Wyszukiwarka
Filtry
wszystkich: 1230
-
Katalog
- Publikacje 971 wyników po odfiltrowaniu
- Czasopisma 12 wyników po odfiltrowaniu
- Konferencje 1 wyników po odfiltrowaniu
- Osoby 62 wyników po odfiltrowaniu
- Wynalazki 11 wyników po odfiltrowaniu
- Projekty 36 wyników po odfiltrowaniu
- Laboratoria 1 wyników po odfiltrowaniu
- Zespoły Badawcze 8 wyników po odfiltrowaniu
- Kursy Online 44 wyników po odfiltrowaniu
- Wydarzenia 2 wyników po odfiltrowaniu
- Dane Badawcze 82 wyników po odfiltrowaniu
wyświetlamy 1000 najlepszych wyników Pomoc
Wyniki wyszukiwania dla: SYNTEZA REPLIKACYJNA DNA
-
Prediction based on integration of Decisional DNA and a feature selection algorithm Relief-F
PublikacjaThe paper presents prediction model based on Decisional DNA and Set of experienced integrated with Relief_F algorithm for feature selection
-
Molecular differences in mitochondrial DNA (mtDNA) genomes of dogs with malignant mammary tumours
Dane BadawczeThe aim of this study was to determine molecular defects in mitochondrial DNA with the use of large-scale genome analysis in malignant canine mammary gland tumours and indicate whether these changes were linked with the carcinogenesis process. With the use of the NGS technology, we sequenced 27 samples of mtDNA isolated from blood and tumours obtained...
-
Aplikacja wspomagająca przetwarzanie sekwencji dna: moduł dopasowań
PublikacjaBiologia molekularna jest obecnie bardzo dynamicznie rozwijającą się dziedziną nauki. Wzrost mocy obliczeniowej komputerów pozwala na coraz szybszą i dokładniejszą analizę wielocząsteczkowych biologicznych polimerów. Poniższy artykuł przedstawia jeden z modułów programu AlignGator - modułowego systemu przeznaczonego do analizy DNA. Omawiany moduł pozwala na tworzenie, oraz edycję wielodopasowań. W początkowej części artykułu opisane...
-
Dominant Pathways of Adenosyl Radical-Induced DNA Damage Revealed by QM/MM Metadynamics
PublikacjaBrominated nucleobases sensitize double stranded DNA to hydrated electrons, one of the dominant genotoxic species produced in hypoxic cancer cells during radiotherapy. Such radiosensitizers can therefore be administered locally to enhance treatment efficiency within the solid tumor while protecting the neighboring tissue. When a solvated electron attaches to 8-bromoadenosine, a potential sensitizer, the dissociation of bromide...
-
Kompleksy [CoCl(S2CNR2)(PR'3)] - synteza i właściwości
PublikacjaDitiokarbamianiany metali są związkami o znaczeniu przemysłowym, ale wciąż stanowią obiekt badań podstawowych. Właściwości tego typu kompleksów można korzystnie modyfikować stosując różnorodne dodatkowe ligandy, w tym P-donorowe. Stosunkowo dobrze poznano budowę układów [MCl(S2CNR2)(PR'3)] zwłaszcza dla M=Ni, gdzie dane strukturalne jednoznacznie pokazują płaską kwadratową geometrię rdzenia NiClS2P tworzących się kompleksów. Dla...
-
Synteza i właściwości poliuretanów otrzymanych z surowców odpadowych
PublikacjaPrzedstawiono sposób otrzymywania glikolizatów z odpadowych wyrobów wykonanych z lanych elastomerów uretanowych oraz wyniki prób wykorzystania tych glikolizatów jako monomerów w syntezie poliuretanów. Glikolizaty uzyskiwano w reakcji glikolu etylenowego z rozdrobnionym materiałem pochodzącym z wycofanych z eksploatacji listew poliuretanowych. Stosunek masowy odpadowego elastomeru uretanowego do glikolu zmieniano od 1:2 do 10:1....
-
Kompleksy [CoCl(S2CNR2)(PR'3)] - synteza i właściwości
PublikacjaDitiokarbamianiany metali są związkami o znaczeniu przemysłowym, ale wciąż stanowią obiekt badań podstawowych. Właściwości tego typu kompleksów można korzystnie modyfikować stosując różnorodne dodatkowe ligandy, w tym P-donorowe. Stosunkowo dobrze poznano budowę układów [MCl(S2CNR2)(PR'3)] zwłaszcza dla M=Ni, gdzie dane strukturalne jednoznacznie pokazują płaską kwadratową geometrię rdzenia NiClS2P tworzących się kompleksów. Dla...
-
Synteza, właściwości i zastosowanie nowych (bio)degradowalnych poliestrouretanów.
PublikacjaArtykuł stanowi przegląd literaturowy dotyczący badań nad syntezą i wybranymi właściwościami dwóch grup nowych (bio)degradowalnych poliestrouretanów. W skłąd jednego z nich wchodzi polilaktyd (PLA) a drugiego alifatyczno-aromatyczny kopolimer poli[(tereftalanu-1,4-butylenu-co-(adypinianu 1,4-butylenu)] (BTA) i/lub ataktyczny poli(RS]-3-hydroksymaślan (a-PHB).
-
Synteza, budowa i właściwości poliestrouretanów sieciowanych metakrylanem metylu
PublikacjaNową grupę poliestrouretanów (PEU) sieciowanych metakrylanem metylu otrzymano z nienasyconych prepolimerów uretanowych zsyntetyzowanych z oligo(alkilenoestro)dioli (OEA) zawierającą wiązania podwójne. Budowę otrzymanych PEU ustalono na podstawie analizy widm FTIR. Wyniki badań statycznych i dynamicznych właściwości mechanicznych oraz właściwości termicznych wykazały, że uzyskane PEU są interesującą grupą polimerów, których właściwości...
-
Synteza i właściwości biologiczne nowych analogów antybiotyków edeinowych
Publikacja.
-
Synteza, właściwości oligouretanodioli i uzyskanych z nich poliuretanów
PublikacjaCelem pracy było otrzymanie oligouretanomeroli, które mogą wykazywać przydatność do otrzymania poliuretanów. Oligouretanodiole otrzymano w recyklingu surowcowym odpadowej pianki polieterometanowej. Poliuretany syntezowano z izocyjanem MDI......oligouretanodiolu z polieterodiolem (Pokopol D2002) i glikolu butylowego. Własności mechaniczne poliuretanów zmierzono przy użyciu maszyn wytrzymałościowych.
-
Decisional DNA with embedded Relief-F linear regression for knowledge and experience management
PublikacjaOmowiono zastowania Decyzyjnego DNA, regresji liniowej oraz funkcji RELIEF-F w procesach formalnego modelowania i wspomagania zarzadzania wiedza oraz zarzadzania doswiadczeniem.
-
DNA repair is responsible for the presence of oxidatively damaged DNA lesions in urine
Publikacja -
Low-Molecular Pyrazine-Based DNA Binders: Physicochemical and Antimicrobial Properties
PublikacjaPyrazine and its derivatives are a large group of compounds that exhibit broad biological activity, the changes of which can be easily detected by a substituent effect or a change in the functional group. The present studies combined theoretical research with the density functional theory (DFT) approach (B3LYP/6-311+G**) and experimental (potentiometric and spectrophotometric) analysis for a thorough understanding of the structure...
-
Molecular basis for the DNA damage induction and anticancer activity of asymmetrically substituted anthrapyridazone PDZ-7
Publikacjanthrapyridazones, imino analogues of anthraquinone, constitute a family of compounds with remarkable anti-cancer activity. To date, over 20 derivatives were studied, of which most displayed nanomolar cytotoxicity towards broad spectrum of cancer cells, including breast, prostate and leukemic ones. BS-154, the most potent derivative, had IC50 values close to 1 nM, however, it was toxic in animal studies. Here, we characterize another...
-
The Neural Knowledge DNA Based Smart Internet of Things
PublikacjaABSTRACT The Internet of Things (IoT) has gained significant attention from industry as well as academia during the past decade. Smartness, however, remains a substantial challenge for IoT applications. Recent advances in networked sensor technologies, computing, and machine learning have made it possible for building new smart IoT applications. In this paper, we propose a novel approach: the Neural Knowledge DNA based Smart Internet...
-
Decisional DNA based framework for representing Virtual Engineering Objects
PublikacjaIn this paper, we propose a frame-work to represent the Virtual Engineering Objects (VEO) utilizing Set of Knowledge Experience Structure (SOEKS) and Decisional DNA. A VEO will enable the discovery of new knowledge in a manufacturing unit and the generation of new rules that drive reasoning. The proposed VEO framework will not only be knowledge based representation but it will also have its associated experience embedded within...
-
How acidic amino acid residues facilitate DNA target site selection
PublikacjaDespite the negative charge of the DNA backbone, acidic residues (Asp/Glu) commonly participate in the base readout, with a strong preference for cytosine. In fact, in the solved DNA/protein structures, cytosine is recognized almost exclusively by Asp/Glu through a direct hydrogen bond, while at the same time, adenine, regardless of its amino group, shows no propensity for Asp/Glu. Here, we analyzed the contribution of Asp/Glu...
-
Effects of metallic silver particles on resonance energy transfer between fluorophores bound to DNA.
PublikacjaZbadano wpływ filmów wysepek metalicznego srebra na rezonansowe przekazywanie energii między fluoroforami związanymi z DNA. Donorem i akceptorem były odpowiednio 4´,6 diamidyno-2-fenylindon i jodek propydyny. Zmierzone dla tego układu czasy zaniku i widma fluorescencji pokazują, że sąsiedztwo cząstek srebra dramatycznie zwiększa promień Forstera, a tym samym i przekazywanie energii w znakowanym DNA.
-
Two-photon induced fluorescence of Cy5-DNA in buffer solution and on silver island film
PublikacjaOpisano fluorescencję barwnika CY5 połączonego z DNA w roztworze buforowym na wysepkach srebrowych.
-
Principles and applications of Ligation Mediated PCR methods for DNA-based typing of microbial organisms
PublikacjaA significant number of DNA-based techniques has been introduced into the field of microorganisms’ characterization and taxonomy. These genomic fingerprinting methods were developed to detect DNA sequence polymorphisms by using general principles, such as restriction endonuclease analysis, molecular hybridization, and PCR amplification. In recent years, some alternative techniques based on ligation of oligonucleotide adapters before...
-
DNA and its Metaphors
Publikacja -
Increased concentration of Taq DNA polymerase as a solution for GC-rich templates from clinical and environmental samples
PublikacjaDNA polymerase is an enzyme which plays crucial role in replication and DNA repair. It found application in PCR (polymerase chain reaction) where catalyses process of in vitro DNA synthesis. To meet the demands posed by mod- ern diagnostic, molecular biology or genetic engineering it is necessary to improve DNA polymerases to obtain new or better features useful in these fields. So far implemented modifications in majority are...
-
Klasyfikacja dna morskiego na podstawie kątowej zależności cech echa z sonaru wielowiązkowego
PublikacjaPrzedstawiono metodę rozpoznawania i klasyfikacji rodzaju dna morskiego opartą na przetwarzaniu echa z sonaru wielowiązkowego. Metoda ta polega na obliczaniu zbioru parametrów obwiedni ech dla poszczególnych wiązek, podobnie jak w metodach wykorzystujących echosondy jednowiązkowe. Następnie estymowana jest zależność wartości poszczególnych parametrów od kąta wiązki oraz badane jest powiązanie otrzymanej zależności z rodzajem dna...
-
Silver nanoparticles induce premutagenic DNA oxidation that can be prevented by phytochemicals from Gentiana asclepiadea
PublikacjaAmong nanomaterials, silver nanoparticles (AgNPs) have the broadest and most commercial applications due to their antibacterial properties, highlighting the need for exploring their potential toxicity and underlying mechanisms of action. Our main aim was to investigate whether AgNPs exert toxicity by inducing oxidative damage to DNA in human kidney HEK 293 cells. In addition, we tested whether this damage could be counteracted...
-
How proteins bind to DNA: target discrimination and dynamic sequence search by the telomeric protein TRF1
PublikacjaTarget search as performed by DNA-binding proteins is a complex process, in which multiple factors contribute to both thermodynamic discrimination of the target sequence from overwhelmingly abundant off-target sites and kinetic acceleration of dynamic sequence interrogation. TRF1, the protein that binds to telomeric tandem repeats, faces an intriguing variant of the search problem where target sites are clustered within short fragments...
-
The influence of the substrate temperature on the preparation of DNA films for studies under vacuum conditions
PublikacjaPrzeanalizowano wpływ temperatury na formowanie warstw DNA. Sprawdzono wpływ stabilizatorów na jakość otrzymanych próbek. Stwierdzono, że optymalnymi warunkami przygotowywania filmów do badań w warunkach próżniowych jest - 10 st. C przy minimalnej zawartości NaOH.
-
Photostability pf Cy3 and Cy5-labeled DNA in the presence of metallic silver particles
PublikacjaZbadano wpływ cząstek metalicznego srebra na fotostabilność oligomerów DNA kowalencyjnie związanych z Cy3 lub Cy5. Zbliżenie fluoroforów do cząstek srebra powodowało zwiększenie intensywności fluorescencji i pojawienie się frakcji emisji bardziej odpornej na wybielanie.
-
DNA adduct formation by C-1748, a potent antitumor 4-methyl-1-nitroacridine of lowered toxicity.
Publikacja4-podstawione 1-nitroakrydyny reprezentują nową grupę pochodnych zsyntetyzowanych na Politechnice Gdańskiej. W porównaniu do macierzystych 1-nitroakrydyn związki te wykazują obniżoną toksyczność i podwyższoną aktywność przeciwnowotworową. Wiodąca pochodna 4-metylo-1-nitroakrydyna o symbolu C-1748 jest obecnie w przygotowaniu do I fazy badań klinicznych w leczeniu raka okrężnicy. Wprowadzenie elektrodonorowej grupy metylowej w...
-
Toward Smart Innovation Engineering: Decisional DNA-Based Conceptual Approach
PublikacjaABSTRACT Knowledge and experience are essential requirements for product innovation. The presented paper proposes a systematic approach for product innovation support using a Smart Knowledge Management System comprising a Set of Experience Knowledge Structure (SOEKS) and Decisional DNA (DDNA). This proposed system is dynamic in nature because it updates itself every time a new decision related to innovation is made. Through this...
-
Aplikacja wspomagająca przetwarzanie sekwencji dna: moduł edycji chromatogramu
PublikacjaModuł edycji chromatogramu jest częścią większej aplikacji, służącej do wspomagania przetwarzania danych pochodzących z sekwencjonowania DNA. Aplikacja skonstruowana jest z odrębnych, samodzielnych programów, które współpracują dwiema drogami - poprzez popularne formaty plików, co umożliwia wprowadzenie do modułów danych opracowanych częściowo w aplikacjach zewnętrznych, oraz poprzez przesyłanie danych pomiędzy modułami, co usprawnia...
-
Decisional-DNA Based Smart Production Performance Analysis Model
Publikacjan order to allocate resources effectively according to the production plan and to reduce disturbances, a framework for smart production performance analysis is proposed in this article. Decisional DNA based knowledge models of engineering objects, processes and factory are developed within the proposed framework. These models are the virtual representation of manufacturing resources, and with help of Internet of Things, are capable...
-
DNA methylation in cancer development, diagnosis and therapy-multiple opportunities for genotoxic agents to act as methylome disruptors or remediators
PublikacjaThe role of DNA methylation and recently discovered hydroxymethylation in the function of the human epigenome is currently one of the hottest topics in the life sciences. Progress in this field of research has been further accelerated by the discovery that alterations in the methylome are not only associated with key functions of cells and organisms, such as development, differentiation and gene expression, but may underlie a number...
-
From Individual to Collective: Intelligence Amplification with Bio-Inspired Decisional DNA and its Extensions
PublikacjaIn nature, deoxyribonucleic acid (DNA) contains the genetic instructions used in the development and functioning of all known living organisms. The idea behind our vision is to develop an artificial system, an architecture that would support discovering, adding, storing, improving and sharing information and knowledge among agents and organizations through experience. We propose a novel Knowledge Representation (KR) approach in...
-
Total DNA Methylation Changes Reflect Random Oxidative DNA Damage in Gliomas
Publikacja -
Total DNA methylation as a biomarker of DNA damage and tumor malignancy in intracranial meningiomas
Publikacja -
Synteza i badania biologiczne nowych analogów kwasu mykofenolowego z pochodnymi adenozyny jako potencjalnych leków immunosupresyjnych
PublikacjaPrzedstawiona praca doktorska pt. „Synteza i badania biologiczne nowych analogów kwasu mykofenolowego z pochodnymi adenozyny jako potencjalnych leków immunosupresyjnych” poświęcona jest związkom immunosupresyjnym opartym o cząsteczkę kwasu mykofenolowego oraz pochodnych adenozyny. Z medycznego punktu widzenia, gdy długotrwała choroba lub nagły przypadek powoduje nieodwracalny uraz tkanek, komórek lub niewydolność organu i żadna...
-
Wpływ warunków naturalnych na zobrazowanie dna Zatoki Gdańskiej przy użyciu sonaru bocznego
PublikacjaGłównym celem artykułu jest przedstawienie wpływu warunków środowiskowych na dokładność zobrazowania dna morza za pomocą systemów hydroakustycznych. Czynniki naturalne, przede wszystkim falowanie powierzchni morza i niejednorodny rozkład prędkości dźwięku w wodzie, mają wpływ na zmianę toru promieni akustycznych. Choć w obu przypadkach mechanizm zjawisk jest zupełnie odmienny, odgrywają one decydującą rolę w odwzorowaniu dna i...
-
Mitochondrial DNA Part B-Resources
Czasopisma -
Recent Advances in DNA and Gene Sequences
Czasopisma -
Diagnostyka zakażeń Candida spp. oparta o amplifikację DNA techniką PCR
PublikacjaZakażenia wywoływane przez oportunistyczne grzyby z rodzaju Candida są poważnym problemem klinicznym. Niezbędne jest poszukiwanie nowych szybkich, czułych i pewnych metod do identyfikacji gatunkowej tych drobnoustrojów. W artykule przedstawiono opisane w literaturze metody diagnostyki molekularnej drożdżaków z rodzaju Candida oparte o amplifikację DNA techniką PCR.
-
Emulgatory acylopropylenoglikolowe otrzymywane w układach mikroemulsyjnych - synteza i właściwości
PublikacjaW pracy przedstawiono możliwości syntezy emulgatorów acylopropylenoglikolowych na drodze bezpośredniej estryfikacji glikolu propylenowego kwasami tłuszczowymi C12:0 - C18:0 przebiegającej w układzie mikroemulsyjnym w obecności surfaktantów: anionowego dodecylosiarczanu sodu i niejonowego polioksyetylenowanego glikolu etylenowego. Opisano wpływ rodzaju i stężenia surfaktantu, budowy kwasu tłuszczowego użytego w syntezie, temperatury...
-
Synteza obrazów parametrycznych w badaniu perfuzji mózgu metodą MRI.
PublikacjaZaprezentowano analizę teoretyczną podstaw obrazowania parametrycznego dla badań dynamicznych mózgu z dożylnym podaniem środka kontrastującego. Opracowano oprogramowanie umożliwiające syntezę obrazów parametrycznych. Na podstawie przeprowadzonej analizy oraz wstępnych wyników symulacji wskazano na potrzebę dalszych badań celem standaryzacji obrazowania parametrycznego.
-
Synteza poliuretanu z udziałem biomonomerów i jego recykling chemiczny
PublikacjaPrzeprowadzono recykling chemiczny (aminoliza i glikoliza) zsyntezowanego wcześniej poliuretanu, otrzymanego z wykorzystaniem surowców pochodzenia naturalnego, oraz zbadano podstawowe właściwości otrzymanych produktów depolimeryzacji chemicznej. Poliuretan otrzymano metodą prepolimerową, wykorzystując surowce pochodzenia naturalnego, czyli poliol PriplastTM 1838 i diizocyjanian TolonateTM X FLO 100. Łańcuchy prepolimeru uretanowego...
-
Typing of Scopulariopsis and Microascus fungi by Random Amplified Polymorphic DNA (RAPD)
PublikacjaOBJECTIVES Scopulariopsis species and their teleomorphs of the genus Microascus are commonly isolated from soil, decaying plant material and indoor environments. Moreover, certain Scopulariopsis and Microascus species are recognised as opportunistic human pathogens. Although most species can be identified by detailed morphological study, phenotypic characters appear to overlap in several cases and morphology seems to be insufficient...
-
32P-postabeling detection of DNA adducts formed by 4-methyl-1-nitro-9-aminoacridine C-1748
PublikacjaWykazano zdolność do tworzenia przez nową pochodną 1-nitroakrydyny o symbolu C-1748, adduktów z DNA komórek nowotworowych oraz z DNA w systemie bezkomórkowym.
-
Low-energy positron scattering from DNA nucleobases: the effects from permanent dipoles
PublikacjaAb initio quantum calculations for low-energy positron scattering from gas-phase isolated molecular nucleobases which are part of the DNA structure are presented and discussed over the range of 1 eV to 25 eV. The calculations report the integral cross sections (ICSs) and the momentum-transfer cross sections (MTCSs) for Adenine, Guanine, Thymine and Cytosine. The calculations show very clearly the important role of the dominant...
-
DNA G-quadruplex structures obtained through MD-based folding procedure
Dane BadawczeThe dataset contains structures of DNA G-quadruplexes (G4s), obtained through steered molecular dynamics simulations, for 128 oligonucleotides capable of forming 3- and 2-tetrad G4s. The general sequence of the oligonucleotides is GxTiGxTjGxTkGx, where x = 3 or 2 for 3- and 2-tetrad G4s, respectively, while i, j, and k vary independently from 1 to 4,...
-
A Framework for Enhancing Supplier Selection Process by Using SOEKS and Decisional DNA
PublikacjaAbstract. Supplier selection process is one of the significant stages in supply chain management for industrial manufactured products. It plays an integral role in the success of any manufacturing organization and is an important part starting right from selecting raw material to dispatch of finished products. This paper contributes to enhance the supplier selection process by proposing a multi-criteria decision making framework...
-
Cross sections for electron scattering from selected components of DNA and RNA
PublikacjaWykorzystując metodę atomów niezależnych obliczono różniczkowe i całkowite przekroje czynne na sprężyste rozproszenie elektronów na wybranych drobinach, będących analogami składników DNA i RNA. Przekroje te obliczono w zakresie energii zderzenia od 50eV do 200 eV dla następujących drobin: C4H8O, C4H8O2, C5H10O2 oraz H3PO4. Przy użyciu metody BEB (binary-ecounter Bethe method) dla powyższych związków obliczono również przekroje...