Filtry
wszystkich: 1782
wybranych: 1547
-
Katalog
- Publikacje 1547 wyników po odfiltrowaniu
- Czasopisma 2 wyników po odfiltrowaniu
- Osoby 60 wyników po odfiltrowaniu
- Wynalazki 3 wyników po odfiltrowaniu
- Projekty 13 wyników po odfiltrowaniu
- Laboratoria 5 wyników po odfiltrowaniu
- Zespoły Badawcze 15 wyników po odfiltrowaniu
- Kursy Online 130 wyników po odfiltrowaniu
- Wydarzenia 5 wyników po odfiltrowaniu
- Oferty 1 wyników po odfiltrowaniu
- Dane Badawcze 1 wyników po odfiltrowaniu
Filtry wybranego katalogu
wyświetlamy 1000 najlepszych wyników Pomoc
Wyniki wyszukiwania dla: symulacje md
-
New trim configurations for laser trimmed thick-film resistors - theoretical analysis, numerical simulation and experimential verification
PublikacjaW pracy przedstawiono nowe podejście do korekcji rezystorów warstwowych polegające na wytwarzaniu dodatkowego kontaktu w celu rozszerzenia zakresu korekcji i uproszczenia projektowania. Ponadto zaprezentowano nową szybką metodę wyznaczania charakterystyk korekcyjnych a także weryfikację eksperymentalną. Przedstawiono wyniki w postaci zakresów korekcji i względnych przyrostów rezystancji w funkcji kształtu dodatkowego kontaktu oraz...
-
Simulation of fracture process in concrete elements with steel fibres using discrete lattice model
PublikacjaArtykuł omawia wyniki modelowania procesu zarysowania w elementach betonowych zawierające stalowe włókna przy zastosowaniu dyskretnego modelu kratownicowego. Beton był modelowany na poziomie mezoskali z uwzględnieniem 5 faz: kruszywa, zaczynu cementowego, włókien i obu stref kontaktu. Obliczenia wykonano dla jednoosiowego ściskania, jednoosiowego rozciągania i zginania prostego.
-
Progress in module design for membrane distillation
PublikacjaThere have been tremendous advances in membrane distillation (MD) since the concept was introduced in 1961: new membrane designs and process configurations have emerged, and its commercial viability has been evaluated in several pilot-scale studies. However, its high energy consumption has hindered its commercialization. One of the most promising ways to overcome this obstacle is to develop more energy-efficient membrane modules....
-
FE-modelling of concrete behaviour under mixed mode conditions with non-local and cohesive constitutive models.
PublikacjaW artykule przedstawiono wyniki symulacji rys zaokrąglonych w elementach betonowych w warunkach mieszanego sposobu obciążenia. Symulacje wykonano przy zastosowaniu modelu rys kohezyjnych i modeli mechaniki ośrodka ciągłego z nielokalnym osłabieniem.. Wyniki symulacji porównano z doświadczeniami.
-
Algorithms for processing and visualization of Critical Infrastructure security data as well as simulation and analysis of threats = Algorytmy przetwarzania i wizualizacji danych dotyczących bezpieczeństwa infrastruktur krytycznych oraz symulacji i analizy zagrożeń
PublikacjaRozprawa traktuje o algorytmach przetwarzania danych dotyczących różnego rodzaju zagrożeń, w szczególności wyników analiz ryzyka infrastruktur krytycznych, pozwalających na przestrzenną analizę tych danych w kontekście geograficznym za pomocą dedykowanego Systemu Informacji Przestrzennej. Prezentowane metody analizy zgrupowań Infrastruktur Krytycznych oraz propagacji ich zagrożeń wykorzystują wyniki syntetycznej analizy podatności...
-
Membrane distillation assisting food production processes of thermally sensitive food liquid items: a review
PublikacjaPhysical separation technologies have become important tool for processing in the current food manufacturing industries, especially for the products containing bioactive compounds thanks to their health benefits in costumers. As for the processing of bioactive food ingredients implies the implementation of integrated systems oriented to their separation, fractionation, and recovery. In this field, membrane distillation (MD), which...
-
Theoretical and Measurement Investigations of DS CDMA Signal Detection Problem
PublikacjaPrzedstawiono opis teoretyczny wybranej motody wykrywania sygnałów z widmem rozproszonym DS CDMA. Przedstawiono prototypowe stanowisko laboratoryjne do wykrywania sygnałów DS CDMA i zaprezentowano wyniki pomiarowe.
-
Simulation of water flow in double -porosity soils on unstructured grids with the finite element method.
PublikacjaRozważa sie model przepływu wody w gruntowym ośrodku o podwójnej porowatości. Model matematyczny uzyskano poprzez zastosowanie teorii homogenizacji zastosowanej do gruntów o bardzo dużej różnicy przepuszczalności.
-
Simulations of spacing of localized zones in reinforced concrete beams using elastic-plasticity and damage mechanics with non-local softening
PublikacjaArtykuł omawia obliczanie belek żelbetowych z uwzględnieniem lokalizacji odkształceń. Obliczenia wykonano przy zastosowaniu MES na bazie sprężysto-plastycznego prawa konstytutywnego i modelu zniszczeniowego uwzględniającego degradację sztywności rozszerzonego o długość charakterystyczną mikrostruktury za pomocą teorii nielokalnej.
-
Non-linear viscoelastic modelling of earthquake-induced structural pounding
PublikacjaCelem artykułu jest analiza nieliniowego lepko-sprężystego modelu siły zderzenia, który ma zastosowanie do symulacji zderzeń pomiędzy konstrukcjami budowlanymi podczas trzęsień ziemi. Efektywność modelu sprawdzono poprzez porównanie wyników symulacji numerycznych z wynikami eksperymentalnymi. Wyniki pracy pokazują, iż w stosunku do innych modeli zderzeń, nieliniowy model lepko-sprężysty umożliwia najdokładniejszą symulację siły...
-
Molecular Dynamics to Predict Cryo-EM: Capturing Transitions and Short-Lived Conformational States of Biomolecules
PublikacjaSingle-particle cryogenic electron microscopy (cryo-EM) has revolutionized the field of the structural biology, providing an access to the atomic resolution structures of large biomolecular complexes in their near-native environment. Today’s cryo-EM maps can frequently reach the atomic-level resolution, while often containing a range of resolutions, with conformationally variable regions obtained at 6 Å or worse. Low resolution...
-
Discrete simulations of a triaxial compression test for sand by DEM.
PublikacjaArtykuł przedstawia wyniki symulacji dyskretnych dla ściskania trójosiowego stosując metodę elementów dyskretnych DEM. Symulacje wykonano dla piasku. Zastosowano kuli z momentami kontaktu do symulacji kształtu ziaren. Przeprowadzono analizy dla różnych zmiennych parametrów: średnica piasku, krzywa uziarnienia, kształt ziaren, wymiary próbki i warunki brzegowe.
-
Badania symulacyjne dynamicznej odporności na zakłócenia układów cyfrowych. Zastosowanie Komputerów w Nauce i Technice.XIII cykl seminariów zorganizowanych przez PTETiS, Oddział Gdańsk.
PublikacjaPrzedstawiono metodę pomiaru dynamicznej odporności na zakłócenia układów cyfrowych z zastosowaniem wzorcowego sygnału szumowego. Przeprowadzono badania symulacyjne z wykorzystaniem kilku modeli badanego układu cyfrowego, w tym modelu detektora progowego oraz szybkiego komparatora z histerezą.
-
Molecular basis and potential activity of HIV-1 reverse transcriptase toward trimethylamine-based compounds
PublikacjaReverse transcriptase (RT) inhibitors are currently used to treat human immunodeficiency virus (HIV)-1 infections. In this work, novel triethylamine derivatives were designed and studied by rigid and flexible docking and molecular dynamics (MD) approaches. An apo form of HIV-1 RT was also studied by MD simulation to analyze comparative response of protein in ligand-bound and ligand-unbound forms. Among newly designed HIV-1 RT inhibitors,...
-
Metoda szacowania przybliżonego poziomu optymalnych cen zbytu paliw płynnych.
PublikacjaW artykule przedstawiono metodę zarządzania cenami w oparciu o przybliżony punkt równowagi na rynku oligopolu homogenicznego. W celu zobrazowania metody przeprowadzono symulacje dostosowywania się cen paliw do zmieniających się warunków rynkowych. Do symulacji wykorzystano oryginalne wyniki oszacowań modeli ekonometrycznych popytu na paliwa oraz cen paliw w Polsce. Artykuł przedstawia też symulacje powiązań typu wertykalnego między...
-
Dynamiczna aplikacja Internetowa ASP.NET silnika indukcyjnego jako elementu wirtualnego laboratorium maszyn elektrycznych
PublikacjaTematem referatu jest dynamiczna aplikacja internetowa, która umożliwia symulację obwodową silnika indukcyjnego trójfazowego Sg 100 L2 z wykorzystaniem interfejsu przeglądarki WWW. Model matematyczny silnika jest zdefiniowany w tzw. osiach naturalnych i sformułowany na podstawie metody energetycznej Lagrange’a. Do implementacji modelu maszyny w aplikacji internetowej wybrano projekt typu Web Forms, który jest składnikiem środowiska...
-
Food Bioactive Ingredients Processing Using Membrane Distillation
PublikacjaSeparation processes are an important part of today’s food industries, especially in the case of specific bioactive components due to their health benefits. In general, processing of bioactive food ingredients assumes the introduction of integrated system directed to their separation, fractionation, and recovery. Recently, membrane distillation (MD) has been considered as an alternative membrane-based separation and concentration...
-
J. FE modelling of cracks in concrete elements within continuum mechanics.
PublikacjaW artykule przedstawiono wyniki symulacji rys zakrzywionych w elementach betonowych w warunkach mieszanego sposobu obciążenia. Symulacje wykonano przy zastosowaniu 3 różnych modeli: modelu sprężysto-plastycznego, modelu w ramach mechaniki zniszczeniowej i modelu z rysami obracającymi się.
-
Keep It Flexible: Driving Macromolecular Rotary Motions in Atomistic Simulations with GROMACS
PublikacjaWe describe a versatile method to enforce the rotation of subsets of atoms, e.g., a protein subunit, in molecular dynamics (MD) simulations. In particular, we introduce a “flexible axis” technique that allows realistic flexible adaptions of both the rotary subunit as well as the local rotation axis during the simulation. A variety of useful rotation potentials were implemented for the GROMACS 4.5 MD package. Application to the...
-
Róża i jej egzystencja autentyczna i nieautentyczna a sytuacje graniczne. Heideggerowskie bycie i jego formy na przykładzie życia głównej bohaterki opowiadania „Róża” Jarosława Iwaszkiewicza
Publikacja -
Ocena wykonania hydrodynamicznego modelu numerycznego Dolnej Wisły oraz symulacji numerycznych przepływów na Dolnej Wiśle, w ramach realizacji zadania: „Odbudowa budowli regulacyjnych na Dolnej Wiśle w km 718 – 933 – dokumentacja projektowa
PublikacjaPrzedstawiono opinię na temat opracowanego modelu numerycznego Dolnej Wisły w ramach realizacji zadania: „Odbudowa budowli regulacyjnych na Dolnej Wiśle w km 718 – 933. Przeanalizowano wyniki symulacji numerycznych przepływów w rzece i oceniono skuteczność regulacji rzeki ostrogami w celu zapewnienia drogi wodnej dla lodołamaczy.
-
Deformation degree estimators for several basic structural units in numerically simulated materials
PublikacjaW pracy wprowadzono i zdefiniowano kilka estymatorów stopnia deformacji dla serii bazowych jednostek strukturalnych typu CA_n (C-kation, A-anion) występujących w strukturach symulowanych numerycznie. Do wyznaczenia rozkładu wartości estymatoróww funkcji stopnia deformacji kształtu zadanego wielościanu zastosowano symulacje Monte Carlo. Otrzymane rozkłady są danymi referencyjnymi, które są bardzo użyteczne przy jakościowej analizie...
-
Problem modelowania połączeń pomiędzy obiektami zabytkowymi, a elementami nowoprojektowanymi
PublikacjaW artykule przedstawiono badania i symulacje numeryczne dotyczące modelowania połączeń pomiędzy obiektami zabytkowymi, a elementami nowoprojektowanymi. Zakres prac obejmuje projekt koncepcyjny zewnętrznej klatki schodowej wraz z tarasem obserwacyjnym połączonej z zabytkową wieżą ciśnień, która znajduje się na terenie Politechniki Gdańskiej, badania doświadczalne oraz symulacje numeryczne różnego rodzaju podparcia elementów klatki...
-
Anharmonic Infrared Spectroscopy through the Fourier Transform of Time Correlation Function Formalism in ONETEP
PublikacjaDensity functional theory molecular dynamics (DFT-MD) provides an efficient framework for accurately computing several types of spectra. The major benefit of DFTMD approaches lies in the ability to naturally take into account the effects of temperature and anharmonicity, without having to introduce any ad hoc or a posteriori corrections. Consequently, computational spectroscopy based on DFT-MD approaches plays a pivotal role in...
-
Probability analysis of life Raft capsizing on rough sea
PublikacjaArtykuł przedstawia metodę obliczania prawdopodobieństwa przewrócenia się tratwy ratunkowej za pomocą symulacji ruchu na fali nieregularnej. Przedstawiono obliczenia ruchów tratwy na falowaniu nieregularnym, którego symulacje wykonano dla znanej funkcji gęstości widmowej falowania dla Bałtyku oraz niedeterministycznego (stochastycznego) rozkładu amplitudy fali.
-
Numerical simulation of extreme flooding in a built-up area
PublikacjaPrzedstawiono dwie numeryczne symulacje propagacji gwałtownej fali powodziowej przez schematyczny model obszaru zabudowanego. Do obliczeń wykorzystano równania przepływu wody płytkiej. Wyniki obliczeń porównano z dostępnymi pomiarami wykonanymi w laboratorium hydraulicznym ENEL-CESI w Mediolanie. Uzyskano zadowalającą zgodność symulacji z eksperymentami.
-
New methods for assessment and stimulation of non-communicative patients employing advanced multimodal HCI . Nowe metody oceny i stymulacji pacjentów niekomunikatywnych z wykorzystaniem zaawansowanych interfejsów multimodalnych człowiek-komputer
PublikacjaIn most cases of patients with locomotor system damage it is possible to find a solution to the medical problems originating from the injury. However, it is much more difficult to prevent cognitive and emotional impairments. Therefore, we believe that the technological support of therapists working with such patients on an everyday basis may be essential. We have acquired experience in designing and providing diagnostic and therapeutic...
-
Improvements to the two-phase sandwich method for calculating the melting points of pure metals
PublikacjaThe thermophysical properties of metal alloys are often investigated via molecular dynamics (MD) simulations.An exact and reliable estimation of the thermophysical parameters from the MD data requires a properly and carefullyelaborated methodology. In this paper, an improved two-phase sandwich method for the determination of the metal meltingtemperature is proposed, based on the solid-liquid equilibrium theory. The new method was...
-
Hybrid Monte-Carlo simulations of fluorescence anisotropy decay in disordered two-component systems in the presence of forward and back energy transfer
PublikacjaW pracy przedstawiono hybrydowy algorytm symulacji Monte Carlo zaniku anizotropii emisji fluorescencji w układach dwuskładnikowych z uwzględnieniem prostego i powrotnego transferu energii. Poprawność nowego algorytmu symulacji Monte Carlo zweryfikowano poprzez porównanie z wynikami obliczeń teoretycznych otrzymanymi w ramach modelu SCDM i z wynikami standardowej symulacji Monte Carlo (algorytm 'step by step').
-
ADAPTACYJNY DOBÓR KROKU OBLICZEŃ DLA SYMULATORA CZASU RZECZYWISTEGO O MIĘKKICH WYMAGANIACH CZASOWYCH
PublikacjaSymulacje czasu rzeczywistego mają duże walory praktyczne i dydaktyczne w zastosowaniach automatyki. Praca z symulatorem czasu rzeczywistego pozwala na poznaniei doświadczenie dynamiki symulowanego obiektu, wprowadzanie sterowań oraz decyzji operatorskich w warunkach czasowych odpowiadających rzeczywistemu obiektowi. Realizacja symulatorów czasu rzeczywistego wymaga zakończenia obliczeń numerycznych jednego kroku symulatora w czasie...
-
Mechanical Modelling of Human Fascia in the Problem of Ventral Hernia Repair
PublikacjaPraca dotyczy badań doświadczalnych tkanki ludzkiej oraz symulacji numerycznej zachowania tej tkanki. Na podstawie eksperymentu dokonuje się identyfikacji modelu materiałowego tkanki a następnie w celu wweryfikacji przeprowadza się symulacje numeryczną zachowania modelowanej struktury. Celem badań jest uzyskanie informacji przydatnych podczas leczenia przepuklin brzusznych u ludzi.
-
KOAKSJALNY MAGNETOKUMULACYJNY GENERATOR PRĄDU
PublikacjaW pracy przedstawiono wyniki symulacji komputerowej koaksjalnego magnetokumulacyjnego generatora prądu (MGP). Badania symulacyjne przeprowadzono dla różnych wartości średnicy wewnętrznej, długości i prędkości odkształcania elementu MGP
-
Numeryczna symulacja penetracji sondy CPTU w gruncie nawpdnionym.**2003, 218 s. 57 rys. 11 tab. bibliogr. 192 poz. maszyn. Rozprawa doktorska /04.07.2003/ P. Gdań. WBWiIŚ. Promotor: dr hab. Z. Sikora, prof. PG.
Publikacja.
-
Comparative molecular dynamics study of dimeric and monomeric forms of HIV-1 protease in ligand bound and unbound state
PublikacjaHuman immunodeficiency virus type 1 protease (HIV-1 PR) is a viral-encoded enzyme that forms a homodimer. HIV-1 PR is essential for replication and assembly of the virus and inactivation of HIV-1 PR enzyme causes production of immature, noninfectious viral particles and thus HIV-1 PR is an attractive target in anti-AIDS drug design. In our current work, we performed molecular dynamics (MD) calculations (500 ns) for two different...
-
Molecular basis and quantitative assessment of TRF1 and TRF2 protein interactions with TIN2 and Apollo peptides
PublikacjaShelterin is a six-protein complex (TRF1, TRF2, POT1, RAP1, TIN2, and TPP1) that also functions in smaller subsets in regulation and protection of human telomeres. Two closely related proteins, TRF1 and TRF2, make high-affinity contact directly with double-stranded telomeric DNA and serve as a molecular platform. Protein TIN2 binds to TRF1 and TRF2 dimer-forming domains, whereas Apollo makes interaction only with TRF2. To elucidate...
-
News that Moves the Market: DSEX-News Dataset for Forecasting DSE Using BERT
PublikacjaStock market is a complex and dynamic industry that has always presented challenges for stakeholders and investors due to its unpredictable nature. This unpredictability motivates the need for more accurate prediction models. Traditional prediction models have limitations in handling the dynamic nature of the stock market. Additionally, previous methods have used less relevant data, leading to suboptimal performance. This study...
-
Structural and dynamic insights on the EmrE protein with TPP+ and related substrates through molecular dynamics simulations
PublikacjaEmrE is a bacterial transporter protein that forms an anti-parallel homodimer with four transmembrane helices in each monomer. EmrE transports positively charged aromatic compounds, such as TPP+ and its derivatives. We performed molecular dynamics (MD) simulations of EmrE in complex with TPP+, MeTPP+, and MBTPP+ embedded in a membrane. The detailed molecular properties and interactions were analysed for all EmrE-ligand complexes....
-
Estimation of autotrophic maximum specific growth rate constant-experience from the long-term operation of a laboratory-scale Sequencing Batch Reactor System
PublikacjaW pracy wykorzystano wyniki badań z długookresowej eksploatacji laboratoryjnego reaktora typu SBR do estymacji stałej szybkości przyrostu bakterii nitryfikacyjnych. Badania obejmowały zarówno pomiary empiryczne (doświadczenia przy niskim stosunku substratu do biomasy) oraz symulacje komputerowe. Do symulacji dynamicznych wykorzystano jedną wartość współczynnika = 1,2 1/d, pomimo różnych wartości mierzonych jednostkowych szybkości...
-
Simulation of the IT Service and Project Management Environment
PublikacjaThe authors of this paper present a simulation of the socio-technical system in which teams of students – regarded as low-maturity organizations – were given a task to utilize the (relatively) mature technologies that support IT project and service management. The experiment consisted of the following phases: teams formation, introduction to technologies used during the simulation, performing a set of reactive and proactive service...
-
Analiza kinematyki docierarek tarczowych
PublikacjaPrzedstawiono symulację kinematyki docierania powierzchni płaskich. Opracowano modele symulacyjne standardowych układów kinematycznych. Stan plaskości powierzchni czynnej docieraka ma zasadniczy wpływ na płaskość powierzchni obrabianych. Decyduje o tym stosunkowo złożona kinematyka docierania.
-
Analiza kinematyki docierarki jednotarczowej
PublikacjaPrzedstawiono symulację kinematyki docierania powierzchni płaskich. Opracowano modele symulacyjne standardowych układów kinematycznych. Stan płaskości powierzchni czynnej docieraka ma zasadniczy wpływ na płaskość powierzchni obrabianych. Decyduje o tym stosunkowo złożona kinematyka docierania.
-
Two approaches to model the behaviour of soft natural clays under principal stress axes rotation.
PublikacjaPrzedstawiono porównanie dwóch podstawowych metod modelowania konstytutywnego pozwalających na symulację odkształcenia przy obrocie składowych głównych naprężenia. Dotyczy to zastosowania wzmocnienia kinematycznego oraz modelu wielopłaszczyznowego (multi-laminate). Wyniki symulacji porównano z wynikami badań laboratoryjnym w cylindrycznym aparacie skrętnym na próbkach w kształcie wydrążonego walca.
-
A method of nonlinearities of transformer no-load characteristic modelling
PublikacjaA way in which changes of the no-load characteristic are taken into account in the mathematical model of the transformer is presented. Changes of saturation within core of transformer are presented as a combined non-linear flux curve. Analysis of magnetization of the transformer core and simulation of no-load state for distribution transformer of 30 kVA power rating and 15.75/0.4 kV/kV (especially supplying VLV) transformation...
-
Optymalizacja prędkości obrotowej narzędzia podczas frezowania - procedura eksploatacyjna
PublikacjaW pracy zaproponowano metodę wyznaczenia optymalnej prędkości obrotowej narzędzia podczas frezowania na podstawie symulacji procesu obróbki przeprowadzonej dla uproszczonego modelu przedmiotu wraz z modelem procesu skrawania. Parametry modelu określane są bezpośrednio na podstawie wyników identyfikacji (eksperymentalna analiza modalna) co znacznie skraca czas doboru prędkości względem pełnej procedury modalnej. Tworzony jest model...
-
Optymalizacja postaci konstrukcyjnej dynamometru-uchwytu próbek badanych wwarunkach mikrooscylacji. W: [CD-ROM] III Konferencja Naukowo-Techniczna SYMULACJA 2002. Wdzydze Kiszewskie, 16 - 18 październik 2002. Tarnowskie Góry: MESco**2002 [16 s. 19 rys. bibliogr. 9 poz.]
PublikacjaW ramach badań tribologicznych prowadzonych w Katedrze Konstrukcji i Eksplo-atacji Maszyn Politechniki Gdańskiej zaprojektowano i skonstruowano stanowi-sko z głowicą SOOG do wyznaczenia odporności materiałów ślizgowych na zuży-cie w warunkach mikroprze-mieszczeń w płaszczyźnie ślizgania. Specyfika sta-nu obciążenia próbek z badanych materiałów, wymagała zastosowania wielu ory-ginalnych rozwiązań konstrukcyjnych. Do głównych...
-
Bounds on the cover time of parallel rotor walks
PublikacjaThe rotor-router mechanism was introduced as a deterministic alternative to the random walk in undirected graphs. In this model, a set of k identical walkers is deployed in parallel, starting from a chosen subset of nodes, and moving around the graph in synchronous steps. During the process, each node successively propagates walkers visiting it along its outgoing arcs in round-robin fashion, according to a fixed ordering. We consider...
-
Analiza numeryczna wpływu długości zakotwienia pręta na zachowanie przyczepności w teście pull-out
PublikacjaW artykule przedstawiono symulacje numeryczne testu pull-out w programie ABAQUS. Symulacje miały na celu ocenienie wpływu długości zakotwienia pręta żebrowanego na przyczepność w tym teście, opierając się na wynikach przeprowadzonych eksperymentów. Interakcję pręta z betonem odwzorowano za pomocą kohezyjnej powierzchni kontaktu, wykorzystując skalibrowane krzywe przyczepność-poślizg, otrzymane z doświadczeń wykonanych w ramach...
-
Förster Resonance Energy Transfer and Trapping in Selected Systems: Analysis by Monte-Carlo Simulations
PublikacjaMetoda symulacji Monte Carlo została opisana i zastosowana jako efektywne narzędzie do analizy wyników pomiarów transferu energii w wybranych układach, dla których zastosowanie podejścia analitycznego jest ograniczone lub nawet niemożliwe. Pokazano, że symulacja Monte Carlo pozwala obliczyć tzw. czynnik orientacyjny dla układów częściowo uporządkowanych oraz szereg innych wielkości ważnych do opisu zjawiska transferu energii, które...
-
Bounds on the Cover Time of Parallel Rotor Walks
PublikacjaThe rotor-router mechanism was introduced as a deterministic alternative to the random walk in undirected graphs. In this model, a set of k identical walkers is deployed in parallel, starting from a chosen subset of nodes, and moving around the graph in synchronous steps. During the process, each node maintains a cyclic ordering of its outgoing arcs, and successively propagates walkers which visit it along its outgoing arcs in...
-
Establishing the allosteric mechanism in CRISPR‐Cas9
PublikacjaAllostery is a fundamental property of proteins, which regulates biochemical information transfer between spatially distant sites. Here, we report on the critical role of molecular dynamics (MD) simulations in discovering the mechanism of allosteric communication within CRISPR‐Cas9, a leading genome editing machinery with enormous promises for medicine and biotechnology. MD revealed how allostery intervenes during at least three...