strojenia modelu rozmytego zarządzania przedsięwzięciami informatycznymi, wskazując na metody, które zapewniają wysoką dokładność otrzymywanych wyników, przy możliwie niedużym nakładzie obliczeń. W pierwszej kolejności stosuje się podejścia, które wynikają z intuicji i doświadczenia autorów, oparte na twardej metodzie jednowymiarowej klasteryzacji K-means z wykorzystaniem trójkątnego kształtu...
-
Wpływ teorii chaosu na niektóre tradycyjne stanowiska ontologiczne oraz na spór o redukcjonizm
PublicationTeoria chaosu stanowi nie tylko nowy paradygmat w nauce, ale także inspirację do badań filozoficznych nad rzeczywistością. W artykule podjęto próbę zarysowania głównych założeń teorii chaosu oraz określenia jej wpływu na niektóre tradycyjne stanowiska ontologiczne oraz spór o redukcjonizm. Z punktu widzenia ontologii, w dynamice nieliniowej szczególnie interesujący jest powrót do ciągłościowego monoizmu w opozycji do atomizmu....
-
System sterowania zamknięcia segmentowego z przeciwwagą na stopniu wodnym Łapino na rzece Raduni
PublicationKaskada Raduni jest cennym zabytkiem budownictwa wodnego, na której można spotkać bardzo rozmaite konstrukcje hydrotechniczne. Przedstawiono oryginalną konstrukcję zamknięcia segmentowego z przeciwwaga i sposobu jego sterowania.
-
Wpływ temperatury na zależność pomiędzy wytrzymałością zapraw na ściskanie a ilością wydzielonego ciepła hydratacji
PublicationPomiar szybkości oraz ilości wydzielonego ciepła za pomocą kalorymetru izotermicznego stanowi precyzyjne narzędzie do oceny kinetyki hydratacji kompozytów cementowych: zaczynów, zapraw i betonów. Szereg badań naukowych wskazuje, że ilość wydzielonego ciepła pozostaje w korelacji z wytrzymałością na ściskanie w zależności od czasu dojrzewania. W pracy przedstawiono wyniki badań kalorymetrycznych i wytrzymałościowych zaprawy na bazie...
-
Możliwości zastosowania zasobnikowych jednostek trakcyjnych na liniach kolejowych na przykładzie Pomorskiej Kolei Metropolitalnej
PublicationW artykule zwrócono uwagę, że zasobniki stosowane głównie do rekuperacji energii, mogą być również wykorzystane do zasilania pociągów na niezelektryfikowanych i zelektryfikowanych odcinkach linii kolejowych. Innowacyjność tego rozwiązania wykazano na podstawie dwóch aplikacji kolejowych elektrycznych zasobnikowych jednostek trakcyjnych: pierwszej funkcjonującej od 2014 roku na linii Utsunomiya – Karasuyama w Japonii oraz drugiej,...
-
Deformacje filtracyjne i ich oddziaływanie na osiadanie podłoża na przykładzie zabytkowego obiektu sakralnego
PublicationW artykule omówiono studium przypadku wykorzytując dane dotyczzące pęknięć i deformacji w zabytkowym budynku oraz przecieków wody w jego podłozu. Przedstawiono charakterytykę deformacji filyracyjnych gruntu z uwagi na jego rodzaj i przyczynę. Na podstawie danych z monitoringu poziomu wody gruntowej w okolicach obiketu przeanalizowano przecieki i wyznaczono strefy w których przekroczone zostało kryterium inicjacji procesu deformacji...
-
Wpływ temperatury powietrza na energochłonność elektrycznego transportu miejskiego na przykładzie gdyńskiej komunikacji trolejbusowej
PublicationMała sprawność silników cieplnych umożliwia ogrzewanie wnętrza autobusów i innych pojazdów napędzanych paliwami płynnymi i gazowymi energią chłodzenia układu. W odróżnieniu od silników spalinowych, elektryczne układy napędowe charakteryzują się wysoką sprawnością energetyczną, która w obecnym rozwoju techniki osiąga poziom 90–95%. Oznacza to, że ogrzewanie wnętrza pojazdu możliwe jest jedynie za pomocą energii elektrycznej pobieranej...
-
Wpływ napięcia takielunku na odkształcenia kadłuba jachtu regatowego na przykładzie jednostki klasy Omega
PublicationPrzedstawiono problem deformacji kadłuba pod wpływem sił generowanych przez takielunekj, w kontekście przepisów klasowych oraz pożądanych i niepożądanych własności konstrukcyjnych kadłuba.
-
Badania przelewowe na wale eksperymentalnym DREDGDIKES w Gdańsku – wytrzymałość powierzchni wału na erozję
PublicationW pracy opisano eksperymentalne badania erozjyjności okrywy roślinnej wału testowego w ramach projektu DREDGDIKES. Eksperymenty przelewowe wykonano, instalując po stronie odpowietrznej wału dwa identyczne kanały, służące do badań odporności na erozję okrywy roślinnej oraz warstw okrywowych zbudowanych z gliny, a także kompozytów na bazie UPS. Kanały zaprojektowano zgodnie z normą ASTM D 6460.
-
Analiza wpływu generacji wiatrowej na cenę rozliczeniową odchylenia na rynku bilansującym w Polsce
PublicationTematem artykułu jest analiza wpływu generacji wiatrowej na ustalanie się Ceny Rozliczeniowej Odchylenia (CRO) na Rynku Bilansującym (RB) w Polsce. Autorzy we wstępie swej pracy przestawiają stan aktualny energetyki wiatrowej oraz wyjaśniają sposób ustalania się ceny na Rynku Bilansującym. Poruszają tematykę przesuwania się stosu jednostek wytwórczych, który ich zdaniem zależy bezpośrednio od aktualnych warunków pracy wiatrowych...
-
Zmiany składu chemicznego wód podziemnych na obszarach sandrowych na przykładzie rejonu Borów Tucholskich
PublicationW artykule przedstawiono wyniki badań, których celem jest analiza zmienności składu chemicznego wód podziemnych poziomu sandrowego na tle naturalnego tła hydrogeochemicznego. Badaniami objęto obszar sandru Brdy i sandru Wdy, które znajdują się w granicach mezoregionu Borów Tucholskich. Porównano wyznaczone wcześniej naturalne tło hydrogeochemiczne do aktualnego składu chemicznego wód podziemnych poziomu sandrowego. Stwierdzono...
-
Badania symulacyjne wpływu sterowania ruchem na wykorzystanie energii hamowania pojazdów na przykładzie metra
PublicationPrzedstawiono modele sieci zasilającej oraz poruszających się pociągów metra, opracowane dla potrzeb badań symulacyjnych wpływu odpowiedniego sterowania ruchem na stopień wykorzystania energii hamowania odzyskowego w komunikacji miejskiej. Porównywano energię pobraną z sieci i całkowity czas przejazdu dla wykonania zadanej pracy przewozowej przy różnych algorytmach sterowania ruchem pociągów. Zaproponowano warianty sterowania w...
-
Możliwości przyrządów wirtualnych na przykładzie programu do pomiaru i analizy drgań na statkach.
PublicationOmówiono rozwój przyrządów wirtualnych stosowanych w diagnostyce, wynikający z rozwoju narzędzi do ich programowania. Przedstawiono oprogramowanie do pomiaru i analizy drgań na statkach. Umożliwia ono analizę zarejestrowanych sygnałów w funkcji czasu, częstotliwości i prędkości obrotowej wału silnika.