Wyszukiwarka
Katedra Chemii Fizycznej
Publikacje
Filtry
wszystkich: 388
Katalog Publikacji
Rok 2011
-
Stabilizing agents and protein stability
PublikacjaBiałka są kluczowymi elementami żywych organizmów, jak również efektywnymi katalizatorami w biotechnologii i medycynie. Szybki rozwój wielu gałęzi biotechnologii wiąże się z coraz większym zapotrzebowaniem na produkty białkowe charakteryzujące się wysoką stabilnością. Jednym ze sposobów osiągnięcia większej stabilności białek jest wykorzystanie małych związków organicznych, tzw. osmolitów. Do tej grupy związków należą aminokwasy,...
-
Vibrational spectroscopic studies of N,N'-dimethylpropyleneurea-water system: Affected solvent spectra and factor analysis
PublikacjaZmierzono widma FT-IR układu N,N'-dimetylopropylenomocznik (DMPU) - woda w całym zakresie składów w zakresie 4000-500 cm-1 przy użyciu techniki całkowitego wewnętrznego odbicia (ATR). Hydratacja DMPU została dodatkowo zbadana przy pomocy transmisyjnej spektroskopii FT-IR izotopowo rozcieńczonej HDO w H2O. Widma zanalizowano przy użyciu ilościowej wersji metody widm różnicowych, prowadzącej do wyizolowania widma rozpuszczalnika...
Rok 2010
-
An effective method for studying intermolecular interactions in binary liquids with hydrogen bonds: FTIR spectra and ab initio calculations in the N-methylformamide - methanol system
PublikacjaMolecular complexes in methanol (MeOH)−N-methylformamide (NMF) mixtures were studied based on their FTIR-ATR spectra, to which two methods of analysis were applied: factor analysis and a quantitative version of the difference-spectra method. The mean composition of a complex between NMF and MeOH molecules over the whole range of mixture compositions was determined. Absorbing species differentiated with regard to the interaction...
-
Apparent molar volume and compressinility of tetrabutylphosphonium bromide in various solvents
PublikacjaW oparciu o pomiary gęstości wyznaczono pozorne objętości molowe bromku czero-n-butylofosfoniowego w etanolu, 1-propanolu, 1-butanolu, acetonie i acetonitrylu w przedziale temperatur od 288,15 K do 323,15 K. Ponadto zmierzone w 298,15 K szybkości rozchodzenia się dźwięku w badanych cieczach pozwoliły obliczyć pozorne ściśliwości adiabatyczne bromku. Wielkości pozorne ekstrapolowano do nieskończenie rozcieńczonego stężenia w celu...
-
Apparent molar volumes and compressibilities of alkaline earth metal ions in methanol and dimethylsulfoxide
PublikacjaTemperature dependencies of density of magnesium (II), calcium (II), strontium (II), barium (II) perchlorates as well as beryllium (II), and sodium trifluoromethanesulfonates in methanol and dimethylsulfoxide have been determined over the composition range studied. From density data the apparent molar volumes and partial molar volumes of the salts at infinite dilution as well as the expansibilities have been evaluated. The apparent...
-
Apparent molar volumes and compressibilities of selected electrolytes in dimethylsulfoxide
PublikacjaDensities at T = (293.15, 298.15, 303.15, 313.15, 323.15, and 333.15) K and sound velocities at T = 298.15 K of tetraphenylphosphonium bromide, sodium tetraphenylborate, sodium bromide, and sodium perchlorate in dimethylsulfoxide have been measured over the composition range from (0 to 0.3) mol kg1. From these data, apparent molar volumes and apparent molar isentropic compressibilitiesat infinite dilution as well as the expansibilities...
-
Charakterystyka otoczki solwatacyjnej białka przeciwdziałającego zamarzaniu wody
PublikacjaWiele organizmów rozwinęło oryginalne sposoby na radzenie sobie z niebezpieczeństwami związanymi z narażaniem na niskie temperatury. Istnieje np. szczególna grupa białek powstrzymujących wzrost zarodków krystalizacji wody. W budowie analizowanego tu białka wskazać można trzy powierzchnie: jedną wiążącą się do lodu oraz dwie pozostające w kontakcie z wodą w stanie ciekłym. Przedmiotem tej pracy było opisanie struktury wody sąsiadującej...
-
Chemometric determination of solute-affected solvent vibrational spectra as a superior way of information extraction on solute solvation phenomena
PublikacjaW pracy zaprezentowano dwie chemometryczne metody wyznaczania widm zaburzonych rozpuszczalnika oraz liczby cząsteczek zaburzonych, na podstawie zmierzonych serii wibracyjnych widm FT-IR roztworów substancji. Pierwsza z metod została stworzona na podstawie Namiarowej Analizy Faktorowej (ang. Target Factor Analysis). Druga z nich wykorzystuje algorytm izolacji widm czystych składników z serii widm mieszanin. Działanie obu metod zostało...
-
Current trends in solid-phase microextraction (SPME) fibre catings
PublikacjaThis critical review presents information on known and innovative approaches to the manufacture of fibre coatings used in solid-phase microextraction (SPME). The properties, advantages and drawbacks of the different types of commercially available SPME fibre coatings are discussed in detail, as are those of novel types of coatings and the methodologies of their preparation. The applications of fibre coatings in the solid-phase...
-
Electrochemical sensor for measurement of volatile organic compounds employing square wave perturbation voltage
PublikacjaThe paper presents the results of investigation on a prototype sensor for measurement of benzaldehyde in air. Sensitivity and limit of quantification of the sensor were determined for different internal electrolyte using the square wave voltammetry (SWV) as a detection technique. The working and counter electrodes were made of platinum. Ionic liquids 1-hexyl, 3-methylimidazolium chloride,1-hexyl, 3-methylimidazolium bis (trifluoromethanesulfonyl)...
-
Electrochemical sensor for measurement of volatile organic compounds in air
PublikacjaPrzedstawiono rezultaty badań prototypowego czujnika do oznaczania mrówczanu etylu i formaldehydu w powietrzu. Określono czułość wskazań czujnika i jego granice oznaczalności wykorzystując jako techniki detekcyjne pulsową woltamperometrię różnicową (DPV) oraz woltamperometrię fali prostokątnej (SWV). Elektrodę roboczą i przeciwelektrodę stanowiły elektrody z Pt. Elektrolitem wewnętrznym była ciecz jonowa (chlorek 1-heksylo,3-metyloimidazolinowy)....
-
Hydratacja domeny katalitycznej kinezyny
PublikacjaKinezyna należy do białek zwanych motorami molekularnymi, które są zdolne do wykonywania pracy mechanicznej. Konwencjonalna kinezyna wyposażona jest w dwie domeny motoryczne. Potrafi ona poruszać się w uporządkowany sposób przemieszczając się po szlakach wyznaczanych przez tzw. mikrotubule, które tworzone są przez białko tubulinę. Jej rola polega m.in. na transporcie białek i organelli komórkowych. Naturalnym środowiskiem działania...
-
Sol-gel technique - a versatile tool for adsorbent preparation
PublikacjaPrzygotowanie próbek do analizy, w tym przede wszystkim izolacja i/lub wzbogacanie analitów stanowi kluczowy element każdej procedury analitycznej z zakresu oznaczania składników śladowych. Wyzwania analityczna są związane zarówno z właściwościami fizykochemicznymi samych analitów jak i składników matrycy oraz stosowanych sorbentów. Choć gama znanych sorbentów i faz stacjonarnych, które można wykorzystać w praktyce analitycznej...
-
Structural properties of hydration shell around various conformations of simple polypeptides
PublikacjaIn this paper we investigate structural properties of water within the solvation shell around the peptide core created by a well-defined conformation of polypeptide chain. The following secondary structures are investigated: linear (straight chain), and three helices PII (polyproline-like), 310, and α. We propose using the two-particle contribution to entropy as a rational measure of the water structural ordering within the solvation...
-
Synthesis and structural characterization of novel 2-benzimidazolylthioureas: adducts of natural isothiocyanatesand 2-amino-1-methylbenzimidazole
PublikacjaNa drodze syntezy chemicznej uzyskano addukty naturalnych izotiocyjanianów - alilu, benzylu i fenyloetylu i 2-amino-1-metylobenzoimidazolu. W następstwie optymalizacji warunków reakcji, poszczególne 2-benzimidazolilotiomoczniki otrzymano produkty z umiarkowanymi wydajnościami. Strukturę molekularną i krystaliczną produktów scharakteryzowano przy użyciu metod spektroskopowych i X-ray. Analiza uzyskanych widm pozwoliła stwierdzić,...
-
The hydrogen bond network structure within the hydration shell around simple osmolytes: Urea, tetramethylurea, and trimethylamine-N-oxide, investigated using both a fixed charge and a polarizable water model
PublikacjaDespite numerous experimental and computer simulation studies, a controversy still exists regarding the effect of osmolytes on the structure of surrounding water. There is a question, to what extent some of the contradictory results may arise from differences in potential models used to simulate the system or parameters employed to describe physical properties of the mixture and interpretation of the results. Bearing this in mind,...
-
The hydrogen bond network structure within the hydration shell around simple osmolytes: Urea, tetramethylurea, and trimethylamine-N-oxide, investigated using both a fixed charge and a polarizable water model
PublikacjaDespite numerous experimental and computer simulation studies, a controversy still exists regarding the effect of osmolytes on the structure of surrounding water. There is a question, to what extent some of the contradictory results may arise from differences in potential models used to simulate the system or parameters employed to describe physical properties of the mixture and interpretation of the results. Bearing this in mind,...
-
The noncanonical disulfide bond as the important stabilizing element of the immunoglobulin fold of the Dr fimbrial DraE subunit
PublikacjaAdhezyny fimbrialne bakterii patogennych stanowią liniowe asocjaty białkowe odpowiedzialne za wiązanie do specyficznych receptorów na powierzchni komórek gospodarza. Biogeneza tych struktur odbywa się przez system sekrecji typu chaperone/usher zakonserwowany pośród bakterii Gram-ujemnych. Powyższe struktury adhezyjne charakteryzują się wysoką odpornością na denaturację i deasocjację, powodowane przez temperaturę lub chemiczne czynniki...
-
Theoretical pKa prediction of O-phosphoserine in aqueous solution
PublikacjaSprawdzono zdolność modelu polaryzowalnego kontinuum (PCM) do przewidywania wartości pKa w roztworze wodnym dla O-fosfoseryny (P-Ser). Obliczenia przeprowadzono w ramach teorii funkcjonału gęstości (DFT) przy użyciu funkcjonałów B3LYP i M06-2X oraz baz 6-31+G(d) and 6-31+G(d,p). Obliczenia na poziomie B3LYP/6-31+G(d,p) przy użyciu modelu solwatacji SMD zapewniają doskonałą zgodność z doświadczeniem, pod warunkiem uwzględnienia...
-
Thermodynamic Properties of Inorganic Salts in Nonaqueous Solvents. VI. Apparent Molar Volumes, Expansibilities, and Compressibilities of Divalent Transition Metal Ions in Methanol and Dimethylsulfoxide
PublikacjaThe temperature dependence of the density of divalent transition metal perchlorates in dimethylsulfoxide as well as cobalt(II), nickel(II) perchlorates, and copper(II) trifluoromethanesulfonate in methanol was determined. Moreover, sound velocities for solutions of cobalt(II), nickel(II) perchlorates, and copper(II) trifluoromethanesulfonate in methanol have been measured at 298.15 K. From these data, the partial molar volumes,...
-
Vibrational spectroscopy of semiheavy water (HDO) as a probe of solute hydration
PublikacjaSpektroskopia oscylacyjna jest idealną metodą w badaniach zjawisk hydratacyjnych. Przy zastosowaniu techniki rozcieńczenia izotopowego, gdy mała ilość D2O zostaje wprowadzona do H2O lub vice versa i powstaje woda półciężka (HDO), ominąć można wiele problemów technicznych i interpretacyjnych związanych z pomiarem widm w podczerwieni wody ciekłej. Zwłaszcza izotopowe rozprzężenie drgań rozciągających ułatwia interpretację widm. Systematycznie...
-
Właściwości otoczki hydratacyjnej wokół różnych konformacji poliseryny - analiza wyników dynamiki molekularnej
PublikacjaRozpuszczalnik w istotny sposób wpływa na preferencje peptydu do przyjmowania określonej struktury drugorzędowej. Przykładem tego może być fakt, iż w przypadku polialaniny stabilność konformacji helikalnej w wodzie jest niższa aniżeli w próżni, podczas gdy w przypadku poliseryny mamy do czynienia ze zjawiskiem odwrotnym. W celu lepszego zrozumienia tego zjawiska badano właściwości otoczek hydratacyjnych dookoła czterech konformacji...
-
Właściwości otoczki hydratacyjnej wokół β-warstw o zróżnicowanym składzie aminokwasowym - analiza wyników dynamiki molekularnej
Publikacjaβ-warstwa to jedna z najczęściej spotykanych struktur drugorzędowych w białkach. Jak dotąd mechanizmy rządzące ustrukturyzowaniem wody w warstwie solwatacyjnej wokół tej struktury są słabo poznane [1]. W celu lepszego zrozumienia zjawiska hydratacji wokół struktur o konformacji β-warstwy przeprowadzono analizę wyników pochodzących z symulacji metodą dynamiki molekularnej β-warstw składających się z 8 równoległych nici o różnym...
-
Zastosowanie nowych typów materiałów sorpcyjnych w ekstrakcji analitów z próbek biologicznych
PublikacjaW obecnych czasach wiele uwagi w chemii anlityczanej poświęca się bezrozpuszczalnikowym technikom przygotowania próbki do analizy. Wynika to z potrzeby opracowania szybkich i rzetelnych procedur analitycznych prowadzących do obniżenia granic wykrywalności. Jedna z najbardziej obiecujących technik w tej dziedzinie to ekstrakcja do fazy stacjonarnej, która jest szeroko stosowana w praktyce analitycznej ze względu na jej niewątpliwe...
Rok 2009
-
Adiabatic Compressibilities of Divalent Transition-Metal Perchlorates and Chlorides in N,N-Dimethylacetamide and Dimethylsulfoxide
PublikacjaZmierzono prędkości rozchodzenia się dźwięku roztworów nadchloranów i chlorków manganu(II), kobaltu(II), niklu(II), miedzi(II) i cynku(II) w N,N-dimetyloacetamidzie i dimetylosulfotlenku w temperaturze 298.15 K. Obliczono ściśliwości adiabatyczne i pozorne ściśliwości adiabatyczne badanych roztworów. Przedyskutowano wpływ anionu i rodzaju rozpuszczalnika na uzyskane graniczne wartości pozornych ściśliwości adiabatycznych soli.
-
Effects of Urea and Trimethylamine-N-oxide on the Properties of Water and the Secondary Structure of Hen Egg White Lysozyme
PublikacjaW celu określenia sposobu hydratacji mocznika i N-tlenku trimetyloaminy, wykorzystano spektroskopię oscylacyjną FTIR. Dane eksperymentalne, otrzymane z pomiarów widm oscylacyjnych wody półciężkiej (HDO) rozcieńczonej izotopowo w wodnych roztworach badanych związków, analizowane były za pomocą "metody widm różnicowych". Strukturalno-energetyczna charakterystyka wody zaburzonej przez cząsteczki osmolitów wskazuje, że woda zaburzona...
-
Hydration of Carboxylate Anions: Infrared Spectroscopy of Aqueous Solutions
PublikacjaHydratacja anionów karboksylanowych w roztworach wodnych ich soli sodowych została zbadana przy wykorzystaniu spektroskopii FTIR z zastosowaniem cząsteczki HDO jako sondy molekularnej. Do wyznaczenia widm wody zaburzonej przez rozpuszczalnik wykorzystano ilościową wersję metody widm różnicowych. Widma te wykazują dwa pasma składowe przy ok. 2550 i ok. 2420 cm-1. Pasma te przypisano grupie -COO- anionu R-COO- (R = H, CH3, C2H5),...
-
Identification of chemical pollution problems and causes in the Baltic See in relation to socio-economic drivers
PublikacjaOpisano możliwość wykorzystania nowego narzędzia do zintegrowanej oceny stanu środowiska w akwenie Morza Bałtyckiego. Takie możliwości stwarza narzędzie znane jako DPSIR czyli Drivers (sfery działalności człowieka będące źródłem potencjalnych zznieczyszczeń)-Pressures (ksenobiotyki i specyficzne czynniki szkodliwe emitowane do środowiska)-Stata (stann środowiska)- Impact (efekty niekorzystego oddziaływania na część ożywioną i nieożywioną...
-
Membrane Solid Phase Microextraction - a new concept of sorbent preparation
PublikacjaOpracowano nowy układ sorpcyjny do izolacji i/lub wzbogacania polarnych analitów organicznych z próbek wody z zastosowaniem techniki solid phase microextraction (SPME). Układ bazuje na oddzieleniu sorbentu polarnego od próbki za pomocą membrany hydrofobowej. Próbnik membrane-SPME (M-SPME) sporządzono z zastosowaniem polietylenoglikolu (PEG)o masie cząsteczkowej 20 kDa. Polimer ten jest rozpuszczalny w wodzie i w typowych warunkach...
-
Progress in development of molecularly imprinted polymers as sorbents for sample preparation
PublikacjaSample preparation has been one of the most often investigated steps in analytical procedures.These investigations are focused on problems such as isolation of analytes from the sample matrix, matrix implification, analyte enrichment to the level above the detection limit of the instrumentation used, and the removal of interfering species to improve the final determination. Techniques based on solid (adsorption) and pseudo liquid...
-
Systematic Study of Hydration Patterns of Phosphoric(V) Acid and Its Mono-, Di-, and Tripotassium Salts in Aqueous Solution
PublikacjaSpektroskopia oscylacyjna FTIR w zakresie drgania OD cząsteczki HDO została zastosowana do zbadania różnych form fosforanów w kolejności malejącego stopnia protonacji: H3PO4, KH2PO4, K2HPO4, K3PO4. HDO rozcieńczona izotopowo w H2O została otrzymana przez dodanie odpowiednich ilości wody ciężkiej (D2O) do roztworów w wodzie zwykłej. Do wyizolowania widm HDO zaburzonej przez substancję rozpuszczoną zastosowano metodę widm różnicowych....
-
Theoretical calculation of pKas of phosphoric (V) acidin the polarisable continuum and cluster-continuum models
PublikacjaW pracy oceniono dokładność modelu polaryzowalnego kontinuum (PCM) i mieszanego modelu klaster-kontinuum do przewidywania wartości trzech kolejnych stałych dysocjacji kwasu fosforowego (V). Obliczenia PCM na poziomie MP2/6-31+G(d,p) odtwarzają wartość pierwszego pKa z rozsądną niepewnością, jednak wartości kolejnych pKa obarczone są bardzo dużym błędem, nawet po podniesieniu poziomu teorii do metody zespolonej G3B3. Dopiero obliczenia...
-
Theoretical study of the structure, energetics and vibrational frequencies of water-acetone and water-2-butanone complexes
PublikacjaKompleksy acetonu i 2-butanonu z 0-2 cząsteczkami wody połączonymi wiązaniem wodorowym z tlenem karbonylowym zbadano z wykorzystaniem teorii funkcjonału gęstości (DFT) na poziomie B3LYP/6-311++G(d,p). Obliczenia w fazie gazowej uzupełniono o optymalizacje w otoczeniu rozpuszczalnika, symulowanego za pomocą modelu polaryzowalnego kontinuum (PCM). Częstości drgań oscylacyjnych otrzymane na podstawie zależności empirycznej sa zgodne...
-
Thermodynamic properties of inorganic salts in nonaqueous solvents. V. Apparent molar volumes and compressibilities of divalent transition metal bromides in N,N-dimethylformamide
PublikacjaZmierzono gęstości i szybkości rozchodzenia się dźwięku roztworów bromków dwuwartościowych metali przejściowych w N,N-dimetyloformamidzie. W oparciu o uzyskane parametry wyznaczono pozorne objętości i ściśliwości molowe. Dokonano analizy oraz zbadano wpływ kompleksowania na wyznaczone wielkości.
-
Usefulness of the Free Length Theory for assessment of the self-association of the pure solvents
PublikacjaWykonano pomiary szybkości rozchodzenia się dźwięku i gęstości metanolu, acetonitrylu, N,N-dimetyloformamidu, N,N-dimetyloacetamidu, dimetylosulfotlenku i fosforanu trietylu w zakresie temperatur 294 - 333 K . W oparciu o wyznaczone ściśliwości adiabatyczne zastosowano teorię FLT do oceny wzajemnej asocjacji cząsteczek. Uzyskane wyniki przedyskutowano na tle innych sposobów klasyfikacji rozpuszczalników.
Rok 2008
-
Apparent molar volumes, expansibilities, and isentropic compressibilities of selected electrolytes in methanol
PublikacjaDensities of solutions of sodium bromide, sodium perchlorate, sodium tetraphenylborate, and tetraphenylphosphonium bromide in methanol at the temperatures ranging from 283.15 to 313.15 K have been measured. Ultrasound velocities for the above systems at T = 298.15 K have been determined. From the obtained data, the partial molar volumes and the partial molar isentropic compressibilities for electrolytes in solution have been estimated....
-
ATR FT-IR H2O spectra of acidic aqueous solutions. Insights about proton hydration
PublikacjaW artykule podjęto próbę ilościowej analizy widm oscylacyjnych H2O w wodnych roztworach kwasów. Widma H2O dostarczają głównie informacji o stanie strukturalnym cząsteczek wody, wynikającym ze sprzężeń oscylatorów w układzie. Są jednak znacznie trudniejsze w interpretacji niż widma HDO. Widma wodnych roztworów kwasów jednoprotonowych (HCl, HClO4, HPF6) zmierzono posługując się spektroskopią FT-IR w technice osłabionego wewnętrznego...
-
Entropy of water calculated from harmonic approximation: estimation of the accuracy of method
PublikacjaSome molecular dynamics simulations were performed for liquid TIP4P and SPC water at a constant density (1.00 g/cm(3)) and within the temperature range of 5-90 degrees C. By using harmonic approximation, both the entropy of water S-H and the specific heat c(v) were calculated, and the results were compared to literature data. It was found that harmonic approximation overestimates absolute entropy of TIP4P water by 5.6 J/mol K (similar...
-
Excess volumes of mixing in (N,N-Dimethylacetamide+methanol+water) and (N,N-Dimethylacetamide+ethanol+water) at the temperature 313.15 K
PublikacjaW pracy podane są rezultaty precyzyjnych pomiarów namiarowych objętości molowych dla dwóch układów trójskładnikowych zawierających wodę, amid alifatyczny (N,N-dimetyloacetamid) oraz alkohol: metanol lub etanol. Dla wszystkich badanych układów obserwowane są duże i ujemne wartości nadmiarowych objętości mieszania, wskazujące na obecność silnych oddziaływań międzycząsteczkowych.
-
Hydration of simple amides. FTIR spectra of HDO and theoretical studies
PublikacjaZastosowano metodę ważonych widm różnicowych do opisu hydratacji amidów w roztworach wodnych: formamidu, N-metyloformamidu, N,N-dimetyloformaidu, acetamidu, N-metyloacetamidu, N,N-dimetyloacetamidu. Narzędziem wspomagającym interpretację wyników eksperymentalnych są struktury agregatów solwatacyjnych wokół cząsteczki substancji rozpuszczonej uzyskane na podstawie obliczeń teoretycznych metodą ab initio z korelacją elektronową...
-
Molar volumes and heat capacities of electrolytes and iIons in N,N-dimethylformamide
PublikacjaZmierzono gęstości i molowe pojemności elektrolitów typu 1:1 oraz o soli o wyższych liczbach ładunkowych jonów w roztworach w N,N-dimetyloformamidzie w temperaturze 25 stopni Celsjusza. W oparciu o te pomiary wyznaczono standardowe objętości molowe oraz standardowe wartości izobarycznych ciepeł molowych. Uzyskane wartości podzielono na udziały jonowe wykorzystując tetrafenyloboran tetrafenylofosfoniowy (TPTB) jako elektrolit odniesienia....
-
On new concepts in computer control of auxiliary gas chromatographic equipment = Nowe koncepcje dotyczące komputerowego sterowania wyposażeniem pomocniczym w chromatografii gazowej
PublikacjaChromatografia gazowa była pierwszą techniką analityczną poddaną kontroli komputera, jeszcze przed pojawieniem się komputerów osobistych. W związku z niewystarczającą granicą oznaczalności i rozdzielczością, nawet najbardziej najlepszych systemów, technika ta często wiązana jest z etapem wstępnego przygotowania próbki (izolacji i wzbogacania analitów), realizowanych w odrębnych urządzeniach pomocniczych. Bywają one dość złożone...
-
Profesor Jacek Namieśnik laureatem Nagrody Prezesa Rady Ministrów
PublikacjaPrzedstawiona została sylwetka profesora dr hab. inż. Jacka Namieśnika, laureata nagrody Prezesa Rady Ministrów za działalność naukową, naukowo-techniczną i artystyczną w roku 2006. Profesor Jacek Namieśnik jest dziekanem Wydziału Chemicznego i kierownikiem Katedry Chemii Analitycznej Politechniki Gdańskiej. Nagroda Prezesa Rady Ministrów została mu przyznana za wybitne osiągnięcia w dziedzinie inżynierii i ochrony środowiska.
-
Solvation numbers of manganese(II) and zinc(II) perchlorates in methanol obtained from volumetric and compressibility properties
PublikacjaZmierzono gęstości roztworów nadchloranów manganu(II) i cynku(II) w metanolu w temperaturach: 283.15, 288.15, 293.15, 298.15, 303.15, 308.15, 313.15 K. Ponadto wyznaczono szybkości rozchodzenia się dźwięku w badanych roztworach w 298.15 K. Uzyskane wielkości pozwoliły na obliczenie pozornych objętości molowych oraz pozornych molowych ściśliwości adiabatycznych elektrolitów w metanolu. Oszacowane wielkości graniczne wykorzystane...
-
Structural and dynamic properties of water within the solvation layer around various conformations of the glycine-based polypeptide
PublikacjaSeveral conformations of the solvated glycine-based polypeptides were investigated using molecular dynamics simulations. Some properties of water in the neighbouring space around these molecules were investigated. It was found, that water forms a well-defined layer - the first solvation shell - around the peptide molecule, and thickness of this layer is independent of the peptide structure, and it equals to approximately 0.28 nm....
-
Structural and Dynamic Properties of Water within the Solvation Layer around Various Conformations of the Glycine-based Polypeptide
PublikacjaSeveral conformations of the solvated glycine-based polypeptides were investigated using molecular dynamics simulations. Some properties of water in the neighboring space around these molecules were investigated. It was found that water forms a well-defined layer—the first solvation shell—around the peptide molecule, and thickness of this layer is independent of the peptide structure and is equal to approximately 0.28 nm. Within...
-
Two-particle entropy and structural ordering in liquid water
PublikacjaEntropies of simple point charge (SPC) water were calculated over the temperature range 278-363 K using the two-particle correlation function approximation. Then, the total two-particle contribution to the entropy of the system was divided into three parts, which we call translational, configurational, and orientational. The configurational term describes the contribution to entropy, which originates from spatial distribution of...
-
Type II secretory pathway for surface secretion of DraD invasin from the uropathogenic Escherichia coli Dr+ strain
PublikacjaWłaściwości wirulentne uropatogennych szczepów Escherichia coli Dr+ IH11128 związane są z obecnością struktur fimbrialnych typu Dr i białka inwazyny DraD, które może na powierzchni komórki bakteryjnej pełnić rolę fimbrialnej podjednostki szczytowej. Ostatnie badania wykazały, że białko DraD jest eksponowane na powierzchni bakterii w dwóch formach: związanej ze strukturą fimbrialną i jako niezależna od fimbrii otoczka białkowa....
Rok 2007
-
Apparent molar compressibilities and volumes of some 1,1-electrolytes in N,N-dimethylacetamide and N,N-dimethylformamide
PublikacjaZmierzono gęstości roztworów tetrafenyloboranu sodu, bromku tetrafenylofosfoniowego, bromku sodu i nadchloranu sodu w N, N-dimetyloacetamidzie i N,N-dimetyloformamidzie w zakresie stężeń (0.015 to 0.40) mol·kg-1 w zakresie temperatur od 283.15 K do 333.15 K. Z uzyskanych danych obliczono pozorne i cząstkowe objętości molowe jak również rozszerzalności temperaturowe. Dodatkowo, wartości prędkości rozchodzenia się dźwięku...
-
Chromatograf gazowy do celów dydaktycznych i jego zastosowania
PublikacjaW artykule opisano zastosowania dydaktyczne prostego chromatografu gazowego, specjalnie opracowanego i zbudowanego do tych celów. Pozwala on na zapoznanie studentów chemii analitycznej z podstawowymi koncepcjami chromatografii a równocześnie prowadzenie ćwiczeń z elementami zaawansowanej metrologii chemicznej. W artykule przedstawiono zasady, jakimi kierowano się przy projektowaniu i budowie aparatu, a także ćwiczenie z bardziej...