Filtry
wszystkich: 49
Wyniki wyszukiwania dla: lysozyme
-
Stability of oil/water (ethanol, lysozyme or lysine) emulsions
Publikacja -
Influence of stabilizing osmolytes on hen egg white lysozyme fibrillation
Publikacja-
-
Influence of the ionic strength on the amyloid fibrillogenesis of hen egg white lysozyme
PublikacjaThe study investigates the role of the electrostatic interactions in the fibrillation of the hen egg white lysozyme (HEWL). In order to achieve this aim the influence of the cations Na+, Mg2+ and Al3+ on the amyloid fibril formation and amorphous aggregation was tested. The amyloids are formed in the solution without added salt but the Thioflavin T fluorescence gives the false-negative result. In these conditions, the HEWL fibrils...
-
Lysozyme increases bactericidal activity of ceragenin CSA-13 against Bacillus subtilis
Publikacja -
Effect of lysozyme or nisin on survival of some bacteria treated with high pressure at subzero temperature
PublikacjaCelem pracy było określenie wrażliwości gramujemnych i gramdodatnich bakterii na działanie ciśnienia 193MPa w temp. -20°C w obecności lizozymu lub nizyny. Stwierdzono, że połączone działanie ciśnienia i badanych substancji przeciwdrobnoustrojowych na zawiesiny bakterii Escherichia coli i Staphylococcus aureus powodowało większy stopień inaktywacji komórek niż suma efektów wywieranych przez pojedyncze czynniki.
-
Chemometric Method of Spectra Analysis Leading to Isolation of Lysozyme and CtDNA Spectra Affected by Osmolytes
PublikacjaW niniejszej pracy zaprezentowana została chemometryczna metoda analizy danych widmowych, prowadząca do wyizolowania widm FTIR biomakrocząsteczek (lizozymu z białka jaja kurzego i ctDNA) zaburzonych przez wybrane osmolity (TMAO, betainę) w roztworach wodnych. Została ona oparta na metodzie widm różnicowych, wykorzystywanej pierwotnie do określania struktury rozpuszczalnika wokół cząsteczek substancji rozpuszczonej. Cykliczne wykorzystanie...
-
Molecular basis of the osmolyte effect on protein stability: a lesson from the mechanical unfolding of lysozyme
PublikacjaOsmolytes are a class of small organic molecules that shift the protein folding equilibrium. For this reason, they are accumulated by organisms under environmental stress, and find applications in biotechnology where proteins need to be stabilized or dissolved. However, despite years of research, debate continues over the exact mechanisms underpinning the stabilizing and denaturing effect of osmolytes. Here, we simulated the mechanical...
-
Monitoring of lysozyme thermal denaturation by volumetric measurements and nanoDSF technique in the presence of N-butylurea
PublikacjaThe results of thermal studies of denaturation of hen egg white lysozyme (HEWL) in water and an aqueous solution of N-butylurea (BU) are presented. High-precision densimetric measurements were used to characterize and analyze the changes of the specific volume, v, during temperature elevation. The temperature of the midpoint of protein denaturation was also determined by nanoDSF technique (differential scanning fluorimetry). The...
-
Zeta potential and effective diameter of n-tetradecane emulsions in n-propanol solutions and in the presence of lysozyme
Publikacja -
Effects of Urea and Trimethylamine-N-oxide on the Properties of Water and the Secondary Structure of Hen Egg White Lysozyme
PublikacjaW celu określenia sposobu hydratacji mocznika i N-tlenku trimetyloaminy, wykorzystano spektroskopię oscylacyjną FTIR. Dane eksperymentalne, otrzymane z pomiarów widm oscylacyjnych wody półciężkiej (HDO) rozcieńczonej izotopowo w wodnych roztworach badanych związków, analizowane były za pomocą "metody widm różnicowych". Strukturalno-energetyczna charakterystyka wody zaburzonej przez cząsteczki osmolitów wskazuje, że woda zaburzona...
-
Large-scale DFT calculations in implicit solvent-A case study on the T4 lysozyme L99A/M102Q protein
PublikacjaW ostatnich latach zaproponowano szereg modeli typu implicit solvent, ktore bazują na bezpośrednim rozwiązaniu niejednorodnego równania Poissona w przestrzeni rzeczywistej. Modele te charakteryzują się elegancją, ponieważ wnęka, w której umieszczona jest molekuła substancji rozpuszczanej zdefiniowana jest bezpośrednio w funkcji gęstości elektronowej, a rozkład ładunku jest w sposób samouzgodniony polaryzowany dzięki reakcji dielektryka,...
-
Inhibition of amyloid fibril formation of hen egg white lysozyme by trimethylamine N-oxide at low pH
PublikacjaIn vitro inhibition of the formation of fibrous aggregates of proteins (amyloids) has gained increasing attention due to the number of diseases associated with protein misfolding and fibrillation. An interesting group of compounds for which pronounced activity against this phenomenon can be expected consists of low molecular weight substances (osmolytes) which have the ability to change protein stability. Here we investigate the...
-
A freeze-thaw method for desintegration of Escherichia coli cells producing T7 lysozyme used in pBAD expression systems
PublikacjaPlazmid pLysN zawierający gen kodujący lizozym T7 pod kontrolą promotora lac został skonstruowany w celu ułatwienia dezintegracji komórek po ekspresji rekombinantowych białek w systemach ekspresji indukowanych arabinozą. Użyteczność plazmidu została przetestowana w komórkach Escherichia coli TOP10 i E. coli LMG194, niosących plazmid pBADMHADgeSSB, zawierający gen kodujący białko SSB Deinococcus geothermalis pod kontrolą promotora...
-
Characteristics of hydration water around hen egg lysozyme as the protein model in aqueous solution. FTIR spectroscopy and molecular dynamics simulation
PublikacjaW niniejszej pracy przedstawiono wyniki badań dotyczące hydratacji białka modelowego - lizozymu z jaja kurzego w roztworze wodnym. Wiodącą techniką stosowaną w badaniach była spektroskopia oscylacyjna FTIR z zastosowaniem techniki rozcieńczenia izotopowego wody półciężkiej HDO w roztworze wody zwykłej. Analiza widma HDO przy pomocy "metody widm zaburzonych" pozwoliła na wyizolowanie widma wody zaburzonej przez lizozym, a tym samym...
-
Modulation of expression of genes involved in glycosaminoglycan metabolism and lysosome biogenesis by flavonoids
Publikacja -
The effect of lyophilization on selected biologically active components (vitamin c, catalase, lysozyme), total antioxidant capacity and lipid oxidation in human milk
PublikacjaHuman milk is rich in polyunsaturated fatty acids, as well as lysozyme, vitamin C and other bioactive compounds. The effect of lyophilization on the content of antioxidants (vitamin C and catalase CAT), bactericidal compounds (lysozyme), total antioxidant capacity (TAC) and lipid peroxidation in human milk was investigated in this study. Samples of mature human milk were collected from five healthy women who gave birth on the scheduled...
-
Impact of the Alkyl Side Chains of Cations and Anions on the Activity and Renaturation of Lysozyme: A Systematic Study Performed Using Six Amino‐Acid‐Based Ionic Liquids
PublikacjaThe impact of the structure of ionic liquid on the activity and renaturation of lysozyme from the hen egg white (HEWL) was investigated. A set of six ionic liquids based on morpholinium cation and N-acylated amino acids as anions were exploited. The matrix used was based on two homologous series: one with N-acetyl-L-valinate [Val] as a common anion and morpholinium cation with a different number of carbon atoms in the n-alkyl chain...
-
Impact of the Alkyl Side Chains of Cations and Anions on the Activity and Renaturation of Lysozyme: A Systematic Study Performed Using Six Amino‐Acid‐Based Ionic Liquids
PublikacjaThe impact of the structure of ionic liquid on the activity and renaturation of lysozyme from the hen egg white (HEWL) was investigated. A set of six ionic liquids based on morpholinium cation and N-acylated amino acids as anions were exploited. The matrix used was based on two homologous series: one with N-acetyl-L-valinate [Val] as a common anion and morpholinium cation with a different number of...
-
Correction: Corrigendum: Modulation of expression of genes involved in glycosaminoglycan metabolism and lysosome biogenesis by flavonoids
Publikacja -
Correction: Corrigendum: Modulation of expression of genes involved in glycosaminoglycan metabolism and lysosome biogenesis by flavonoids
Publikacja -
Lysosome Alterations in the Human Epithelial Cell Line HaCaT and Skin Specimens: Relevance to Psoriasis
Publikacja -
The effect of freeze-drying and storage on lysozyme activity, lactoferrin content, superoxide dismutase activity, total antioxidant capacity and fatty acid profile of freeze-dried human milk
PublikacjaPooled human milk samples were freeze-dried and stored for 6 weeks at a temperature of 5 C and 25 C. Freeze-drying decreased the water content of milk by 86.5%, and the obtained lyophilizate was readily soluble in water. The freeze-drying process did not affect superoxide dismutase (SOD) activity, fatty acid (FA) profile or lactoferrin (LF) content, but it decreased total antioxidant capacity (TAC) of human milk by 22.1% and induced...
-
Influence of Osmolytes on Protein and Water Structure: A Step To Understanding the Mechanism of Protein Stabilization
PublikacjaResults concerning the thermostability of hen egg white lysozyme in aqueous solutions with stabilizing osmolytes, trimethylamine-N-oxide (TMAO), glycine (Gly), and its N-methyl derivatives, N-methylglycine (NMG), N,N-dimethylglycine (DMG), and N,N,N-trimethylglycine (betaine, TMG), have been presented. The combination of spectroscopic (IR) and calorimetric (DSC) data allowed us to establish a link between osmolytes’ influence on...
-
Protein thermal stabilization in aqueous solutions of osmolytes
PublikacjaProteins’ thermal stabilization is a significant problem in various biomedical, biotechnological, and technological applications. We investigated thermal stability of hen egg white lysozyme in aqueous solutions of the following stabilizing osmolytes: Glycine (GLY), N-methylglycine (NMG), N,N-dimethylglycine (DMG), N,N,N-trimethylglycine (TMG), and trimethyl-N-oxide (TMAO). Results of CD-UV spectroscopic investigation were compared...
-
Przydatność białka rybiego w postaci kolagenu lub żelatyny oraz polisacharydu - kapa-karagenu do wytwarzania aktywnych opakowań biodegradowalnych = Usefulness of fish collagen, gelatin and carrageenan for preparation of active biodegradable packages
PublikacjaSummary - The possibility of use of protein films made of fish collagen or gelatin as well as polysaccharide carrageenan films as carriers of enzymes (lysozyme or lysostaphyne), for preparation of microbiologically active packages, was investigated. It was found that crosslinking of such systems with N-[3(dimethylamino)propyl]-N'-ethylcarboimide (EDC) does not influence the activity of lysozyme immobilized in the films (Table 1)....
-
Correction: Bocheńska, K. et al. Lysosome Alterations in the Human Epithelial Cell Line HaCaT and Skin Specimens: Relevance to Psoriasis. Int. J. Mol. Sci. 2019, 20, 2255
Publikacja -
The effect of UV-C irradiation on lipids and selected biologically active compounds in human milk
PublikacjaThe effect of UV-C irradiation of human milk on lipid oxidation, content of antioxidants (vitamin C and catalase, CAT) and bactericidal compounds (lysozyme), as well as the total antioxidant capacity (TAC), of the breast milk was investigated. In parallel, the extent of inactivation of some bacteria was also determined. UV-C at doses from 85 to 740 J L−1 caused total inactivation of Escherichia coli and Staphylococcus aureus, but...
-
Influence of Urea and Dimethyl Sulfoxide on K-Peptide Fibrillation
PublikacjaProtein fibrillation leads to formation of amyloids—linear aggregates that are hallmarks of many serious diseases, including Alzheimer’s and Parkinson’s diseases. In this work, we investigate the fibrillation of a short peptide (K-peptide) from the amyloidogenic core of hen egg white lysozyme in the presence of dimethyl sulfoxide or urea. During the studies, a variety of spectroscopic methods were used: fluorescence spectroscopy...
-
Nutrients and Bioactive Components of Human Milk After one Year of Lactation. Implication for Human Milk Banks
PublikacjaObjective: Specifying the nutrient content and bioactive compounds in milk from long-term lactation for the purpose of finding additional sources of donors’ milk for HMBs. Method: Human milk samples were collected from 43 mothers of term infants (term infant human milk, TIHM) (3–6 weeks of lactation) and 50 mothers who have breastfed for over a year (long-nursing human milk, LNHM). The milk collection time was 24 hours. The analyses...
-
Are stabilizing osmolytes preferentially excluded from the protein surface? FTIR and MD studies
PublikacjaInteractions between osmolytes and hen egg white lysozyme in aqueous solutions were studied by means of FTIR spectroscopy and molecular dynamics. A combination of difference spectra method and chemometric analysis of spectroscopic data was used to determine the number of osmolyte molecules interacting with the protein, and the preferential interaction coefficient in presented systems. Both osmolytes – L-proline and trimethylamine-N-oxide...
-
Amyloid fibril formation in the presence of water structure-affecting solutes
PublikacjaThe impact of the differently hydrated non-electrolytes (protein structure destabilizers) on the fibrillation of hen egg white lysozyme (HEWL) was investigated. Two isomeric urea derivatives i.e. butylurea (BU) and N,N,N′,N′-tetramethylurea (TMU) were chosen as a tested compounds. The obtained results show that butylurea exerts greater impact on HEWL and its fibrillation than tetramethylurea. Both substances decrease the time of...
-
Modyfikacja właściwości fizykochemicznych triacylogliceroli na drodze enzymatycznego przeestryfikowania.
PublikacjaPrzeestryfikowano mieszaniny oleju rzepakowego i łoju wołowego (4:6w/w). Katalizatorami reakcji były immobilizowane enzymy lipolityczne: Lipozyme RM IM, Lipozyme TL IM oraz Novozym 435 (Novo Nordisk). Produkty reakcji rozdzielano przy pomocy chromatografii kolumnowej. Triacyloglicerole (TAG) eluowano mieszaniną eteru naftowego i eteru dietylowego(87:13). W otrzymanych produktach oraz w wyizolowanych z nich TAG oznaczano temperaturę...
-
Effect of convection and microwave heating on the retention of bioactive components in human milk
PublikacjaBioactive substances are very important components of human milk (HM), especially for premature newborns. The effects of convection (CH) and microwave heating (MWH) at 62.5 and 66 °C, on the level of selected bioactive components of HM: lysozyme (LZ), lactoferrin (LF), secretory immunoglobulin A (sIgA), basal lipase (BL), cytokine TGF-2, vitamin C and total antioxidant capacity (TAC) was compared. Regardless of the used heating methods...
-
Mechanism of Osmolyte Stabilization–Destabilization of Proteins: Experimental Evidence
PublikacjaIn this work, we investigated the influence of stabilizing (N,N,N-trimethylglycine) and destabilizing (urea) osmolytes on the hydration spheres of biomacromolecules in folded forms (trpzip-1 peptide and hen egg white lysozyme─hewl) and unfolded protein models (glycine─GLY and N-methylglycine─NMG) by means of infrared spectroscopy. GLY and NMG were clearly limited as minimal models for unfolded proteins and should be treated with...
-
DMSO and TMAO—Differences in Interactions in Aqueous Solutions of the K-Peptide
PublikacjaInteractions between a solvent and their co-solute molecules in solutions of peptides are crucial for their stability and structure. The K-peptide is a synthetic fragment of a larger hen egg white lysozyme protein that is believed to be able to aggregate into amyloid structures. In this study, a complex experimental and theoretical approach is applied to study systems comprising the peptide, water, and two co-solutes: trimethylamide...
-
Preparation and characterization of genipin cross-linked porous chitosan–collagen–gelatin scaffolds using chitosan–CO2 solution
PublikacjaNovel porous scaffolds composed of chitosan, collagen and gelatin were prepared by the multistep procedure involving final freeze-drying and characterized. To eliminate the need for residual acid removal from the material after drying, carbon dioxide saturation process was used for chitosan blend formulation. The use of CO2 for chitosan dissolution made the scaffold preparation process more reproducible and economically sustainable....
-
Enzymatyczne przeestryfikowanie oleju rzepakowego kwasem kaprynowym w układzie reakcyjnym o minimalnej zawartości wody
PublikacjaOpisano wyniki badań nad wbudowywaniem się kwasu kaprynowego w triacylogli-cerole (TAG) oleju rzepakowego w procesie enzymatycznego przeestryfikowania, prowadzonego w obecności małej ilości wody. Katalizatorem procesu był sn-1,3 specyficzny enzym lipolityczny, Lipozyme IM. Parametrem zmiennym był czas reakcji. Produkty przeestryfikowania analizowano stosując technikę chromatografii kolumnowej, TLC i GLC oraz hydrolizę enzymatyczną...
-
Otrzymywanie strukturyzowanych lipidów wzbogaconych w kwas kaprylowy na drodze enzymatycznej acydolizy
PublikacjaBadano wpływ wybranych parametrów enzymatycznej acydolizy na ilość wbudowanego kwasu kaprylowego w cząsteczki riacylogliceroli oleju rzepakowego. Zmieniano stosunki molowe reagentów: czas reakcji oraz środowisko reakcji. Stwierdzono,że najkorzystniejsze warunki wbudowywaniania się tego kwasu w cząsteczki TAG były przy następujących parametrach: zawartość wody w peparacie enzymatycznym Lipozyme RM IM - 10% ; stosunek molowy oleju...
-
Porównanie metody DSC do badania stabilności termooksydatywnej triacylogliceroli strukturyzowanych, otrzymanych w wyniku enzymatycznego przeestryfikowania tłuszczu mlecznego lub jego frakcji olejem słonecznikowym.
PublikacjaBadano stabilność oksydatywną produktów enzymatycznego przeestryfikowania tłuszczu mlecznego i jego frakcji olejem słonecznikowym. Katalizatorem reakcji był Lipozyme RM IM. Mieszaniny wyjściowe i produkty reakcji rozdzielano metodą chromatografii kolumnowej. W wyizolowanych TAG oznaczano stabilność oksydatywną metodą DSC. Stwierdzono, że strukturyzowane TAG charakteryzowały się gorszą stabilnością niż TAG mieszanin wyjściowych....
-
Analiza składu kwasów tłuszczowych frakcji WKT wyizolowanej z produktów przeestryfikowania enzymatycznego wysokotopliwej frakcji tłuszczu mlecznego olejem słonecznikowym
PublikacjaOpracowano metodę ilościowego oznaczania kwasów tłuszczowych występujących w WKT mieszaniny poreakcyjnej. Substratem były frakcje WKT pochodzące z produktów enzymatycznego przeestryfikowania frakcji tłuszczu mlecznego i oleju słonecznikowego, w obecności Lipozyme RM IM. Frakcje te izolowano z produktu metodą preparatywnej CCW i przeprowadzano w estry metylowe, stosują jako katalizator SOCl2. Otrzymane estry analizowano metodą chromatografii...
-
Budowa niskokalorycznych strukturyzowanych lipidów otrzymanych na drodze enzymatycznego przeestryfikowania oleju rzepakowego i oleiny palmowej kwasem behenowym. The structure of low-calorie structured lipids obtained by enzymatic interestrification of rapeseed oil and palm oil with behenoic acid.
PublikacjaNiskokaloryczne strukturyzowane lipidy otrzymano na drodze wbudowywania kwasu behenowego, charakteryzującego się niską strawnością, w pozycje sn-1,3 triacylogliceroli dwóch rodzajów oleju rzepakowego oraz oleiny polmowej. Reakcje acydolizy przeprowadzono w obecności biokatalizatora Lipozyme RM IM przez 3 godziny w temp. 72st.C. Otrzymane produkty po usunięciu wolnych kwasów tłuszczowych rozdzielono w kolumnie chromatograficznej...
-
Structured triacylglicerols containing behenic acid: preparation and properties
PublikacjaNiskokaloryczne lipidy strukturyzowane otrzymano na drodze przeestryfikowania właściwego oleju oliwkowego całkowicie uwodornionym wysokoerukowym olejem rzepakowym (TAG/SLHE) oraz na drodze acydolizy oleju oliwkowego kwasem behenowym (TAG/SLB). Reakcje były katalizowane Lipozyme RM IM. Tłuszcz (TAG/SLHE) charakteryzował się wysoką temperaturą topnienia - 45,5 st. C, natomiast tłuszcz (TAG/SLB) miał temperaturę topnienia 37,5 st.C...
-
The Effect of Hyperbaric Storage on the Nutritional Value and Retention of Certain Bioactive Proteins in Human Milk
PublikacjaHuman milk (HM) contains the essential macronutrients and bioactive compounds necessary for the normal growth and development of newborns. The milk collected by human milk banks is stored frozen and pasteurized, reducing its nutritional and biological value. The purpose of this study was to determine the effect of hyperbaric storage at subzero temperatures (HS-ST) on the macronutrients and bioactive proteins in HM. As control samples,...
-
Enzymatyczne przeestryfikowanie łoju wołowego i oleju rzepakowego bez i w obecności różnych rozpuszczalników
PublikacjaPorównywano produkty otrzymane na drodze enzymatycznego przestryfikowania. Stosowano olej rzepakowy i łój wołowy (4:6 w/w). Katalizatorem procesu był Lipozyme RM IM. Proces prowadzono bez i w obecności różnych rozpuszczalników (izooktan, heksan, toluen). Temp. wynosiła 55-65oC. Produkty przeestryfikowania rozdzielano metodą chromatografii kolumnowej na frakcje: TAG, WKT i DAG+MAG. Określano temp. topnienia i zawartość fazy stałej...
-
Taurine as a water structure breaker and protein stabilizer
PublikacjaThe enhancing effect on the water structure has been confirmed for most of the osmolytes exhibiting both stabilizing and destabilizing properties in regard to proteins. The presented work concerns osmolytes, which should be classified as “structure breaking” solutes: taurine and N,N,N-trimethyltaurine (TMT). Here, we combine FTIR spectroscopy, DSC calorimetry and DFT calculations to gain an insight into the interactions between...
-
Density functional theory calculations on entire proteins for free energies of binding: Application to a model polar binding site
PublikacjaIn drug optimization calculations, the molecular mechanics Poisson-Boltzmann surface area (MM-PBSA) method can be used to compute free energies of binding of ligands to proteins. The method involves the evaluation of the energy of configurations in an implicit solvent model. One source of errors is the force field used, which can potentially lead to large errors due to the restrictions in accuracy imposed by its empirical nature....
-
Interactions in aqueous solutions of K-peptide and DMSO – spectroscopic and calorimetric studies
PublikacjaIntroduction K-peptide (GILQINSRW) – short 9 amino acid fragment of the hen egg white lysozyme has the ability to form amyloid structures. Dimethyl sulfoxide (DMSO) is an osmolyte which can alter this ability. Our goal was to get an insight into the mechanism of Kpeptide-DMSO interactions in aqueous solutions. Such a knowledge can be helpful to understand processes leading to various neurodegenerative diseases. Methods ATR-FTIR...
-
Zmiana składu kwasów tłuszczowych tłuszczu mlecznego w wyniku przeestryfikowania olejem słonecznikowym.
PublikacjaProces wzbogacania tłuszczu mlecznego i jego wysokotopliwej frakcji w NNKT prowadzono za pomocą enzymatycznego przeestryfikowania tych tłuszczów olejem słonecznikowym, w obecności lipazy Lipozyme RM IM. Triacyloglicerole (TAG) z surowców i produktów przeestryfikowania izolowano przy pomocy chromatografii kolumnowej. Określono skład kwasów tłuszczowych oraz strukturę otrzymanych TAG. Stwierdzono, że w strukturyzowanych TAG...
-
Imidazoacridinone-dependent lysosomal photodestruction: a pharmacological Trojan horse approach to eradicate multidrug-resistant cancers
PublikacjaMultidrug resistance (MDR) remains a primary hindrance to curative cancer therapy. Thus, introduction of novel strategies to overcome MDR is of paramount therapeutic significance. Sequestration of chemotherapeutics in lysosomes is an established mechanism of drug resistance. Here, we show that MDR cells display a marked increase in lysosome number. We further demonstrate that imidazoacridinones (IAs), which are cytotoxic fluorochromes,...