Filters
total: 965
-
Catalog
- Publications 709 available results
- Journals 152 available results
- Conferences 1 available results
- Publishing Houses 1 available results
- People 26 available results
- Inventions 1 available results
- e-Learning Courses 15 available results
- Events 11 available results
- Open Research Data 49 available results
Search results for: Music genre
-
Novel single-stranded DNA-binding protein from psyvhrophilic bacterium Psychrobacter arcticus
PublicationTo study the biochemical properties of SSB from Psychrobacter arcticus (ParSSB), we have cloned the ssb genes obtained by PCR and have developed Escherichia coli overexpression systems. The gene consists of an open reading frame of 642 nucleotides encoding SSB protein of 213 amino acids with a calculated molecular mass of 22.8 kDa. The amino-acid sequence of ParSSB exhibits 49% identity and 57% similarity to Escherichia coli SSB....
-
Modulation of CYP19 expression by cabbage juices and their active components: indole-3-carbinol and 3,30-diindolylmethene in human breast epithelial cell lines
PublicationThe aim of this study was to evaluate the effect of white cabbage and sauerkraut juices of different origin and indole-3-carbinol (I3C) and diindolylmethane (DIM) on expression of CYP19 gene encoding aromatase, the key enzyme of estrogen synthesis.Remarkable differences in the effect on CYP19 transcript and protein level were found between the cab- bage juices (in 2.5-25 mL/L concentrations) and indoles (in 2.5-50 lM doses) in...
-
Detection of circulating tumor cells by means of machine learning using Smart-Seq2 sequencing
PublicationCirculating tumor cells (CTCs) are tumor cells that separate from the solid tumor and enter the bloodstream, which can cause metastasis. Detection and enumeration of CTCs show promising potential as a predictor for prognosis in cancer patients. Furthermore, single-cells sequencing is a technique that provides genetic information from individual cells and allows to classify them precisely and reliably. Sequencing data typically...
-
Nanoparticles: Taking a Unique Position in Medicine
PublicationThe human nature of curiosity, wonder, and ingenuity date back to the age of humankind. In parallel with our history of civilization, interest in scientific approaches to unravel mechanisms underlying natural phenomena has been developing. Recent years have witnessed unprecedented growth in research in the area of pharmaceuticals and medicine. The optimism that nanotechnology (NT) applied to medicine and drugs is taking serious...
-
Enzyme Conjugation - A Promising Tool for Bio-catalytic and Biotransformation Applications – A Review
PublicationEnzymes have revolutionized conventional industrial catalysts as more efficient, eco-friendly, and sustainable substitutes that can be used in different biotechnological processes, food, and pharmaceutical industries. Yet, the enzymes from nature are engineered to make them adapt and enhance their durability in the industrial environment. One promising approach involves the combined use of multiple enzymes that catalyze highly...
-
Molecular basis of essentiality of early critical steps in the lipopolysaccharide biogenesis in Escherichia coli K-12: requirement of MsbA, cardiolipin, LpxL, LpxM and GcvB
PublicationTo identify the physiological factors that limit the growth of Escherichia coli K-12 strains synthesizing minimal lipopolysaccharide (LPS), we describe the first construction of strains devoid of the entire waa locus and concomitantly lacking all three acyltransferases (LpxL/LpxM/LpxP), synthesizing minimal lipid IVA derivatives with a restricted ability to grow at around 21 °C. Suppressors restoring growth up to 37 °C of Δ(gmhD-waaA)...
-
imPlatelet classifier: image‐converted RNA biomarker profiles enable blood‐based cancer diagnostics
PublicationLiquid biopsies offer a minimally invasive sample collection, outperforming traditional biopsies employed for cancer evaluation. The widely used material is blood, which is the source of tumor-educated platelets. Here, we developed the imPlatelet classifier, which converts RNA-sequenced platelet data into images in which each pixel corresponds to the expression level of a certain gene. Biological knowledge from the Kyoto Encyclopedia...
-
Szeregowanie zadań wieloprocesorowych na maszynach dedykowanych w modelu hipergrafowym
PublicationOstatnimi czasy obserwujemy dwie tendencje w działalności człowieka. Pierwszą jest specjalizacja. Wobec rosnącej wiedzy i zaawansowania technologicznego, niemożliwym stało się, by jedna osoba mogła wiedzieć i robić wszystko. Podobnie jest z maszynami, które im są bardziej wyspecjalizowane tym są tańsze i tym lepiej wykonują swoje zadania. Druga tendencja to wieloprocesorowość, którą inaczej możemy nazwać pracą zespołową. Efekt...
-
Program Erasmus Mundus : szansa na oryginalną formę kształcenia analityków
PublicationNową formą dydaktyki prowadzonej w roku akademickim 2009/2010 na Wydziale Chemicznym Politechniki Gdańskiej w ramach programu Erasmus Mundus są studia magisterskie European Master in Quality in Analytical Laboratories - EMQAL. Program ten wychodzi naprzeciw potrzebom europejskiego szkolnictwa wyższego związanym nie tylko ze stałym podnoszeniem jakości, atrakcyjności i innowacyjności kształcenia, ale również naprzeciw potrzebom...
-
System zabezpieczenia emerytalnego a starzenie się społeczeństwa w Polsce.
PublicationNowy porządek demograficzny w Polsce będący m.in. efektem drugiego przejścia demograficznego, nawiązuje do przemian wzorca płodności (spadek liczby urodzeń, opóźnienie momentu podjęcia decyzji odnośnie posiadania dzieci oraz przesunięcie dominanty wieku rodzenia). Proces odtwarzania pokoleń utrzymuje się tym samym na poziomie poniżej prostej zastępowalności pokoleń. Zmianom tym towarzyszy nieprzerwanie wydłużanie się ludzkiego...
-
Fatigue strength determination of ship structural joints. Part I - Analytical methods for determining fatigue strength of ship tructures
PublicationSpectacular accidents at sea which have happened for a few last years show that hull structures of contemporary sea-going ships are not perfect and must be systematically improved. Fatigue strength is one of the groups of strength problems which affect design of contemporary ship's structures and greatly contribute in their improvement process. In this paper several approaches to estimation of fatigue life of hull structural...
-
Biznes elektroniczny
e-Learning CoursesCelem kursu jest przedstawienie studentom jak wygląda wytwarzania aplikacji na poziomie zbliżonym do stosowanego na rynku. Podczas kursu studenci nauczą się: 1. Podstawowych pojęć związanych z prowadzeniem firmy IT w Polsce; 2. Powszechnych problemach w branży IT; 3. Technologii wykorzystywanych obecnie w branży IT; W ramach zajęć praktycznych studenci uzyskają możliwość pracy nad produktem zbliżonym do rzeczywistego, wykorzystując...
-
Architektura i woda - przekraczanie granic
PublicationPublikacja daje wgląd w procesy kształtowania połączeń wody i form zbudowanych. W obserwowanych współcześnie eksperymentach struktury budynków przeplatają się z zarysami pól wodnych, powstają konstrukcje architektoniczne unoszące się na różnego rodzaju platformach pływających. Woda jest także coraz częściej włączana w projekty urbanistyczne. Linie styku pomiędzy lądem i wodą ulegają modyfikacjom, przywraca się dawne kanały i tworzy...
-
Role of Sports Facilities in the Process of Revitalization of Brownfields
PublicationThe paper gives an evidence that building a large sports facility can generate beneficial urban space transformation and a significant improvement in the dilapidated urban areas. On the basis of theoretical investigations and case studies it can be proved that sports facilities introduced to urban brownfields could be considered one of the best known large scale revitalization methods. Large urban spaces surrounding sport facilities...
-
Evaluation of the use of reindeer droppings for monitoring essential and non-essential elements in the polar terrestrial environment
PublicationExcess or toxic metals, non-metals and metalloids can be eliminated from the organism by deposition in inert tissue (e.g. fur) or excretion with body secretions, urine and faeces. Droppings are one of the main routes for the elimination of multiple elements and they can be collected without direct contact with the animal. Contaminant concentration has been examined in non-lethally collected tissues of several species (especially...
-
Bioaccumulation of Metals in Tissues of Marine Animals, Part I: the Role and Impact of Heavy Metals on Organisms
PublicationHeavy metals contribute to the anthropogenic contamination of marine ecosystems. Some of them are essential to the life processes of organisms; others are toxic, even at low concentrations. They penetrate organisms via food, respiratory pathways or the skin. The extent to which metals penetrate organisms is measured by the bioconcentration and bioaccumulation factors and also by their transport between organisms at different trophic...
-
Cloning, expression, and biochemical characterization of a coldactive GDSL-esterase of a Pseudomonas sp. S9 isolated from Spitsbergen island soil
PublicationAn estS9 gene, encoding an esterase of the psychrotolerant bacterium Pseudomonas sp. S9 was cloned and sequenced. The deduced sequence revealed a protein of 636 amino acid residues with a molecular mass of 69 kDa.Further amino acid sequence analysis revealed that the EstS9 enzyme contained a G-D-S-L motif centered at a catalytic serine, an N-terminal catalytic domain and a C-terminal autotransporter domain. Two recombinant E. coli...
-
Iron–Sulfur Cluster Biogenesis Chaperones: Evidence for Emergence of Mutational Robustness of a Highly Specific Protein–Protein Interaction
PublicationBiogenesis of iron–sulfur clusters (FeS) is a highly conserved process involving Hsp70 and J-protein chaperones. However, Hsp70 specialization differs among species. In most eukaryotes, including Schizosaccharomyces pombe, FeS biogenesis involves interaction between the J-protein Jac1 and the multifunctional Hsp70 Ssc1. But, in Saccharomyces cerevisiae and closely related species, Jac1 interacts with the specialized Hsp70 Ssq1,...
-
Identification of antigen Ag43 in uropathogenic Escherichia coli Dr+ strains and defining its role in the pathogenesis of urinary tract infections
PublicationUrinary tract infections (UTIs) caused by uropathogenic Escherichia coli (UPEC) are among the most common bacterial infectious diseases in the developed world. The urovirulence of UPEC is mainly associated with the surface-exposed fimbrial adhesins and adhesins of the autotransporter (AT) family. The best studied of theses proteins is antigen 43 (Ag43) mediating cell aggregation, adhesion and biofilm development as the causes of...
-
Characterisation of Escherichia coli isolates from the blood of haematological adult patients with bacteraemia: translocation from gut to blood requires the cooperation of multiple virulence factors
PublicationThe aim of the study was to investigate whether there are unique pathotypes of Escherichia coli capable of transmission from the gastrointestinal tract to the vascular bed. The study included E. coli strains isolated from clinical materials collected from 115 patients suffering from haematologic malignancies diagnosed with bacteraemia. The genotyping techniques established that 89 E. coli isolates from the blood had the same genotype...
-
Assessment of diversity and composition of bacterial community in Sludge Treatment Reed Bed systems
PublicationDue to their low emission of odours and lack of the need to apply additional chemical agents, sludge treatment reed beds (STRBs) constitute an economically feasible and eco-friendly approach to sewage sludge management. Correctly designed and operated STRBs ensure effective reduction of the dry matter content coupled with the mineralisation of organic compounds. Successful operation of STRBs relies on complex interactions between...
-
Two bacterial small heat shock proteins, IbpA and IbpB, form a functional heterodimer
PublicationSmall heat shock proteins (sHsps) are a conserved class of ATP-independent chaperones which in stress conditions bind to unfolded protein substrates and prevent their irreversible aggregation. Substrates trapped in sHsps-containing aggregates are efficiently refolded into native structures by ATP-dependent Hsp70 and Hsp100 chaperones. Most γ-proteobacteria possess a single sHsp (IbpA), while in a subset of Enterobacterales, as...
-
Bee Pollen and Bee Bread as a Source of Bacteria Producing Antimicrobials
PublicationThe principal objective of the study was the isolation and identification of bacteria that are present in mature bee bread (BB) and dried (ready for selling and consumption) bee pollen (BP). Obtained isolates were screened for their potential to inhibit select human pathogenic bacteria and their ability to produce enzymes of particular industrial importance. Four and five samples of BP and BB, respectively, were used for the study....
-
Polysaccharide-based Nanocomposites for Biomedical Applications: A Critical Review
PublicationPolysaccharides (PSA) are taking specific position among biomaterials for advanced applications in medicine. Nevertheless, poor mechanical properties is known as the main drawback of PSA, which highlights need for PSA modification. Nanocomposites PSA (NPSA) are a class of biomaterials widely used as biomedical platforms, but despite their importance and worldwide use have not been reviewed. Herein we critically reviewed application...
-
Mechanism of recognition of parallel G-quadruplexes by DEAH/RHAU helicase DHX36 explored by molecular dynamics simulations
PublicationBecause of high stability and slow unfolding rates of G-quadruplexes (G4), cells have evolved specialized helicases that disrupt these non-canonical DNA and RNA structures in an ATP-dependent manner. One example is DHX36, a DEAH-box helicase, which participates in gene expression and replication by recognizing and unwinding parallel G4s. Here, we studied the molecular basis for the high affinity and specificity of DHX36 for parallel-type...
-
Starzejący się pracownik, starzejący się przedsiębiorca, „starzejąca się polityka”
PublicationZmiany demograficzne we współczesnym świecie są nieuniknione, starzenie się społeczeństwa sprawia, że z jednej strony przybywa osób, które oczekują godziwie zapracowanej emerytury, z drugiej strony systemy emerytalne wielu krajów przestają być wydolne, coraz więcej emerytów jest finansowanych ze składek coraz mniejszej liczby pracowników w wieku produkcyjnym. Jest jeszcze jednak jeden aspekt tych zmian – niektóre osoby w wieku...
-
Dworzec kolejowy - jaki był, jaki jest i jaki być powinien
PublicationJeśli pasażerski transport kolejowy nie ma być traktowany w Polsce jedynie jako transport niszowy, musi się zmienić filozofia myślenia nie tylko w zakresie modernizacji linii kolejowych, zakupu nowego taboru i kształtowania przyjaznych podróżnym rozkładów jazdy, ale również w kierunku poprawy jakości miejsc oczekiwania na pociągi oraz warunków przesiadki z jednych na inne środki transportu. Wzorem innych krajów winien być w Polsce...
-
Marburska filozofia krytyczna wobec psychologizmu
PublicationArtykuł omawia stanowisko neokantowskiej szkoły marburskiej wobec ujęć upatrujących źródła i prawomocności poznania w psychologii. Psychologizm był zwalczany w szkole marburskiej do tego stopnia, że sprzeciw wobec niego - "antypsychologizm" - stał się jednym z najważniejszych elementów składających się na "doktrynę szkoły marburskiej" i służył niejako do negatywnego dookreślenia specyfiki stosowanej przez nich metody transcendentalnej,...
-
Gdynia otwarta na morze
PublicationTradycję przestrzenną Gdyni stworzyły lata międzywojenne. To one ukształtowały ją w sensie urbanistycznym i architektonicznym oraz wykreowały główną ideę przestrzenną, którą jest otwarcie miasta na morze. Idea ta jest w pewnym sensie oczywista, gdyż nadmorskie położenie Gdyni wyraźnie do tego predestynowało. Dzięki konsekwentnej działalności zarówno projektanta portu - inżyniera Tadeusza Wendy, jak i głównego projektanta miasta...
-
Czy warto pić wodę butelkowaną? Analiza porównawcza jakości wody z gdańskich ujęć podziemnych i wody butelkowanej
PublicationŻycie ludzkie nierozłącznie wiąże się z obecnością wody. Woda stanowi zarówno element organizmu ludzkiego, jak i środowiska. Prawidłowe funkcjonowanie człowieka w dużej mierze zależy od regularnego dostarczania organizmowi niezbędnej dawki wody oraz odpowiedniej ilości składników mineralnych. Celem pracy była analiza porównawcza jakości wody wodociągowej pochodzącej z ujęć podziemnych oraz dostępnych na rynku wód butelkowanych...
-
Oporność patogennych drożdżaków z rodzaju Candida na chemoterapeutyki przeciwgrzybowe i nowe sposoby jej przełamywania
PublicationCelem badania było określenie podatności na leki przeciwgrzybowe izolatów Candida od pacjentów z polskich szpitali oraz określenie mechanizmów oporności na nie. Drugim celem było zbadanie aktywności przeciwgrzybowej produktów naturalnych (olejków eterycznych i propolisów pszczelich) i mechanizmów ich działania. Prawie 20% zebranych izolatów wykazało oporność na flukonazol oraz oporność krzyżową na cztery badane azole. Większość...
-
Investigation of Microbes in the Stratosphere – Stardust Project
PublicationThe stratospheric microbiota has been investigated many times using the methods of classical microbiology. In this research a few modern methods, including NGS sequencing and multiple displacement amplification of DNA, were in use. The analysis of metagenome helped to determine the content of various species of bacteria in the sample collected in the stratosphere by a hydrogen-filled balloon holding...
-
Transcriptomic landscape of blood platelets in healthy donors
PublicationBlood platelet RNA-sequencing is increasingly used among the scientific community. Aberrant platelet transcriptome is common in cancer or cardiovascular disease, but reference data on platelet RNA content in healthy individuals are scarce and merit complex investigation. We sought to explore the dynamics of platelet transcriptome. Datasets from 204 healthy donors were used for the analysis of splice variants, particularly with...
-
Antibiotic resistance in Staphylococcus aureus strains isolated from cows with mastitis in the eastern Poland and analysis of susceptibility of resistant strains to alternative non-antibiotic agents: lysostaphin, nisin and polymyxin B.
PublicationThe aim of the studies was analysis of resistance of Staphylococcus aureus isolates from bovine mastitis in eastern part of Poland to a set of 20 antibiotics and three alternative agents: lysostaphin, nisin and polymyxin B. Eighty-six out of 123 examined isolates were susceptible to all of 20 tested antibiotics (70 %). The highest percentage of resistance was observed in the case of β-lactam antibiotics: amoxicillin (n=22, 17.9...
-
Identification and characterization of single-stranded DNA-binding protein from the facultative psychrophilic bacteria Pseudoalteromonas haloplanktis
PublicationSingle-stranded DNA-binding protein (SSB) plays an important role in DNA metabolism such as DNAreplication, repair, and recombination, and is essential for cell survival. This study reports on the ssb-likegene cloning, gene expression and characterization of a single-stranded DNA-binding protein of Pseudoal-teromonas haloplanktis (PhaSSB) and is the first report of such a protein from psychrophilic microorganism.PhaSSB possesses...
-
A modern solid waste management strategy – the generation of new by-products
PublicationTo benefit the environment and society, EU legislation has introduced a ‘zero waste’ strategy, in which waste material should be converted to resources. Such legislation is supported by the solid waste hierarchy concept, which is a set of priorities in waste management. Under this concept, municipal solid waste plants (MSWPs) should be equipped with sorting and recycling facilities, composting/incineration units and landfill prisms...
-
Characterization of recombinant homocitrate synthase from Candida albicans
PublicationLYS21 and LYS22 genes from Candida albicans encoding isoforms of homocitrate synthase (HCS), an enzyme catalyzing the first committed step in the L-lysine biosynthetic pathway, were cloned and expressed as NoligoHistagged fusion proteins in Escherichia coli. The purified gene products revealed HCS activity, i.e. catalyzed the condensation of α-ketoglutarate with acetyl-coenzyme A to yield homocitrate. The recombinant enzymes were purified...
-
Recombinant !ermostable AP Exonuclease from Thermoanaerobacter tengcongensis: Cloning, Expression, Purification, Properties and PCR Application
PublicationApurinic/apyrimidinic (AP) sites in DNA are considered to be highly mutagenic and must be corrected to preserve genetic integrity, especially at high temperatures. !e gene encoding a homologue of AP exonuclease was cloned from the thermophilic anaerobic bacterium Thermoanaerobacter tengcongensis and transformed into Escherichia coli. The protein product showed high identity (80%) to human Ape1 nuclease, whereas to E. coli exonuclease...
-
Impact of abiotic stressors on nutrient removal and rhizomicrobiome composition in floating treatment wetland with Equisetum hyemale
PublicationFloating treatment wetlands (FTW) are receiving growing interest as a phyto-technology. However, there are significant research gaps regarding the actual role of plant species and plant-microbiome interactions. In this study, the nutrient uptake of Equisetum hyemale was examined in FTW microcosms under the influence of abiotic stressors: As (3 mg/L) and Pb (3 mg/L) as well as Cl− (300 and 800 mg/L) in reference to a control during...
-
A mechanistically approached review upon assorted cell lines stimulated by athermal electromagnetic irradiation
PublicationThe probable influence of electromagnetic irradiation on cancer treatment has been deduced from the interaction of artificial electromagnetic emissions with biological organisms. Nonetheless, the suspected health effects induced by electromagnetic-based technology imply that such a treatment may contaminate the adjacent healthy cells. Thus, gaining mechanistic insights into the problem is required to avoid athermal health hazards....
-
Transcriptomic landscape of blood platelets in healthy donors
PublicationBACKGROUND Blood platelet RNA-sequencing is increasingly used among the scientific community. Aberrant platelet transcriptome is common in cancer or cardiovascular disease, but reference data on platelet RNA content in healthy individuals are scarce and merit complex investigation. METHODS We sought to explore the dynamics of platelet transcriptome. Datasets from 204 healthy donors were used for the analysis of splice variants,...
-
Transport deficiency is the molecular basis of Candida albicans resistance to antifungal oligopeptides
Publication(FMDP), an inhibitor of glucosamine-6-phosphate synthase, exhibited growth inhibitory activity against Candida albicans, with minimal inhibitory concentration values in the 0.05–50 mg/L range. Uptake by the peptide permeases was found to be the main factor limiting an anticandidal activity of these compounds. Di- and tripeptide containing FMDP (F2 and F3) were transported by Ptr2p/Ptr22p peptide transporters (PTR) and FMDP-containing...
-
Chemical treatment of crystalline silicon solar cells as a method of recovering pure silicon from photovoltaic modules
PublicationProducenci modułów PV stosują ogniwa krzemowe, wyprodukowane w różnej technologii, w efekcie czego różnią się one między sobą. Różnorodność dotyczy zarówno modułów PV, wykonanych z ogniw polikrystalicznych jak i monokrystalicznych. Różnice widoczne są zwłaszcza dla kontaktów elektrycznych. Producenci ogniw wykonują metalizację z zastosowaniem past Al, Ag lub przy jednoczesnym użyciu Al/Ag. Proces recyklingu krzemowych ogniw PV...
-
ZASTOSOWANIE METOD SZTUCZNYCH SIECI NEURONOWYCH DO WYSZUKIWANIA STANÓW REFERENCYJNYCH PRZEPŁYWÓW W KANAŁACH ŁOPATKOWYCH DLA CELÓW DIAGNOSTYKI CIEPLNO-PRZEPŁYWOWEJ TURBIN PAROWYCH
PublicationTurbina jest złożonym urządzeniem cieplno-mechanicznym. O jej efektywności decyduje z kolei jakość przepływu czynnika roboczego przez jej układ łopatkowy. Współczesne metody badawcze doprowadziły do wysokich wartości wskaźników sprawnościowych turbinowych systemów łopatkowych. Jest to najważniejsze zadanie jednej z diagnostyk, a mianowicie diagnostyki cieplno-przepływowej, która koncentruje się przede wszystkim na sprawnościowych...
-
Elementy psychologii w kontekście autonomii robotów
PublicationW niniejszym opracowaniu zaprezentowano szerokie spektrum zagadnień związanych z psychologią poznawczą w kontekście antropoidalnej robotyki. W szczególności omówiono sposób przetwarzania informacji u człowieka, od bodźca do reakcji, tak aby przedstawioną wiedzę można było wykorzystać przy projektowaniu robotów autonomicznych. Na początku pracy szczegółowo omówiono procesy poznawcze: percepcję sensoryczną, spostrzeganie,...
-
Adaptacja osadu do wód poosadowych i zewnętrznego źródła węgla.
PublicationSpełnienie obowiązujących obecnie warunków usuwania azotu, możliwe jest w przypadku osią-gnięcia wysokiej efektywności procesu denitryfikacji, która musi być poprzedzona pełną nitryfikacją, wiąże się to z wysokimi kosztami napowietrzania w bioreaktorach. Do stref anoksycznych konieczne jest dostarczenie odpowiedniej ilości węgla organicznego, co wiąże się z koniecznością wspomagania denitryfikacji. Odcieki z beztlenowych procesów...
-
Urządzenie do pomiaru i rejestracji przepływu wydmuchiwanego przez człowieka strumienia powietrza
InventionsWynalazek obejmuje zastosowanie urządzenia jako interfejsu człowiek-komputer w interaktywnych grach komputerowych wykorzystywanych np. do wspomagania treningu oddechowego w terapii mowy; dotyczy to również sposobu prowadzenia terapii, bądź rehabilitacji poprzez ćwiczenia oddechowe, gdzie ustalane są dolne i górne wartości graniczne rejestrowanego ciśnienia i/lub prędkości wydmuchiwanego strumienia powietrza i/lub...
-
A New Double Digestion Ligation Mediated Suppression PCR Method for Simultaneous Bacteria DNA-Typing and Confirmation of Species: An Acinetobacter sp. Model
PublicationWe have designed a new ddLMS PCR (double digestion Ligation Mediated Suppression PCR) method based on restriction site polymorphism upstream from the specific target sequence for the simultaneous identification and differentiation of bacterial strains. The ddLMS PCR combines a simple PCR used for species or genus identification and the LM PCR strategy for strain differentiation. The bacterial identification is confirmed in the...
-
Host and pathogen factors in Klebsiella pneumoniae upper urinary tract infections in renal transplant patients
PublicationPurpose . To analyse the role of virulence factors (VFs) and host in Klebsiella pneumoniae upper urinary tract infections (UTIs) in renal transplant (RTx) recipients. Methodology. Clinical and demographic data were registered prospectively. Phylogenetic background of K. pneumoniae isolates was analysed by PCR melting profiles (MP) and the following VFs genes: fimH-1, uge, kpn, ycfM, mrkD, rmpA, magA, hlyA, cnf-1, irp-1, irp-2,...
-
New Approaches for Escherichia coli Genotyping
PublicationEasy-to-perform, fast, and inexpensive methods of differentiation of Escherichia coli strains beyond the species level are highly required. Herein two new, original tools for genotyping of E. coli isolates are proposed. The first of the developed method, a PCR-RFLP (polymerase chain reaction-restriction fragment length polymorphism) test uses a highly variable fliC gene, encoding the H antigen as a molecular target. The designing...