Filters
total: 1089
-
Catalog
- Publications 920 available results
- Journals 13 available results
- Conferences 3 available results
- People 23 available results
- Inventions 11 available results
- Projects 11 available results
- Laboratories 1 available results
- Research Teams 2 available results
- e-Learning Courses 21 available results
- Open Research Data 84 available results
displaying 1000 best results Help
Search results for: dna purine bases
-
Wpływ planowanej przystani jachtowej w Sopocie na brzeg morski.
PublicationW artykule przeanalizowano wpływ planowanej przystani jachtowej w sąsiedztwie molo w Sopocie na kształtowanie procesów hydro- i litodynamicznych w strefie brzegowej morza. Przeprowadzono symulacje komputerowe zarówno dla przeciętnych jak i sztormowych warunków meteorologicznych występujących w średnim roku statystycznym. W rezultacie stwierdzono, że usytuowanie przystani po odmorskiej stronie bocznej ostrogi molo nie spowoduje...
-
Właściwości podłoża gruntowego jako czynnik determinujący proces inwestycyjny farmy wiatrowej
PublicationW artykule przedstawiono opis usterek i uszkodzeń fundamentu kołowegowieży turbinyelektrowni wiatrowej spowodowanych lokalnym osłabieniem podłoża gruntowego, będących następstwem błednego, na etapie prac przygotowawczychrozpoznania warunków gruntowychw stosunku do warunków rzeczywistych, zweryfikowanych na etapiewznoszenia obiektu. W czasie realizacji fundamentu nastąpiło jego zalanie woda gruntowąspowodowane wyłamaniem dna wykopu....
-
Valence and ionic lowest-lying electronic states of small esters studied by high resolution vacuum ultraviolet photoabsorption, photoelectron spectroscopy and ab initio calculations
PublicationEsters are an important class of oxygenated volatile organic compounds used in food flavorings, perfumes and other cosmetic products. They are present in fruits and pheromones and are emitted to the atmosphere naturally. Esters are also formed in the atmosphere as a product of the oxidation of ethers. Some of them form poly-molecule chains and are used in plastics. Phosphoesters form DNA backbone, while nitroesters are known for...
-
Smart Innovation Management in Product Life Cycle
PublicationThe present paper proposes a framework for smart innovation management of the product using a Smart Knowledge Management System comprising Set of Experience Knowledge Structure (SOEKS) and Decisional DNA. This proposed system will allow the entrepreneurs and organizations to perform the innovation process technically and quickly as this framework will store knowledge as well as experiences of the past innovations done in various...
-
Genotoxic effects of antitumor 1-nitroacridines C-857 and its novel analoque 4-methyl-1-nitroacridine C-1748
Publication4-podstawione 1-nitroakrydyny reprezentują nową grupę pochodnych akrydyny zsyntetyzowanych na Politechnice Gdańskiej. W przeprowadzonych badaniach nad pochodnymi C-1748 i C-857 zastosowano dwie metody badawcze: test kometowy oraz zmodyfikowany test mikrojąderkowy (CBMN assay). W teście kometowym wykazano wzrost uszkodzeń DNA w zależności od czasu i stężenia badanych pochodnych 1-nitroakrydyny. Badania aberracji chromosomalnych...
-
Diagnostyka molekularna w zakażeniach szpitalnych
PublicationOpisano najczęściej wykorzystywane techniki genotypowania w badaniach zakażeń szpitalnych z uwzględnieniem ich powtarzalności i potencjału różnicującego oraz problemów technicznych i ponoszonych kosztów. Makrorestrykcyjna analiza genomowego DNA z wykorzystaniem PFGE (ang. Pulsed Field Gel Electrophoresis)jest uważana za ''złoty standard'' w typowaniu molekularnym. Jednak jest ona czasochłonna, pracochłonna i dlatego nie nadaje...
-
Koncepcja międzynarodowej konkurencyjności makrootoczenia przedsiębiorstw
PublicationCelem badań przedstawionych w niniejszym artykule jest opracowanie koncepcji konkurencyjności międzynarodowej (IC) krajów, której podstawą jest makroekonomiczne otoczenie przedsiębiorstw. Motywem podjęcia tych badań były poważne wady metodologii pomiaru IC gospodarek stosowanej przez Światowe Forum Ekonomiczne (WEF). WEF rekomenduje Globalny Indeks Konkurencyjności (GCI) jako globalną miarę produktywności kraju. WEF utrzymuje,...
-
The Effect of Oxygenated Diesel-N-Butanol Fuel Blends on Combustion, Performance, and Exhaust Emissions of a Turbocharged CRDI Diesel Engine
PublicationThe article deals with the effects made by using various n-butanol-diesel fuel blends on the combustion history, engine performance and exhaust emissions of a turbocharged four-stroke, four-cylinder, CRDI 1154HP (85 kW) diesel engine. At first, load characteristics were taken when running an engine with normal diesel fuel (DF) to have ‘baseline’ parameters at the two ranges of speed of 1800 and 2500 rpm. Four a fossil diesel (class...
-
First detection of spectral resonance structures of the ionospheric Alfvén resonance in ULF/ELF magnetic field recorded at Suwałki, Poland
Publication -
“Electromagnetic ULF/ELF Fields on Earth and in Space” Conference, Warsaw, Poland, 2019. Preface
Publication -
Ilona Kołodziejska prof. dr hab. inż.
People -
Hopf bifurcation in time‐delayed gene expression model with dimers
PublicationWe study a mathematical model of gene transcription and protein synthesis with negative feedback. We consider a system of equations taking into account the formation of dimers (i.e., complex formed by two protein monomers), the way in which dimers bind to DNA and time delay in translation process. For the model consisting of three ordinary differential equations with time delay, we derive conditions for stability of the positive...
-
System detekcji miny morskiej oparty na układzie FPGA
PublicationObiekt metalowy znajdujący się w wodzie morskiej wytwarza wokół siebie pole elektryczne. Źródłem tego pola są procesy elektrochemiczne. Wśród wielu metalowych obiektów znajdujących się w morzu są miny morskie. Miny denne często ukryte są w dnie morza w celu utrudnienia ich wykrycia przez sonary. W pracy przedstawiono wyniki analizy numerycznej wpływu przewodności elektrycznej dna na rozkład pola elektrycznego oraz opisano system...
-
Dissociative electron attachment of furan, tetrahydrofuran, and fructose
PublicationPrzeprowadzono badania wychwytu dysocjacyjnego elektronów w cząsteczkach furanu, tetrahydrofuranu i fruktozy w przedziale energii 0-14eV. Stwierdzono, że w przypadku wychwytu elektronów o energiach poniżej progu wzbudzenia (< 3eV), jedynie fruktoza jest podatna na rozerwanie pierścienia cukrowego. W cząsteczkach furanu i tetrahydrofuranu struktury rezonansowe odpowiadające fragmentom pierścienia pojawiają się dla energii elektronów...
-
Electrooxidation of dissolved dsDNA backed by in situ UV-Vis spectroscopy
PublicationPrzeprowadzono badania elektrochemicznego utleniania dsDNA stosując metody cyklowoltametryczne na elektrodzie weglowej, platynowej, platynowej w formie siatki oraz z siatki platynowej osadzonej na węglu. Otrzymane wyniki analizy spektroelektrochemicznej wykazały, że wraz ze wzrostem potencjału i piku prądowego absorpcja roztworu dsDNA wzrasta w sposób zależny od typu elektrody. Jednak położenie maksimum absorpcji nie zmieniało...
-
Optymalizacja transformacji wyników pomiarów bloków kadłuba statku z uwzględnieniem ograniczeń
PublicationArtykuł przedstawia algorytm optymalizujący transformację wyników pomiarów bloków i sekcji kadłuba statku z uwzględnieniem ograniczeń. Optymalizacji podlega suma odległości pomiędzy mierzonymi punktami, a korespondującymi punktami w modelu CAD, uwzględniając jedno z dwóch możliwych ograniczeń: wspólna płaszczyzna, albo wspólna oś. Transformacja wyników pomiarów wykonywana jest wcelu przeprowadzenia porównania faktycznych wymiarów...
-
Pre-clinical evaluation of 1-nitroacridine derived chemotherapeutic agent that has preferential cytotoxic activity towards prostate cancer
PublicationPraca zawiera wyniki badań przedklinicznych pochodnej 1-nitroakrydyny C-1748 wobec komórek ludzkiego raka prostaty CaP in vitro, jak i przeszczepialnego na zwierzęta. W oparciu o fosforylację histonu H2AX jako markera podwójnych cięć DNA wykazano, że C-1748 jest bardziej aktywny w komórkach CaP niż HL60. Zidentyfikowano poza tym receptor androgenny (AR) jako cel molekularny badanego związku. W doświadczeniach na zwierzętach stwierdzono...
-
New PCR test for detection of Candida glabrata based on the molecular target chosen by the RAPD technique
PublicationRapid, reliable diagnosis is a necessary condition for the successful treatment of infections. Such diagnostic assays are continually being developed. #e paper presents a method for selecting the molecular target for PCR-based diagnostics based on the comparison of RAPD patterns. A sequence encoding Candida glabrata CBS138 hypothetical protein was selected. The limit of detection for PCR and real-time PCR reactions with DNA extracted...
-
Jan Hupka prof. dr hab. inż.
People -
Dietary intervention with beetroot juice during doxorubicin cancer chemotherapy in vivo reduces markers of oxidative stress
PublicationCancer chemotherapy with doxorubicin, despite high antitumor activity and broad spectrum of this drug, is on decline due to toxic side effects. The clinical efficacy of anthracyclines have continuously prompted the search for new adjuvants to alleviate undesirable side toxicity incurred by this group of cytostatics. The recent approaches involve the application of synthetic or purified natural antioxidants in combination with doxorubicin...
-
Sequence variants of p21 gene of the MRL/MpJ mouse: a possible association with the deficit of p21 protein and regenerative phenotype.
PublicationThe MRL/MpJ mouse is known for its enhanced regeneration abilities that manifested themselves by scarless ear-hole wound closure. The deficit of p21 found in the MRL is associated with the regenerative capacity as the p21 gene knockout in a mouse strain unrelated to the MRL mouse results in an ear-hole closure effect, similar to that observed in the MRL mouse. Cdkn1a gene encodes p21 protein, a cyclin-dependent kinase inhibitor,...
-
Sposób prowadzenia badań dna akwenu wodnego
Inventions -
The New LM-PCR/Shifter Method for the Genotyping of Microorganism
PublicationTechniques relies on the ligation of appropriates adapters (LM-PCR) as AFLP, PCR MP and ADSRRS are successfully used for epidemiological studies for prokaryotic and eukaryotic microorganisms. In this study we propose a new method, called the LM-PCR/Shifter, based on the use of a Class IIS restriction enzyme giving restriction fragments with different 4 base 5' overhangs (Shifter) and the ligation of appropriate oligonucleotide...
-
PRZYDATNOŚĆ DIAGNOSTYCZNA REAKCJI PCR W ROZPOZNAWANIU BORELIOZY
PublicationBorelioza jest wieloukładową chorobą wywoływaną przez bakterie zaliczane do kompleksu Borrelia burgdorferi sensu lato. Wektorem przenoszącym infekcję są kleszcze z rodzaju Ixodes, które zakażają kolejnych żywicieli krętka podczas spożywania ich krwi. Zróżnicowany przebieg boreliozy uniemożliwia jej rozpoznanie na podstawie objawów klinicznych. W związku z tym diagnostyka choroby z Lyme opiera się głównie na metodach laboratoryjnych,...
-
Diagnostic PCR assay for Microsporum and Trichophyton infections
PublicationWe have previously described a highly sensitive 5-hour PCR test for the rapid diagnosis of onychomycosis which detects any dermatophyte and species-identify T. rubrum from patient specimens. We have subsequently developed and evaluated new PCR tests for detection of Trichophyton and Microsporum canis/audouinii infections.58 dermatophyte isolates (21) Microsporum spp. (4 different species), 35 Trichophyton spp (10 different species)...
-
Transcriptional activity of epigenetic remodeling genes declines in keratinocytes after in vitro expansion
PublicationPURPOSE: In vitro expansion is an invaluable method to obtain keratinocytes in amounts necessary for effective transplantation therapies. In vitro cell culturing provokes questions concerning potential epigenetic alterations occurring in expanded cells in the context of usefulness for transplantation and safety. The purpose of this study was to investigate as to whether keratinocyte expansion is associated with changes in the activity...
-
Genotoxicity of selected pharmaceuticals, their binary mixtures, and varying environmental conditions – study with human adenocarcinoma cancer HT29 cell line
PublicationPharmaceutical residues are present in the environment in mixtures and their adverse effects may also result from interactions that occur between compounds. Studies presented in this work focus on genotoxicity of pharmaceuticals from different therapeutic groups in mixtures and in individual solutions impacted with different environmental conditions assessed using comet assay (alkaline approach). Binary mixtures of pharmaceuticals...
-
Impact of pollution derived from ship wrecks on the marine environment on the basis of s/s ''Stuttgart'' (Polish coast, Europe)
PublicationW 1943 roku niemiecki statek szpitalny, s/s Stuttgart (Lazaretschiff ''C'') został zatopiony w pobliżu portu w Gdyni. Doprowadziło to do zanieczyszczenia dna morskiego paliwem. Podczas badań przeprowadzonych w 2009 r. pobranych zostało 11 próbek osadów powierzchniowych i wody morskiej oraz 4 rdzenie. Próbki poddano analizie na zawartość zanieczyszczeń priorytetowych należących do grupy wielopierścieniowych węglowodorów aromatycznych...
-
MODERNIZACJA KASKADOWEGO UKŁADU REGULACJI WYWOŁYWACZA FAL BASENU MODELOWEGO
PublicationArtykuł opisuje modernizację stanowiska badawczego w Centrum Techniki Okrętowej (CTO) S.A. – głębokowodnego basenu modelowego z płytowym wywoływaczem fal z płytą mocowaną powyżej dna basenu na pojedynczym przegubie. Modernizacja obejmowała zastąpienie oryginalnego analogowego układu regulacji nowoczesnym cyfrowym układem sterowania, opartym na 8-bitowym mikrokontrolerze AVR. Na podstawie dokonanej identyfikacji poprzedniego układu...
-
TopFUNG Yeast DNA topoisomerase II as a model molecular target for novel antifungal compounds
ProjectsProject realized in Department of Pharmaceutical Technology and Biochemistry according to UMO-2022/45/B/NZ6/01149 agreement from 2023-07-03
-
TopFung Yeast DNA topoisomerase II as a model molecular target for novel antifungal compounds
ProjectsProject realized in Gdańsk University of Technology according to UMO-2022/45/B/NZ6/01149 agreement from 2023-07-03
-
Kwasy nukleinowe - niedoceniane składniki żywności
PublicationObecnie badania nad kwasami nukleinowymi koncentrują się na roli genetycznej tych makromolekuł. Można jednak przypuszczać, że DNA jak i RNA powszechnie występujące w żywności mają także ważne znaczenie żywieniowe. Świadczy o tym obecność w układzie pokarmowym szeregu mechanizmów odpowiedzialnych za detekcję, trawienie i przyswajanie tych składników pokarmu. W literaturze naukowej rośnie liczba doniesień sugerujących istotną rolę...
-
Molecular mechanism of the enzymatic oxidation investigated for imidazoacridinone antitumor drug C-1311.
PublicationPraca miala na celu określenie molekularnego mechanizmu enzymatycznej utleniającej aktywacji wymienionego związku przeciwnowotworowego w takim układzie modelowym, w którym wcześniej wykazano jego kowalencyjne wiązanie się do DNA. Badania struktur chemicznych produktów enzymatycznej aktywacji wykazały, że dwa z nich powstają w wyniku dealkilacji łańcucha bocznego cząsteczki, natomiast dwa inne w wyniku aktywacji pierścienia imidazoakrydonu....
-
Strenght analysis of the floating dock-ship system.
PublicationOmówiono krytycznie wymagania przepisów towarzystw klasyfikacyjnych dotyczące wytrzymałości doków pływających. Przedstawiono wyniki analizy MES sił wewnętrznych i naprężeń w kadłubie doku o długości podporowej 255m, obciążonego ciężarem masowca o długości między pionami 252m i masie 20900 ton. Pokazano wpływ na wartość sił redukcji w kilblokach i naprężenia takich czynników jak: rozłożenie balastu wyrównwczego w zbiornikach doku,...
-
Transmission of digital signals in a nonstationary hydroacoustic channel.
PublicationZ telekomunikacyjnego punktu widzenia właściwości transmisyjne kanału hydroakustyczny są ograniczone przez występowanie wielokrotnych odbić fali dźwiękowej od dna i powierzchni wody oraz niestacjonarność wprowadzaną głównie przez ruch powierzchni wody. Artykuł przedstawia model własności transmisyjnych kanału. Wprowadzono niestacjonarność do odpowiedzi impulsowych kanału przez założenie przypadkowej zmienności czasów przyjścia...
-
Virtual Engineering Object (VEO): Toward Experience-Based Design and Manufacturing for Industry 4.0
PublicationIn this article we propose the concept, its framework, and implementation methodology for Virtual Engineering Objects (VEO). A VEO is the knowledge representation of an engineering object that embodies its associated knowledge and experience. A VEO is capable of adding, storing, improving, and sharing knowledge through experience. Moreover, it is demonstrated that VEO is a specialization of a Cyber-Physical System (CPS). In this...
-
In silico design of telomerase inhibitors.
PublicationTelomerase is a reverse transcriptase enzyme involved in DNA synthesis at the end of linear chromosomes. Unlike in most other cells, telomerase is reactivated most cancerous cells and, therefore, has become a promising new anticancer target. Despite extensive research, direct telomerase inhibitors have yet not been introduced to the clinics because of the complexity of this enzyme. Structures of this protein from simple organisms...
-
Potent antitumor 4-methyl-1-nitroacridine C-1748 induces apoptosis only in part of colon cells
PublicationZbadaliśmy zdolność pochodnej 4-metylo-1-nitroakrydyny C-1748 do indukcji apoptozy w ludzkich komórkach nowotworów jelita grubego HCT-8 i HT29 w stężeniach biologicznie istotnych. Zjawisko apoptozy określiliśmy na podstawie zmian morfologicznych jak i biochemicznych tj. fragmentacji DNA, aktywacji kaspazy-3, spadku potencjału mitochondrialnego, eksternalizacji fosfatydyloseryny i pojawiania się frakcji sub-G1. Wykazaliśmy, że pochodna...
-
“Shadow” vs. “Phase 3D” method within endoscopic examinations of marine engines
PublicationA visual investigation of surfaces creating internal, working spaces of marine combustion engines by means of specialized view-finders so called endoscopes is at present almost a basic method of technical diag-nostics. The surface structure of constructional material is visible during investigations like through the magnifying glass (usually with a precisely determined magnification), which makes possible a detection, recognition...
-
Internet photogrammetry for inspection of seaports
PublicationThis paper intends to point out the possibility of using Internet photogrammetry to construct 3D models from the images obtained by means of UAVs (Unmanned Aerial Vehicles). The solutions may be useful for the inspection of ports as to the content of cargo, transport safety or the assessment of the technical infrastructure of port and quays. The solution can be a complement to measurements made by using laser scanning and traditional...
-
Field investigation of low-temperature cracking and stiffness moduli on selected roads with conventional and high modulus asphalt concrete
PublicationHigh Modulus Asphalt Concrete (HMAC) was introduced in Poland as a one of the solutions to the problem of rutting, type of deterioration common in the 1990s. After first encouraging trials in 2002 HMAC was widely used for heavily loaded national roads and motorways. However some concerns were raised about low-temperature cracking of HMAC. This was the main reason of the studies presented in this article were started. The article...
-
Synthesis, crystal structure and spectroscopic characterization of new anionic iridium(III) complexes and their interaction with biological targets
PublicationThe synthesis and characterisation of new anionic iridium(II) complexes (NH4)2[IrCl4(κ2N,N’-H2biim)]2 · 5H2O (1) and ((CH3)2NH2)[IrCl4(κ2N,N’-PyBIm)] · H2O (2) are presented in this article. Spectroscopic methods (1H, 13C and 15N NMR, FTIR, UV-Vis) were used to characterize these new complexes. Solid-state structural analysis (SC-XRD) of complexes 1 and 2 shows a slightly distorted octahedral geometry of Ir(III) ions, which is...
-
Experimental guinea pig model of dermatophytosis: a simple and useful tool for the evaluation of new diagnostics and antifungals
PublicationCelem badań było opracowanie prostego modelu zwierzęcego (świnki morskie) odpowiedniego do sprawdzania systemów diagnostycznych oraz terapii infekcji dermatofitów. Następujące zmienne były analizowane: przygotowanie skóry przez golenie versus użycie taśmy, testowy szczep Microsporum canis czy Trichophyton mentagrophytes jako czynnik etiologiczny, sposób inokulacji. Przebieg infekcji był oceniany poprzez ocenę zaczerwienienia i...
-
High prevalence of Escherichia coli belonging to the B2+D phylogenetic group in inflammatory bowel disease
PublicationBACKGROUND: It is not clear which species of bacteria may be involved in inflammatory bowel disease (IBD). One way of determining which bacteria might be likely candidates is to use culture-independent methods to identify microorganisms that are present in diseased tissues but not in controls. AIMS: (1) To assess the diversity of microbial communities of biopsy tissue using culture-independent methods; (2) to culture the bacteria...
-
Analiza oddziaływań w kryształach związków zawierających w strukturze pierścień pirydynowy
PublicationMożliwość tworzenia się wiązań wodorowych jest kluczowym parametrem z punktu widzenia inżynierii kryształu, ponieważ wiązania wodorowe mają bezpośredni wpływ na strukturę oraz trwałość sieci krystalicznej. Głównym celem niniejszej rozprawy doktorskiej była analiza porównawcza wiązań wodorowych występujących w układach, zawierających w strukturze pierścień pirydynowy. Badane układy podzielono na: (1) układy ze związkami krzemosiarkowymi...
-
A new division of bacterial UvrA homologues
PublicationThe UvrA protein is a DNA-binding and damage-recognition enzyme which participates in the prokaryotic type nucleotide excision repair (NER) pathway. It has recently been noted that some bacterial genomes comprise additional uvrA genes which encode five distinct types of UvrA homologue. We investigated the sequences of over 2400 bacterial genomes and found 130 examples of bacteria containing uvrA 2 genes. The sequence analyses conducted...
-
Akrydyny jako związki aktywne przeciwnowotworowo = Acridines as antitumor drugs
PublicationAkrydyny należą do grupy policyklicznych związków heteroaromatycznych. Wykazują szeroki zakres aktywności biologicznej obejmujący aktywność przeciwpierwotniakową, przeciwbakteryjną,przeciwwirusową i przeciwnowotworową. Pochodne akrydyny o działaniu przeciwnowotworowym wykazują zróżnicowany mechanizm działania na poziomie molekularnym. Z uzyskanych dotychczas danych wynika, że jednym z podstawowych etapów działania jest tworzenie...
-
EpiFood Adaptation of electrophoretic methods for the determination of the impact of food components on global DNA methylation.
ProjectsProject realized in Faculty of Chemistry according to UMO-2017/27/N/NZ9/02351 agreement from 2018-10-02
-
Budowa chemiczna i setreostruktura kowalencyjnych adduktów wybranych przeciwnowotworowych pochodnych akrydyny z zasadami DNA
ProjectsProject realized in Faculty of Chemistry according to UMO-2018/28/T/ST5/00165 agreement from 2018-09-14
-
Biochemistry - Laboratory exercises - Nowy
e-Learning CoursesExerise 1. The ability to accumulate metal cations by edible mushrooms, comparison with edible plants Exercise 2. Measurement of activity of glutathione S-transferases - the detoxifying enzymes present in the cytosol of eukaryotic cells Exercise 3. Cell membranes permeability Exercise 4. Detection of mutagenic substances using Ames test Exercise 5. Gluten content in food products part 1. Exercise 6. Gluten content in food...