Filtry
wszystkich: 898
-
Katalog
- Publikacje 810 wyników po odfiltrowaniu
- Czasopisma 2 wyników po odfiltrowaniu
- Osoby 24 wyników po odfiltrowaniu
- Wynalazki 3 wyników po odfiltrowaniu
- Projekty 3 wyników po odfiltrowaniu
- Kursy Online 21 wyników po odfiltrowaniu
- Wydarzenia 6 wyników po odfiltrowaniu
- Dane Badawcze 29 wyników po odfiltrowaniu
Wyniki wyszukiwania dla: aminy myjace
-
Tin Oxide Encapsulated into Pyrolyzed Chitosan as a Negative Electrode for Lithium Ion Batteries
PublikacjaTin oxide is one of the most promising electrode materials as a negative electrode for lithium-ion batteries due to its higher theoretical specific capacity than graphite. However, it suffers lack of stability due to volume changes and low electrical conductivity while cycling. To overcome these issues, a new composite consisting of SnO2 and carbonaceous matrix was fabricated. Naturally abundant and renewable chitosan was chosen...
-
Miasto w kontekście uchwał krajobrazowych
PublikacjaKrajobraz miejski jest zjawiskiem wizualnym, które oddaje charakter przestrzeni, a także określa jej tożsamość. Niestety, zagraża mu jednak powszechny chaos, przekładający się na negatywny wizerunek miasta. Za jedną z jego najistotniejszych przyczyn uznaje się ogromną liczbę reklam umieszczanych dowolnie w przestrzeni publicznej. Mimo że informacja wizualna stanowi nieodłączny element współczesnego miasta, istnieje głęboka potrzeba...
-
Hydroperoxyl radical and formic acid formation from common DNA stabilizers upon low energy electron attachment
Publikacja2-Amino-2-(hydroxymethyl)-1,3-propanediol (TRIS) and ethylenediaminetetraacetic acid (EDTA) are key components of biological buffers and are frequently used as DNA stabilizers in irradiation studies. Such surface or liquid phase studies are done with the aim to understand the fundamental mechanisms of DNA radiation damage and to improve cancer radiotherapy. When ionizing radiation is used, abundant secondary electrons are formed...
-
Synthesis of 7-oxo-7h-naphto[1,2,3-de]quinoline derivatives as potential anticancer agents active on multidrug resistant cell lines
PublikacjaOpierając się na naszym wcześniejszym stwierdzeniu, że tetracykliczne analogi antrachinonów z wbudowanym pierścieniem pirydynowym wykazują aktywną cytotoksyczność względem komórek z indukowaną opornością, przeprowadzono syntezę pochodnych 7-oxo-7h-nafto[1,2,3-de]chinoliny (3, 6-8, 10-12, 14,15 i 18) posiadających jeden lub dwa zasadowe łańcuchy boczne i różne podstawniki w pierścieniu pirydynowym, związków o potencjalnym działaniu...
-
Synthesis of amides under microwave irradiation
PublikacjaAmides belong to the most important carboxylic acid derivatives. They are constituents of natural compounds like peptides and proteins. They found applications in many branches of science and industry, especially in pharmaceutical and polymer science. Conventional procedures for amide preparation involve reaction between amine and carboxylic acid or their more active derivatives such as acid chlorides, acid anhydrides or esters....
-
Novel primosomal protein B from thermophilic bacterium Thermoanerobacter tengcongensis
PublikacjaWe report the identification and characterization of theprimosomal protein B (PriB) from thermophilic bacteriumThermoanerobacter tengcongensis (TtePriB). It is the largestknown bacterial PriB protein consisting 216 amino acidresidues with a calculated molecular mass of 25 kDa. Surprisingly,it is functional as monomer containing two single-stranded DNA binding domain (OB-fold) and it is thecompletely new kind structure of SSB protein....
-
Interactions of fish gelatin and chitosan in uncrosslinked and crosslinked with EDC films: FT-IR study
PublikacjaFilms based on fish gelatin, chitosan and blend of fish gelatin and chitosan before and after cross-linking with EDC have been characterized by FT-IR spectroscopy. The FT-IR spectrum of fish gelatin film showed the characteristic amide I, amide II and amide III bands, and the FT-IR spectrum of chitosan film confirmed that the polymer was only a partially deacetylated product, and included CH3-C=O and NH2 groups, the latter both...
-
Usefulness of Toxoplasma gondii recombinant antigens (GRA1, GRA7 and SAG1) in an immunoglobulin G avidity test for the serodiagnosis of toxoplasmosis
PublikacjaOpisano wykorzystanie mieszanki trzech antygenów rekombinantowych (GRA1, GRA7 i SAG1) Toxoplasma gondii w serodiagnostyce toksoplazmozy z wykorzystaniem oznaczenia awidności przeciwciał klasy IgG. Zastosowana mieszanka może z powodzeniem zastąpić całkowity lizat antygenów natywnych który obecnie stosowany jest w komercyjnie dostępnych zestawach. Ponadto wykazano, że zastosowane antgeny rekombinantowe różnicują fazy choroby lepiej...
-
Removal of lead ions from wastewater using lanthanum sulfide nanoparticle decorated over magnetic graphene oxide
PublikacjaIn this study, the new lanthanum sulfide nanoparticle (La2S3) was synthesized and incorporated onto magnetic graphene oxide (MGO) sheets surface to produce potential adsorbent (MGO@LaS) for efficient removal of lead ions (Pb2+) from wastewater. The synthesized MGO@LaS adsorbent was characterized using Fourier transform infrared spectroscopy, field emission scanning electron microscopy and energy-dispersive X-ray spectroscopy. The...
-
Conversion of waste biomass into activated carbon and evaluation of environmental consequences using life cycle assessment
PublikacjaIn this article, activated carbon was produced from Lantana camara and olive trees by H3PO4 chemical activation. The prepared activated carbons were analyzed by characterizations such as scanning electron microscopy, energy-dispersive X-ray spectroscopy, Brunauer–Emmett–Teller, X-ray diffraction, thermogravimetric analysis, and Fourier transform infrared spectroscopy. H3PO4 is used as an activator agent to create an abundant pore...
-
Spectroscopic and Physicochemical Investigations of Azomethines with Triphenylamine Core towards Optoelectronics
Publikacja -
Zwarcia łukowe w rozdzielnicach osłoniętych i sposoby ograniczania ich skutków
PublikacjaW artykule przedstawiono zagadnienie związane z jednym z najpoważniejszych zakłóceń pracy urządzeń rozdzielczych, jakim są zwarcia łukowe. Podano możliwe przyczyny oraz miejsca powstawania zwarć i towarzyszące im zjawiska. Zwrócono uwagę na zagrożenia, jakie za sobą niosą, a także przedstawiono sposoby mające na celu zminimalizowanie przyczyn powstawania zwarć, a w przypadku ich wystąpienia, ograniczenie zagrożeń związanych z...
-
Macierzowy opis okretowego środowiska elektromagnetycznego
PublikacjaW artykule poruszono problemy zwiazane z analizowaniem stanu kompatybilności elektromagnetycznej systemów i urzadzeń okretowych. Scharakteryzowano i opisano zagrożenia w postaci źródeł zaburzeń występujące w okrętowym środowisku elektromagnetycznym, mogace wpływać na bezpieczeństwo okrętu i załogi. Z punktu widzenia ograniczenia emisji e-m omówiono rolę struktur okrętowych. Na podstawie analizy źródeł emisji pola elektromagnetycznego...
-
Projektowanie systemów radiokomunikacyjnych opartych na metodzie OFDMA na potrzeby transportu morskiego
PublikacjaW referacie przedstawiono podstawy projektowania systemów radiokomunikacyjnych do szybkiej transmisji danych, opartych na metodzie OFDMA, na potrzeby morskich systemów transportowych. W pierwszej części scharakteryzowano podstawowe właściwości kanału radiokomunikacyjnego w morskiej strefie przybrzeżnej A1, mające wpływ na proces projektowania interfejsu radiowego OFDMA. Następnie opisano podstawowe charakterystyki systemu oraz...
-
BEARING SYSTEMS OF WIND TURBINES – MAINTENANCE PROBLEMS
PublikacjaW praktyce eksploatacyjnej turbin wiatrowych o tradycyjnej konstrukcji (przekładniowych) obserwowana jest duża awaryjność przekładni, a zwłaszcza łożysk tocznych szybkoobrotowych wałów przekładni. W Polsce na zlecenie właściciela dużej farmy wiatrowej, firmy Energa Wytwarzanie S.A., Politechnika Gdańska we współpracy z Politechniką Poznańską i Akademią Górniczo Hutniczą podjęły badania mające na celu diagnozowanie przyczyn uszkodzeń...
-
Pomiary szumów i zakłóceń
PublikacjaPraca zawiera uzasadnienie potrzeby doskonalenia techniki pomiarów szumów i zakłóceń, zwłaszcza sygnałów losowych - zarówno ergodycznych jak i niestacjonarnych, z wykorzystaniem sprzętu komputerowego. Przedstawione zostały uwarunkowania aparaturowe mające zasadniczy wpływ na algorytmiczne wyznaczanie wielkości charakteryzujących szumy i zakłócenia po procesie ich digitalizacji. Podane zostały także przykładowe zastosowania wspomaganych...
-
Some new soliton solutions to the higher dimensional Burger–Huxley and Shallow water waves equation with couple of integration architectonic
PublikacjaIn this paper, we retrieve some traveling wave, periodic solutions, bell shaped, rational, kink and anti-kink type and Jacobi elliptic functions of Burger’s equation and Shallow water wave equation with the aid of various integration schemes like improved -expansion scheme and Jacobi elliptic function method respectively. We also present our solutions graphically in various dimensions.
-
Transformation pathways and fate of engineered nanoparticles (ENPs) in distinct interactive environmental compartments: A review
Publikacja -
Construction, production and evaluation of the diagnostic utility of a recombinant Toxoplasma gondii chimeric antigen SAG1-SAG2-MAG1S
Dane BadawczeThe intracellular parasite Toxoplasma gondii has the ability to infect a wide range of warm-blooded animals, including humans. Currently, diagnosis of toxoplasmosis is based mainly on the use of the native antigens in enzyme immunoassay which allow for detection of IgG, IgM and IgA antibody classes. However, in some cases the performed studies give...
-
Construction, production and evaluation of the diagnostic utility of a recombinant Toxoplasma gondii chimeric antigen AMA1-MIC1-MIC3
Dane BadawczeThe intracellular parasite Toxoplasma gondii has the ability to infect a wide range of warm-blooded animals, including humans. Currently, diagnosis of toxoplasmosis is based mainly on the use of the native antigens in enzyme immunoassay which allow for detection of IgG, IgM and IgA antibody classes. However, in some cases the performed studies give...
-
Construction, production and evaluation of the diagnostic utility of a recombinant Toxoplasma gondii chimeric antigen MIC3-MAG1-ROP1
Dane BadawczeThe intracellular parasite Toxoplasma gondii has the ability to infect a wide range of warm-blooded animals, including humans. Currently, diagnosis of toxoplasmosis is based mainly on the use of the native antigens in enzyme immunoassay which allow for detection of IgG, IgM and IgA antibody classes. However, in some cases the performed studies give...
-
Construction, production and evaluation of the diagnostic utility of a recombinant Toxoplasma gondii chimeric antigen MIC1-MIC3-ROP1
Dane BadawczeThe intracellular parasite Toxoplasma gondii has the ability to infect a wide range of warm-blooded animals, including humans. Currently, diagnosis of toxoplasmosis is based mainly on the use of the native antigens in enzyme immunoassay which allow for detection of IgG, IgM and IgA antibody classes. However, in some cases the performed studies give...
-
Construction, production and evaluation of the diagnostic utility of a recombinant Toxoplasma gondii chimeric antigen MIC3-MAG1-AMA1
Dane BadawczeThe intracellular parasite Toxoplasma gondii has the ability to infect a wide range of warm-blooded animals, including humans. Currently, diagnosis of toxoplasmosis is based mainly on the use of the native antigens in enzyme immunoassay which allow for detection of IgG, IgM and IgA antibody classes. However, in some cases the performed studies give...
-
Construction, production and evaluation of the diagnostic utility of a recombinant Toxoplasma gondii chimeric antigen AMA1-MIC1-ROP1
Dane BadawczeThe intracellular parasite Toxoplasma gondii has the ability to infect a wide range of warm-blooded animals, including humans. Currently, diagnosis of toxoplasmosis is based mainly on the use of the native antigens in enzyme immunoassay which allow for detection of IgG, IgM and IgA antibody classes. However, in some cases the performed studies give...
-
Construction, production and evaluation of the diagnostic utility of a recombinant Toxoplasma gondii chimeric antigen SAG1-SAG2-MIC1S
Dane BadawczeThe intracellular parasite Toxoplasma gondii has the ability to infect a wide range of warm-blooded animals, including humans. Currently, diagnosis of toxoplasmosis is based mainly on the use of the native antigens in enzyme immunoassay which allow for detection of IgG, IgM and IgA antibody classes. However, in some cases the performed studies give...
-
Wykorzystanie techniki mikroekstrakcji do fazy stacjonarnej w analityce środowiskowej.**2002, 122 s. 25 rys. 31 tab. bibliogr. 465 poz. maszyn. Rozprawa doktorska /10.12.2002/ Wydz. Chem. PG Promotor: prof. dr hab. inż. Jacek Namieśnik
PublikacjaPrzeprowadzone badania obejmowały: opracowanie podstaw metodycznych oznacza-nia lotnych amin alifatycznych w powietrzu za pomocą GC ze wzbogacaniem te-chniką SPME; określenie warunków oraz parametrów pracy urządzenia do SPME wwarunkach badań modelowych; zbadanie wpływu temperatury, wilgotności i stę-żenia gazowej mieszaniny wzorcowej na efektywność procesu wzbogacania anali-tów z wykorzystaniem urządzenia do SPME; porównanie...
-
Zarządzanie bezpieczeństwem w złożonych obiektach i instalacjach krytycznych
PublikacjaW rozdziale scharakteryzowano wybrane metody wspomagające zarządzanie bezpieczeństwem w systemach technicznych, w tym metodę RCM (reliability-centered maintenance) polegającą na proaktywnej obsłudze, której celem jest nie dopuszczać lub przynajmniej ograniczać skutki potencjalnych uszkodzeń oraz metodę RBM (risk-based maintanance) i procedurę RIMAP (risk-based inspection and maintanance procedures) stosowaną w zarządzaniu bezpieczeństwem...
-
Efektywność działania smarownic a redukcja hałasu generowanego na łukach linii tramwajowych
PublikacjaIntensywne procesy urbanizacyjne oraz rozwój gospodarczy są przyczyną zwiększenia wrażliwości człowieka na otaczające go w miastach niedogodności - hałas, drgania i zanieczyszczenie powietrza. Jednocześnie podejmowane sa działania mające na celu ograniczenie wpływu zjawisk obniżających standard życia. W zakresie komunikacji tramwajowej następuje wymiana taboru i modernizacja linii. Poprawa stanu infrastruktury tramwajowej powinna...
-
Non-volatile molecular composition and discrimination of single grape white of chardonnay, riesling, sauvignon blanc and silvaner using untargeted GC–MS analysis
PublikacjaThis study developed and applied a GC–MS method aiming at molecular fingerprinting of 120 commercial single grape white wines (Chardonnay, Riesling, Sauvignon Blanc and Silvaner) for possible authentication according to grape variety. The method allowed detection of 372 peaks and tentative identification of 146 metabolites including alcohols, organic acids, esters, amino acids and sugars. The grape variety effect explained 8.3%...
-
Phosphorylation‐mediated regulation of heat shock response in Escherichia coli
PublikacjaEscherichia coli has two heat shock regulons under the transcriptional control of Esigma(32) and Esigma(E) RNA polymerases. These polymerases control the expression of genes, the products of which are needed for correct folding of proteins in the cytoplasm and the extracytoplasm respectively. In this study, we report that mutations in a tyrosine phosphatase-encoding gene led to decreased activity of these heat shock regulons. The...
-
Development and validation of an LC–MS/MS method for the determination of biogenic amines in wines and beers
PublikacjaBiogenic amines are group of organic, basic, nitrogenous compounds that naturally occur in plant, microorganism, and animal organisms. Biogenic amines are mainly produced through decarboxylation of amino acids. They are formed during manufacturing of some kind of food and beverages such as cheese, wine, or beer. Histamine, cadaverine, agmatine, tyramine, putrescine, and b-phenylethylamine are the most common biogenic amines found...
-
Engineering Candida albicans glucosamine-6-phosphate synthase for efficient enzyme purification
PublikacjaRationally designed muteins of Candida albicans glucosamine-6-phosphate synthase, an enzyme known as a promising target for antifungal chemotherapy, were constructed, overexpressed in Escherichia coli and purified to near homogeneity. To facilitate and to optimize the purification of the enzyme, three recombinant versionscontaining internal oligoHis fragments were constructed: (i) by substituting residues 343 - 348...
-
Rozwój małych miast w świetle wydatków inwestycyjnych - na przykładzie gmin miejskich województwa pomorskiego
PublikacjaArtykuł poświęcony jest ocenie możliwości rozwoju małych miast - gmin województwa pomorskiego przeprowadzonej na podstawie badań ich wydatków inwestycyjnych. Analizy poprzedzone zostały rozważaniami poświęconymi znaczeniu i interpretacji we współczesnej gospodarce następujących pojęć: małe miasto, czynniki i bariery rozwoju ze szczególnym uwzględnieniem znaczenia inwestycji dla procesu rozwoju. Badania zawarte w artykule nie zostały...
-
The crystal and solution studies of glucosamine-6-phosphate synthase from Candida albicans
PublikacjaOkreślono strukturę krystaliczną domeny izomerazowej syntazy glukozamino-6-fosforanu z Candida albicans w stanie natywnym, oraz w kompleksie z inhibitorem allosterycznym UDP-GlcNAc, fruktozo-6-P, glukozo-6-P oraz analogiem stanu przejściowego reakcji enzymatycznej - 2-amino-2-deoksy-D-mannitolo-6-P (ADMP). Na podstawie wyników badań metodą niskokątowego rozpraszania promieni X (SAXS) wydedukowano przypuszczalną strukturę kompletnej...
-
Luminescence recognition material as an INHIBIT logic gate in presence of Pb2+ and Cu2+ ions in aqueous solutions
PublikacjaA recognition material consisting of silica xerogel with amino-modified surface selectively recognizes Pb2+ and Cu2+ (but only in presence of Pb2+ ions) in aqueous solutions of other metal ions. The analytical action of the material is based on a significant change in luminescence emission spectra of the material after chemisorption of Pb2+ ions. In the presence of Pb2+ in octahedral coordination environment, a new broad and strong...
-
A magnetic imprinted polymer nano-adsorbent with embedded quantum dots and mesoporous carbon for the microextraction of triazine herbicides
PublikacjaA magnetic molecularly imprinted polymer (MMIP) adsorbent incorporating amino-functionalized magnetite nanoparticles, nitrogen-doped graphene quantum dots and mesoporous carbon (MIP@MPC@NGQDs@ Fe3O4–NH2) was fabricated to extract triazine herbicides from fruit juice. The embedded magnetite nanoparticles simplified the isolation of the adsorbent from the sample solution. The N-GQDs and MPC enhanced adsorption by affinity binding...
-
Evaluation of headspace solid-phase microextraction for the analysis of volatile carbonyl compounds in spirits and alcoholic beverages
PublikacjaOpracowano metodę oznaczania C1-C6 związków karbonylowych w układzie GC-ECD w roztworach alkoholowych poprzez derywatyzację pentafluorobenzylohydroksy-aminą i mikroekstrakcję w fazie stacjonarnej z fazy nadpowierzchniowej. Zoptymalizowano warunki eksperymantalne: zawartość alkoholu, czas ekspozycji, temperaturę i sposób mieszania próbki. W metodzie tej najpierw przeprowadza się rozcieńczenie spirytusu lub napojów alkoholowych do...
-
A theoretical probe into the effects of material and operational variables on water purification with zeolite membranes
Publikacja -
Catalytic impact of alloyed Al on the corrosion behavior of Co50Ni23Ga26Al1.0 magnetic shape memory alloy and catalysis applications for efficient electrochemical H2 generation
PublikacjaThe electrochemical and corrosion behaviour of Co50Ni23Ga27-xAlx (x = 0 and 1.0 wt%) magnetic shape memory alloys (MSMAs) was studied in 0.5 M NaCl solutions using various electrochemical techniques. Results showed remarkable activation of the tested MSMA toward pitting corrosion upon alloying it with Al. XPS examination confirmed the activation influence of alloyed Al. It proved that the presence of Al in the alloy's matrix weakens...
-
Comparative effects of biochar-nanosheets and conventional organic-amendments on health risks abatement of potentially toxic elements via consumption of wheat grown on industrially contaminated-soil
Publikacja -
Evaluation of the Effect of Four Bioactive Compounds in Combination with Chemical Product against Two Spider Mites Tetranychus urticae and Eutetranychus orientalis(Acari: Tetranychidae)
Publikacja -
Właściwości przeciwnowotworowe kapusty białej
PublikacjaNa Wydziale Chemicznym Politechniki Gdańskiej podjęto wielokierunkowe prace mające na celu ocenę przeciwnowotworowych właściwości zarówno świeżej kapusty, jak i poddanej obróbce kulinarnej, stosując różne modele badawcze, dawki i formy preparatów warzywnych, zbliżone do rzeczywistego spożycia. Przedstawiona praca stanowi podsumowanie badań prowadzonych przez trzy zespoły badawcze. Stwierdzono, że składniki kapusty, zarówno świeżej,...
-
Projektowanie konstrukcji tymczasowych służących wsparciu ciężkiego sprzętu do modyfikacji podłoża gruntowego
PublikacjaTymczasowe konstrukcje wzmacniające, tzw. platformy robocze, umożliwiają bezpieczne poru-szanie się oraz operowanie sprzętem do modyfikacji słabonośnego podłoża gruntowego. W Polsce nie istnieją żadne poradniki ani zbiory zaleceń dotyczące wykonawstwa platform roboczych. Natomiast projektów nie wykonuje się w ogóle. Obecnie dostępne są dwie metody projektowe - jedna oparta na kącie strefy oddziaływania obciążeń oraz druga, bazująca...
-
WYMAGANIA PRAWNE DOTYCZĄCE JAKOŚCI ENERGII W INSTALACJACH ELEKTROENERGETYCZNYCH
PublikacjaW referacie przedstawiono podstawowe parametry jakości energii elektrycznej, które podano w wymaganiach rozporządzenia w sprawie szczegółowych warunków funkcjonowania systemu elektroenergetycznego [2] oraz normy PN – EN 50160 [1] zawierającej podstawowe wytyczne dla sieci elektroenergetycznych do 132 kV włącznie. Wymagania dla sieci wysokich napięć rozszerzono w oparciu o inne dokumenty mające zastosowanie w przypadkach szczególnych,...
-
Algorytmy przetwarzania widm Ramana podczas detekcji substancji chemicznych
PublikacjaW pracy zostaną przedstawione algorytmy wstępnego przetwarzania widm mające na celu usunięcie lub zmniejszenie intensywności zakłóceń obecnych w rejestrowanych widmach Ramana, ze szczególnym uwzględnieniem automatyzacji tego procesu (bez konieczności wyboru parametrów przetwarzania przez obsługę urządzenia). Kolejną prezentowaną grupę algorytmów stanowią procedury parametryzacji widm, które opisują widma w postaci zbioru kilku...
-
Construction, production and evaluation of the diagnostic utility of a recombinant Toxoplasma gondii chimeric antigen MIC1-MAG1-MIC3
Dane BadawczeThe intracellular parasite Toxoplasma gondii has the ability to infect a wide range of warm-blooded animals, including humans. Currently, diagnosis of toxoplasmosis is based mainly on the use of the native antigens in enzyme immunoassay which allow for detection of IgG, IgM and IgA antibody classes. However, in some cases the performed studies give...
-
Construction, production and evaluation of the diagnostic utility of a recombinant Toxoplasma gondii chimeric antigen MIC1-MAG1-ROP1
Dane BadawczeThe intracellular parasite Toxoplasma gondii has the ability to infect a wide range of warm-blooded animals, including humans. Currently, diagnosis of toxoplasmosis is based mainly on the use of the native antigens in enzyme immunoassay which allow for detection of IgG, IgM and IgA antibody classes. However, in some cases the performed studies give...
-
Construction, production and evaluation of the diagnostic utility of a recombinant Toxoplasma gondii chimeric antigen MIC1-MAG1-AMA1
Dane BadawczeThe intracellular parasite Toxoplasma gondii has the ability to infect a wide range of warm-blooded animals, including humans. Currently, diagnosis of toxoplasmosis is based mainly on the use of the native antigens in enzyme immunoassay which allow for detection of IgG, IgM and IgA antibody classes. However, in some cases the performed studies give...
-
Optimization of parallel implementation of UNRES package for coarse‐grained simulations to treat large proteins
PublikacjaWe report major algorithmic improvements of the UNRES package for physics-based coarse-grained simulations of proteins. These include (i) introduction of interaction lists to optimize computations, (ii) transforming the inertia matrix to a pentadiagonal form to reduce computing and memory requirements, (iii) removing explicit angles and dihedral angles from energy expressions and recoding the most time-consuming energy/force terms...
-
Understanding the interactions between protein stabilizers and the peptide bond through the analysis of the volumetric and compressibility properties for the model systems
PublikacjaThis work confirms our earlier supposition, that volumetric and acoustic parameters for simple model proposed by us are directly related to stabilizing/destabilizing effect of osmolytes on proteins structure. The apparent molar volumes, V and the apparent molar isentropic compressions, KS,, of glycine and N,N,N –trimethylglycine (betaine) were determined from densities and speed of sound measurements in aqueous solution of N-methylacetamide...