Filtry
wszystkich: 800
-
Katalog
- Publikacje 554 wyników po odfiltrowaniu
- Czasopisma 5 wyników po odfiltrowaniu
- Osoby 14 wyników po odfiltrowaniu
- Wynalazki 5 wyników po odfiltrowaniu
- Projekty 5 wyników po odfiltrowaniu
- Laboratoria 1 wyników po odfiltrowaniu
- Kursy Online 20 wyników po odfiltrowaniu
- Dane Badawcze 196 wyników po odfiltrowaniu
Wyniki wyszukiwania dla: inhibicja enzymu
-
Influence of sulphanilamide in wastewater on Anammox process
PublikacjaBadano wpływ krótko- oraz długookresowej ekspozycji mieszanej kultury Anammox na działanie sulfonamidu. Otrzymane wyniki potwierdziły, że sulfanilamid (SA)hamuje proces Anammox. Wyższe stężenia SA powodowały silniejszy efekt inhibicji usuwania związków azotu ze ścieków. Natomiast długookresowe testy potwierdziły hipotezę, że wydłużenie czasu ekspozycji mikroorganizmów Anammox na działanie SA skutkuje obniżeniem stopnia inhibicji...
-
Extracellular secretion of Pseudoalteromonas sp. cold-adapted esterase in Escherichia coli in the presence of Pseudoalteromonas sp. components of ABC transport system
PublikacjaEnzymy lipolityczne, głównie lipazy i esterazy, stanowią cenną grupę biokatalizatorów wykorzystywanych w przemyśle. Coraz większe zainteresowanie tą klasą enzymów sprawiło, że poszukuje się alternatywnych źródeł ich pozyskiwania. W celu zbadania wpływu białek transportu ABC Pseudoalteromonas sp. 643A na ekspresję genu, sekrecję i aktywność esterazy EstA z tego mikroorganizmu w systemie ekspresyjnym E. coli skonstruowano układ do...
-
Synthesis of phosphono and phosphate derivatives of hydroxyimino-D-alditols as new potential antifungal agents
PublikacjaIn search for new effective we antyfungals we focus on two enzymes involved in biosynthesis of the fungal cell wall. The first enzyme is glucosamine-6-phosphate (GlmS), which catalyzes transformation of D-fructose-6-phosphate (Fru-6P) to D-glucosamine-6-phodphate (GlcN-6P) in the chitin biosynthesis pathway. The second enzyme is phosphomannose isomerase (PMI) repored to play a crucial role in biosynthesis of many mannosylated structures,...
-
porównanie sinigriny i glukotrapeoliny jako substratów podczas oznaczania aktywności enzymatycznej mirozynazy
PublikacjaMirozynaza jest ważnym enzymem dla przebiegu procesu biofumigacji. Dzięki opracowaniu metodyki oznaczania aktywności tego enzymu, możliwe będą dalsze badania nad optymalizacją procesu hydrolizy glukozynolanów do izotiocyjnianów, które są związkami o największym znaczeniu w nauralnej ochronie roślin. W badaniach zastosowano dwie metody oznaczania aktywności enzymatycznej mirozynazy - metodę spektrofotometryczną i pH-statyczną, oraz...
-
Thermostable beta-glucosidase with a broad substrate specifity suitable for processing of lactose-containing products.
PublikacjaHipertermofilny archeon Sulfolobus shibatae wytwarza termostabilną beta glukozydazę przydatną do hydrolizy laktozy w mleku i serwatce przejawiającą największą aktywność w 85 stC przy pH 5,5. Aktywność ekstraktu bezkomórkowego Sulfolobus shibatae wynosi 0.29 U/mg białka i może być 17-krotnie zwiększona poprzez frakcjonowanie siarczanem amonu, chromatografię jonowymienną i filtrację żelową. Badany enzym ma dużą termostabilność i...
-
Harman and norharman, metabolites of entomopathogenic fungus Conidiobolus coronatus (Entomopthorales), disorganize development of Galleria mellonella (Lepidoptera) and affect serotonin-regulating enzymes
Publikacja -
In vitro enzyme kinetics and NMR-based product elucidation for glutathione S-conjugation of the anticancer unsymmetrical bisacridine C-2028 in liver microsomes and cytosol: major role of glutathione S-transferase M1-1 isoenzyme
PublikacjaThis work is the next step in studying the interplay between C-2028 (anticancer-active unsymmetrical bisacridine developed in our group) and the glutathione S-transferase/glutathione (GST/GSH) system. Here, we analyzed the concentration- and pH-dependent GSH conjugation of C-2028 in rat liver microsomes and cytosol. We also applied three recombinant human GST isoenzymes, which altered expression was found in various tumors. The...
-
Oznaczanie tlenu – od metody Winklera do czujników enzymatycznych (Determination of oxygen – from Winkler Method to enzymatic sensor)
PublikacjaMonitoring of dioxygen levels is of utmost importance from the view-point of life processes, medical diagnostics, nutrition and chemical industries. In all these measurements both low and high levels of this element are important. The common methods for the determination of dioxygen are the Winkler method, Clark electrode and pulsoxymeters. A new, already strong field of research can be now recognized – the development of miniaturized...
-
Sporothrix schenckii: purification and partial biochemical characterisation of glucosamine-6-phosphate synthase, a potential antifungal target
PublikacjaW artykule opisano izolację i charakterystykę właściwości natywnego enzymu, syntazy GlcN-6-P z komórek dimorficznego grzyba patogennego Sporothrix schenckii. Masę cząsteczkową enzymu natywnego określono na 350 kDa, a enzymu zdenaturowanego na około 79 kDa, co sugeruje homotetrameryczną strukturę białka. Wartość punktu izoelektrycznego wyniosła 6,26; wyznaczono także parametry kinetyczne katalizowanej reakcji. Aktywność enzymu była...
-
Cloning, expression, and biochemical characterization of a coldactive GDSL-esterase of a Pseudomonas sp. S9 isolated from Spitsbergen island soil
PublikacjaAn estS9 gene, encoding an esterase of the psychrotolerant bacterium Pseudomonas sp. S9 was cloned and sequenced. The deduced sequence revealed a protein of 636 amino acid residues with a molecular mass of 69 kDa.Further amino acid sequence analysis revealed that the EstS9 enzyme contained a G-D-S-L motif centered at a catalytic serine, an N-terminal catalytic domain and a C-terminal autotransporter domain. Two recombinant E. coli...
-
The ability of new sugar-modified derivatives of antitumour anthracycline, daunorubicin, to stimulate NAD(P)H Oxidation in Different Cellular Oxidoreductase Systems: NADH Dehydrogenase, NADPH Cytochrome P450 Reductase, and Xanthine Oxidase.
PublikacjaUboczne działanie cytostatyków z grupy antracyklin prowadzi do uszkodzenia serca (kardiotoksyczność) w wyniku pośredniczenia przez te związki przeniesienia jednoelektronowego ze zredukowanych nukleotydów do tlenu i powstania reaktywnych anionorodników tlenowych. Proces ten jest katalizowany głównie przez trzy enzymy: dehydrogenazę NADH, reduktazę NADPH/cytochrom P450 oraz oksydazę ksantynową. W publikacji przedstawione są wyniki...
-
Photoprotection and Antiaging Activity of Extracts from Honeybush (Cyclopia sp.)—In Vitro Wound Healing and Inhibition of the Skin Extracellular Matrix Enzymes: Tyrosinase, Collagenase, Elastase and Hyaluronidase
Publikacja -
Siderofory bakteryjne – rola w patogenezie i potencjał wykorzystania w diagnostyce
PublikacjaDo prawidłowego funkcjonowania i wzrostu organizmów żywych zarówno ludzi, jak i bakterii niezbędne jest żelazo. Mikroelement ten występuje na dwóch różnych stopniach utlenienia: jako jon żelazawy (Fe2+) rozpuszczalny w roztworach fizjolo-gicznych oraz jako jon żelazowy (Fe3+), który nie tworzy roztworów wodnych [1]. Dzięki swoim właściwościom oksydo-redukcyjnym, żelazo wpływa na poprawne funkcjonowanie bardzo licznej grupy enzymów,...
-
Reduktaza NADPH:cytochrom P450 - nie tylko partner cytochromu P450.
PublikacjaReduktaza NADPH:cytochrom P450 (CPR) zlokalizowana w siateczce śródplazmatycznej większości komórek eukariotycznych jest przedstawicielem rodziny reduktaz diflawinowych. Białko CPR składa się z trzech domen. Jedna z nich, na C-końcu, wiąże cząsteczkę FAD i NADPH, druga, na N-końcu, cząsteczkę FMN, trzecia jest domeną regulacyjną. Enzym ten posiada zdolność jednoczesnego przyjmowania dwóch równoważników jonu hydroniowego z NADPH...
-
Beta-Galactosidases of Pseudoalteromonas sp. – Characteristics and application for lactose hydrolysis and galactopyranosides synthesis
PublikacjaBeta-galactosidase [EC 3.2.1.23] is an enzyme that catalyzes the hydrolysis of O-glycosidic linkages in galactosides. It has biotechnological applications in the dairy industry for the production of milk with a low content of lactose and galactooligosacharides for use in healthy food. The transgalactosylation activity of beta-galactosidase can be used in the synthesis of alkyl galactopyranosides. Due to the fact that conditions of...
-
Mikroorganizmy w degradacji celulozy
PublikacjaCeluloza jest podstawowym składnikiem komórek roślinnych. Włókna celulozowe są bardzo ciasno upakowane w ścianach komórek, przez co utrudniają dostęp enzymom celulolitycznym oraz cząsteczkom wody. Najważniejszą rolę w procesie rozkładu celulozy pełnią celulazy, które należą do rodziny hydrolaz glikozydowych. Zdolność do hydrolizy celulozy i hemicelulozy wykazują mikroorganizmy celulolityczne. Prezentują one dwa różne mechanizmy...
-
Molecular modelling of a psychrophilic β-galactosidase
PublikacjaAntarktyczny szczep, gram-ujemnych bakterii, wyizolowanych z przewodu pokarmowego kryla z gatunku Thyssanoessa macrura, sklasyfikowany na podstawie analizy sekwencji nukleotydowej geny 16S rDNA jako Pseudoalteromonas sp. 22b jest producentem wewnątrzkomórkowej zimnolubnej beta-galaktozydazy. Ponieważ enzym ten wykazuje wysoką aktywność katalityczną w zakresie temperatur od 0 do 30 stC, stanowi on atrakcyjny biokatalizator, użyteczny...
-
Expression of a GDSL esterase from Pseudomonas sp. S9 in Pichiapastoris
PublikacjaCold active lipolytic enzymes are promising to replace the conventional enzymes processes of biotechnological industries. One of the most important feature of the cold-active lipases and esterases is that they offer economic benefits through energy saving. In general, they exhibit high activity at low temperatures and low thermostability at moderate temperatures. Lipolytic enzyme EstS9 was isolated from Pseudomonas sp. S9. A multiple...
-
INFOGEST inter-laboratory recommendations for assaying gastric and pancreatic lipases activities prior to in vitro digestion studies
PublikacjaIn vitro digestion studies often use animal digestive enzyme extracts as substitutes of human gastric and pancreatic secretions. Pancreatin from porcine origin is thus commonly used to provide relevant pancreatic enzymes such as proteases, amylase and lipase. Rabbit gastric extracts (RGE) have been recently introduced to provide gastric lipase in addition to pepsin. Before preparing simulated gastric and pancreatic extracts with...
-
Characterization of two aminotransferases from Candida albicans
PublikacjaAminoadipate aminotransferase (AmAA) is an enzyme of α-aminoadipate pathway (AAP) for l-lysine biosynthesis. AmAA may also participated in biosynthesis or degradation of aromatic amino acids and in d-tryptophan based pigment production. The AAP is unique for fungal microorganisms. Enzymes involved in this pathway have specific structures and properties. These features can be used as potential molecular markers. Enzymes catalyzing...
-
Przemiany metaboliczne in vitro niesymetrycznych bisakrydyn w układach bezkomórkowych i w komórkach nowotworowych oraz określenie wpływu tych pochodnych na aktywność enzymów metabolizujących leki
PublikacjaPrzedmiotem badań prowadzonych w ramach niniejszej pracy doktorskiej są cztery niesymetryczne bisakrydyny: C-2028, C-2041, C-2045 i C-2053, wykazujące wysoką aktywność cytotoksyczną [Konopa i in. 2019]. Otrzymane wyniki wskazały, że każdy z pierścieni (imidazoakrydonu i 1-nitroakrydyny) obecny w strukturze badanych związków odgrywa inną rolę w wykazywanych przez nie właściwościach fizykochemicznych i biologicznych. Właściwości...
-
Autofagia: mechanizm molekularny, apoptoza i nowotwory = Autophagy: molecular mechanism, apoptosis and cancer
PublikacjaW pracy omówiono molekularny mechanizm autofagii oraz najważniejsze szlaki sygnałowe uczestniczące w regulacji przebiegu tego procesu w komórkach nowotworowych. Omówiona została również dwojaka rola autofagii w procesie nowotworzenia oraz skutki zarówno indukcji, jak i inhibicji autofagii w terapii przeciwnowotworowej
-
Unieruchamianie rekombinowanej beta-galaktozydazy w reakcjach katalizowanych transglutaminazą
PublikacjaTermostabilną beta-galaktozydazę wyizolowaną z Escherichia coli zawierającej gen enzymu z Pyrococcus woesei, sieciowano transgluta-minazą na żelu krzemionkowym. Otrzymany preparat wykazuje w 70 st.C aktywność hydrolizy ONPG wynoszącą 11,573 U/g nośnika. Optymalne pH i temperatura działania enzymu wynosi odpowiednio 5,5 oraz 95 st.C. Preparat unieruchomionego enzymu zachowuje około 70 % początkowej aktywności po 1 godzinie inkubacji...
-
Beta-D-galaktozydazy - źródła, właściwości i zastosowanie
PublikacjaArtykuł przeglądowy opisujący mechanizm działania enzymu beta-D-galaktozydazy, właściwości beta-D-galaktozydaz pochodzących z różnych mikroorganizmów, zarówno mezofilnych jak i psychrofilnych oraz termofilnych, a także możliwości zastosowania enzymu w przemysłowych procesach hydrolizy laktozy w mleku, serwatce oraz w reakcji syntezy galaktooligosacharydów.
-
Metabolic transformation of antitumor agent C1311 with various fractions of rat liver.
PublikacjaWykazano, że enzymatyczna aktywacja jest konieczna dla aktywności bilogicznej pochodnej C-1311. Zbadano przemiany związku w obecności różnych frakcji enzymatycznych mikrosomalnych komórek wątroby szczura.Badania te wykazały, że związek C-1311 jest bardziej podatny na transformację pod wpływem frakcji aktywowanych enzymów mikrosomalnych (CYP1A, CYP2B, CYP3A i CYP4A) niż frakcji S9, cytozolowej czy mikrosomów nieaktywowanych. Związek...
-
Cloning, expression, and purification of a recombinant cold-adapted β-galactosidase from antarctic bacterium Pseudoalteromonas sp. 22b
PublikacjaAntarktyczny szczep, gram-ujemnych bakterii Pseudoalteromonas sp. 22b, wyizolowanych z przewodu pokarmowego kryla z gatunku Thyssanoessa macrura, jest producentem wewnątrzkomórkowej zimnolubnej beta-galaktozydazy. Białko to jest homotetramerem, w którym każda z jednostek monomeru zbudowana jest z 1028 reszt aminokwasowych. Gen kodujący ten enzym został sklonowany i eksprymowany w komórkach E. coli. Następnie z zastosowaniem procedury...
-
Ryszard Andruszkiewicz prof. dr hab. inż.
Osoby -
Enzymatic cross-linking of β-lactoglobulin in solution and at air–water interface: Structural constraints
PublikacjaEffective and controlled use of cross-linking enzymes in structure engineering of food systems depends on characterization of the favorable conditions for enzyme-substrate complex and the limiting factors for the desired modification. In this respect, we analyzed the susceptibility of bovine β-lactoglobulin (BLG) to enzymatic cross-linking by Trichoderma reesei tyrosinase (TrTyr) and transglutaminase (TG). Changes in BLG molecular...
-
Synthesis and biological evaluation of thiophosphate tricyclic coumarin derivatives as steroid sulfatase inhibitors
PublikacjaSteroid sulfatase (STS) enzyme inhibition is an important approach to the management of hormone-dependent breast cancer. In this paper, we report convenient methods for the synthesis and biological evaluation of thiophosphate tricyclic coumarin analogs exhibiting STS activity. The described methods are based on the straightforward preparation of 7-hydroxy-2,3-dihydro-1H-cyclopenta[c]chromen-2-one, 3-hydroxy- 7,8,9,10-tetrahydro-6H-benzo[c]chromen-6-one,...
-
Esteraza GDSL z psychrotolerancyjnego szczepu Pseudomonas sp. S9 - konstrukcja systemów ekspresyjnych opartych o komórki Escherichia coli i Pichia pastoris, produkcja, oczyszczanie i charakterystyka uzyskanych białek rekombinowanych
PublikacjaW rozprawie doktorskiej celu opracowania wydajnej metody produkcji rekombinantowych wariantów sekwencyjnych enzymu esterolitycznego z psychrotolerancyjnego szczepu Pseudomonas sp. S9 zaprojektowano układy ekspresyjne umożliwiające ich produkcję w bakteriach Escherichia coli oraz drożdżach Pichia pastoris. W systemie ekspresyjnym E. coli wyprodukowano dwa warianty białek: EstS9Auto (białko zbudowane z domeny katalitycznej, domeny...
-
Immobilized preparation of cold-adapted and halotolerant Antarctic β-galactosidase as a highly stable catalyst in lactose hydrolysis
PublikacjaZimnolubna rekombinowana beta-galaktozydaza antarktycznej morskiej bakterii Pseudoalteromonas sp. 22b została immobilizowana na chitozanie za pomocą aldehydu glutarowego. Preparat immobilizowanego enzymu w przeciwieństwie do preparatu enzymu w buforze reakcyjnym nie był inhibowany przez glukozę. Immobilizacja enzymu wpłynęła na podwyższenie o 10°C optymalnej temperatury aktywności względem jego nieimmobilizowanego odpowiednika...
-
A new Thermus sp. class-IIS enzyme subfamily: isolation of a ''twin'' endo nuclease TspDTI with a novel specificity 5´-ATGAA(N11/9)-3´, related to TspGWI, Taqll and Tth111II. 5´-ATGAA(N11/9)-3´, spokrewnionej z TspGWI, TaqII i Tth111II.
PublikacjaOdkryto i scharakteryzowano nową subrodzinę enzymów klasy IIS z Thermus sp.
-
New source of the thermostable alpha-glucosidase suitable for single stepstarch processing
PublikacjaZbadana wewnątrzkomórkowa termostabilna alfa-glukozydaza z Thermus thermo-philus przejawia największą aktywność w 85 C przy pH 6.2. Aktywność enzymu po 5 h inkubacji w 75 C (pH 6.2) prawie nie ulega zmianie a okres połowicznej inaktywacji w 85 C wynosi 2 h. Właściwości te wskazują na przydatność wymienionego enzymu w jednoetapowej hydrolizie skrobi.
-
Disruption of homocitrate synthase genes in Candida albicans affects growth but not virulence
PublikacjaDwa geny, LYS21 i LYS22, kodujące izoformy syntazy homocytrynianowej, enzymu katalizującego pierwszy wyjątkowy etap w szlaku biosyntezy lizyny, zostały rozbite z komórkach Candida albicans z wykorzystaniem strategii ''SAT flipper''. Podwójny mutant lys21delta/lys22delta nie wykazywał aktywności syntazy homocytrynianowej, natomiast charakteryzował się auksotrofią wzrostową wobec lizyny w podłożach minimalnych, co można było odwrócić...
-
Tri-tert-butoksysilanotiolanowe kompleksy cynku(II), kadmu(II) i kobaltu(II) jako modele koordynacji jonu cynku w miejscu aktywnym dehydrogenazy alkoholowej i niektórych innych enzymów
PublikacjaDehydrogenaza alkoholowa (ADH) katalizuje odwracalne utlenienie alkoholi do aldehydów przy użyciu NAD+ co można podsumować równaniem:R1R2CHOH + NAD+ = R1R2CO + NADH + H+. Geometria koordynacyjna cynku w miejscu aktywnym ADH opisywana jest na ogół jako tetraedryczna jednak istnieją również przesłanki wskazujące na poszerzanie sfery koordynacyjnej metalu w cyklu katalitycznym do LK=5. W pracy przeglądowej opisano badania nad syntetycznymi,...
-
Prediction of Bioactive Peptides From Chicken Feather and Pig Hair Keratins Using In Silico Analysis Based on Fragmentomic Approach
PublikacjaBackground: Keratin is among the most abundant structural proteins of animal origin, however it remains broadly underutilized. Objective: Bioinformatic investigation was performed to evaluate selected keratins originating from mass-produced waste products, i.e., chicken feathers and pig hair, as potential sources of bioactive peptides. Methods: Pepsin, trypsin, chymotrypsin, papain, and subtilisin were used for in silico keratinolysis...
-
Konstrukcja nowych układów do diagnostyki molekularnej zakażeń o etiologii Candida spp.
PublikacjaDrożdżaki z rodzaju Candida należą do jednych z najczęściej izolowanych czynników etiologicznych zakażeń krwi. Szybka i bezbłędna identyfikacja gatunkowa pozwala na wdrożenie odpowiedniego leczenia i zwiększa szansę na powodzenie terapii. Celem badań była konstrukcja nowych układów wykorzystujących narzędzia diagnostyki molekularnej do specyficznej identyfikacji gatunkowej i rodzajowej drożdżaków Candida. Poszukiwano również nowych...
-
Effect of antitumor compounds on the yeast topoisomerase II relaxation activity
Dane BadawczeThe datasets contain results of antitumor compounds* (known inhibitors of human topoisomerase alpha II) inhibitory activity against yeast topoisomerase II. DNA topoisomerases (Topo) are enzymes that catalyze changes in the spatial structure of DNA and play an important role in replication, transcription and recombination. Beyond their normal functions,...
-
Optimised five-hour multiplex PCR test for the detection of Tinea ungium: performance in a routine PCR laboratory
PublikacjaWe recently published the development of a 5-hour multiplex PCR test for the detection of dermatophyte nail infection. We have optimized this test by inclusion of an inhibition control and evaluated the test in a routine laboratory when compared to the conventional microscopy and culture. A total of 109 clinical samples received at the mycology reference lab at Statens Serum Institute were included. The samples were divided equally...
-
3D polypyrrole structures as a sensing material for glucose detection
PublikacjaIn this work, 3D polypyrrole (PPy) structures as material for glucose detection is proposed. Polypyrrole was electrochemically polymerized on platinum screen-printed electrode from an aqueous solution of lithium perchlorate and pyrrole. The growth mechanism of such PPy structures was studied by ex-situ scanning electron microscopy. Preliminary studies show that studied here PPy film is a good candidate as a sensing material for...
-
THE GENE CLONING, OVEREXPRESSION, PURIFICATION AND BIOCHEMICAL CHARACTERISATION OF A NEW COLD-ADAPTED β–GALACTOSIDASE FROM ARTHROBACTER SP. VII-4
PublikacjaINTRODUCTION. β-Galactosidase [EC 3.2.1.23] is an enzyme that catalyzes the hydrolysis of O-glycosidic linkages in galactosides. It is commercially used in dairy industry for the production of milk with reduced lactose content. Potentially, the best method for lactose removal under cooling conditions should be carried out with a cold-adapted enzyme. AIM. The aim of this study was to determine the taxonomic affiliation of the isolate...
-
Isolation of the GFA1 gene encoding glucosamine-6-phosphate synthase of Sporothrix schenckii and its expression in Saccharomyces cerevisiae
PublikacjaGlucosamine-6-phosphate synthase (GlcN-6-P synthase) is an essential enzyme involved in cell wall biogenesis that has been proposed as a strategic target for antifungal chemotherapy. Here we describe the cloning and functional characterization of Sporothrix schenckii GFA1 gene which was isolated from a genomic library of the fungus. The gene encodes a predicted protein of 708 amino acids that is homologous to GlcN-6-P synthases...
-
Interakcje składników żywności. Rozdział 7
PublikacjaWpływ na interakcje składników żywności w czasie przechowywania i przetwarzania mają struktury komórkowe i subkomórkowe w których te składniki występują, enzymy i inhibitory enzymów, promieniowanie UV i jonizujące, temperatura, ciśnienie, rodniki, aktywne formy tlenu, sensybilizatory, przeciwutleniacze, wielowartościowe kationy, aktywność wody, siła jonowa, kwasowość i lepkość środowiska. Interakcje składników wpływają na barwę...
-
Molecular modelling of transition state analogue inhibitors of glucosamine-6-P synthase and glucose-6-P isomerase.
PublikacjaStruktura kompleksu 2-amino-2-deoksy-D-glucitolo-6-P (ADGP) z centrum aktywnym syntazy GlcN-6-P z E. coli została wykorzystAna jako punkt wyjścia do modelowania molekularnego analogów ADGP. Używając programu GROMOS96 wygenerowano konformacje analogów o najniższych energiach wewnętrznych, które następnie ''dokowano'' w centrum aktywnym enzymu. Dokonano syntezy wybranych związków i określono parametry kinetyczne i termodynamiczne...
-
Homoisocitrate dehydrogenase from Candida albicans: properties, inhibition, and targeting by an antifungal pro-drug
PublikacjaThe LYS12 gene from Candida albicans, coding for homoisocitrate dehydrogenase was cloned and expressed as a His-tagged protein in Escherichia coli. The purified gene product catalyzes the Mg2+- and K+-dependent oxidative decarboxylation of homoisocitrate to alpha-ketoadipate. The recombinant enzyme demonstrates strict specificity for homoisocitrate. SDS-PAGE of CaHIcDH revealed its molecular mass of 42.6±1 kDa, while in size-exclusion...
-
Catalytic topoisomerase II inhibitors in cancer therapy.
PublikacjaDNA topoizomeraza II jest jednym z głównych celów molekularnych dla leków stosowanych w terapii przeciwnowotworowej. Wszystkie inhibitory tego enzymu są zdolne do zakłócania w jeden z etapów cyklu katalitycznego topoizomerazy II. Związki, które stabilizują kowalencyjny kompleks DNa i topoizomerazy II (znany jako kompleks rozszczepialny) są nazywane truciznami topoizomerazy, inne związki, które hamują aktywność enzymu na innych...
-
Green chemical and hybrid enzymatic pretreatments for lignocellulosic biorefineries: Mechanism and challenges
PublikacjaThe greener chemical and enzymatic pretreatments for lignocellulosic biomasses are portraying a crucial role owing to their recalcitrant nature. Traditional pretreatments lead to partial degradation of lignin and hemicellulose moieties from the pretreated biomass. But it still restricts the enzyme accessibility for the digestibility towards the celluloses and the interaction of lignin-enzymes, nonproductively. Moreover, incursion...
-
Isolation and some properties of the thermostable beta-galactosidase of Pyrococcus woesei expressed in Escherichia coli
PublikacjaOpracowano metodę izolowania oraz zbadano właściwości enzymu otrzymanego ze szczepu Escherichia coli zawierającego gen kodujący termostabilną beta-ga-laktozydazę z Pyrococcus woesei.
-
Regulacja topologii DNA przez topoizomerazę typu II, czyli jak struktura DNA wpływa na funkcjonowanie genów
PublikacjaW wielu ważnych procesach jakie zachodzą w komórce zmienia się topologia DNA i struktura chromatyny. Enzym, topoizomeraza typu II, jest jednym z ważnych czynników, który reguluje zmiany topologiczne i strukturalne w jądrze, przez co ma bezpośredni lub pośredni wpływ na takie procesy jak uporządkowanie struktury chromatyny poprzez wiązanie pętli chromatyny do szkieletu jądrowego, transkrypcję i replikację DNA, reperację uszkodzeń...
-
A standardised static in vitro digestion method suitable for food – an international consensus
PublikacjaSimulated gastro-intestinal digestion is widely employed in many fields of food and nutritional sciences, as conducting human trials are often costly, resource intensive, and ethically disputable. As a consequence, in vitro alternatives that determine endpoints such as the bioaccessibility of nutrients and non-nutrients or the digestibility of macronutrients (e.g. lipids, proteins and carbohydrates) are used for screening and building...