Filtry
wszystkich: 779
Wyniki wyszukiwania dla: RECOMBINANT VP3 PROTEIN
-
Cloning, expression, and purification of a recombinant cold-adapted β-galactosidase from antarctic bacterium Pseudoalteromonas sp. 22b
PublikacjaAntarktyczny szczep, gram-ujemnych bakterii Pseudoalteromonas sp. 22b, wyizolowanych z przewodu pokarmowego kryla z gatunku Thyssanoessa macrura, jest producentem wewnątrzkomórkowej zimnolubnej beta-galaktozydazy. Białko to jest homotetramerem, w którym każda z jednostek monomeru zbudowana jest z 1028 reszt aminokwasowych. Gen kodujący ten enzym został sklonowany i eksprymowany w komórkach E. coli. Następnie z zastosowaniem procedury...
-
Role of the disulfide bond in stabilizing and folding of the fimbrial protein DraE from uropathogenic Escherichia coli
PublikacjaDr fimbriae are homopolymeric adhesive organelles of uropathogenic Escherichia coli composed of DraE subunits, responsible for the attachment to host cells. These structures are characterized by enormously high stability resulting from the structural properties of an Ig-like fold of DraE. One feature of DraE and other fimbrial subunits that makes them peculiar among Ig-like domain-containing proteins is a conserved disulfide bond...
-
Effect of increased protein intake on the risk of female infertility
Publikacja -
The SERRATE protein is involved in alternative splicing in Arabidopsis thaliana
Publikacja -
The SERRATE protein is involved in alternative splicing in Arabidopsis thaliana
Publikacja -
Role of Oligosaccharide Chain Polarity in Protein–Glycosaminoglycan Interactions
Publikacja -
A bifunctional chimeric protein consisting of MutS and beta-galactosidase
Publikacja -
The protein folding problem: global optimization of force fields
Publikacja -
Lipid-protein interactions in membranes: a molecular modelling study
Publikacja -
Copper containing protein sites - structure, properties and models
PublikacjaEnzymy organizmów żywych katalizują wiele reakcji stosowanych w przemyśle chemicznym. Przykładem potencjalnego zastosowania enzymu w produkcji jest synteza L-Dopy przy udziale tyrozynazy. Ze względu na możliwe praktyczne zastosowanie w katalizie, otrzymano i opisano wiele prostych modeli miejsc aktywnych enzymów. W artykule opisano niektóre modele białek zawierających miedź.
-
A bifunctional chimeric protein consisting of MutS and beta-galactoside
PublikacjaPraca pokazuje konstrukcję DNA plazmidowego kodującego bifunkcjonalne białko chimeryczne złożone z MutS Thermus thermophilus i beta-galaktozydazy E.coli, optymalizację jego ekspresji i oczyszczania. Białko to testowano w metodzie wykrywania mutacji punktowych, wykorzystując kolorymetryczne mierzenie aktywności domeny reporterowej beta galaktozydazy.
-
Electrosynthesis of potato starch–whey protein isolate complexes
Publikacja -
c-Myc Protein Level Affected by Unsymmetrical Bisacridines Influences Apoptosis and Senescence Induced in HCT116 Colorectal and H460 Lung Cancer Cells
PublikacjaUnsymmetrical bisacridines (UAs) are highly active antitumor compounds. They contain in their structure the drugs previously synthesized in our Department: C-1311 and C-1748. UAs exhibit different properties than their monomer components. They do not intercalate to dsDNA but stabilize the G-quadruplex structures, particularly those of the MYC and KRAS genes. Since MYC and KRAS are often mutated and constitutively expressed in cancer...
-
Ahmer Bin Hafeez
OsobyI have experience in Computational Biology, particularly bioinformatics, homology modeling, phylogenetics, structural biology, and drug discovery. Furthermore, I have hands-on experience with Bioinformatics software. Currently, my interest lies in translatable omics studies and drug discovery against novel protein targets involved in cancer and infectious diseases and Host-Pathogen PPIs. My aim involves the use of computational...
-
Long-range, water-mediated interaction between a moderately active antifreeze protein molecule and the surface of ice
PublikacjaUsing molecular dynamics simulations, we show that a molecule of moderately active antifreeze protein (type III AFP, QAE HPLC-12 isoform) is able to interact with ice in an indirect manner. This interaction occurs between the ice binding site (IBS) of the AFP III molecule and the surface of ice, and it is mediated by liquid water which separates these surfaces. As a result, the AFP III molecule positions itself at a specific orientation...
-
Monocyte Chemoattractant Protein-Induced Protein 1 (MCPIP1) Enhances Angiogenic and Cardiomyogenic Potential of Murine Bone Marrow-Derived Mesenchymal Stem Cells
Publikacja -
Optical method supported by machine learning for dynamics of C‐reactive protein concentrations changes detection in biological matrix samples
PublikacjaIn this article we present the novel spectroscopy method supported with machine learning for real-time detection of infectious agents in wastewater. In the case of infectious diseases, wastewater monitoring can be used to detect the presence of inflammation biomarkers, such as the proposed C-reactive protein, for monitoring inflammatory conditions and mass screening during epidemics for early detection in communities of concern,...
-
Recombinant Human Plasma Gelsolin Stimulates Phagocytosis while Diminishing Excessive Inflammatory Responses in Mice with Pseudomonas aeruginosa Sepsis
Publikacja -
A new MIC1-MAG1 recombinant chimeric antigen can be used instead of the Toxoplasma lysate antigen in the serodiagnosis of human toxoplasmosis
PublikacjaW niniejszej publikacji po raz pierwszy przedstawiono otrzymanie i oszacowanie przydatności diagnostycznej nowego chimerycznego antygenu MIC1-MAG1 Toxoplasma gondii do rozpoznawania toksoplazmozy u ludzi. Antygen chimeryczny MIC1-MAG1 został otrzymany jako białko fuzyjne zawierające dwie domeny oligohistydynowe na N- i C-końcu z użyciem systemu ekspresyjnego Escherichia coli. Po oczyszczeniu z wykorzystaniem metody chromatografii...
-
GRA2 and ROP1 recombinant antigens as potential markers for detection of Toxoplasma gondii-specific immunoglobulin G in humans with acute toxoplasmosis.
PublikacjaArtykuł przedstawia oszacowanie przydatności w serodiagnostyce toksoplazmozy dwóch rekombinatowych białek antygenowych GRA2 i ROP1 Toxoplasma gondii. Białka rekombinantowe otrzymano z wykorzystaniem bardzo wydajnego, bakteryjnego systemu ekspresyjnego, który pozwolił na otrzymanie miligramowych ilości antygenów z 1 litra hodowli po zastosowaniu jednoetapowego oczyszczania metodą chromatografii metalopowinowactwa. Użyteczność diagnostyczna...
-
Study of the influence of the presence of Dr fimbriae on the sedimentation of recombinant Escherichia coli strains: AAEC191A and BL21(DE3)
Dane BadawczeCell sedimentation in the medium is a common phenomenon in most bacterial enviroments. This study specifically investigated the impact of Dr fimbriae presence on cell deposition. To explore this, recombinant Escherichia coli strains were employed, including BL21(DE3)/pCC90, BL21(DE3)/pACYCpBAD, BL21(DE3)/pCC90 Dra D-mut, BL21(DE3)/pCC90 D54-STOP, AAEC191A/pCC90,...
-
Quantitative determination of mechanical stability in the novel coronavirus spike protein
Publikacja -
Delay induced oscillations in gene expression of Hes1 protein model
PublikacjaW pracy został omówiony model produkcji białka Hes1. Stężenie Hes1 jest kontrolowane przez ujemne sprzężenie zwrotne wbudowane w białko i jego mRNA. Przeprowadzona analiza potwierdziła znane wyniki numeryczne, że oscylacje wywołane są przez opóźnienie. Pokazaliśmy również, że jeśli współczynnik Hilla jest większy niż 1, to istnieje krytyczna wartość opóźnienia, dla której ma miejsce bifurkacja Hopfa i pojawiają się rozwiązania...
-
C-reactive Protein as a Diagnostic and Prognostic Factor of Endometrial Cancer
Publikacja -
Assessment of chemical‐crosslink‐assisted protein structure modeling in CASP13
Publikacja -
C-reactive protein as a diagnostic and prognostic factor of endometrial cancer
Publikacja -
Structural Analysis of a Peptide Fragment of Transmembrane Transporter Protein Bilitranslocase
Publikacja -
Software tools for identification, visualization and analysis of protein tunnels and channels
Publikacja -
Nutritional value, protein and peptide composition of edible cricket powders
Publikacja -
Structure and evolution of the 4-helix bundle domain of Zuotin, a J-domain protein co-chaperone of Hsp70
PublikacjaThe J-domain protein Zuotin is a multi-domain eukaryotic Hsp70 co-chaperone. Though it is primarily ribosome-associated, positioned at the exit of the 60S subunit tunnel where it promotes folding of nascent polypeptide chains, Zuotin also has off-ribosome functions. Domains of Zuotin needed for 60S association and interaction with Hsp70 are conserved in eukaryotes. However, whether the 4-helix bundle (4HB) domain is conserved remains...
-
Toxoplasma godnii recombinant chimeric antigens - IgM and IgG ELISAs - mouse serum samples
Dane BadawczeThis study presents an evaluation of tetravalent recombinant chimeric proteins containing fragments of the Toxoplasma gondii antigens, SAG2, SAG1, GRA1, GRA2, MIC1, MAG1, ROP1 and AMA1, as potential replacements of a the soluble, whole-cell tachyzoite lysate (TLA) used in serological assays. Recombinant chimeric proteins (SAG1-MIC1-MAG1-GRA2, SAG2-GRA1-ROP1-GRA2,...
-
Toxoplasma gondii recombinant chimeric antigens - IgG and IgM ELISAs - human serum samples
Dane BadawczeThis study presents an evaluation of tetravalent recombinant chimeric proteins containing fragments of the Toxoplasma gondii antigens, SAG1, SAG2, GRA1, GRA2, MIC1, MAG1, ROP1 and AMA1, as potential replacements of a the soluble, whole-cell tachyzoite lysate (TLA) used in serological assays. Recombinant chimeric proteins (SAG1-MIC1-MAG1-GRA2, SAG2-GRA1-ROP1-GRA2,...
-
Towards temperature-dependent coarse-grained potentials of side-chain interactions for protein folding simulations. I: Molecular dynamics study of a pair of methane molecules in water at various temperatures
Publikacja -
The Efficacious Benefit of 25-Hydroxy Vitamin D to Prevent COVID-19: An In-Silico Study Targeting SARS-CoV-2 Spike Protein
PublikacjaThe environment has rapidly looked at proven specialist task forces in the aftermath of the COVID-19 pandemic to build public health policies and measures to mitigate the effects of emerging coronaviruses. According to the researchers, taking 10 μg of 25-hydroxy vitamin D daily is recommended to keep us safe. There have been several studies recently indicating that there is a reduced risk of contracting Coronavirus by 25-hydroxy...
-
Performance of electrochemical immunoassays for clinical diagnostics of SARS-CoV-2 based on selective nucleocapsid N protein detection: Boron-doped diamond, gold and glassy carbon evaluation
PublikacjaThe 21st century has already brought us a plethora of new threats related to viruses that emerge in humans after zoonotic transmission or drastically change their geographic distribution or prevalence. Severe acute respiratory syndrome coronavirus 2 (SARS-CoV-2) was first spotted at the end of 2019 to rapidly spread in southwest Asia and later cause a global pandemic, which paralyzes the world since then. We have designed novel...
-
Enhanced susceptibility of SARS-CoV-2 spike RBD protein assay targeted by cellular receptors ACE2 and CD147: Multivariate data analysis of multisine impedimetric response
PublikacjaSevere acute respiratory syndrome coronavirus 2 (SARS-CoV-2) enters the cells through the binding of spike protein to the host cell surface-expressing angiotensin-converting enzyme 2 (ACE2) or by endocytosis mediated by extracellular matrix metalloproteinase inducer (CD147). We present extended statistical studies of the multisine dynamic electrochemical impedance spectroscopy (DEIS) revealing interactions between Spike RBD and...
-
TOLLIP Protein Expression Predicts Unfavorable Outcome in Renal Cell Carcinoma
Publikacja -
Functional Protein Composition in Femoral Glands of Sand Lizards (Lacerta agilis)
Publikacja -
Zeta potential and droplet size of n-tetradecane/ethanol (protein) emulsions
Publikacja -
Two-dimensional gel-based serum protein profile of growing piglets
Publikacja -
Effect of Functionalization of Carbon Nanotubes with Psychosine on Complement Activation and Protein Adsorption
Publikacja -
Myotilin, a New Topotecan Resistant Protein in Ovarian Cancer Cell Lines
Publikacja -
C-reactive protein as a diagnostic and prognostic factor in inflammatory bowel diseases
Publikacja -
Simulation of Protein Structure and Dynamics with the Coarse-Grained UNRES Force Field
Publikacja -
Inhibition of protein glycosylation reverses the MDR phenotype of cancer cell lines
Publikacja -
Blind prediction of homo‐ and hetero‐protein complexes: The CASP13‐CAPRI experiment
Publikacja -
Trial Proteomic Qualitative and Quantitative Analysis of the Protein Matrix of Submandibular Sialoliths
Publikacja -
CAVER 3.0: A Tool for the Analysis of Transport Pathways in Dynamic Protein Structures
Publikacja -
BALCONY: an R package for MSA and functional compartments of protein variability analysis
Publikacja -
Stability of delay induced oscillations in gene expression of Hes1 protein model
PublikacjaW pracy prezentowana jest matematyczna analiza modelu ekspresji genu białka Hes1. Rozważamy układ równań z dwoma opóźnieniami - w produkcji białka Hes1 oraz jego mRNA. Dowodzimy istnienia i jednoznaczności oraz nieujemności rozwiązań. Pokazujemy istnienie dokładnie jednego dodatniego stanu stacjonarnego. Wykazujemy, że stabilność stanu stacjonarnego zależy od sumy opóźnień. Podajemy warunek dostateczny na wystąpienie bifurkacji...