Filters
total: 3762
filtered: 1680
-
Catalog
- Publications 1680 available results
- Journals 32 available results
- People 69 available results
- Inventions 2 available results
- Projects 10 available results
- Laboratories 3 available results
- Research Teams 1 available results
- Research Equipment 2 available results
- e-Learning Courses 62 available results
- Events 6 available results
- Open Research Data 1895 available results
Chosen catalog filters
displaying 1000 best results Help
Search results for: ADMS-PCA
-
A comparative evaluation of PCR ribotyping and ERIC PCR for determining the diversity of clinical Pseudomonas aeruginosa isolates
PublicationW pracy porównano dwie metody stosowane do badania różnorodności genetycznej drobnoustrojów. Modelem do badań była grupa 62 klinicznych izolatów bakterii P. aeruginosa. Zdecydowanie wyższy potencjał różnicujący stwierdzono w przypadku metody ERIC PCR, której zastosowanie pozwoliło na wyodrębnienie 36 różnych genotypów. W przypadku rybotypowania wyróżniono tylko 9 genotypów.
-
Low-cost data-driven modelling of microwave components using domain confinement and PCA-based dimensionality reduction
PublicationFast data-driven surrogate models can be employed as replacements of computationally demanding full-wave electromagnetic simulations to facilitate the microwave design procedures. Unfortunately, practical application of surrogate modelling is often hindered by the curse of dimensionality and/or considerable nonlinearity of the component characteristics. This paper proposes a simple yet reliable approach to cost-efficient modelling...
-
Optimized 5-hour multiplex PCR test for the detection of tinea unguium: performance in a routine PCR laboratory
PublicationWe recently reported the development of a 5-hour multiplex PCR test for the detection of tinea unguium and the optimization of this test by the inclusion of an inhibition control. Here we report the performance of this procedure as used in a routine clinical laboratory as compared to conventional microscopy and culture-based techniques performed in a mycology reference laboratory. We found in processing 109 samples that 22 (20.2%)...
-
Optimised five-hour multiplex PCR test for the detection of Tinea ungium: performance in a routine PCR laboratory
PublicationWe recently published the development of a 5-hour multiplex PCR test for the detection of dermatophyte nail infection. We have optimized this test by inclusion of an inhibition control and evaluated the test in a routine laboratory when compared to the conventional microscopy and culture. A total of 109 clinical samples received at the mycology reference lab at Statens Serum Institute were included. The samples were divided equally...
-
DDLMS PCR double digestion Ligation Mediated Suppression PCR - a new technique for bacterial specific differentiation
PublicationA new diagnostic kit for K. oxytoca specific differentiation based on ddLMS PCR (ang. double digest ligation Mediated PCR) technique is shown. As a species-specific DNA fragment pehX gene, encoding the enzyme polygalactouronase, was chosen. The genome sequence of K. oxytoca is digested with two endonucleases: AclI and BclI which cut DNA before and after pehX gene. The polymorphic DNA fragments are ligated with AclI-end-specific...
-
Modified DNA polymerases for PCR troubleshooting
PublicationPCR has become an essential tool in biological science. However, researchers often encounter problems with difficult targets, inhibitors accompanying the samples, or PCR trouble related to DNA polymerase. Therefore, PCR optimization is necessary to obtain better results. One solution is using modified DNA polymerases with desirable properties for the experiments. In this article, PCR troubleshooting, depending on the DNA polymerase...
-
The construction and use of a PCR internal control
Publication -
Thermal Properties of PLA/TPS Blends
PublicationFour types of polymer compositions having different amount of potato starch, glycerin and poly(lactic acid) was obtained and characterized by DSC. Adding of TPS to PLA lowered Tg.
-
PCR test for Microsporum canis identification
PublicationMicrosporum canis, for which the natural hosts are cats and dogs, is the most prevalent zoophilic agent causing tinea capitis and tinea corporis in humans. We present here a diagnostic PCR test for M. canis, since its detection and species identification is relevant to the choice of treatment and to the understanding of a probable source of infection. An M. canis-specific PCR was evaluated using 130 clinical isolates of dermatophytes...
-
Optimising approach to designing kernel PCA model for diagnosis purposes with and without a priori known data reflecting faulty states
PublicationFault detection plays an important role in advanced control of complex dynamic systems since precise information about system condition enables efficient control. Data driven methods of fault detection give the chance to monitor the plant state purely based on gathered measurements. However, they especially nonlinear, still suffer from a lack of efficient and effective learning methods. In this paper we propose the two stages learning...
-
Przegląd metod oznaczania pestycydów i PCB w żywności. Methods of determination of pesticides and PCB´s in food - review
PublicationPestycydy i PCB występują w różnych elementach środowiska w dość małych stężeniach, ale związki te ulegają kumulacji i stąd są bardzo niebezpieczne dla zdrowia i życia ludzi i zwierząt. Różnorodność matryc i właściwości fizyko-chemicznych tych związków wymaga stosowania wielu metod przygotowania próbek do analizy i oznaczania. Procedura analityczna składa się z kolejnych bardzo ważnych etapów: pobrania i przygotowania próbki do...
-
PLA–Potato Thermoplastic Starch Filament as a Sustainable Alternative to the Conventional PLA Filament: Processing, Characterization, and FFF 3D Printing
PublicationThe growing popularity of the fused filament fabrication (FFF) 3D printing technology in science, industry, and in-home use is associated with an increased demand for high-quality polymer filaments. This study presents an in-depth characterization and analysis of a self-made bio-based polylactide (PLA)/thermoplastic potato starch (TPS) filament dedicated for the FFF 3D printing technology. The obtained results were compared with...
-
PCR and real-time PCR approaches to the identification of Arthroderma otae species Microsporum canis and Microsporum audouinii/Microsporum ferrugineum
PublicationObjectives The identification of species in the Arthroderma otae complex is essential to determine the origin of infection and to eliminate the risk of transmission. Microsporum canis is a zoophilic species, whereas Microsporum audouinii and Microsporum ferrugineum are anthropophilic species. In this paper, we propose alternative methods that permit species-specific identification of both anthropophilic and zoophilic members of...
-
Anticarcinogenic and antioxidant activities of leaves and flowers hydroalcoholic extracts of Nerium oleander L.: PCA analysis and phytochemical content by FTIR spectroscopy
PublicationAims: The aim of this work is the evaluation the anticarcinogenic effect on HT29 cancer cells lines and antioxidant effect of three extracts from different morphological parts (leaves (LE), pink flowers (PFE) and white flowers (WFE)) of Nerium oleander lin. Methods: This research provides the anticarcinogenic activity of extracts from N. oleander white flowers. Principal Component Analysis (PCA) was applied to estimate the relationship...
-
The influence of the welding thermal cycles on corrosion resistance of duplex stainless steel
PublicationBadano skłonnośc strefy wpływu ciepła spoin ze stali dupleks do korozyjnego pękania narężeniowego. Wykonano próby korozyjne z wykorzystaniem metody SSRT w środowisku korozyjnym wrzącego MgCl2. Wykazano, że duży udział ferrytu w strukturze SWC pogarsza odpornośc na korozję. Badania metalograficzne na mikroskopie lektronowym wykazały różne sposoby propagacji pęknięcia zależnie od zawartości austenitu w strukturze SWC.
-
Diagnostic PCR assay for Microsporum and Trichophyton infections
PublicationWe have previously described a highly sensitive 5-hour PCR test for the rapid diagnosis of onychomycosis which detects any dermatophyte and species-identify T. rubrum from patient specimens. We have subsequently developed and evaluated new PCR tests for detection of Trichophyton and Microsporum canis/audouinii infections.58 dermatophyte isolates (21) Microsporum spp. (4 different species), 35 Trichophyton spp (10 different species)...
-
Pea Protein for Hempseed Oil Nanoemulsion Stabilization
Publication -
Ligation Mediated PCR methods, their possibilities and limitations
PublicationThe application of molecular diagnostics for bacterial strain typing or identifying bacteria at the strain level is of particular importance at present. However, among the many genotyping methods that are currently available, no single one is universally ideal. In this article, we thus review the Ligation Mediated PCR group methods as prospects from which to choose. We discuss different strategies for selecting the amplified PCR...
-
The New LM-PCR/Shifter Method for the Genotyping of Microorganisms Based on the Use of a Class IIS Restriction Enzyme and Ligation Mediated PCR
PublicationThis study details and examines a novel Ligation-Mediated - Polymerase Chain Reaction (LM-PCR) method. Named the LM-PCR/Shifter, it relies on the use of a Class IIS restriction enzyme giving restriction fragments with different 4 base, 5' overhangs, this being the Shifter, and the ligation of appropriate oligonucleotide adapters. A sequence of 4-base, 5' overhangs of the adapter and a 4-base sequence of the 3' end of the primer(s)...
-
PCA and multidimensional visualization techniques united to aid bioindication of elements from transplanted Sphagnum palustre moss exposed in the Gdańsk city area
PublicationPrzedstawiono wyniki badań zanieczyszczenia atmosfery w Gdańsku za pomocą oznaczeń 18 metali ciężkich w martwych i żyjących mchach Spagnum palustre. Mchy były eksponowane w 12 punktach miasta, a oznaczenia metali przeprowadzono techniką analizy neutronowej. Celem pracy było zbadanie: przydatności żywych i martwych mchów do biokumulacji metali, zanieczyszczenia poszczególnych dzielnic Gdańska metalami ciężkimi oraz narażenia mieszkańców...
-
Determination of pKa by pH Gradient Reversed-Phase HPLC
Publication -
Simultaneous Determination of pKa and Lipophilicity by Gradient RP HPLC
Publication -
Real-Time PCR: molecular technique of many applications
PublicationReal-Time PCR is a sensitive DNA amplification technique initially applied in genetics and molecular biology. It enables in vivo copying of the selected DNA fragment (flanked by two primers) by the thermostable polymerase (in the presence of magnesium ions and deoxynucleotide triphosphates) and simultaneous measurement of the fluorescence. For one or more specific sequences in a DNA sample, real-time PCR enables both detection...
-
The New LM-PCR/Shifter Method for the Genotyping of Microorganism
PublicationTechniques relies on the ligation of appropriates adapters (LM-PCR) as AFLP, PCR MP and ADSRRS are successfully used for epidemiological studies for prokaryotic and eukaryotic microorganisms. In this study we propose a new method, called the LM-PCR/Shifter, based on the use of a Class IIS restriction enzyme giving restriction fragments with different 4 base 5' overhangs (Shifter) and the ligation of appropriate oligonucleotide...
-
Theoretical pKa prediction of O-phosphoserine in aqueous solution
PublicationSprawdzono zdolność modelu polaryzowalnego kontinuum (PCM) do przewidywania wartości pKa w roztworze wodnym dla O-fosfoseryny (P-Ser). Obliczenia przeprowadzono w ramach teorii funkcjonału gęstości (DFT) przy użyciu funkcjonałów B3LYP i M06-2X oraz baz 6-31+G(d) and 6-31+G(d,p). Obliczenia na poziomie B3LYP/6-31+G(d,p) przy użyciu modelu solwatacji SMD zapewniają doskonałą zgodność z doświadczeniem, pod warunkiem uwzględnienia...
-
PRZYDATNOŚĆ DIAGNOSTYCZNA REAKCJI PCR W ROZPOZNAWANIU BORELIOZY
PublicationBorelioza jest wieloukładową chorobą wywoływaną przez bakterie zaliczane do kompleksu Borrelia burgdorferi sensu lato. Wektorem przenoszącym infekcję są kleszcze z rodzaju Ixodes, które zakażają kolejnych żywicieli krętka podczas spożywania ich krwi. Zróżnicowany przebieg boreliozy uniemożliwia jej rozpoznanie na podstawie objawów klinicznych. W związku z tym diagnostyka choroby z Lyme opiera się głównie na metodach laboratoryjnych,...
-
Wykorzystanie reakcji PCR do badania charakterystycznych obszarów genomu
PublicationW pracy zostały opisane metody wykorzystujące technię PCR do długo- i krótkoterminowych badań epidemiologicznych. Typowanie szczepów oparte jest na analizie fragmentów genów, bądź całego genomu w zależności od potrzeby posiadania potencjału różnicującego metody. Przez ostatnie 30 lat rozwijały się nie tylko metody badawcze, doszło również do rozwoju międzynarodowych baz danych i przepływu informacji o obecnych sytuacjach epidemiologicznych...
-
Aproksymacja zmian stężenia znacznika w badaniach pCT płuc
PublicationW artykule zaproponowano nową metodę aproksymacji zmian stężenia znacznika w badaniach pCT płuc. Zmiany stężenia znacznika są skanowane z częstotliwością kilkakrotnie większą niż częstotliwość oddechu. Metoda opiera się na spostrzeżeniu, że częstotliwość występowania pików na krzywych zmian stężenia znacznika jest równa częstotliwości oddechu badanego. Zaprezentowano przykładowe dopasowanie funkcji regresji w postaci krzywej Gaussa...
-
Preparation of double-sided self-adhesive tape Si-PSA
Publication -
Detection of sulfonamide resistance genes via in situ PCR-FISH
PublicationDue to the rising use of antibiotics and as a consequence of their concentration in the environment an increasing number of antibiotic resistant bacteria is observed. The phenomenon has a hazardous impact on human and animal life. Sulfamethoxazole is one of the sulfonamides commonly detected in surface waters and soil. The aim of the study was to detect sulfamethoxazole resistance genes in activated sludge biocenosis by use of...
-
Detecting evoked potentials with SVD and ICA BASED statistical models
PublicationDokonano porównania rezultatów detekcji potencjałów wywołanych przy zastosowaniu metod statystycznych SVD i ICA. Jako dane wejściowe użyto dane wynikowe addytywnego modelu aktywności elektrycznej mózgu.
-
Polymer humidity sensors deposited directly on PCB laminate substrate
PublicationW artykule przedstawiono wyniki badań stabilności polimerowych czujników wilgotności zbudowanych na podłożu z laminatu PCB
-
The Effect of Nanosilica on the Mechanical Properties of polymer-Cement Composites (PCC)
Publication -
Ewaluation of a PCR Melting Profile technique for bacterial strain differentiation
PublicationBadano przydatność techniki PCR MP w efektywnym typowaniu szczepów w badaniach epidemiologicznych zakażeń szpitalnych. Technika oparta jest na użyciu niskiej temperatury denaturacji podczas LM PCR. Badaniu zostały poddane izolaty Escherichia coli pochodzące od pacjentów Szpitala Klinicznego w Gdańsku. Wykazano, że technika jest szybka, o wysokim potencjale różnicującym i bardzo dobrej powtarzalności i może być zastosowana w badaniach...
-
Preparation and characterization of biodegradable and compostable PLA/TPS/ESO compositions
PublicationIn this study, biodegradable and compostable compositions, derived from totally natural feedstock/raw materials, namely polylactide (PLA), potato thermoplastic starch (TPS) and plant glycerin have been made by melt extrusion with epoxydized soybean oil (ESO) as reactive modifier in order to improve PLAs ductility and reduce the products cost without compromising biodegradation. The obtained PLA/mTPS(0,5ESO)[75/25] and PLA/ mTPS(2ESO)[75/25]...
-
Thermal energy storage using stearic acid as PCM material
PublicationThis work presents an experimental study of thermal energy storage by use of PCM. The aim of the study was to establish the influence of different inlet temperature of heat transfer fluid (HTF) and different Reynolds number of HTF on intensity of charging process. The PCM used in this study was stearic acid and water was used as HTF. A copper helical coil mounted in cylindrical container served as a heat transfer surface.
-
Tomografia perfuzyjna pCT w diagnostyce cukrzycowej mikroangiopatii płucnej
PublicationNiniejsza rozprawa jest poświęcona zagadnieniom diagnostyki mikroangiopatii płucnej ze szczególnym uwzględnieniem perfuzyjnej tomografii komputerowej (pCT). Retinopatia, nefropatia i neuropatia są znanymi powikłaniami cukrzycy. Mało poznany jest wpływ cukrzycy na funkcjonowanie układu oddechowego. Obecnie stosowana metoda diagnostyki cukrzycowej mikroangiopatii płucnej ma ograniczoną wiarygodność. W rozprawie została przedstawiona...
-
Rime samples characterization and comparison using classical and fuzzy principal components analysis
PublicationEfektywność dwóch nowych algorytmów w stosunku do klasycznego wariantu techniki PCA porównano analizując dane dotyczące zanieczyszczeń próbek sadzi zebranych na terenie trzech stacji w okresie 2004-2007. Zastosowane algorytmy FPCA-1 i FPCA-o pozwalają na wyodrębnienie większej liczby miejsc zbierania próbek i analitów w stosunku do sytuacji, kiedy stosuje się klasyczny wariant techniki PCA.
-
Determination of tributylotin (TBT) in marine sediment using pressurised liquid extraction-gas chromatography-isotope dilution mass spectrometry (PLE-GC-IDMS) with a hexane-tropolone mixture
PublicationOpracowano metodę oznaczania zawartości tributylocyny w próbkach osadu morskiego. Na etapie izolacji zastosowano technikę przyspieszonej ekstrakcji za pomocą roztworu tropolonu w heksanie.Na etapie oznaczeń końcowych wykorzystano technikę chromatografii gazowej, stosując metodę spektrometrii mas rozcieńczenia izotopowego. Wyznaczono parametry walidacyjne opracowanej metody: granicę wykrywalności, precyzję, poprawność i niepewność.
-
Determination of tributyltin (TBT) in marine sediment using pressurised liquid extraction–gas chromatography–isotope dilution mass spectrometry (PLE–GC–IDMS) with a hexane–tropolone mixture
Publication -
Diagnostic PCR tests for Microsporum audouinii, M. canis and Trichophyton infections
PublicationSince traditional diagnosis of dermatophyte infections is slow, we present a rapid new pcr test for detection of trichophyton spp., microsporum canis and m. audouinii infections. the performance of the test was evaluated with: 58 dermatophyte isolates; 10 yeast, mould and human dna control samples; 25 routine specimens from patients suspected of having dermatophytosis; 10 hair specimens from guinea pigs experimentally infected...
-
<title>Data acquisition module implemented on PCI mezzanine card</title>
Publication -
<title>FPGA based PCI mezzanine card with digital interfaces</title>
Publication -
Rating mathematical models for first-pass of tracer in pCT lung studies
PublicationThis paper presents a comparison of model based on the Gauss function and the most commonly used Gamma-variate model in perfusion computed tomography (pCT) lung studies. It also verifies whether used model affects value of blood volume parameter. Three mean concentration-time curves were created from actual pCT measurements: arterial input function, blood vessels in lungs and lung parenchyma. On the basis of these mean curves we...
-
Intercomparison on measurements of PCBs in pork fat during the Belgian PCB-crisis
PublicationW pracy przedstawiono wyniki porównania międzylaboratoryjnego oznaczania PCB w tłuszczu wieprzowym. Porównanie międzylaboratoryjne przeprowadzono w związku z tzw. "belgijskim kryzysem PCB" w latach 1999-2000. W porównaniu uczestniczyło 31 laboratoriów. Materiałem do badań były wyprodukowane w Instytucie Metod i Pomiarów Odniesienia (IRMM) w Geel - Belgia, trzy materiały odniesienia zawierające PCB w tłuszczu wieprzowym (suma PCB...
-
Analysis of the Environmental Impact of the Hull Construction of a Small Vessel Based on LCA
PublicationIn recent years, issues related to the impact of human activity on the natural environment have become pressing, and the challenge of global warming necessitates immediate action. To support environmental protection efforts, it has become imperative to adopt a broader perspective when evaluating various products and systems. A valuable tool for such assessments is a life cycle assessment (LCA), which enables a comprehensive analysis...
-
Analytical procedures for PAH and PCB determination in water samples - error sources
PublicationW pracy przedstawiono poszczególne etapy procedury analitycznej wykorzystywanej do oznaczania analitów z grupy WWA i PCB w próbkach wody. Pokazano jakie problemy występują podczas oznaczania wyżej wymienionych analitów i jaki mogą mieć wpływ na końcowy wynik analizy.
-
Sources of errors associated with the determination of PAH and PCB analytes in water samples
PublicationW pracy przedstawiono problemy związane z oznaczaniem analitów z grupy WWA i PCB w próbkach wody. Zidentyfikowano źródła błędów. Szczególną uwagę zwrócono na:- proces adsorpcji analitów na ściankach szklanych naczyń używanych w trakcie obróbki i przechowywania próbek,- wpływ etapu odparowywania nadmiaru rozpuszczalnika z ekstraktów na odzysk analitów,- wpływ materiału, z którego jest wykonana kolumienka ekstrakcyjna (szkła, polietylenu)...
-
The role of resilience in explaining hotel growth: A fuzzy-set QCA approach
PublicationPurpose: Due to the detrimental effects of the recent pandemic on the hotel sector, hotel resilience research and its impact on hotel recovery have received lots of academic attention. However, a sustainable perspective on hotel resilience, as an approach for investigating its impact on long-term hotel growth, has been largely overlooked in the hospitality resilience literature. Therefore, this paper aims to address the research...
-
Real-time PCR approach in dermatophyte detection and Trichophyton rubrum identification
PublicationDermatophytes are keratinophilic molds that infect human hair, nails and skin. Diagnosis of dermatophytosis is based on morphological, serological and biochemical features. However, identification is difficult and laborious due to similarities between microorganisms. Thus, there is considerable interest to develop mycological diagnostic procedures based on molecular biology methods. In this study, fast, two-step DNA extraction...