Wyszukiwarka
Filtry
wszystkich: 580
-
Katalog
Wyniki wyszukiwania dla: pathogenic escherichia coli
-
Identification and characterization of single-stranded DNA-binding protein from the facultative psychrophilic bacteria Pseudoalteromonas haloplanktis
PublikacjaSingle-stranded DNA-binding protein (SSB) plays an important role in DNA metabolism such as DNAreplication, repair, and recombination, and is essential for cell survival. This study reports on the ssb-likegene cloning, gene expression and characterization of a single-stranded DNA-binding protein of Pseudoal-teromonas haloplanktis (PhaSSB) and is the first report of such a protein from psychrophilic microorganism.PhaSSB possesses...
-
Characterization of recombinant homocitrate synthase from Candida albicans
PublikacjaLYS21 and LYS22 genes from Candida albicans encoding isoforms of homocitrate synthase (HCS), an enzyme catalyzing the first committed step in the L-lysine biosynthetic pathway, were cloned and expressed as NoligoHistagged fusion proteins in Escherichia coli. The purified gene products revealed HCS activity, i.e. catalyzed the condensation of α-ketoglutarate with acetyl-coenzyme A to yield homocitrate. The recombinant enzymes were purified...
-
A new MIC1-MAG1 recombinant chimeric antigen can be used instead of the Toxoplasma lysate antigen in the serodiagnosis of human toxoplasmosis
PublikacjaW niniejszej publikacji po raz pierwszy przedstawiono otrzymanie i oszacowanie przydatności diagnostycznej nowego chimerycznego antygenu MIC1-MAG1 Toxoplasma gondii do rozpoznawania toksoplazmozy u ludzi. Antygen chimeryczny MIC1-MAG1 został otrzymany jako białko fuzyjne zawierające dwie domeny oligohistydynowe na N- i C-końcu z użyciem systemu ekspresyjnego Escherichia coli. Po oczyszczeniu z wykorzystaniem metody chromatografii...
-
Zaawansowane metody charakterystyki i uzdatniania wody w basenach kąpielowych
PublikacjaW literaturze przedmiotu szeroko opisywane są zagrożenia dla zdrowia kąpiących się i obsługi ze względu na losowe występowanie w wodzie bakterii grupy coli, bakterii Escherichia coli typu kałowego, gronkowca koagulazo-dodatniego, pierwotniaków Cryptosporidium Parvum, Gardia i innych mikroorganizmów, a także produktów reakcji związków dezynfekujących z zanieczyszczeniami organicznymi w wodzie. Stosowane dotychczas technologie uzdatniania...
-
Ultrafiltration Process in Disinfection and Advanced Treatment of Tertiary Treated Wastewater
PublikacjaThe paper presents the results of research on the use of ultrafiltration, using membranes of 200 and 400 kDa separation, for disinfection of municipal treated wastewater. The research was conducted on a fractional technical scale using real municipal treated wastewater from two large wastewater treatment plants treating most of the wastewater over the one-million polycentric Gdańsk agglomeration (1.2 million inhabitants). UF 200...
-
Structural studies of a cold-adapted dimeric Beta-D-galactosidase from Paracoccus sp. 32d
PublikacjaThe crystal structure of a novel dimeric [beta]-D-galactosidase from Paracoccus sp. 32d (Par[beta]DG) was solved in space group P212121 at a resolution of 2.4 Å by molecular replacement with multiple models using the BALBES software. This enzyme belongs to glycoside hydrolase family 2 (GH2), similar to the tetrameric and hexameric [beta]-D-galactosidases from Escherichia coli and Arthrobacter sp. C2-2, respectively. It is the second...
-
Bioactivation of Konjac Glucomannan Films by Tannic Acid and Gluconolactone Addition
PublikacjaWound healing is a dynamic process that requires an optimal extracellular environment, as well as an accurate synchronization between various cell types. Over the past few years, great efforts have been devoted to developing novel approaches for treating and managing burn injuries, sepsis, and chronic or accidental skin injuries. Multifunctional smart-polymer-based dressings represent a promising approach to support natural healing...
-
Toxoplasma gondii: Enzyme-Linked Immunosorbent Assay using different fragments of recombinant microneme protein 1 (MIC1) for detection of immunoglobulin G antibodies
PublikacjaTrzy rekombinantowe fragmenty białka antygenowego MIC1 Toxoplasma gondii (r-MIC1ex2, r-MIC1ex34 i r-MIC1) zostały wyprodukowane jako białka fuzyjne (zawierające dwie domeny oligohistydynowe na N- i C-końcu) w komórkach bakteryjnych Escherichia coli. Homogenne preparaty antygenów rekombinantowych otrzymane z zastosowaniem jednoetapowego oczyszczania metodą chromatografii metalopowinowactwa, wykorzystano następnie do immunoidentyfikacji...
-
Characterization of a single-stranded DNA-binding-like Protein from Nanoarchaeum equitans - a nucleic acid binding protein with broad substrate specificity
PublikacjaBackground SSB (single-stranded DNA-binding) proteins play an essential role in all living cells and viruses, as they are involved in processes connected with ssDNA metabolism. There has recently been an increasing interest in SSBs, since they can be applied in molecular biology techniques and analytical methods. Nanoarchaeum equitans, the only known representative of Archaea phylum Nanoarchaeota, is a hyperthermophilic, nanosized,...
-
THE GENE CLONING, OVEREXPRESSION, PURIFICATION AND BIOCHEMICAL CHARACTERISATION OF A NEW COLD-ADAPTED β–GALACTOSIDASE FROM ARTHROBACTER SP. VII-4
PublikacjaINTRODUCTION. β-Galactosidase [EC 3.2.1.23] is an enzyme that catalyzes the hydrolysis of O-glycosidic linkages in galactosides. It is commercially used in dairy industry for the production of milk with reduced lactose content. Potentially, the best method for lactose removal under cooling conditions should be carried out with a cold-adapted enzyme. AIM. The aim of this study was to determine the taxonomic affiliation of the isolate...
-
B-GALACTOSIDASE ARTHROBACTER SP. 32cB - OBTAINING THE GENE SEQUENCE, CONSTRUCTION OF THE EXPRESSION SYSTEM, BIOSYNTHESIS AND BIOCHEMICAL CHARACTERIZATION OF THE ENZYME
PublikacjaINTRODUCTION: β-Galactosidase is an enzyme which catalyzes the hydrolysis of O glycosidic bond in β-galactosides. Another activity of β galactosidase is a transglycosylation activity. The main industrial use of this protein is the hydrolysis of lactose in milk in a cooling conditions. Synthesis of galactooligosaccharides, which are mostly used as a prebiotics added to some foods or available as dietary supplements, is only one...
-
Preclusion of irreversible destruction of Dr adhesin structures by a high activation barrier for the unfolding stage of the fimbrial DraE subunit
PublikacjaFimbrie Dr uropatogennych szczepów Escherichia coli stanowią przykład eksponowanych powierzchniowo struktur adhezyjnych podlegających biogenezie według zakonserwowanego, pośród bakterii Gram-ujemnych, systemu "chaperone-usher" ("białko opiekuńcze-zewnątrzbłonowe białko kanałowe"). Powyższe struktury adhezyjne są niezbędne w procesie specyficznej adhezji bakterii do receptorów zlokalizowanych na powierzchni docelowych komórek gospodarza....
-
FUNKCJONALIZOWANIE 2H-TIAZOLO[3,2-α]PIRYDYN-5-(3H)-ONÓW, ALTERNATYWNA ŚCIEŻKA SYNTEZY NOWYCH PILICYDÓW
PublikacjaUropatogenne szczepy Escherichia coli są przyczyną blisko 80% przypadków zakażeń dróg moczowych (ang. UTI- Urinary tract infection). Ponadto, aż 30% odmiedniczkowego zapalenia nerek występującego u ciężarnych kobiet jest spowodowane przez szczepy E.coli Dr+. Szerząca się lekooporność bakterii i trudności w leczeniu UTI wymusiły na środowiskach naukowych poszukiwania nowych związków chemicznych pełniących rolę chemoterapeutyków. Na...
-
MutS3: a MutS homologue of unknown biological function
PublikacjaThe homologues of MutS proteins are widespread among both Prokaryotes and Eukaryotes. MutS designated as MutS1 is a part of MMR (mismatch repair) system which is responsible for removal of mispaired bases and small insertion/deletion loops in DNA. Initially, the only MutS homologues known were those engaged in mismatch repair and these were later designated as MutS1. Subsequently, the MutS2 homologue was distinguished. MutS2 does...
-
Structural analogues of reactive intermediates as inhibitors of glucosamine-6-phosphate synthase and phosphoglucose isomerase
PublikacjaCentra aktywne izomerazy fosfoglukozowej (PGI) oraz domeny izomerazowej (HPI) syntazy glukozamino-6-fosforanu (GlcN-6-P), wykazują podobieństwo ułożenia przestrzennego kluczowych reszt aminokwasowych, z wyjątkiem reszty Arg272 PGI i reszt Lys603 i Lys485 HPI. Dziesięć pochodnych D-heksitolo-6-P, kwasu 5-fosfoarabonowego i kwasu 6-fosfoglukonowego, strukturalnych analogów cis-enolaminy lub cis-enolanu, przypuszczalnych stanów przejściowych...
-
A method for the production of D-tagatose using a recombinant Pichia pastoris strain secreting beta-D-galactosidase from Arthrobacter chlorophenolicus and a recombinant L-arabinose isomerase from Arthrobacter sp. 22c
PublikacjaD-Tagatose is a natural monosaccharide which can be used as a low-calorie sugar substitute in food, beverages and pharmaceutical products. It is also currently being tested as an anti-diabetic and obesity control drug. D-Tagatose is a rare sugar, but it can be manufactured by the chemical or enzymatic isomerization of D-galactose obtained by a beta-D-galactosidase-catalyzed hydrolysis of milk sugar lactose and the separation of...
-
Agnieszka Potęga dr hab. inż.
Osoby -
Evaluation of antimicrobial activity of porous composites based on chitosan/poly (vinyl alcohol)
Dane BadawczeThe dataset contains the results of microbiological tests of composite porous materials whose activity was assessed for their ability to reduce the number of Escherichia coli and Staphylococcus aureus strain, representing the Gram (-) and Gram (+) bacteria, respectively.
-
Biofilm bakteryjny uropatogennych szczepów E. coli Dr+ jako czynnik indukujący przewlekłość zakażeń dróg moczowych ograniczający ich leczenie
PublikacjaZakażenia dróg moczowych (ZUM) stanowią jedne z najczęściej występujących infekcji bakteryjnych, dotykających każdego roku miliony osób na świecie. Problematyka tych zakażeń wynika z ich przewlekłości i nawrotów, pomimo stosowania terapii antybiotykowej oraz ciągle wzrastającej lekooporności uropatogenów je wywołujących. Dominującym czynnikiem etiologicznym ZUM są uropatogenne szczepy E. coli (UPECs), wykazujące zdolność do adhezji,...
-
Systemy ekspresji genów - Wykład - 2021_22
Kursy OnlineTematyka wykładów kursu przedstawia następujące treści: Ekspresja genów w organizmach żywych. Źródła informacji:gdy sekwencja genu jest znana, gdy sekwencja genu nie jest znana, bazy danych, biblioteki DNA genomowego, biblioteki cDNA, narzędzia on-line używane do analizy sekwencji DNA. System ekspresyjny genów - pojęcia podstawowe. Kryteria wyboru systemu ekspresyjnego do produkcji białek heterogenicznych w zależności od ich...
-
The Role of Proteases in the Virulence of Plant Pathogenic Bacteria
Publikacja -
Voriconazole-Based Salts Are Active against Multidrug-Resistant Human Pathogenic Yeasts
PublikacjaVoriconazole (VOR) hydrochloride is unequivocally converted into VOR lactates and valinates upon reaction with silver salts of organic acids. This study found that the anticandidal in vitro activity of these compounds was comparable or slightly better than that of VOR. The Candida albicans clinical isolate overexpressing CaCDR1/CaCDR2 genes, highly resistant to VOR, was apparently more susceptible to VOR salts. On the other hand,...
-
Various modes of action of dietary phytochemicals, sulforaphane and phenethyl isothiocyanate, on pathogenic bacteria
Publikacja -
Identification of Novel Chemical Scaffolds Inhibiting Trypanothione Synthetase from Pathogenic Trypanosomatids
Publikacja -
Phage therapy as a novel strategy in the treatment of urinary tract infections caused by E. coli
PublikacjaUrinary tract infections (UTIs) are regarded as one of the most common bacterial infections affecting millions of people, in all age groups, annually in the world. The major causative agent of complicated and uncomplicated UTIs are uropathogenic E. coli strains (UPECs). Huge problems with infections of this type are their chronicity and periodic recurrences. Other disadvantages that are associated with UTIs are accompanying complications...
-
CFD COUPLING OF VOF MODEL WITH ARRHENIUS EQUATION FOR ANALYSIS OF LASER-INDUCED THERMAL DEACTIVATION OF E. COLI
PublikacjaUnderstanding bacterial deactivation at the micro-scale, particularly with E. coli, is crucial for advancing microbiology and has promising applications in biomedical research. In this research contribution, we investigate the thermal inactivation of E. coli bacteria using gold nanoparticles irradiated by a green 1-W laser within a microfluidic chamber. The microfluidic device comprises a fluidic chamber filled with a thin film...
-
Patomechanizm zakażeń dróg moczowych wywoływanych przez uropatogenne szczepy E. coli
PublikacjaZakażenia układu moczowego (ZUM) to jedne z najczęstszych i najbardziej powszechnych infekcji bakteryjnych, dotykających każdego roku nawet 150 milionów ludzi na świecie. Problem z tego typu infekcjami wynika z przewlekłości choroby, nawrotów i wzrastającej lekooporności powodujących je patogenów. Uropatogenne szczepy E. coli (UPEC) są głównym czynnikiem przyczynowym ZUM. Bakterie tej grupy zawierają wiele czynników adhezyjnych...
-
Enhancement of photocatalytic-based processes by mono- and bimetallic (CuPd) rutile loaded nanoparticles for antibiotic resistance genes and facultative pathogenic bacteria removal
PublikacjaThe aim of the study was the strong reduction of facultative pathogenic bacteria (FPB), and clinically relevant antibiotic resistance genes (ARGs) from secondary effluent. To evaluate the ARGs removal efficiency comparative study of individual unit processes and combined AOPs has been performed. The present work investigated: i) removal of selected ARGs, namely blaTEM, ermB, qnrS, tetM, five FPB as well as 16S rDNA and the integrase...
-
Effects of stressful physico-chemical factors on the fitness of the plant pathogenic bacterium Dickeya solani
Publikacja -
Critical factors for the performance of chip array-based electrical detection of DNA for analysis of pathogenic bacteria
Publikacja -
The Activity of Isoquinoline Alkaloids and Extracts from Chelidonium majus against Pathogenic Bacteria and Candida sp.
Publikacja -
Synthesis and transport studies of model dipeptides with modified n-terminal amino groups into e. coli k12 mutant strains
Publikacjaotrzymano na drodze syntezy chemicznej kilka modelowych dipeptydów zawierających n-terminalna guanidynę oraz betainę. zbadano transport tych peptydów do komorek e. coli k12, posiadających zróżnicowane systemy transportowe. wyniki badań potwierdziły brak transportu do komórek bakteryjnych z wykorzystaniem permeaz peptydowych. dodatnio naładowana i silnie polarna grupa aminowa uniemożliwia efektywny transport tych związków do komórek...
-
Analysis of heat transfer and AuNPs-mediated photo-thermal inactivation of E. coli at varying laser powers using single-phase CFD modeling
PublikacjaPurpose In the wake of the COVID-19 pandemics, the demand for innovative and effective methods of bacterial inactivation has become a critical area of research, providing the impetus for this study. The purpose of this research is to analyze the AuNPs-mediated photothermal inactivation of E. coli. Gold nanoparticles irradiated by laser represent a promising technique for combating bacterial infection that combines high-tech and...
-
In vitro biodegradation of bacterial nanocellulose under conditions simulating human plasma in the presence of selected pathogenic microorganisms
PublikacjaThe Biodegradability of bacterial nanocellulose (BNC) was assessed based on a change in its properties under conditions simulating human plasma in the presence or absence of the pathogens Staphylococcus aureus, Candida albicans and Aspergillus fumigatus. It was shown that the dry mass of BNC did not change during 6 months of incubation, except for samples stored in the presence of moulds, where the dry mass reduced by 40 %. The...
-
Fibronectin-, vitronectin- and laminin-binding proteins at the cell walls of Candida parapsilosis and Candida tropicalis pathogenic yeasts
Publikacja -
The ability of selected plant essential oils to enhance the action of recommended antibiotics against pathogenic wound bacteria
Publikacja -
Panax quinquefolium hairy root extracts and their effect in connections with antibiotics against pathogenic bacteria – preliminary study
Publikacja -
Cuticular fatty acids of Galleria mellonella (Lepidoptera) inhibit fungal enzymatic activities of pathogenic Conidiobolus coronatus
Publikacja -
Effect of Water Activity and Titania P25 Photocatalyst on Inactivation of Pathogenic Fungi - Contribution to the Protection of Public Health
Publikacja -
Characterization of the interactions between human high-molecular-mass kininogen and cell wall proteins of pathogenic yeasts, Candida tropicalis
Publikacja -
The activity of different extracts from Panax quinquefolium L. cultures against pathogenic Staphylococcus aureus with respect to ginsenoside content
Publikacja -
Activity of Polish unifloral honeys against pathogenic bacteria and its correlation with colour, phenolic content, antioxidant capacity and other parameters.
PublikacjaThe use of honey as an antimicrobial agent gains importance due to often ineffectiveness of conventional treatment. However, activity of honey depends mainly on its botanical and geographical origin. To date, antimicrobial potential of Polish honeys has not yet been entirely investigated. In this study, 37 unifloral samples of 14 honey types (including rare varieties) from Poland were analysed and compared with manuka honey. The...
-
Conformational stability of the full-atom hexameric model of the ClpB chaperone fromEscherichia coli
Publikacja -
Test of the antimicrobial properties against E. coli of the innovative CS-2a preservative.
Dane BadawczeThe dataset contains the results of a single series of determinations of the antimicrobial properties against E. coli of the innovative CS-2 a preservative in the solution of model fluids.During the test, the infected product is inoculated (on chromogenic Coliform Agar) at specified intervals (0 min. [cs2a 0] and after 1 day-24 h of incubation [cs2a...
-
Test of the antimicrobial properties against E. coli of the innovative CS-2b preservative.
Dane BadawczeThe dataset contains the results of a single series of determinations of the antimicrobial properties against E. coli of the innovative CS-2 b preservative in the solution of model fluids.During the test, the infected product is inoculated (on chromogenic Coliform Agar) at specified intervals (0 min. [cs2b 0] and after 1 day-24 h of incubation [cs2b...
-
Letter to the Editor: Complete resonance assignments of the 'donor-strand' AfaD: The afimbrial invasin from Diffusely Adherent E. coli.
PublikacjaUstalono strukturę NMR rekombiantowego białka AfaD-dsc. Uzyskane wyniki są podstawą do badań rentgenograficznych struktury białek AfaD/DraD.
-
Complete Genome Sequences of Five Gram-Negative Bacterial Strains Comprising Synthetic Bacterial Consortium “The Great Five” with Antagonistic Activity Against Plant-Pathogenic Pectobacterium spp. and Dickeya spp.
Publikacja -
Analysis of heat transfer and AuNPs-mediated photo-thermal inactivation of E. coli at varying laser powers using single-phase CFD modeling
Publikacja -
Aneta Łuczkiewicz prof. dr hab. inż.
OsobyProwadzę badania nad zdolnościami adaptacyjnymi mikroorganizmów oraz możliwością ich wykorzystania do wspomagania procesów technologicznych. Łączę inżynierię środowiska z elementami inżynierii biomedycznej i materiałowej. Interesują mnie nowatorskie metody detekcji mikroorganizmów istotnych klinicznie w środowisku wodnym (tzw. epidemiologia oparta na ściekach) oraz zaawansowane i praktyczne rozwiązania w sektorze gospodarki wodnej....
-
Microorganisms in the air within the Gdańsk-Szadółki landfill and adjacent area in 2015
Dane BadawczeThis data set contains the results of microbiological examination of air samples collected at Gdańsk Szadółki Landfill (Poland) in 2015. The range of examination included qualitative and quantitative assesment of selected species of bacteria and mold fungi, with particular focus on pathogenic and potentially pathogenic fungi and bacteria. The collected...