Publikacje
Filtry
wszystkich: 455
Katalog Publikacji
Rok 2002
-
Comparative studies of the Acinetobacter genus and the species identification method based on the recA sequences
PublikacjaZaproponowano metodę genotypowania bakterii rodzaju Acinetobacter, opartą o analizę sekwencji genów recA, amplifikację fragmentów genu recA i analizę profili fragmentów restrykcyjnych po cięciu produktów reakcji PCR enzymami restrykcyjnymi (recA PCR/RFLP). Profile RFLP otrzymane za pomocą enzymu Tsp509I są użyteczne w identyfikacji poszczególnych gatunków bakterii rodzaju Acinetobacter. Na podstawie analizy otrzymanych sekwencji...
-
Działanie preparatu antyseptycznego Betadine (EGIS Pharmaceutical L.t.d.) na wielooporne szpitalne szczepy bakterii
PublikacjaStwierdzono silne działanie bakteriobójcze preparatu Betadine na wszystkie badane izolaty. Uzyskano redukcję liczby żywych bakterii w zawiesinie o 99,99% co jest zgodne z wymaganiami dla preparatów przeznaczonych do dezynfekcji higienicznej i chirurgicznej.
-
Identification and characterization of single-stranded-DNA-binding proteins from Thermus thermophilus and Thermus aquaticus - new arrangement of binding domains
PublikacjaOkreślono molekularne właściwości białek SSB-podobnych z Thermus thermophi-lus i T. aquaticus. Zbadano aktywność białek oraz termostabilność. Ponadto, dowiedziono homodimeryczność obu białek i ustalono minimalną sekwencję wiążącą ssDNA.
-
Identification of anisakid nematodes from the Southern Baltic Sea usingPCR-based methods
PublikacjaZaproponowano metodę identyfikacji nicieni gatunków Anisakis, Hysterothyla-cium, Contracaecum przy użyciu techniki PCR/RFLP.
-
Novel thermostable ssDNA-binding proteins from Thermus thermophilus and T. aquaticus-expression and purification
PublikacjaSklonowano w system ekspresyjny pET-30LIC Escherichia coli gen kodujący białka SSB-podobne Thermus thermophilus i T. aquaticus. Oczyszczono do homogenności białka SSB-podobne, a uzyskane preparaty umożliwiają wykonanie badań strukturalnych w/w białek.
-
Ocena wrażliwości na fluorochinolony drobnoustrojów izolowanych od pacjentów z zakażeniami układu moczowego leczonych w warunkach ambulatoryjnych
PublikacjaWykazano, że drobnoustroje powodujące zakażenia układu moczowego u pacjentów ambulatoryjnych są nadal wrażliwe na fluorochinolony; dotyczy to jednak drobnoustrojów z rodziny Enterobacteriacae. Natomiast w przypadku zakażeń drobnoustrojami Gram-dodatnimi leki te mogą okazać się nieskuteczne. Stwierdzono silne działanie bakteriobójcze preparatu Betadine na wszystkie badane izolaty. Uzyskano redukcję liczby żywych bakterii w zawiesinie...
-
Species - specific detection of the toxic mushrooms Amanita virosa and Amanita verna by PCR amplification of the gpd gene fragment
PublikacjaZaprojektowano dwie pary starterów do reakcji PCR, które umożliwiają gatunkowo specyficzną amplifikację unikalnych fragmentów genów gpd dla dwóch grzybów kapeluszowych: muchomora wiosennego (Amanita verna) i muchomora jadowitego (Amanita virosa).
-
Structure-function analysis of decay-accelerating factor: identification ofresidues important for binding of the Escherichia coli Dr adhesin and complement regulation
PublikacjaZidentyfikowano ważne dla wiązania adhezyny Dr uropatogennych Escherichiacoli reszty aminokwasowe w ludzkim receptorze DAF SCR-3.
Rok 2003
-
Antarctic marine bacterium Pseudoalteromonas sp. 22b as a source of cold adapted á-galaktosidase.
PublikacjaAntarktyczny morski szczep Pseudoalteromonas sp. 22b. jest źródłem wewnątrzkomórkowej beta-galaktozy. Enzym ten wykazuje wysoką aktywność hydrolizy laktozy w zakresie temperatur od 0 do 20 st. C oraz pH 6,0-8,0. W niniejszej pracy opisano metodykę uzyskania homogennego preparatu tego enzymu, oraz pełną charakterystykę jego własności enzymatycznych i kinetycznych.
-
Chimeric Dr fimbriae with a Herpes Simplex virus type 1 epitope as a model for a recombinant vaccine.
PublikacjaBiałko adhezyny DraE uropatogennych szczepów E. coli Dr+ zostało wykorzystane jako nośnik 11a a determinanty antygenowej glikoproteiny D wirusa HSV ty-pu 1. Sekwencja kodująca epitop HSV została wklonowana do genu draE w obrębie regionu N- terminalnego eksponowanej powierzchniowo domeny 2. Ekspresjachimerycznych białek DraE-HSV została potwierdzona za pomocą mikroskopii immunofluorescencyjnej i elektronowej.
-
Construction and purification of his6-Thermus thermophilus MutS protein.
PublikacjaGen mutS z termofilnej bakterii Thermus thermophilus zamplifikowano przy użyciu PCR, sklonowano i przeprowadzono jego ekspresję w E. coli. Rekombinantowe białko MutS zawierające oligohistydynową domenę na N-końcu oczyszczono w jednoetapowej procedurze przy wykorzystaniu chromatografii powinowactwaNi(2+). Zdolność do rozpoznania niekomplementarności białka his(6)-MutS potwierdzono w eksperymentach ochrony DNA przed trawieniem...
-
Evaluation and comparison of random amplification of polymorphic DNA, pulsed field gel electrophoresis and ADSRRS-fingerprinting for typing Serratiamarcescens outbreaks.
PublikacjaADSRRS-fingerprinting, nowa metoda genotypowania oparta na supresji reakcji PCR została zastosowana do badań epidemiologicznych izolatów S. marcescens,pochodzących z trzech różnych epidemii Szpitala Publicznego w Gdańsku. Wyniki uzyskane metodą ADSRRS-fingerprinting porównano z wynikami uzyskanymi technikami RAPD-fingerprinting i PFGE.
-
Evaluation of a novel method based on amplification of DNA fragments surrounding rare restriction sites (ADSRRS-figerprinting) for typing strains of vancomycin resistant Enterococcus faecium.
PublikacjaBadania objęły wankomycyno oporne szczepy Enterococcus faecium izolowane od pacjentów oddziału Hematologii Szpitala Klinicznego w Gdańsku. Wykazano, że ADSRRS-fingerprinting jest metodą szybką o dużym potencjale różnicującym i dużej powtarzalności w badaniach epidemiologicznych.
-
High level expression, secretion and purification of the termostable aqualysin I from Thermus aquaticus YT-1 in Pichia pastoris.
PublikacjaOtrzymano aktywną proteazę serynową Thermus aquaticus z systemu nadprodukcji Escherichia coli. Oczyszczono enzym przy zastosowaniu chromatografii metalo-powinowactwa.
-
High yield expression and single step purification of Toxoplasma gondii SAG1, GRA1, GRA7 antigens in Escherichia coli.
PublikacjaPraca przedstawia metodę uzyskiwania antygenów rekombinowanych Toxoplasmagondii o wysokiej czystości, które można zastosować w immunodiagnostyce. Antygeny T. gondii eksprymowane w komórkach E. coli zawierały polihistydynowedomeny fuzyjne na końcu N i C białka. Pozwalało to na jednoetapowe oczyszczanie białek metodą chromatografii metalopowinowactwa na złożu Ni2+ -IDA-Sepharose. Immunoreaktywność antygenów rekombinowanych...
Rok 2004
-
Molecular epidemiology of Serratia marcescens in two hospitals in Danzig, Poland, over a 5-year period.Molecular epidemiology of Serratia marcescens in two hospitals in Gdańsk, Poland, over a 5-year period.
PublikacjaW pracy badano zmiany populacji Serratia marcescens w ciągu 5 lat w dwóch szpitalach klinicznych Gdańska. Posłużono się wartościami MIC, wynikami typowania genetycznego RAPD-PCR, PFGE i nową metodą ADSRRS-fingerprinting oraz analizą beta-laktamaz o rozszerzonym spektrum substratowym (ESBL). Dzięki określeniu lekowrażliwości na najnowsze antybiotyki beta-laktamowe wykryto fenotypy wykazujące derepresję cefalosporynazy AmpC u 23%...
-
Usefulness of the PCR technique for bacterial DNA detection in blood of the patients after ''oppened heart'' operations.
PublikacjaOperacje kardiochirurgiczne w krążeniu pozaustrojowym (KPU) poprzez ogromny uraz, powodowanie występowania zaburzeń odporności oraz uszkodzenie barier anatomicznych stwarzają sytuację wybitnie sprzyjającą rozwojowi powikłań infekcyjnych u tych chorych. Prowadzenie terapii antybiotykowej profilaktycznej i leczniczej, a także selektywna dekontaminacja przewodu pokarmowego może utrudniać i przedłużać czas rozpoznania obecności bakterii...
Rok 2006
-
A highly thermostable, homodimeric single-stranded DNA-binding protein from Deinococcus radiopugnans
PublikacjaWe report the identification and characterization of the single-stranded DNA-binding protein (SSB) from the mesophile and highly radiation-resistant Deinococcus radiopugnans (DrpSSB). PCR-derived DNA fragment containing the complete structural gene for DrpSSB protein was cloned and expressed in Escherichia coli. The gene consisting of an open reading frame of 900 nucleotides encodes a protein of 300 amino acids with a calculated...
-
Detection of Blastocystis hominis in unpreserved stool specimens byusing polymerase chain reaction
PublikacjaBlastocystis hominis jest pasożytem występującym na całym świecie. Patogenność tego pasożyta nie jest jeszcze w pełni udowodniona, aczkolwiek opisanych jest wiele przypadków, sugerujących, że B. hominis może wywoływać objawy żołądkowo-jelitowe. Wykrywanie tego pasożyta opiera się na bezpośredniej obserwacji mikroskopowej rozmazów i zagęszczonych próbek kału lub rozmazów utrwalonych, jednakże w pewnych przypadkach nie jest to możliwe.Celem...
-
Escherichia coli - zapomniany patogen posocznic
PublikacjaPrzedstawiono próbę retrospektywnej analizy częstości występowania bakteriemii Gram-ujemnych, wywołanych przez E. coli u chorych hospitalizowanych w ośmiu grupach oddziałów klinicznych SPSK1 ACK AM w Gdańsku w latach 2002-2004. Dokonano oceny częstości występowania bakteriemii o etologii E. coli, liczby zgonów związanych bezpośrednio z posocznicą, analizy potencjalnych wrót zakażenia oraz analizy lekowrażliwości szczepów E. coli...
-
Ewaluation of a PCR Melting Profile technique for bacterial strain differentiation
PublikacjaBadano przydatność techniki PCR MP w efektywnym typowaniu szczepów w badaniach epidemiologicznych zakażeń szpitalnych. Technika oparta jest na użyciu niskiej temperatury denaturacji podczas LM PCR. Badaniu zostały poddane izolaty Escherichia coli pochodzące od pacjentów Szpitala Klinicznego w Gdańsku. Wykazano, że technika jest szybka, o wysokim potencjale różnicującym i bardzo dobrej powtarzalności i może być zastosowana w badaniach...
-
Novel thermostable single-stranded DNA-binding protein (SSB) from Deinococcus geothermalis
PublikacjaW celu zbadania właściwości biochemicznych białka wiążącego się do jednoniciowego DNA (SSB) pochodzącego z Deinococcus geothermalis (DgeSSB), sklonowano gen ssb otrzymany w reakcji PCR, a następnie uzyskano wydajną biosyntezę białka DgeSSB. Gen składa się z 900 par zasad, kodujących białko złożone z 300 reszt aminokwasowych, o wyliczonej masie molekularnej równej 32.45 kDa. Sekwencja aminokwasowa wykazuje 43, 44% i 75% identyczności...
-
The construction of bifunctional fusion proteins consisting of MutS and GFP
PublikacjaSkonstruowano białka chimeryczne zawierające białko MutS z Thermus thermophilus i białko zielonej fluoresceiny GFP z Aequorea victoria, posiadające dla łatwiejszego oczyszczania domeny oligo-histydynowe na N- lub C-końcu. Fuzyjne białka rozpoznawały niekomplementarności w DNA podobnie do MutS T. thermophilus. Fluorescencyjne białka rozpoznające niekomplementarne DNA mogą być użyteczne w wykrywaniu jednonukleotydowych polimorfizmów...
-
Toxoplasma gondii: an evaluation of diagnostic value of recombinant antigens in a murine model
PublikacjaPraca dotyczy oceny użyteczności sześciu rekombinantowych białek antygenowych Toxoplasma gondii (GRA1, GRA6, GRA7, p35, SAG1 i SAG2) w diagnozowaniu doświadczalnej toksoplazmozy u myszy. Przeprowadzone badania pozwoliły na określenie stopnia reaktywności zastosowanych antygenów z surowicami z wczesnej i przewlekłej toksoplazmozy. W przypadku ostrej fazy choroby obserwowano silną odpowiedź humoralną na antygeny GRA7, GRA6 i p35,...
Rok 2007
-
A bifunctional chimeric protein consisting of MutS and beta-galactoside
PublikacjaPraca pokazuje konstrukcję DNA plazmidowego kodującego bifunkcjonalne białko chimeryczne złożone z MutS Thermus thermophilus i beta-galaktozydazy E.coli, optymalizację jego ekspresji i oczyszczania. Białko to testowano w metodzie wykrywania mutacji punktowych, wykorzystując kolorymetryczne mierzenie aktywności domeny reporterowej beta galaktozydazy.
-
A cold-adapted esterase from psychrotrophic Pseudoalteromonas sp. strain 643A
PublikacjaDzięki zastosowaniu lipaz możliwa jest biotechnologiczna produkcja m.in. biodegradowalnych biopolimerów, biopaliw (tzw. biodiesel), wielu terapeutyków, herbicydów, pestycydów, kosmetyków, substancji smakowych, serów i in. Szczególnie interesującą grupę stanowią enzymy lipolityczne, pochodzące z organizmów psychrofilnych i psychrotrofowych, ze względu na zdolność do wydajnego katalizowania reakcji w temperaturach rzędu 10-20 ºC....
-
A freeze-thaw method for desintegration of Escherichia coli cells producing T7 lysozyme used in pBAD expression systems
PublikacjaPlazmid pLysN zawierający gen kodujący lizozym T7 pod kontrolą promotora lac został skonstruowany w celu ułatwienia dezintegracji komórek po ekspresji rekombinantowych białek w systemach ekspresji indukowanych arabinozą. Użyteczność plazmidu została przetestowana w komórkach Escherichia coli TOP10 i E. coli LMG194, niosących plazmid pBADMHADgeSSB, zawierający gen kodujący białko SSB Deinococcus geothermalis pod kontrolą promotora...
-
A two-plasmid Escherichia coli system for expression of Dr adhesins
PublikacjaPraca opisuje konstrukcję wydajnego systemu produkcji fimbrii Dr. System składa się z dwóch plazmidów. Plazmid pACYCpBAD-DraC-C-His zawiera pod kontrolą promotora arabinozowego gen draC kodujący białko kanałotwórcze DraC. Plazmid pET-30b-sygDraBE zawiera pod kontrolą promotora T7lac geny draB i draE kodujące odpowiednio białko opiekuńcze DraB oraz adhezynę DraE. Oba plzamidy posiadają różne ori replikacji co pozwala na ich jednoczesne...
-
ADSRRS-fingerprinting and PCR MP techniques for studies of intraspecies genetic relatedness in Staphylococcus aureus
PublikacjaW pracy pokazano użyteczność dwóch nowych metod do typowania molekularnego Staphylococcus aureus, ADSRRS-fingerprinting (Amplification of DNA fragments Surrounding Rare Restriction Sites) i PCR MP (PCR melting profile). Przebadano 37 szczepów Staphylococcus aureus izolowanych od pacjentów z czyracznością. Jako metodę referencyjną zastosowano REA-PFGE. Okazało się, że izolaty Staphylococcus aureus z nosa od niektórych pacjentów...
-
Antygeny rekombinantowe Toxoplasma gondii jako narzędzie w diagnostyce toksoplazmozy
Publikacja -
Bacterial SSB-like proteins of family Deinococcaceae - indentification, isolation, obtaining, purification and molecular characteristic
PublikacjaWiększość poznanych białek SSB jest aktywna w formie homotetramerycznej. Od 2002 roku znane są białka organizmów ekstremofilnych. Scharakteryzowano białka mikroorganizmów rodziny Deinococaceae. Uzyskane termostabilne białka stanowią atrakcyjną alternatywę w stosunku do znanych białek SSB w metodach diagnostyki molekularnej, technikach biologii molekularnej i analityce.
-
DAF - and collagen-binding properties of chimeric Dr fimbriae
PublikacjaEkspozycja białek heterologicznych na powierzchni mikroorganizmów jest jedną z nowych strategii stosowanych w mikrobiologii, biotechnologii oraz projektowaniu nowoczesnych szczepionek. W niniejszej pracy zbadano możliwość wykorzystania białka podjednostkowego DraE fimbrii Dr uropatogennych szczepów Escherichia coli jako nośnika heterologicznych sekwencji. W rejon odpowiadający N-terminalnej domenie 2 białka DraE wprowadzono epitopową...
-
Diagnostyka molekularna w zakażeniach szpitalnych
PublikacjaOpisano najczęściej wykorzystywane techniki genotypowania w badaniach zakażeń szpitalnych z uwzględnieniem ich powtarzalności i potencjału różnicującego oraz problemów technicznych i ponoszonych kosztów. Makrorestrykcyjna analiza genomowego DNA z wykorzystaniem PFGE (ang. Pulsed Field Gel Electrophoresis)jest uważana za ''złoty standard'' w typowaniu molekularnym. Jednak jest ona czasochłonna, pracochłonna i dlatego nie nadaje...
-
Five-hour diagnosis of dermatophyte nail infections with specific detection of Trichophyton rubrum
PublikacjaW publikacji przedstawiono szybką dwuetapową metodę oczyszczania DNA oraz opartą na technice multiplex PCR metodę wykrywania grzybów z rodzaju dermatofitów oraz gatunku Trichophyton rubrum z hodowli grzybów oraz bezpośrednio ze zmienionych chorobowo paznokci. Testy stu osiemnastu próbek z użyciem zaprojektowanej reakcji multiplex PCR i dwóch kolejnych (jedna wykrywająca grzyby z rodzaju dermatofitów, druga wykrywająca gatunek T....
-
Genetyczne metody różnicowania mikroorganizmów
PublikacjaPrzedstawiono przegląd i porównanie kilku najczęściej stosowanych technik różnicowania genetycznego mikroorganizmów, uwzględniając molekularne podstawy metod, ich powtarzalność, siłę dyskryminacji, łatwość i koszt użycia, aby dać czytelnikowi pogląd na możliwości klinicznego zastosowania dostępnych aktualnie narzędzi molekularnego różnicowania mikroorganizmów.
-
GRA1 protein vaccine confers better immune response compared to codon-optimized GRA1 DNA vaccine
PublikacjaW publikacji oszacowano immunogenność i właściwości protekcyjne szczepionki anty-Toxoplasma gondii opartej na białku rekombinantowym GRA1 oraz dwóch rodzajach szczepionek DNA (plazmidu zawierającego gen kodujący białko GRA1 dzikiego typu oraz modyfikowanego genu kodującego białko GRA1). Uzyskane wyniki sugerują lepsze właściowści immunoprotekcyjne rekombinantowego białka antygenowego niż szczepionek DNA.
-
High prevalence of Escherichia coli belonging to the B2+D phylogenetic group in inflammatory bowel disease
PublikacjaBACKGROUND: It is not clear which species of bacteria may be involved in inflammatory bowel disease (IBD). One way of determining which bacteria might be likely candidates is to use culture-independent methods to identify microorganisms that are present in diseased tissues but not in controls. AIMS: (1) To assess the diversity of microbial communities of biopsy tissue using culture-independent methods; (2) to culture the bacteria...
-
Identification and properties of the Deinococcus grandis andDeinococcus proteolyticus single-stranded DNA binding proteins (SSB)
PublikacjaW celu poznania właściwości biochemicznych białek SSB pochodzących z Deinococcus grandis (DgrSSB) i Deinococcus proteolyticus (DprSSB) sklonowano zaamplifikowane w reakcji PCR geny ssb w systemie ekspresyjnym Escherichia coli. Geny składają się z 891(DgrSSB) i 876 (DprSSB) nukleotydów kodujących odpowiednio 296 i 291 reszt aminokwasowych o teoretycznie wyznaczonej masie cząsteczkowej dla białek, równej 32,29 i 31,33 kDa. Sekwencja...
-
Identification, cloning, expression, and characterizationof a highly thermostable single-stranded-DNA-binding protein (SSB) from Deinococcus murrayi
PublikacjaZidentyfikowano i scharakteryzowano białko SSB-podobne, pochodzące z Deinococcus murrayi (DmuSSB). Otrzymany w reakcji PCR fragment zawierający kompletny gen ssb sklonowano w systemie ekspresyjnym Escherichia coli. Gen składa się z 826 nt, kodujących 276 reszt aminokwasowych z wyliczoną teoretycznie masą cząsteczkową monomeru równą 30,14 kDa. DmuSSB zawiera dwie domeny wiążące jednoniciowe DNA OBna monomer I funkcjonuje jako homodimer....
-
Immobilized preparation of cold-adapted and halotolerant Antarctic β-galactosidase as a highly stable catalyst in lactose hydrolysis
PublikacjaZimnolubna rekombinowana beta-galaktozydaza antarktycznej morskiej bakterii Pseudoalteromonas sp. 22b została immobilizowana na chitozanie za pomocą aldehydu glutarowego. Preparat immobilizowanego enzymu w przeciwieństwie do preparatu enzymu w buforze reakcyjnym nie był inhibowany przez glukozę. Immobilizacja enzymu wpłynęła na podwyższenie o 10°C optymalnej temperatury aktywności względem jego nieimmobilizowanego odpowiednika...
-
Konstrukcja i wstępna ocena użyteczności szczepionki anty-Toxoplasma gondii opartej na chimerycznych fimbriach Escherichia coli typu Dr z epitopami antygenów SAG1, GRA1 lub MAG1
Publikacja -
Molecular typing of clinical isolates of Escherichia coli by a new PCR MP method
PublikacjaTypowanie epidemiologiczne bakterii jest rutynową procedurą stosowaną w badaniach zakażeń szpitalnych i wymaga stosowania odpowiednich metod o wysokim potencjale różnicującym. Przedstawiliśmy możliwości nowej techniki PCR MP w różnicowaniu szczepów E. coli. Rezultaty zostały porównane z wynikami uzyskanymi metodą PFGE.
-
Molecular typing of clinical isolates of Escherichia coli by a new PCR MP method
PublikacjaTypowanie epidemiologiczne bakterii jest rutynową procedurą stosowaną w badaniach zakażeń szpitalnych i wymaga stosowania odpowiednich metod o wysokim potencjale różnicującym. Przedstawiliśmy możliwości nowej techniki PCR MP w różnicowaniu szczepów E. coli. Rezultaty zostały porównane z wynikami uzyskanymi metodą PFGE.
-
Optymalizacja i walidacja metody ADSRRS-fingerprinting - konstrukcja zestawu diagnostycznego do różnicowania genetycznego drobnoustrojów
PublikacjaSpośród wszystkich metod typowania mikroorganizmów na szczególną uwagę zasługują metody oparte na analizie całego materiału genetycznego zawartego w komórce. Jedną z nich jest stosunkowo nowa technika ADSRRS-fingerprinting (ang. Amplification of DNA Fragments Surrounding Rare Restriction Sites). Na podstawie naszych badań można stwierdzić, iż charakteryzuje się ona wysokim potencjałem różnicującym, wiarygodnością, powtarzalnością...
-
PCR Melting Profile method for genotyping analysis of vancomycin-resistant Enterococcus faecium isolates from Hematological Unit patients
PublikacjaW ostatnich latach znacząco wzrasta liczba szczepów Enterococcus opornych na wankomycynę. Stwarzają one problemy medyczne u pacjentów skolonizowanych czy zainfekowanych tymi drobnoustrojami. W przedstawionych badaniach, określiliśmy genetyczne podobieństwo pomiędzy izolatami E. faecium VRE, pozyskiwanymi w okresie od kwietnia 2003 do kwietnia 2005 od pojedynczych pacjentów oddziału Hematologicznego Specjalistycznego Publicznego...
-
Szczepionki przeciw toksoplazmozie - aktualny stan badań
PublikacjaArtykuł prezentuje współczesną wiedzę na temat opracowywania skutecznej szczepionki przeciwko toksoplazmozie. W publikacji zebrane zostały informacje dotyczące nowych strategii w konstruowaniu efektywnych szczepionek opartych na antygenach natywnych, rekombinantowych, DNA lub RNA pasożyta.
-
Technika PCR MP (PCR Melting Profile) - możliwości zastosowania w badaniach epidemiologicznych
PublikacjaUżyteczność PCR MP (ang. PCR Melting Profile), stosunkowo nowej techniki różnicowania genetycznego szczepów mikroorganizmów, pokazano na przykładach badań epidemiologicznych, dotyczących wykrywania zakażeń szpitalnych, analizy sytuacji epidemiologicznej i identyfikacji transmisji bakteryjnej u poszczególnych pacjentów. Technikę PCR MP charakteryzuje prostota, niskie koszty wykonania oraz potencjał różnicujący porównywalny do metody...
-
Toksoplazmoza ludzi i zwierząt Cz. I. Zasadnicze elementy etiopatogenezy i epidemiologii
PublikacjaPrzedstawiono obecny stan wiedzy na temat etiopatologii i epidemiologii zarażeń pierwotniakiem Toxoplasma gondii u ludzi i zwierząt.
-
Toksoplazmoza ludzi i zwierząt Cz. II. Zasadnicze elementy diagnostyki oraz terapii i profilaktyki
PublikacjaPrzedstawiono aktualny stan wiedzy na temat diagnostyki, terapii i profilaktyki zarażenia Toxoplasma gondii u ludzi i zwierząt.
-
Use of MAG1 recombinant antigen for diagnosis of Toxoplasma gondii infection in humans
PublikacjaPraca opisuje klonowanie, oczyszczanie oraz zastosowanie w immunodiagnostyce toksoplazmozy antygenu rekombinantowego macierzy cyst tkankowych (MAG1) Toxoplasma gondii. Zastosowany system ekspresyjny pozwolił uzyskać dużą ilość rekombinantowego antygenu, który następnie wykorzystano w teście ELISA do wykrywania specyficzych przeciwciał anty-T. gondii klasy IgG w surowicach pacjentów chorych na toksoplazmozę. W przeprowadzonych badaniach...
-
Usefulness of Toxoplasma gondii recombinant antigens (GRA1, GRA7 and SAG1) in an immunoglobulin G avidity test for the serodiagnosis of toxoplasmosis
PublikacjaOpisano wykorzystanie mieszanki trzech antygenów rekombinantowych (GRA1, GRA7 i SAG1) Toxoplasma gondii w serodiagnostyce toksoplazmozy z wykorzystaniem oznaczenia awidności przeciwciał klasy IgG. Zastosowana mieszanka może z powodzeniem zastąpić całkowity lizat antygenów natywnych który obecnie stosowany jest w komercyjnie dostępnych zestawach. Ponadto wykazano, że zastosowane antgeny rekombinantowe różnicują fazy choroby lepiej...
Rok 2008
-
A nosocomial outbreak of Candida parapsilosis in southern Sweden verified by genotyping
PublikacjaIn a haematology ward, Candida parapsilosis was found in blood cultures from 4 patients within a month. As C. parapsilosis is known to have a restricted genetic diversity, a combined methodological approach was adopted to establish a possible epidemiological relationship among the isolates (n = 9). Multilocus sequence typing and random amplified polymorphic DNA analysis suggested a clonal origin of the isolates. The clonal origin...
-
Adaptowana do zimna esteraza Pseudoalteromonas sp. 643A - produkcja w systemach ekspresyjnych Escherichia coli, oczyszczanie i charakterystyka
Publikacja -
ALIS-FLP: amplified ligation selected fragment-length polymorphism method for microbial genotyping
PublikacjaA DNA fingerprinting method known as ALIS-FLP (amplified ligation selected fragment-length polymorphism) has been developed for selective and specific amplification of restriction fragments from TspRI restriction endonuclease digested genomic DNA. The method is similar to AFLP, but differs in that only one specific restriction enzyme (TspRI) is used. The cohesive ends of the DNA fragments are ligated with two types of oligonucleotide....
-
Amplification of a single-locus variable-number direct-repeats with restriction fragment length polymorphism (DR-PCR/RFLP) for genetic typing of Acinetobacter baumannii strains
PublikacjaW celu poszukiwania nowych metod typowania genetycznego szczepów Acinetobacter baumannii przydatnych w szpitalnych badaniach epidemiologicznych przeprowadzono analizę dostępnych w banku genów sekwencji szczepów referencyjnych na obecność nowych motywów repetytywnych. Do badania polimorfizmu sekwencji repetytywnych w szczepach Acinetobacter sp. wykorzystano proste powtórzenia typu "direct repeat" (DR) zlokalizowane w jednym miejscu...
-
Białko DraD uropatogennych szczepów Escherichia coli Dr+ - mechanizm transportu na powierzchnię komórki i rola w procesie polimeryzacji struktur fimbrialnych
Publikacja -
Drożdżowe systemy ekspresyjne jako narzędzie nowoczesnej mikrobiologii przemysłowej
PublikacjaDrożdże łączą zalety prokariotycznych i eukariotycznych systemów ekspresyjnych. Charakteryzuje je szybki wzrost, osiągają też znacznie większą biomasę w porównaniu z bakteriami. W odróżnieniu od bakterii, drożdże zdolne są do przeprowadzania modyfikacji posttranslacyjnych białek. Kolejną zaletą drożdżowych systemów ekspresyjnych jest zdolność komórek drożdżowych do sekrecji białek do pożywki hodowlanej. W laboratoriach naukowych...
-
Experimental guinea pig model of dermatophytosis: a simple and useful tool for the evaluation of new diagnostics and antifungals
PublikacjaCelem badań było opracowanie prostego modelu zwierzęcego (świnki morskie) odpowiedniego do sprawdzania systemów diagnostycznych oraz terapii infekcji dermatofitów. Następujące zmienne były analizowane: przygotowanie skóry przez golenie versus użycie taśmy, testowy szczep Microsporum canis czy Trichophyton mentagrophytes jako czynnik etiologiczny, sposób inokulacji. Przebieg infekcji był oceniany poprzez ocenę zaczerwienienia i...
-
Extracellular secretion of Pseudoalteromonas sp. cold-adapted esterase in Escherichia coli in the presence of Pseudoalteromonas sp. components of ABC transport system
PublikacjaEnzymy lipolityczne, głównie lipazy i esterazy, stanowią cenną grupę biokatalizatorów wykorzystywanych w przemyśle. Coraz większe zainteresowanie tą klasą enzymów sprawiło, że poszukuje się alternatywnych źródeł ich pozyskiwania. W celu zbadania wpływu białek transportu ABC Pseudoalteromonas sp. 643A na ekspresję genu, sekrecję i aktywność esterazy EstA z tego mikroorganizmu w systemie ekspresyjnym E. coli skonstruowano układ do...
-
Metody molekularne w dochodzeniach epidemiologicznych zakażeń szpitalnych
PublikacjaW dochodzeniu epidemiologicznym wykorzystuje się zmienność genetyczną mikroorganizmów do tzw. typowania genetycznego drobnoustrojów. W pracy omówiono metody genotypowe wykorzystujące podstawowe narzędzia molekularne, ukazano możliwości wykorzystania typowania drobnoustrojów w różnych aspektach badań mikrobiologicznych.
-
Molecular characterization of a cryptic plasmid from the psychrotrophic antarctic bacterium Pseudoalteromonas sp. 643A
PublikacjaW ostatnich latach znacznie wzrosło zainteresowanie organizmami zimnolubnymi, głównie z powodu ich enzymów o biotechnologicznym znaczeniu. Jednak, aby wydajnie produkować takie enzymy w skali przemysłowej użyteczne jest stworzenie rekombinantowych systemów ekspresyjnych, które pozwolą na ich opłacalną produkcję. W osiągnięciu tego celu mogą pomóc odpowiednie wektory, konstruowane na bazie plazmidów pozyskiwanych z bakterii psychrofilnych/psychrotrofowych....
-
Naturally occurring mitochondrial DNA heteroplasmy in the MRL mouse
PublikacjaThe MRL/MpJ mouse is an inbred laboratory strain of Mus musculus, known to exhibit enhanced autoimmunity, increased wound healing, and increased regeneration properties. We report the full-length mitochondrial DNA (mtDNA) sequence of the MRL mouse (Accession # EU450583), and characterize the discovery of two naturally occurring heteroplasmic sites. The first is a T3900C substitution in the TpsiCloop of the tRNA methionine gene...
-
Opracowanie zestawu diagnostycznego do genetycznego typowania szczepów bakteryjnych metodą PCR MP
PublikacjaOmówiono etapy tworzenia zestawu diagnostycznego przeznaczonego do genetycznego typowania szczepów bakteryjnych wykorzystującego procedurę PCR MP (PCR Melting Profiles). Dokonano optymalizacji warunków i walidacji metody w celu przystosowania jej do potrzeb epidemiologicznej oceny zakażeń szpitalnych. Opracowany zestaw stwarza możliwości zastosowania go w laboratoriach prowadzących rutynowo badania diagnostyczne.
-
Population-based case-control study of alpha 1-antitrypsin and SLC11A1 in Crohn's disease and ulcerative colitis.
PublikacjaBackground: Crohn’s disease (CD) and ulcerative colitis (UC) are chronic inflammatory diseases of the digestive tract. Genetic factors and an abnormal immune response to infections are suspected to be involved in inflammatory bowel diseases. Methods: In the present study 300 blood samples from CD patients (n 100), UC patients (n 100), and healthy controls (n 100) were taken from a population-based case-control study. PCR assays...
-
Rozdział 5. Nowoczesne metody diagnostyki zakażeń grzybiczych wywoływanych przez dermatofity = Novel diagnostic methods of funfal infections caused by dermatophytes
PublikacjaDermatofity są głównym czynnikiem etiologicznym grzybic powierzchownych. Do tej klasy grzybów należą przedstawiciele trzech rodzajów: Epidermophyton, Microsporum i Trichophyton. Klasyczne metody diagnostyczne polegają na bezpośredniej ocenie mikroskopowej oraz badaniu hodowlanym. Identyfikacja gatunkowa jest możliwa na podstawie cech makroskopowych kolonii: ich struktury, koloru, kształtu, oraz obserwacji mikroskopowych (kształt...
-
Rozdział 6. Epidemiologia molekularna - nowe metody typowania diagnostycznego mikroorganizmów = Molecular epidemiology new methods for diagnostic typing of microorganismus
PublikacjaMolekularne metody diagnostyczne oparte o analizę kwasów nukleinowych dają nowe możliwości laboratoriom w szybkim wykrywaniu i różnicowaniu mikroorganizmów patogennych. W pracy przedstawiono panujące tendencje w zastosowaniach metod typowania genetycznego znaczących klinicznie mikroorganizmów w Europie, a także omówiono niektóre techniki stosowane w laboratoriach mikrobiologicznych, z uwzględnieniem ich zdolności aplikacyjnych,...
-
Toxoplasma gondii: Chimeric Dr fimbriae as a recombinant vaccine against toxoplasmosis
PublikacjaW publikacji przedstawiono protekcyjne i immunogenne właściowści chimerycznych fimbrii typu Dr zawierających sekwencje epitopowe antygenów SAG1, MAG1 oraz GRA1 Toxoplasma gondii. Uzyskane wyniki porównano z właściwościami immunogennymi antygenowych białek rekombinantowych oraz poliwalentnego antygenu natywnego. Antygeny rekombinantowe indukują silną odpowiedź immunologiczną i w 89% zapobiegają formowaniu się cyst w mózgu myszy....
-
Toxoplasma gondii: Enzyme-Linked Immunosorbent Assay using different fragments of recombinant microneme protein 1 (MIC1) for detection of immunoglobulin G antibodies
PublikacjaTrzy rekombinantowe fragmenty białka antygenowego MIC1 Toxoplasma gondii (r-MIC1ex2, r-MIC1ex34 i r-MIC1) zostały wyprodukowane jako białka fuzyjne (zawierające dwie domeny oligohistydynowe na N- i C-końcu) w komórkach bakteryjnych Escherichia coli. Homogenne preparaty antygenów rekombinantowych otrzymane z zastosowaniem jednoetapowego oczyszczania metodą chromatografii metalopowinowactwa, wykorzystano następnie do immunoidentyfikacji...
-
Two highly thermostable paralogous single-stranded DNA-binding proteins from Thermoanaerobacter tengcongensis
PublikacjaThe thermophilic bacterium Thermoanaerobacter tengcongensis has two single-stranded DNA-binding (SSB) proteins, designated TteSSB2 and TteSSB3. In a SSB complementation assay in Escherichia coli, only TteSSB3 took over the in vivo function of EcoSSB. We have cloned the ssb genes obtained by PCR and have developed E. coli overexpression systems. The TteSSB2 and TteSSB3 consist of 153 and 150 amino acids with a calculated molecular...
-
Type II secretory pathway for surface secretion of DraD invasin from the uropathogenic Escherichia coli Dr+ strain
PublikacjaWłaściwości wirulentne uropatogennych szczepów Escherichia coli Dr+ IH11128 związane są z obecnością struktur fimbrialnych typu Dr i białka inwazyny DraD, które może na powierzchni komórki bakteryjnej pełnić rolę fimbrialnej podjednostki szczytowej. Ostatnie badania wykazały, że białko DraD jest eksponowane na powierzchni bakterii w dwóch formach: związanej ze strukturą fimbrialną i jako niezależna od fimbrii otoczka białkowa....
-
Wykorzystanie reakcji PCR do badania charakterystycznych obszarów genomu
PublikacjaW pracy zostały opisane metody wykorzystujące technię PCR do długo- i krótkoterminowych badań epidemiologicznych. Typowanie szczepów oparte jest na analizie fragmentów genów, bądź całego genomu w zależności od potrzeby posiadania potencjału różnicującego metody. Przez ostatnie 30 lat rozwijały się nie tylko metody badawcze, doszło również do rozwoju międzynarodowych baz danych i przepływu informacji o obecnych sytuacjach epidemiologicznych...
Rok 2009
-
A cryptic ribosome binding site, false signals in reporter systems and avoidance of protein translation chaos
PublikacjaThe expression of reporter gene may be induced by activation of cryptic signalling sequences, as we found while constructing the mutS-lacZ fusion gene. We cloned the Escherichia coli lacZ gene encoding beta-galactosidase into a plasmid vector carrying the Thermus thermophilus mutS gene. The clones expected to produce beta-galactosidase as the C-terminal fusion were selected for the complementation of beta-galactosidase activity...
-
A new B-D-galactosidase with a low temperature optimum isolated from the Antarctic Arthrobacter sp. 20B: gene cloning, purification and characterization.
PublikacjaA psychrotrophic bacterium producing a coldadaptedB-galactosidase upon growth at low temperatureswas classiWed as Arthrobacter sp. 20B. A genomic DNAlibrary of strain 20B introduced into Escherichia coliTOP10F' and screening on X-Gal (5-bromo-4-chloro-3-indolyl-B-D-galactopyranoside)-containing agar plates ledto the isolation of B-galactosidase gene. The B-galactosidasegene (bgaS) encoding a protein of 1,053 amino acids,with a...
-
A new cold-adapted beta-D-galactosidase from the Antarctic Arthrobacter sp. 32c - gene cloning, overexpression, purification and properties
PublikacjaThe development of a new cold-active β-D-galactosidases and microorganisms that efficiently ferment lactose is of high biotechnological interest, particularly for lactose removal in milk and dairy products at low temperatures and for cheese whey bioremediation processes with simultaneous bio-ethanol production. In this article, we present a new β-D-galactosidase as a candidate to be applied in the above mentioned biotechnological...
-
An MTA-phosphorylase gene discovered in the metagenomic library derived from Antarctic top soil during screening for lipolytic active clones confers strong pink fluorescence in the presence of rhodamine B.
PublikacjaIn this work, we present the construction of a metagenomic library in Escherichiacoli using the pUC19 vector and environmental DNA directly isolated fromAntarctic topsoil and screened for lipolytic enzymes. Unexpectedly, the screeningon agar supplemented with olive oil and rhodamine B revealed one unusual pinkfluorescent clone (PINKuv) out of 85 000 clones. This clone harbored a plasmid,pPINKuv, which has an insert of 8317 bp that...
-
Antarctic, cold-adapted beta-galactosidase of Pseudoalteromonas sp. 22b as an effective tool for alkyl galactopyranosides synthesis
PublikacjaPrzedstawione jest zastosowanie arktycznej beta-galaktozydazy Pseudoalteromonas sp. 22b do katalizy syntezy alkilowych galaktopyranozydów. Njwyższą wydajność syntezy uzyskuje się przy pH 6-9 i 10-30% stężenia wody. Podobnie jak dla mezofilnych beta-galaktozydaz enzym antarktyczny syntetyzował najwydajniej kiedy reakcja przebiega w mieszaninie buforu i rozpuszczalnika organiczego (poniżej 50%, v/v).
-
Badania epidemiologiczne populacji kobiet gminy Przodkowo w kierunku toksoplazmozy
PublikacjaW pracy przedstawiono badania dotyczące rozpowszechnienia toksoplazmozy wśród grupy kobiet w wieku 12-81 lat zamieszkujących teren typowej wiejskiej gminy Przodkowo w województwie pomorskim. Analizowano częstość występowania specyficznych przeciwciał IgG i IgM anty-Toxoplasma gondii oraz awidność przeciwciał IgG w tej grupie społecznej.
-
Benzonaza(R): możliwości praktycznych zastosowań.
PublikacjaBenzonaza znajduje zastosowanie w efektywnym obniżaniu lepkości i usuwaniu kwasów nukleinowych z roztworów białkowych. Zbadano w praktyce jej możliwości aplikacyjne w oczyszczaniu białek rekombinantowych wiążących jednoniciowe DNA (ang. SSB - single stranded DNA binding protein).
-
Biofilm formation as a virulence determinant of uropathogenic Escherichia coli Dr+ strains
PublikacjaInfekcje dróg moczowych stanowią największy problem zdrowotny dotykający miliony osób populacji ludzkiej każdego roku. Uropatogenne szczepy Escherichia coli są najczęstszym czynnikiem etiologicznym odpowiedzialnym za wywoływanie górnych i dolnych dróg moczowych. Powyższe szczepy bakteryjne produkują szereg czynników wirulentnych pośród, których wyróżnić można eksponowane powierzchniowo polimeryczne struktury adhezyjne (fimbrie/pile)...
-
Characterization of a cryptic plasmid pSFKW33 from Shewanella sp. 33b
PublikacjaA cryptic plasmid pSFKW33 from psychrotrophic bacterium Shewanella sp. 33B, an isolate from the Gulf of Gdansk (the Baltic Sea), was sequenced and characterized. It is an 8021 bpcircular molecule with 38% GC content, which shows a distinctive nucleotide sequence without homology to other known plasmids. The nucleotide sequence analysis predicts eight open reading frames. The deduced amino acid sequence of ORF-1 shared significant...
-
Current status of toxoplasmosis vaccine development
PublikacjaToksoplazmoza, choroba wywoływana przez wewnątrzkomórkowego pasożyta Toxoplasma gondii jest szeroko rozpowszechniona na całym świecie. Zarażenie tym pasożytem stanowi bardzo poważny problem medyczny i weterynaryjny, ponieważ jest przyczyną ciężkiej wrodzonej postaci choroby (tzw. toksoplazmozy wrodzonej) oraz poronień, które dotyczą zarówno ludzi jak i zwierząt domowych. Toksoplazmoza może mieć także ciężki przebieg u osób upośledzoną...
-
Diagnostic PCR assay for Microsporum and Trichophyton infections
PublikacjaWe have previously described a highly sensitive 5-hour PCR test for the rapid diagnosis of onychomycosis which detects any dermatophyte and species-identify T. rubrum from patient specimens. We have subsequently developed and evaluated new PCR tests for detection of Trichophyton and Microsporum canis/audouinii infections.58 dermatophyte isolates (21) Microsporum spp. (4 different species), 35 Trichophyton spp (10 different species)...
-
Genotyping and characterization of virulence factors in Escherichia coli strains isolated from patients from Polish hospital
PublikacjaZakażenia układu moczowego (UTIs - ang. urinary track infections) są jedną z najczęstszy infekcji, za które w 85% przypadków odpowiedzialne są bakterie Escherichia coli. Infekcje układu moczowego mogą prowadzić do groźnych powikłań m. in. odmiedniczkowego zapalenia nerek. Śmiertelność wśród tej grupy pacjentów wynosi 1-3%. Zakażenia układu moczowego występują również u ok. 7% kobiet ciężarnych. W pracy przebadano 82 szczepy E....
-
GRA2 and ROP1 recombinant antigens as potential markers for detection of Toxoplasma gondii-specific immunoglobulin G in humans with acute toxoplasmosis.
PublikacjaArtykuł przedstawia oszacowanie przydatności w serodiagnostyce toksoplazmozy dwóch rekombinatowych białek antygenowych GRA2 i ROP1 Toxoplasma gondii. Białka rekombinantowe otrzymano z wykorzystaniem bardzo wydajnego, bakteryjnego systemu ekspresyjnego, który pozwolił na otrzymanie miligramowych ilości antygenów z 1 litra hodowli po zastosowaniu jednoetapowego oczyszczania metodą chromatografii metalopowinowactwa. Użyteczność diagnostyczna...
-
Identification and molecular modeling of a novel lipase from an Antarctic soil metagenomic library.
PublikacjaIn this work, we present the construction of a metagenomic library in Escherichia coli using pUC19 vector and environmental DNA directly isolated from Antarctic topsoil and screened for lipolytic enzymes. The screening on agar supplemented with olive oil and rhodamine B revealed one clone with lipolytic activity (Lip1) out of 11,000 E. coli clones. This clone harbored a plasmid, pLip1, which has an insert of 4722 bp that has been...
-
Nowoczesne metody diagnostyki zakażeń dermatofitowych
PublikacjaGrzyby należące do rodzajów Microsporum, Trichophyton i Epidermophyton są główną przyczyną powierzchownych zakażeń grzybiczych. Klasyczna identyfikacja gatunkowa czynnika etiologicznego tych grzybic oparta na obserwacjach mikro- i makroskopowych możliwa jest dopiero po uzyskaniu czystej hodowli dermatofitów. W związku z powolnym tempem wzrostu jest ona możliwa po dwóch, trzech tygodniach po pobrania próbki. Molekularne metody diagnostyczne...
-
Optimised five-hour multiplex PCR test for the detection of Tinea ungium: performance in a routine PCR laboratory
PublikacjaWe recently published the development of a 5-hour multiplex PCR test for the detection of dermatophyte nail infection. We have optimized this test by inclusion of an inhibition control and evaluated the test in a routine laboratory when compared to the conventional microscopy and culture. A total of 109 clinical samples received at the mycology reference lab at Statens Serum Institute were included. The samples were divided equally...
-
PCR melting profile (PCR MP) - a new tool for differentiation of Candida albicans strains
PublikacjaPo raz pierwszy przedstawiliśmy użyteczność techniki PCR MP opartej na metodzie ligacji adaptorów (LM PCR) i obniżonej temperaturze denaturacji w cyklach PCR do wewnątrzgatunkowego różnicowania szczepów Candida albicans. Przebadaliśmy 123 szczepy Candida albicans z zastosowaniem trzech metod genotypowania: PCR MP, REA-PFGE i RAPD i uzyskaliśmy odpowiednio 27, 26 i 25 unikalnych genotypów. Zaprezentowane dane pokazały, że technika...
-
Preclusion of irreversible destruction of Dr adhesin structures by a high activation barrier for the unfolding stage of the fimbrial DraE subunit
PublikacjaFimbrie Dr uropatogennych szczepów Escherichia coli stanowią przykład eksponowanych powierzchniowo struktur adhezyjnych podlegających biogenezie według zakonserwowanego, pośród bakterii Gram-ujemnych, systemu "chaperone-usher" ("białko opiekuńcze-zewnątrzbłonowe białko kanałowe"). Powyższe struktury adhezyjne są niezbędne w procesie specyficznej adhezji bakterii do receptorów zlokalizowanych na powierzchni docelowych komórek gospodarza....
-
Purification and biochemical characteristic of a cold-active recombinant esterase from Pseudoalteromonas sp. 643A under denaturing conditions.
PublikacjaIn this paper production of a cold-active esterase EstA from the Antarctic bacterium Pseudoalteromonas sp. 643A in E. coli expression system was described. The purification and biochemical characteristic of EstA were performed in the presence of urea and then compared with results obtained for the esterase with no addition of urea and isolated from the native source. In both cases the cold-active enzyme displayed similar properties....
-
Retained features of embryonic metabolism in the adult MRL mouse
PublikacjaThe MRL mouse is an inbred laboratory strain that was derived by selective breeding in 1960 from the rapidly growing LG/J (Large) strain. MRL mice grow to nearly twice the size of other commonly used mouse strains, display uncommonly robust healing and regeneration properties, and express later onset autoimmune traits similar to Systemic Lupus Erythematosis. The regeneration trait (heal) in the MRL mouse maps to 14-20 quantitative...
-
Retrospective analysis of genetic diversity of Klebsiella oxytoca isolated in Poland over a 50-year period.
PublikacjaAnaliza genetyki populacji i określenie powiązań filogenetycznych pomiędzy szczepami może być niezwykle użytecznym podejściem w określaniu rozprzestrzeniania się wzorów genetycznych różnych gatunków bakterii na potrzeby epidemiologiczne. Nie ma danych, które opisywałyby długoterminowe sytuacje epidemiologiczne powodowane przez wielolekooporne, oportunistyczne szczepy Klebsiella oxytoca metodami molekularnymi. Celem przedstawionych...
-
Structure of EstA esterase from psychrotrophic Pseudoalteromonas sp. 643A covalently inhibited by monoethylphosphonate.
PublikacjaThe crystal structure of the esterase EstA from the cold-adapted bacteriumPseudoalteromonas sp. 643A was determined in a covalently inhibited form at aresolution of 1.35 A˚. The enzyme has a typical SGNH hydrolase structureconsisting of a single domain containing a five-stranded beta-sheet, with threehelices at the convex side and two helices at the concave side of the sheet, and isornamented with a couple of very short helices...
-
Szczepionki DNA i antygeny rekombinantowe w prewencji zarażeń Toxoplasma gondii - aktualny stan badań
PublikacjaToksoplazmoza wywoływana przez wewnątrzkomórkowego pasożyta Toxoplasma gondii jest jedną z najbardziej rozpowszechnionych odzwierzęcych chorób na świecie o bardzo dużym znaczeniu medycznym. Stanowi ponadto bardzo poważny problem weterynaryjny, ponieważ jest główną przyczyną strat reprodukcyjnych w hodowli zwierząt (głównie owiec). Z tego względu bardzo ważne są prace dotyczące konstrukcji i opracowania nowych, skutecznych i tanich...
-
Usefulness of PCR Melting Profile Method for Genotyping Analysis of Klebsiella oxytoca Isolates from Patients of a Single Hospital Unit
PublikacjaOpracowanie szybkich i prostych metod typowania jest wymagane w celu identyfikacji potencjalnych źródeł zakażenia ludzi drobnoustrojami oportunistycznymi. Klebsiella spp. należą do grupy bakterii oportunistycznych odpowiedzialnych za wzrost liczby wieloopornych zakażeń szpitalnych. Ostatnio pokazaliśmy wysoką różnorodność genetyczną K. oxytoca używając dużej kolekcji szczepów izolowanych przez 50 lat od pacjentów z kilku szpitali...
Rok 2010
-
A new cold-active β-galactosidase from Arthrobacter sp. S3* - gene cloning, overexpression, purification and properties
PublikacjaA psychrotrophic bacterium producing a cold-active β-galactosidase was isolated from Spitsbergen soil and classified as Arthrobacter sp. S3*. The gene encoding β-galactosidase was isolated from the genomic DNA library, sequenced, cloned, expressed in Escherichia coli, purified by ion exchange chromatography and characterized. The Arthrobaster sp. S3* β-galactosidase is a homotrimeric enzyme composed of 74,4 kDa subunits. It is...
-
Application of recombinant antigens in serodiagnosis of swine toxoplasmosis and prevalence of Toxoplasma gondii infection among pigs in Poland
PublikacjaNiniejsza praca przedstawia częstość występowania toksoplazmozy w populacji świń obejmującej 1754 osobników pochodzących z różnych regionów Polski, która określona została z wykorzystaniem testu IgG ELISA opartego na antygenie natywnym pasożyta. Specyficzne przeciwciała anty-T. gondii klasy IgG zostały wykryte u 19,2% zwierząt z testowanej grupy. Ponadto w pracy oszacowano użyteczność diagnostyczną w rozpoznawaniu toksoplazmozy...
-
Characterization of exceptionally thermostable single-stranded DNA-binding proteins from Thermotoga maritima and Thermotoga neapolitana
PublikacjaBACKGROUND: In recent years, there has been an increasing interest in SSBs because they find numerous applications in diverse molecular biology and analytical methods.RESULTS: We report the characterization of single-stranded DNA binding proteins (SSBs) from the thermophilic bacteria Thermotoga maritima (TmaSSB) and Thermotoga neapolitana (TneSSB). They are the smallest known bacterial SSB proteins, consisting of 141 and 142 amino...
-
Comparison of immune response in sheep immunized with DNA vaccine encoding Toxoplasma gondii GRA7 antigen in different adjuvant formulations
PublikacjaPraca przedstawia badania dotyczące odpowiedzi immunologicznej owiec immunizowanych plazmidowym DNA kodującym antygen granul GRA7 Toxoplasma gondii w trzech różnych formulacjach adjuvanta. Sześćdziesiąt owiec było szczepionych domięśniowo z DNa plazmidów. Dwanaście otrzymało liposomową formę plazmidu pVAXIgGRA7, 12 formulację z Emulsigen P plazmidu pVAXIgGRA7 1 12 formulację z Emulsigen D plazmidu pVAXIgGRA7. Wszystkie zwierzęta...
-
Conservation and diversity of MutS proteins
PublikacjaThe homologues of MutS, mismatch repair protein, exist in all prokaryotes, with the exception of Actinobacteria, Mollicutes and part of the Archaea. Multiple alignments of 316 MutS amino acid sequences from 169 species revealed conserved residues and sequence motifs distinguishing MutS homologues. All MutS homologues show high conservation within the ATPase domain. MutS1, the homologue responsible for DNA mismatch recognition,...