Wyszukiwarka
Filtry
wszystkich: 1106
wybranych: 897
-
Katalog
- Publikacje 897 wyników po odfiltrowaniu
- Czasopisma 12 wyników po odfiltrowaniu
- Konferencje 1 wyników po odfiltrowaniu
- Osoby 43 wyników po odfiltrowaniu
- Wynalazki 11 wyników po odfiltrowaniu
- Projekty 28 wyników po odfiltrowaniu
- Laboratoria 1 wyników po odfiltrowaniu
- Zespoły Badawcze 4 wyników po odfiltrowaniu
- Kursy Online 28 wyników po odfiltrowaniu
- Wydarzenia 5 wyników po odfiltrowaniu
- Dane Badawcze 76 wyników po odfiltrowaniu
Filtry wybranego katalogu
Wyniki wyszukiwania dla: SONDOWANIE DNA MORZA
-
Wpływ warunków naturalnych na zobrazowanie dna Zatoki Gdańskiej przy użyciu sonaru bocznego
PublikacjaGłównym celem artykułu jest przedstawienie wpływu warunków środowiskowych na dokładność zobrazowania dna morza za pomocą systemów hydroakustycznych. Czynniki naturalne, przede wszystkim falowanie powierzchni morza i niejednorodny rozkład prędkości dźwięku w wodzie, mają wpływ na zmianę toru promieni akustycznych. Choć w obu przypadkach mechanizm zjawisk jest zupełnie odmienny, odgrywają one decydującą rolę w odwzorowaniu dna i...
-
Obrazy akustyczne dna morskiego w wybranych akwenach Bałtyku
PublikacjaMetody akustyczne obserwacji obszarów podwodnych mórz i oceanów stosowane są od początku XX wieku. Początkowo były to echosondy nawigacyjne najczęściej składające się z pojedynczych przetworników. Następnie zaczęto stosować sonary do wykrywania obiektów stanowiących przeszkody nawigacyjne pod woda, które miały głównie zastosowanie w marynarce wojennej. W drugiej połowie XX wieku rozpoczęto konstruowanie urządzeń akustycznych, których...
-
Numeryczny model terenu dla studium wykonalności inwestycji
PublikacjaAutorzy prezentują możliwość pozyskania numerycznego modelu terenu (lądu i dna morskiego) w oparciu o korelację pomiarów fotogrametrycznych i batymetrycznych. Prezentują autorskie opracowanie geoinformatyczne połączone z wdrożeniem na przykładzie wybranej inwestycji w strefie brzegowej Morza Bałtyckiego.
-
Wpływ planowanej przystani jachtowej w Sopocie na brzeg morski.
PublikacjaW artykule przeanalizowano wpływ planowanej przystani jachtowej w sąsiedztwie molo w Sopocie na kształtowanie procesów hydro- i litodynamicznych w strefie brzegowej morza. Przeprowadzono symulacje komputerowe zarówno dla przeciętnych jak i sztormowych warunków meteorologicznych występujących w średnim roku statystycznym. W rezultacie stwierdzono, że usytuowanie przystani po odmorskiej stronie bocznej ostrogi molo nie spowoduje...
-
System detekcji miny morskiej oparty na układzie FPGA
PublikacjaObiekt metalowy znajdujący się w wodzie morskiej wytwarza wokół siebie pole elektryczne. Źródłem tego pola są procesy elektrochemiczne. Wśród wielu metalowych obiektów znajdujących się w morzu są miny morskie. Miny denne często ukryte są w dnie morza w celu utrudnienia ich wykrycia przez sonary. W pracy przedstawiono wyniki analizy numerycznej wpływu przewodności elektrycznej dna na rozkład pola elektrycznego oraz opisano system...
-
Hydrodynamical loads on a floating dock towed in sea conditions
PublikacjaPrzedstawiono i analizowano charakterystyki amplitudowe (RAO) oraz prognozy krótko i długoterminowe hydrodynamicznych reakcji doku pływającego holowanego w warunkach morskich na akwenach Bałtyku i Morza Północnego. Przedmiotem badań były: nurzania i kołysania wzdłużne, ciśnienia dynamiczne indukowane w różnych częściach dna doku, pionowy moment gnący i opór doku holowanego na falach czołowych. Charakterystyki RAO rozpatrywanych...
-
Interactions of antitumor triazoloacridinones with DNA
PublikacjaW niniejszej pracy zbadano oddziaływanie sześciu wybranych pochodnych triazoloakrydonu z DNA. Analiza wiskozymetryczna pokazała, że związki te interkalują do DNA. Jednocześnie dalsze badania wykazały, że proces interkalacji nie jest istotny aktywności cytotoksycznej tej grupy związków. Badania z wykorzystaniem fibroblastów dowiodły, że jedna z pochodnych triazoloakrydonu, związek C-1305, po uprzedniej metabolicznej aktywacji indukuje...
-
Abstract DNA-type systems
PublikacjaAbstrakcyjny system typu DNA jest definiowany przez zestaw nieliniowych kinetycznych równań z wielomianowymi nieliniowościami, które przyjmują rozwiązania solitonowe związane z geometrią helis. Zestaw równań pozwala na dwie różne reprezentacje Laxa: forma von Neumanna i Darboux-kowariantna para Laxa. Wyjaśniamy dlaczego nie-Kolmogorowskie modele prawdopodobieństwa pojawiające się w kinetyce solitonowej są naturalnie związane z...
-
Processing of 1-nitroacridine-induced DNA-DNA cross-links by topoisomerase I is associated with enhanced cellular survival: a possible role of topoisomerase I in the removal of DNA cross-links
PublikacjaW tej pracy wykazujemy, że modyfikacje plazmidu indukowane przez wzrastające dawki 1-nitroakrydyn (nitracrine i związek C-857) prowadzą do zahamowania aktywności katalitycznej topoizomerazy I. Hamowanie to związane jest z pojawieniem się pojedynczoniciowych uszkodzeń DNA i tworzeniem kowalencyjnych kompleksów topoizomeraza I-DNA. Nie obserwowano takich efektów dla topoizomerazy typu II.Dalsze badania wykazały, że jedna z 1-nitroakrydyn...
-
Applying fuzzy logic to decisional DNA digital TV
PublikacjaWprowadzono wspomaganie oparte na logice rozmytej do modelu telewizji wykorzystujacej decyzyjny DNA.
-
Region Morza Bałtyckiego - lokomotywą Europy?
PublikacjaArtykul prezentuje potencjalne szanse regionu Morza Bałtyckiego na stanie się lokomotywą integrującej się Europy.
-
Naturally occurring mitochondrial DNA heteroplasmy in the MRL mouse
PublikacjaThe MRL/MpJ mouse is an inbred laboratory strain of Mus musculus, known to exhibit enhanced autoimmunity, increased wound healing, and increased regeneration properties. We report the full-length mitochondrial DNA (mtDNA) sequence of the MRL mouse (Accession # EU450583), and characterize the discovery of two naturally occurring heteroplasmic sites. The first is a T3900C substitution in the TpsiCloop of the tRNA methionine gene...
-
Fuzyjne polimerazy DNA – otrzymywanie, charakterystyka i zastosowanie
PublikacjaObecnie reakcje PCR (ang. Polymerase Chain Reaction) wykazują bardzo szerokie zastosowanie w diagnostyce medycznej, biologii molekularnej czy inżynierii genetycznej. Efektywność tych reakcji rozumiana jako wydajność i wierność przeprowadzonej amplifikacji jest nieodłącznie związana ze stosowaną polimerazą DNA i warunkami prowadzenia reakcji PCR. Aby sprostać wymaganiom stawianym przez nowoczesne metody diagnostyczne oraz współczesną...
-
DNA modification by 1-nitroacridine derivatives. Comparison of 32P-Postlabeling and restriction enzyme analysis method for the detection of DNA adducts formed by 1-nitroacridines C-1748 and C-857
Publikacja4-podstawione 1-nitroakrydyny reprezentują nową grupę pochodnych akrydyny, zsyntetyzowanych na Politechnice Gdańskiej. Metoda 32P-postlabellingu wykazała, że pochodne C-1748 i C-857 tworzą od 4-6 adduktów DNA w systemie komórkowym i bezkomórkowym o innym rozkładzie plam chromatograficznych, jednakże niezależnym od zastosowanego systemu aktywacyjnego. Metoda enzymatycznej analizy restrykcyjnej pozwoliła natomiast śledzić kinetykę...
-
Sondowanie statyczne : Metody i zastosowanie w geoinżynierii.
PublikacjaKsiążka stanowi pierwsze polskie kompendium nt. sondowań statycznych metodą CPTU. Przedstawiono w niej problematykę sondowania w dwóch częściach: numerycznej i praktycznej. W części pierwszej autor zwraca uwagę na złożoność obliczeniową omawianych zagadnień, porusza kwestie zaawansowanej mechaniki obliczeniowej. Druga część zawiera wiele praktycznych wskazówek jak korzystać z metody CPTU i jak interpretować jej wyniki w celu określenia...
-
System transportowy Regionu Morza Bałtyckiego po rozszerzeniu Unii Europejskiej
PublikacjaSieć TEN-T w Regionie Morza Bałtyckiego. Inicjatywy i projekty transportowe w Regionie Morza Bałtyckiego. Rozwój transportu w Strategii dla Regionu Morza Baltyckiego.
-
Interstrand crosslinking of DNA by C-1311 (Symadex) and other imidazoacridinones
PublikacjaImidazoakrydony, w tym pochodna C-1311 (Symadex) znajdująca się w pierwszej fazie badań klinicznych prowadzonych w USA, należą do grupy bardzo aktywnych związków przeciwnowotworowych zsyntetyzowanych w Katedrze Technologii Leków i Biochemii PG. Za pomocą zmodyfikowanej metody Parsons'a wykazaliśmy, że C-1311 indukuje, w sposób zależny od stężenia, międzyłańcuchowe wiązania sieciujące w komórkach różnych nowotworów ludzkiego pochodzenia...
-
Electroanalytical and spectroscopic procedures for examination of interactions between double stranded DNA and intercalating drugs
PublikacjaPrzedstawiono metodę elektrochemicznego opisu oddziaływań dsDNA ze związkiem biologicznie czynnym w warunkach, w których zarówno badany związek jak i cząsteczka DNA są w roztworze elektrolitu. Opracowano warunki pomiaru, gdzie ani związek, ani DNA nie adsorbuje na elektrodzie. Wykazano, podobnie jak podczas badania innymi metodami, że oddziaływania są dwojakiego rodzaju: elektrostatyczne i poporzez interkalację.
-
Two highly thermostable paralogous single-stranded DNA-binding proteins from Thermoanaerobacter tengcongensis
PublikacjaThe thermophilic bacterium Thermoanaerobacter tengcongensis has two single-stranded DNA-binding (SSB) proteins, designated TteSSB2 and TteSSB3. In a SSB complementation assay in Escherichia coli, only TteSSB3 took over the in vivo function of EcoSSB. We have cloned the ssb genes obtained by PCR and have developed E. coli overexpression systems. The TteSSB2 and TteSSB3 consist of 153 and 150 amino acids with a calculated molecular...
-
Interaction of antitumor triazoloacridone C-1305 and its analogs with telomeric DNA
PublikacjaBadaliśmy oddziaływanie pochodnej triazoloakrydonu C-1305 i jego bliskich analogów strukturalnych z oligonukleotydami zawierającycmi sekwencje telomerowe TTAGGG oraz oligonukleotydami sfałdowanymi w strukturę G-kwadrupleksu. Wykazaliśmy, że spośród badanych związków pochodna C-1305 wykazała największą specyficzność w stosunku do telomerowego DNA. Związek ten stabilizował także strukturę G-kwadrupleksu, podczas gdy jego analogi...
-
Cellular senescence induced by DNA damage and its role in carcinogenesis and chemotherapy
PublikacjaUszkodzenia DNA indukują w komórce różne procesy, w tym starzenie komórkowe, co może uruchamiać proces karcinogenezy jak i być związane z odpowiedzią na leki przecinowotworowe. Biologiczna rola starzenia komórkowego nie jest jednak jasna. Zasugerowano, że proces starzenia komórkowego może hamować proces karcinogenezy poprzez indukcję nieodwracalnego zahamowania wzrostu przez czynniki genotoksyczne. Indukcja starzenia komórkowego...
-
Barwy Morza
PublikacjaOgólnopolska Wystawa Marynistyczna
-
Barwy morza
Publikacja -
Kulturowo-cywilizacyjna odrębność Regionu Morza Bałtyckiego
PublikacjaRegion Morza Bałtyckiego, jako przestrzeń kulturowo-cywilizacyjna ujawnia istotne cechy wyznaczające jego odrębność i stanowiące o konkurencyjności, m.in.: kondycję cywilizacyjną, stan rozwoju gospodarczego i infrastrukturalnego, sieć kontaktów międzynarodowych, poziom zorganizowania społecznego i politycznego, stabilizację polityczną oraz identyfikację z rzeczywistością i dokonującymi się zmianami w wymiarze globalnym. Kształtowaniu...
-
Comet assay-based methods for measuring DNA repair in vitro; estimates of inter- and intra-individual variation.
PublikacjaZdolność do naprawy uszkodzeń DNA jest jednym z najważniejszych wyznaczników podatności na choroby nowotworowe. Dlatego też użytecznym staje się możliwość pomiaru stopnia naprawy DNA w próbkach materiału badawczego pobranego od ochotników. Celem pracy było, po pierwsze, opracowanie w warunkach in vitro prostej metody (z wykorzystaniem techniki testu kometowego), w której naprawa DNA odbywa się poprzez wycinanie nukleotydów (NER)....
-
Epigenetic Basis of Regeneration: Analysis of Genomic DNA Methylation Profiles in the MRL/MpJ Mouse
PublikacjaEpigenetic regulation plays essential role in cell differentiation and dedifferentiation, which are the intrinsic processes involved in regeneration. To investigate the epigenetic basis of regeneration capacity, we choose DNA methylation as one of the most important epigenetic mechanisms and the MRL/MpJ mouse as a model of mammalian regeneration known to exhibit enhanced regeneration response in different organs. We report the...
-
Novel thermostable single-stranded DNA-binding protein (SSB) from Deinococcus geothermalis
PublikacjaW celu zbadania właściwości biochemicznych białka wiążącego się do jednoniciowego DNA (SSB) pochodzącego z Deinococcus geothermalis (DgeSSB), sklonowano gen ssb otrzymany w reakcji PCR, a następnie uzyskano wydajną biosyntezę białka DgeSSB. Gen składa się z 900 par zasad, kodujących białko złożone z 300 reszt aminokwasowych, o wyliczonej masie molekularnej równej 32.45 kDa. Sekwencja aminokwasowa wykazuje 43, 44% i 75% identyczności...
-
GRA1 protein vaccine confers better immune response compared to codon-optimized GRA1 DNA vaccine
PublikacjaW publikacji oszacowano immunogenność i właściwości protekcyjne szczepionki anty-Toxoplasma gondii opartej na białku rekombinantowym GRA1 oraz dwóch rodzajach szczepionek DNA (plazmidu zawierającego gen kodujący białko GRA1 dzikiego typu oraz modyfikowanego genu kodującego białko GRA1). Uzyskane wyniki sugerują lepsze właściowści immunoprotekcyjne rekombinantowego białka antygenowego niż szczepionek DNA.
-
Współczesna unifikacja życia kulturowego w Regionie Morza Bałtyckiego
PublikacjaRozpoznając zjawiska i procesy społeczne, polityczne i gospodarcze współczesnego świata zauważa się unifikację ładu kulturowego. Szczególny jej wymiar obrazuje nadbałtycka przestrzeń kulturowa, której odrębność regionalną odnosi się do rzeczywistości hegemonicznej obszaru Morza Bałtyckiego. Ujawniają się przemiany, generowanych przez postęp naukowo-techniczny, kształtujących ład prawny, a przede wszystkim prawa człowieka, wyzwania...
-
Region Morza Bałtyckiego wobec wyzwań integracji europejskiej
PublikacjaWspółcześnie w Regionie Morza Bałtyckiego obserwuje się tendencje związane ze wzamacnianiem wartości politycznych, gospodarczych i społecznych, a w tym relacji międzynarodowych. Państwa Regionu odpowiadają na współczesne wyzwania integracji europejskiej, dostarczając licznych przykładów wielostronnej instytucjonalnej współpracy. Rozwój spraw międzynarodowych ujawnia konieczność wspólnego rozwiązywania problemów cywilizacyjnych...
-
Sondowanie statyczne metodą CPTU podłoża gruntowego pod nasypem drogowym.
PublikacjaW artykule przedstawiono sposób wykonania badania sondowania statycznego metodą CPTU przez nasyp drogowy w celu oszacowania warunków konsolidacji podłoża gruntowego.
-
Generation and Characterization of a DNA-GCN4 Oligonucleotide-Peptide Conjugate: The Impact DNA/Protein Interactions on the Sensitization of DNA
PublikacjaRadiotherapy, the most common therapy for the treatment of solid tumors, exerts its effects by inducing DNA damage. To fully understand the extent and nature of this damage, DNA models that mimic the in vivo situation should be utilized. In a cellular context, genomic DNA constantly interacts with proteins and these interactions could influence both the primary radical processes (triggered by ionizing radiation) and secondary reactions,...
-
Basis for a valuation of the Polish Exclusive Economic Zone of the Baltic Sea: Rationale and quest for tools.
PublikacjaW pracy przedstawiono zasoby i usługi Polskiej Strefy Ekonomicznej ekosystemu Morza Bałtyckiego. Dokonano przeglądu specyficznych właściwości tej strefy, które mogą mieć wartość ekonomiczną.
-
Interstrand crosslinking of DNA in tumor and fibroblast cells by C-1311 (Symadex) and other imidazoacridinones
PublikacjaImidazoakrydony, w tym pochodna C-1311 znajdująca się w pierwszej fazie badań klinicznych prowadzonych przez firmę Xanthus Life Sciences, należą do grupy bardzo aktywnych związków przeciwnowotworowych zsyntetyzowanych w Katedrze Technologii Leków i Biochemii PG. Za pomocą zmodyfikowanej metody Parsons'a wykazaliśmy, że C-1311 indukuje w sposób zależny od stężenia międzyłańcuchowe wiązania sieciujące w komórkach różnych nowotworów...
-
Bezpieczeństwo Ekonomiczne Casus Państw Regionu Morza Bałtyckiego w latach 2005-2015
PublikacjaW publikacji przedstawiono autorski model oceny bezpieczeństwa ekonomicznego państwo. Za pomocą wspomnianego wskaźnika dokonano oceny bezpieczeństwa ekonomicznego państw regionu morza Bałtyckiego w latach 2005-2015.
-
Zmiany zlodzenia Morza Karskiego w latach 1979-2015. Podejście systemowe
PublikacjaPraca omawia zmiany powierzchni lodów na Morzu Karskim i mechanizmy tych zmian. Scharakteryzowano przebieg zmian zlodzenia, ustalając momenty skokowego zmniejszenia się letniej powierzchni lodów. Rozpatrzono wpływ cyrkulacji atmosferycznej, zmian temperatury powietrza i zmian zasobów ciepła w wodach na zmiany zlodzonej tego morza. Analizy wykazały, że wszystkie zmienne opisujące zarówno stan zlodzenia jak i stan elementów klimatycznych...
-
Identification and properties of the Deinococcus grandis andDeinococcus proteolyticus single-stranded DNA binding proteins (SSB)
PublikacjaW celu poznania właściwości biochemicznych białek SSB pochodzących z Deinococcus grandis (DgrSSB) i Deinococcus proteolyticus (DprSSB) sklonowano zaamplifikowane w reakcji PCR geny ssb w systemie ekspresyjnym Escherichia coli. Geny składają się z 891(DgrSSB) i 876 (DprSSB) nukleotydów kodujących odpowiednio 296 i 291 reszt aminokwasowych o teoretycznie wyznaczonej masie cząsteczkowej dla białek, równej 32,29 i 31,33 kDa. Sekwencja...
-
Folding‐upon‐repair DNA nanoswitches for monitoring DNA repair enzymes activity
PublikacjaWe demonstrate here a new class of DNA‐based nanoswitches that, upon enzymatic repair, could undergo a conformational change mechanism leading to a change in fluorescent signal. Such folding‐upon‐repair DNA nanoswitches are synthetic DNA sequences containing O6‐methyl‐guanine (O6‐MeG) nucleobases and labelled with a fluorophore/quencher optical pair. The nanoswitches are rationally designed so that only upon enzymatic demethylation...
-
Algorytmy analizy i przetwarzania danych z sonarów wielowiązkowych w rozproszonych systemach GIS
PublikacjaTelemonitoring morski oraz szeroko rozumiane badania morza są ważnym elementem aktywności człowieka w sferze badań, nauki oraz gospodarki. Prowadzenie działań związanych z tworzeniem map dna, inspekcją nadbrzeży, umocnień, badaniem fauny morskiej pozwala zrozumieć procesy zachodzące w środowisku morskim oraz przyczynia się do rozwoju wielu gałęzi gospodarki takich jak transport morski, bezpieczeństwo, ochrona portów i inne. W ramach...
-
Wpływ gospodarki komunalnej obszarów wiejskich na jakość wód Morza Bałtyckiego
PublikacjaCelem pracy była analiza danych dotyczących zlewni Morza Bałtyckiego oraz wykonanie przeglądu literatury i przedstawienie badań własnych dotyczących gospodarki ściekowej głównie na terenach wiejskich. Morze Bałtyckie jest prawie całkowicie zamknięte. W każdym roku tylko 3% objętości wody ulega wymieniane. Z tego powodu jest bardzo podatne na eutrofizacje. Dodatkowo gospodarka wodno-ściekowa na obszarach niezurbanizowanych jest...
-
Wystawa Malarstwa pt. Barwy Morza
Publikacja -
Frontem do morza. Plan, budowa i architektura portu w Gdyni
PublikacjaGdynia to port, a port to Gdynia. Tak na początku istnienia II Rzeczpospolitej ukształtowała się jej morska stolica. Monografia Anny Orchowskiej to pierwsza publikacja poświęcona całokształtowi jednej z największych realizacji międzywojnia. Realizacji, która nie tylko pełniła istotne funkcje gospodarcze, ale też szybko stała się wizytówką kraju. Zwrócone niejako frontem do morza budynki były awangardowe i śmiałe w formie. Budowane...
-
Pollution of the Baltic Sea - DPSIR approach oriented. Pesticide pollution case study
PublikacjaPraca przedstawia krótką charakterystykę systemu DPSIR i podjętą próbę zastosowania go dla Morza Bałtyckiego. Opisano projekt szczegółowy, którego tematem było zanieczyszczenie pestycydami Morza Bałtyckiego. Przedstawiono sposób postępowania przy ustalaniu elementów systemu DPSIR, przedstawiono również skrótową charakterystykę pestycydów.
-
Towards neural knowledge DNA
PublikacjaIn this paper, we propose the Neural Knowledge DNA, a framework that tailors the ideas underlying the success of neural networks to the scope of knowledge representation. Knowledge representation is a fundamental field that dedicates to representing information about the world in a form that computer systems can utilize to solve complex tasks. The proposed Neural Knowledge DNA is designed to support discovering, storing, reusing,...
-
Identification, cloning, expression, and characterizationof a highly thermostable single-stranded-DNA-binding protein (SSB) from Deinococcus murrayi
PublikacjaZidentyfikowano i scharakteryzowano białko SSB-podobne, pochodzące z Deinococcus murrayi (DmuSSB). Otrzymany w reakcji PCR fragment zawierający kompletny gen ssb sklonowano w systemie ekspresyjnym Escherichia coli. Gen składa się z 826 nt, kodujących 276 reszt aminokwasowych z wyliczoną teoretycznie masą cząsteczkową monomeru równą 30,14 kDa. DmuSSB zawiera dwie domeny wiążące jednoniciowe DNA OBna monomer I funkcjonuje jako homodimer....
-
Ocena wpływu pokarmowych kwasów nukleinowych i ich komponentów na replikacyjną i naprawczą syntezę DNA w modelach komórek ludzkiego układu pokarmowego
PublikacjaKwasy nukleinowe, do których należą DNA i RNA, są podstawowymi elementami każdej komórki niezbędnymi do prawidłowego funkcjonowania organizmu. Pomimo, że cząsteczki te stanowią również nieodłączne składniki produktów żywnościowych spożywanych przez człowieka, to badania na temat ich zawartości w żywności oraz wartości odżywczej są ograniczone. Wyniki uzyskane w niniejszej pracy doktorskiej pokazały istotne różnice w ilości, wielkości...
-
Taq DNA polymerase fused with DNA binding protein with increased resistance to inhibitors from clinical samples
PublikacjaNowadays PCR method is commonly used in molecular diagnostic. However, in many cases PCR is limited, by the presence of inhibitory substances in biological, soil or food samples Efficiency and fidelity of amplification is strongly connected with DNA polymerase and reaction conditions. To meet the requirements of modern diagnostic methods it is essential to seeking for new DNA polymerases with better properties useful in these field....
-
Viability of decisional DNA in robotics
PublikacjaThe Decisional DNA is an artificial intelligence system that uses prior experiences to shape future decisions. Decisional DNA is written in the Set Of Experience Knowledge Structure (SOEKS) and is capable of capturing and reusing a broad range of data. Decisional DNA has been implemented in several fields including Alzheimer’s diagnosis, geothermal energy and smart TV. Decisional DNA is well suited to use in robotics due to the...
-
Modified DNA polymerases for PCR troubleshooting
PublikacjaPCR has become an essential tool in biological science. However, researchers often encounter problems with difficult targets, inhibitors accompanying the samples, or PCR trouble related to DNA polymerase. Therefore, PCR optimization is necessary to obtain better results. One solution is using modified DNA polymerases with desirable properties for the experiments. In this article, PCR troubleshooting, depending on the DNA polymerase...
-
Fusion of Taq DNA polymerase with single-stranded DNA binding-like protein of Nanoarchaeum equitans—Expression and characterization
PublikacjaDNA polymerases are present in all organisms and are important enzymes that synthesise DNA molecules. They are used in various fields of science, predominantly as essential components for in vitro DNA syntheses, known as PCR. Modern diagnostics, molecular biology and genetic engineering need DNA polymerases which demonstrate improved performance. This study was aimed at obtaining a new NeqSSB-TaqS fusion DNA polymerase from the...
-
Warunki odprowadzania ścieków do rzek, jezior i morza w Polsce w okresie 1945-2005
PublikacjaAspekt legislacyjny i ekonomiczny ochrony wód w kontekście postępu technologicznego wskazuje na ewolucję ogólnych zasad dotyczących odprowadzania ścieków do rzek, jezior i morza. Podano przykłady obliczeniowe ilustrujące zmiany w przepisach w ostatnich kilku dziesięcioleciach.]
-
Adding Interpretability to Neural Knowledge DNA
PublikacjaThis paper proposes a novel approach that adds the interpretability to Neural Knowledge DNA (NK-DNA) via generating a decision tree. The NK-DNA is a promising knowledge representation approach for acquiring, storing, sharing, and reusing knowledge among machines and computing systems. We introduce the decision tree-based generative method for knowledge extraction and representation to make the NK-DNA more explainable. We examine...
-
Modelowanie przepływu wód podziemnych w strefie brzegowej morza - możliwości prognozowania = Groundwater flow modeling in the coastline area - prediction possibilities
PublikacjaSpecyficzne warunki występowania wód podziemnych w strefie brzegowej morza sprawiają, że ich eksploatacja jest sprawą złożoną i powinna być weryfikowana na modelu numerycznym. Zasadniczym zagrożeniem jest ingresja słonych wód morskich, która może być wzbudzona eksploatacją. Innym czynnikiem, który może przyczynić się do ingresji wód słonych do warstwy wodonośnej może być podniesienie się poziomu morza. W pracy przedstawiono wyniki...
-
Dual inhibition of PI3K/Akt signaling and the DNA damage checkpoint in p53-deficient cells with strong survival signaling: implications for cancer therapy
PublikacjaOporność komórek nowotworowych na leki uszkadzjące DNA związana jest ściśle ze zdolnością do utrzymywania blok z fazie G2 cyklu komórkowego. Blok ten regulowany jest przez mechanizmy punktu kontrolnego G2/M oraz szlaki przeżycia komórkowego. W pracy badaliśmy rolę szlaku kinazy PI3K/Akt w funkcjonowaniu punktu kontrolnego cyklu komórkowego i wpływ na przeżycie komórek traktowanych lekiem przeciwnowotworowym - cisplatyną. Nasze...
-
Regulacja topologii DNA przez topoizomerazę typu II, czyli jak struktura DNA wpływa na funkcjonowanie genów
PublikacjaW wielu ważnych procesach jakie zachodzą w komórce zmienia się topologia DNA i struktura chromatyny. Enzym, topoizomeraza typu II, jest jednym z ważnych czynników, który reguluje zmiany topologiczne i strukturalne w jądrze, przez co ma bezpośredni lub pośredni wpływ na takie procesy jak uporządkowanie struktury chromatyny poprzez wiązanie pętli chromatyny do szkieletu jądrowego, transkrypcję i replikację DNA, reperację uszkodzeń...
-
Zapotrzebowanie na wsparcie innowacyjności wśród małych i średnich przedsiębiorstw w rejonie Morza Bałtyckiego
Publikacjacelem ekspertyzy było zbadanie rzeczywistego zapotrzebowania małych i średnich przedsiębiorstw z rejonu morza bałtyckiego na wsparcie innowacyjności. wyniki z przeprowadzonego badania mają służyć sformułowaniu rekomendacji, mających w przyszłości przyczynić się do podniesieniu innowacyjności i tym samym konkurencyjności mśp w rejonie nadbałtyckim. do zadań wykonywanych w ramach tej ekspertyzy należały m.in.: ocena dotychczasowego...
-
Produkty poliolowe otrzymane przez proces upłynniania biomasy z Morza Bałtyckiego
PublikacjaNiniejsza praca pt. „Produkty poliolowe otrzymywane poprzez proces upłynniania biomasy z Morza Bałtyckiego”, składa się z dwóch części, teoretycznej oraz eksperymentalnej. W części pierwszej przedstawiono aktualne kierunki badań dotyczące stosowania surowców odnawialnych w produkcji poliuretanów. Omówiono zastosowanie olejów roślinnych, odpadowej gliceryny oraz biomasy do otrzymywania spienionych materiałów poliuretanowych. Przedstawiono...
-
The development of Decisional DNA digital TV
PublikacjaZaproponowano koncepcje opartej na wiedzy i doswiadczeniu telewizji cyfrowej z wbudowanym decyzyjnym DNA.
-
Gentiana asclepiadea exerts antioxidant activity and enhances DNA repair of hydrogen peroxide- and silver nanoparticles-induced DNA damage
PublikacjaExposure to high levels of different environmental pollutants is known to be associated with induction of DNA damage in humans. Thus DNA repair is of great importance in preventing mutations and contributes crucially to the prevention of cancer. In our study we have focused on quantitative analysis of Gentiana asclepiadea aqueous or methanolic extracts obtained from flower and haulm, their antioxidant potency in ABTS post-column...
-
Decisional DNA applied to digital TV
PublikacjaPrzedstawiono nowoczesną koncepcje integracji decyzyjnego DNA z telewizją cyfrową w celu pozyskiwania wiedzy o oglądalności poszczególnych programów.
-
ANALIZA NUMERYCZNA WPŁYWU POZIOMU MORZA NA PRZEBIEG WEZBRAŃ W NADMORSKICH CIEKACH POWIERZCHNIOWYCH NA PRZYKŁADZIE POTOKU STRZYŻA W GDAŃSKU
PublikacjaW dzisiejszych czasach coraz większym problemem stają się podtopienia na terenach zurbanizowanych. Biorąc to pod uwagę, należy większą wagę przyłożyć do prawidłowego obliczania przepustowości koryta. Jednym z czynników wpływających na nie są warunki na odpływie. W przypadku potoków nadmorskich zależą one ściśle od poziomu morza. W pracy podjęto próbę wyznaczenia wpływu poziomu morza na przebieg wezbrań w nadmorskich ciekach powierzchniowych....
-
Fusion of DNA-binding domain of Pyrococcus furiosus ligase with TaqStoffel DNA polymerase as a useful tool in PCR with difficult targets
PublikacjaThe DNA coding sequence of TaqStoffel polymer- ase was fused with the DNA-binding domain of Pyrococcus furiosus ligase. The resulting novel recombinant gene was cloned and expressed in E. coli. The recombinant enzyme was purified and its enzymatic features were studied. The fusion protein (PfuDBDlig-TaqS) was found to have enhanced processivity as a result of the conversion of the Taq DNA polymerase from a relatively low processive...
-
Testing the usability of decisional DNA in robotics
PublikacjaW pracy poddano dyskusji i nalizie obszary mozliwych zastowac reprezentacji wiedzy zwanej Decisional DNA w zagadnieniach zwiazanych z robotyka.
-
Wiatr od morza. W sto lat później
Publikacja -
Preparation of DNA films for studies under vacuum conditions
PublikacjaExperiments were carried out to determine the optimum conditions required for the preparation of uniform films of supercoiled plasmid DNA to be used in irradiation experiments under high vacuum conditions. Investigations reveal that significant damage to the DNA molecules occurs due to the evacuation process when films were formed from DNA samples in ultra high purity water only. A variety of bases were tested for their possible...
-
Thermodynamics aspects of interactions between acridine derivatives and DNA
PublikacjaDNA is a molecular target for many anticancer and antiviral drugs. Therefore, a clear understanding of the interaction of small molecules with DNA is important in the rational design of ligands that can bind to DNA with high affinity and selectivity. There are several methods to investigate interactions between drug and DNA. Some of them measure changing into DNA structures, such as lengthening and untwisting of helix of DNA. Other...
-
Isoform-specific inhibition of DNA topoisomerase II as the mechanism of action of novel anticancer agent C-1305
Publikacja -
Early models of DNA damage formation
PublikacjaPrzeanalizowano jedne z pierwszych modeli opisujących uszkodzenia nici DNA. Przeanalizowano uszkodzenia powstające w pojedynczych i podwójnych niciach, pod wpływem czynników fizycznych i chemicznych.
-
Toward Intelligent Recommendations Using the Neural Knowledge DNA
PublikacjaIn this paper we propose a novel recommendation approach using past news click data and the Neural Knowledge DNA (NK-DNA). The Neural Knowledge DNA is a novel knowledge representation method designed to support discovering, storing, reusing, improving, and sharing knowledge among machines and computing systems. We examine our approach for news recommendation tasks on the MIND benchmark dataset. By taking advantages of NK-DNA, deep...
-
Badanie i porównanie zdolności wybranych leków i związków przeciwnowotworowych do międzyłańcuchowego sieciowania DNA mitochondrialnego i jądrowego w komórkach nowotworowych
PublikacjaCelem pracy było zbadanie zdolności przeciwnowotworowych związków do indukowania międzyłańcuchowych wiązań sieciujących DNA mitochondrialne w ludzkich komórkach nowotworowych oraz porównanie ze zdolnością do sieciowania DNA jądrowego. Pochodna 4-metylo-1-nitroakrydyny C-1748, Ledakrin i mitomycyna C wykazują zdolność do sieciowania mtDNA i jDNA w komórkach raka okrężnicy HCT-8 w sposób zależny od dawki; C-1748 w komórkach raka...
-
The Decisional DNA-Based Smart Bike for Internet of Things
PublikacjaIn this paper, we introduce a novel application of the Internet of Things, the Decisional DNAbased Smart Bike. The Decisional DNA is a domain-independent, flexible and standard knowledge representation structure; it allows its domains to acquire and store experiential knowledge and formal decision events in an explicit way. By using Decisional DNA, the sensor-equipped bicycle is able to learn its user’s weight, riding habits, etc....
-
An insight into the mixed quantum mechanical-molecular dynamics simulation of a ZnII-Curcumin complex with a chosen DNA sequence that supports experimental DNA binding investigations
PublikacjaAn important aspect of research pertaining to Curcumin (HCur) is the need to arrest its degradation in aqueous solution and in biological milieu. This may be achieved through complex formation with metal ions. For this reason, a complex of HCur was prepared with ZnII, that is not likely to be active in redox pathways, minimizing further complications. The complex is monomeric, tetrahedral, with one HCur, an acetate and a molecule...
-
Measuring the density of DNA films using ultraviolet-visible interferometry
PublikacjaIn order to determine a proper value for the density of dry DNA films we have used a method based upon the measurement of interference effects in transmission spectra of thin DNA layers. Our results show that the methodology is effective and the density of DNA in this state, 1.407 g/cm3, is much lower than the commonly used 1.7 g/cm3. Obtaining accurate values for the DNA film density will allow the optical constants for DNA to...
-
A case study of constructing decisional DNA on finanse
PublikacjaPrzedstawiono koncepcję i rozwiązanie analityczne opisu rynku finansowego przy pomocy reprezentacji wiedzy zwanej ''decyzyjne DNA''.
-
Problem of aggregation in dye-DNA interaction, calorimetry studies
PublikacjaNucleic acids are the biological target for many antimicrobial, antitumor and antiviral drugs. Ligand-DNA interactions can be classified into two major categories: 1. covalent binding, which can provide to intermolecular adducts, 2. physico-chemical interactions, which can be divided into intercalation (e.g. adriamycin) or groove binding (e.g. dystamycin). There are several methods to investigate interactions between drug and DNA....
-
Termodynamika niekowalencyjnego oddziaływania małocząsteczkowych ligandów z dna
PublikacjaKwasy nukleinowe są jednym z głównych celów biologicznych dla wielu antybiotyków oraz leków przeciwnowotworowych i przeciwwirusowych. Podczas tworzenia nowych farmaceutyków ważna jest dokładna wiedza na temat sposobu wiązania się leku do DNA. Oddziaływanie ligand-DNA można podzielić na dwie grupy: 1. wiązanie kowalencyjne, które często prowadzi do utworzenie trwałych wiązań pomiędzy nićmi DNA, 2. fizykochemiczne wiązanie, które...
-
Decisional DNA and Optimization Problem
PublikacjaMany researchers have proved that Decisional DNA (DDNA) and Set of Experience Knowledge Structure (SOEKS or SOE) is a technology capable of gathering information and converting it into knowledge to help decision-makers to make precise decisions in many ways. These techniques have a feature to combine with different tools, such as data mining techniques and web crawlers, helping organization collect information from different sources...
-
Decisional DNA: the concept and its implementation platforms
PublikacjaOmowiono kopncepcje zarzadzania wiedza oparta na decyzyjnym DNA gdzie wiedza jest reprezentowana poprzez zbiory doswiadczen. Przedstawiono obecne oraz przyszle zastosowania omawianej koncepcji.
-
Metylacja DNA w rozwoju, diagnostyce i terapii nowotworów
PublikacjaDotychczas kowalencyjna modyfikacja DNA, jaką jest zarówno naturalna metylacja DNA, jak i addukty DNA egzogennych niskocząsteczkowych związków chemicznych, były ropatrywane z punktu widzenia genomu. W świetle obecnej wiedzy dotyczącej epigenomu można sądzić, że stosunkowo niewielkie modyfikacje czy to w postaci metylacji cytozyny, czy adduktu DNA mogą mieć znaczący wpływ na działanie komórki, a co za tym idzie także jej transformację...
-
Sarmaci znad Morza Czarnego [Sarmatians from the Black Sea]
Publikacja -
Kształcenie ustawiczne – trendy w krajach regionu Morza Bałtyckiego
PublikacjaKwestie kształcenia ustawicznego i dostosowania kwalifikacji do potrzeb rynku pracy są przedmiotem dyskusji zarówno na szczeblu europejskim, jak i poszczególnych krajów. Działania administracji powinny zmierzać w kierunku określenia zapotrzebowania na określone umiejętności oraz aktywizacji społeczeństwa poprzez realizację idei uczenia się przez całe życie. Doświadczenia krajów skandynawskich dostarczają wielu przykładów dobrych...
-
Therapeutic intervention by the simultaneous inhibition of DNA repair and type I or type II DNA topoisomerases: one strategy, many outcomes
PublikacjaMany anticancer drugs reduce the integrity of DNA, forming strand breaks. This can cause mutations and cancer or cell death if the lesions are not repaired. Interestingly, DNA repair-deficient cancer cells (e.g., those with BRCA1/2 mutations) have been shown to exhibit increased sensitivity to chemotherapy. Based on this observation, a new therapeutic approach termed 'synthetic lethality' has been developed, in which radiation...
-
Framework for Product Innovation Using SOEKS and Decisional DNA
PublikacjaProduct innovation always requires a foundation based on both knowledge and experience. The production and innovation process of products is very similar to the evolution process of humans. The genetic information of humans is stored in genes, chromosomes and DNA. Similarly, the information about the products can be stored in a system having virtual genes, chromosomes and decisional DNA. The present paper proposes a framework for...
-
Termodynamiczne aspekty oddziaływania niskocząsteczkowych ligandów z DNA
PublikacjaKwasy nukleinowe są celem biologicznym dla wielu antybiotyków oraz leków przeciwnowotworowych i przeciwwirusowych. Dlatego podczas tworzenia nowych farmaceutyków ważna jest dokładna wiedza na temat sposobu wiązania się leku do DNA.Oddziaływanie ligand-DNA można podzielić na dwie grupy: 1. wiązanie kowalencyjne, które często prowadzi do utworzenie trwałych wiązań pomiędzy nićmi DNA, 2. fizykochemiczne wiązanie, które może być podzielone...
-
Raman spectroscopic study of Ni2+-DNA interactions in aqueous systems
PublikacjaMetodą ramanowskich widm różnicowych określono sposób oddziaływania jonu Ni2+ z DNA(CT) w układach wodnych. Kation Ni(II) koordynuje w pozycjach N7 guaniny (G) i adeniny (A) w powtarzających się sekwencjach GG, AA i GA cząsteczki DNA. Jednocześnie Ni2+ oddziałuje zewnątrz sferowo poprzez cząsteczki wody z grupami fosforanowymi DNA.
-
Application of decisional DNA in web data mining
PublikacjaPrzedstawiono pilotową koncepcję i aplikację integracji reprezentacji wiedzy opartej na decyzyjnym DNA oraz systemów pozyskiwania wiedzy i danych z Internetu. Wskazano na zalety proponowanej integracji oraz przedstawiono kierunki przyszłych badań w tym zakresie.
-
Adding Intelligence to Cars Using the Neural Knowledge DNA
PublikacjaIn this paper we propose a Neural Knowledge DNA based framework that is capable of learning from the car’s daily operation. The Neural Knowledge DNA is a novel knowledge representation and reasoning approach designed to support discovering, storing, reusing, improving, and sharing knowledge among machines and computing devices. We examine our framework for drivers' classification based on their driving behaviour. The experimental...
-
Decisional DNA based embedded systems: a new perspective
PublikacjaOmówiono nowe kierunki i perspektywy badań w zakresie systemów podporządkowanych opartych na decyzyjnym DNA.
-
Decisional DNA digitral TV: concept and initial experiments
PublikacjaPrzedstawiono pierwsze wyniki eksperymentalnej integracji telewizji cyfrowej z decyzyjnym DNA reprezentujacym wiedze o odbiorcy programow.
-
VUV irradiation studies of plasmid DNA in aqueous solution
PublikacjaInteractions of VUV light and DNA samples in aqueous solutions are reported. The damage induced by such radiation is quantified by monitoring both loss of supercoiled DNA and formation of single and double strand breaks using agarose gel electrophoresis. Irradiations were performed using synchrotron VUV photons of 130, 150, 170 and 190 nm. VUV irradiation experiments revealed enhanced damage upon irradiation with 170 nm photons...
-
Set of Experience and Decisional DNA: Experience-Based Knowledge Structures
PublikacjaThis chapter presents a description of Set of Experience Knowledge Structure (SOEKS) and Decisional DNA (DDNA), argumentation for a knowledge representation, composition, configuration and metrics. SOEKS is a combination of filtered and amalgamated information obtained from formal decision events. It facilitates effective explicit representation of decisional experience taken from different technologies. SOEKS comprises variables,...
-
Wybrane metody badania poziomu metylacji DNA w komórkach eukariotycznych
PublikacjaMetylacja regionów promotorowych jest jednym z głównych mechanizmów regulacji transkrypcji genów u eukariota. W komórkach ssaczych metylacja DNA zachodzi głównie na reszcie cytozyny występującej w dinukleotydach CpG i jest katalizowana przez metylotransferazy DNA (DNMT1, DNMT3A i DNMT3B) (Turek Plewa, Jagodziński 2005). Mapowanie 5 metylocytozyny w DNA genomowym jest jednym z narzędzi do badania wpływu metylacji na tkankowo-specyficzną...
-
Binding free energy of selected anticancer compounds to DNA - theoreticalcalculations
PublikacjaPraca dotyczy swobodnej energii wiązania z DNA trzech związków o działaniu przeciwnowotworowym (mitoksantronu i dwóch pochodnych pirymidoakrydyny). Obliczenia wykorzystywały metody Poissona-Boltzmanna (udział elektrostatyczny) i metody SASA (udział nieelektrostatyczny). W wyniku badań zaproponowano struktury kompleksów jakie tworzą badane ligandy z DNA.
-
Molecular Recognition in Complexes of TRF Proteins with Telomeric DNA
PublikacjaTelomeres are specialized nucleoprotein assemblies that protect the ends of linear chromosomes. In humans and many other species, telomeres consist of tandem TTAGGG repeats bound by a protein complex known as shelterin that remodels telomeric DNA into a protective loop structure and regulates telomere homeostasis. Shelterin recognizes telomeric repeats through its two major components known as Telomere Repeat-Binding Factors, TRF1...
-
H2AX phosphorylation, its role in DNA damage response and cancer therapy
PublikacjaDouble-strand breaks (DSBs) are the most deleterious DNA lesions, which, if left unrepaired, may have severe consequences for cell survival, as they lead to chromosome aberrations, genomic instability, or cell death. Various physical, chemical, and biological factors are involved in DSB induction. Cells respond to DNA damage by activating the so-called DNA damage response (DDR), a complex molecular mechanism developed to detect...
-
Tratwy Meduzy. - Barwy Morza : Ogólnopolska Wystawa Marynistyczna- Gdynia 2014
Publikacja -
Applying Decisional DNA to Internet of Things: The Concept and Initial Case Study
PublikacjaIn this article, we present a novel approach utilizing Decisional DNA to help the Internet of Things capture decisional events and reuse them for decision making in future operations. The Decisional DNA is a domain-independent, standard and flexible knowledge representation structure that allows its domains to acquire, store, and share experiential knowledge and formal decision events in an explicit way. We apply this approach...
-
Principles of target DNA cleavage and the role of Mg2+ in the catalysis of CRISPR–Cas9
PublikacjaAt the core of the CRISPR–Cas9 genome-editing technology, the endonuclease Cas9 introduces site-specific breaks in DNA. However, precise mechanistic information to ameliorate Cas9 function is still missing. Here, multimicrosecond molecular dynamics, free energy and multiscale simulations are combined with solution NMR and DNA cleavage experiments to resolve the catalytic mechanism of target DNA cleavage. We show that the conformation...
-
Radiosensitization of DNA in presence of Pt(II)-based compounds
PublikacjaX-ray irradiation of plasmid DNA in presence of platinum (II)-based compounds was carried out in order to assess the radiosensitization capabilities of these drugs. In present investigations pBR322 plasmid DNA was used to monitor the effectiveness of chosen compounds in inducing strand breaks. Samples were incubated in the presence of potential radiosensitisers: platinum (II) bromide and cis-diamminedibromoplatinum (II). The results...
-
Decisional DNA, reflexive ontologies, and security: developing decisional trust
PublikacjaOmowiono model osiagania zaufania decyzjnego opartego na decyzyjnym DNA, refleksyjnych ontologiach oraz na bezpieczenstwie technologicznym.